A kutatócsoport 33 egészséges felnőtt résztvevőt vizsgált meg tanulmányukban. A 2014-2015-ös influenza szezonban 22 önkéntes csoportot vizsgáltak, és a második csoportot 11 önkéntessel vizsgálták a 2015-2016-os influenza szezonban. A 22 önkéntesből álló csoport korábban magas immunitással rendelkezett a 2014–2015-ös szezonális influenza elleni oltóanyagban található influenzavírus-törzsekkel szemben. A 11 önkéntesből álló csoport alacsony immunitással rendelkezett a 2015–2016-os szezonális influenza elleni vakcina vírustörzseivel szemben.
A vizsgálat minden résztvevője szezonális influenza elleni védőoltást kapott. Minden csoport résztvevőinek fele kapott egy ötnapos, széles spektrumú antibiotikum-kúrát (neomicinből, vankomicin, és metronidazol) szájon át a vakcina beadása előtt. A széklet- és vérszérumminták elemzésével, különböző időpontokban, legfeljebb egy évvel a vakcinázást követően, a kutatók nyomon követték a résztvevők immunválaszát az influenza elleni oltásokra, valamint a bél mikrobiomjaiban található organizmusok sokfélesége és bősége.
A várakozásoknak megfelelően, a legtöbb résztvevő, aki antibiotikumot kapott, csökkent bélbaktérium -szintet tapasztalt. Továbbá, a 2015-2016-os résztvevők között, akiknek csekély volt az immunitásuk a szezonális influenza vírus elleni oltóanyag-törzsekkel szemben, egy antibiotikum kúra gátolta immunválaszukat a vakcina három influenza vírustörzsének egyikére, egy H1N1 A/California-specifikus vírus. Ez valószínűleg azt jelzi, hogy ha az oltás után ki vannak téve ennek a H1N1 vírusnak, ezek a résztvevők kevésbé lennének védve ezzel a törzzsel való fertőzéssel szemben, mint azok, akik nem kaptak antibiotikumot, a szerzők szerint. Ez a megállapítás alátámasztja az egereken végzett korábbi kutatási eredményeket.
A kutatók azt is megállapították, hogy azok, akik antibiotikumot szedtek, olyan változásokat tapasztaltak az immunrendszerükben, amelyek elősegítették a gyulladást elősegítő állapotot, hasonló az idős felnőtteknél tapasztalt állapothoz, akik influenza elleni védőoltást kaptak. A kutatók úgy vélik, hogy ez a gyulladást elősegítő állapot összefügg azzal a folyamattal, amellyel a mikrobiom szabályozza az epesav anyagcseréjét-kevesebb mikroorganizmussal, ez a folyamat megszakad. Az emberek mikrobiomái természetesen változnak az életkor előrehaladtával, és a kutatók azt sugallják, hogy ezen utak további kutatása betekintést nyújthat abba, hogy az idősebb felnőttek miért reagálnak másképp az influenza elleni védőoltásra, és miért van gyengébb az immunrendszerük.