Группа исследователей провела исследование 33 здоровых взрослых участников. Одна группа из 22 добровольцев была изучена в течение сезона гриппа 2014-2015 гг. а вторая группа из 11 добровольцев изучалась в течение сезона гриппа 2015–2016 гг. Группа из 22 добровольцев имела ранее существовавший высокий иммунитет к штаммам вируса гриппа, содержащимся в вакцине от сезонного гриппа 2014-2015 гг. Группа из 11 добровольцев имела низкий иммунитет к штаммам вируса сезонной вакцины против гриппа 2015-2016 гг.
Все участники исследования получили вакцину от сезонного гриппа. Половина участников в каждой группе также прошли пятидневный курс лечения антибиотиками широкого спектра действия (состоящий из неомицина, ванкомицин, и метронидазол) внутрь перед вакцинацией. Анализируя образцы стула и сыворотки крови, взятые в разное время в течение одного года после вакцинации, исследователи отслеживали иммунный ответ участников на вакцины против гриппа, а также разнообразие и изобилие организмов в их кишечном микробиоме.
Как и ожидалось, у большинства участников, получавших антибиотики, наблюдалось снижение уровня кишечных бактерий. Кроме того, среди участников 2015-2016 гг., у которых ранее не было иммунитета к вакцинным штаммам вируса сезонного гриппа, курс антибиотиков препятствовал их иммунным ответам на один из трех штаммов вируса гриппа в вакцине, вирус H1N1 A / Калифорния. Это, вероятно, указывает на то, что если они подвергнутся воздействию этого вируса H1N1 после вакцинации, эти участники будут менее защищены от заражения этим штаммом, чем люди, не получавшие антибиотики, по мнению авторов. Это открытие подтверждает более ранние результаты исследований на мышах.
Исследователи также обнаружили, что у людей, принимавших антибиотики, наблюдались изменения в своей иммунной системе, которые способствовали провоспалительному состоянию. похоже на состояние, наблюдаемое у пожилых людей, получивших вакцину от гриппа. Исследователи полагают, что это провоспалительное состояние связано с процессом, с помощью которого микробиом регулирует метаболизм желчной кислоты с меньшим количеством микроорганизмов, этот процесс нарушен. Микробиомы людей меняются естественным образом с возрастом, и исследователи предполагают, что дальнейшие исследования этих путей могут дать представление о том, почему пожилые люди по-разному реагируют на вакцинацию против гриппа и почему у них в целом более слабая иммунная система.