Das Forschungsteam untersuchte in ihrer Studie 33 gesunde erwachsene Teilnehmer. Eine Gruppe von 22 Freiwilligen wurde während der Grippesaison 2014-2015 untersucht. und die zweite Gruppe mit 11 Freiwilligen wurde während der Grippesaison 2015-2016 untersucht. Die Gruppe von 22 Freiwilligen hatte eine hohe vorbestehende Immunität gegen die Influenzavirusstämme, die im saisonalen Grippeimpfstoff 2014-2015 enthalten waren. Die Gruppe von 11 Freiwilligen hatte eine geringe Immunität gegen die Virusstämme des saisonalen Influenza-Impfstoffs 2015-2016.
Alle Studienteilnehmer erhielten einen saisonalen Grippeimpfstoff. Die Hälfte der Teilnehmer jeder Gruppe erhielt außerdem eine fünftägige Kur mit einem Breitbandantibiotikum (bestehend aus Neomycin, Vancomycin, und Metronidazol) oral einzunehmen, bevor Sie den Impfstoff erhalten. Durch die Analyse von Stuhl- und Blutserumproben, die zu verschiedenen Zeitpunkten bis zu einem Jahr nach der Impfung entnommen wurden, die Forscher verfolgten die Immunantwort der Teilnehmer auf die Grippeimpfstoffe, sowie die Vielfalt und Fülle der Organismen in ihrem Darmmikrobiom.
Wie erwartet, die meisten Teilnehmer, die Antibiotika erhielten, hatten eine verminderte Darmbakterienkonzentration. Zusätzlich, unter den Teilnehmern aus den Jahren 2015-2016, die zuvor eine geringe Immunität gegen die saisonalen Influenzavirus-Impfstoffstämme hatten, eine Antibiotika-Kur behinderte ihre Immunantwort auf einen der drei Influenzavirus-Stämme im Impfstoff, ein H1N1 A/California-spezifisches Virus. Dies deutet wahrscheinlich darauf hin, dass sie nach der Impfung diesem H1N1-Virus ausgesetzt sind, diese Teilnehmer wären weniger vor einer Infektion mit diesem Stamm geschützt als Personen, die keine Antibiotika erhalten hatten, nach Angaben der Autoren. Dieser Befund unterstützt frühere Forschungsergebnisse an Mäusen.
Die Forscher fanden auch heraus, dass Menschen, die Antibiotika einnahmen, Veränderungen ihres Immunsystems aufwiesen, die einen entzündungsfördernden Zustand förderten. ähnlich wie bei älteren Erwachsenen, die Grippeimpfstoffe erhalten haben. Die Forscher glauben, dass dieser entzündungsfördernde Zustand mit dem Prozess zusammenhängt, durch den das Mikrobiom den Gallensäurestoffwechsel reguliert – mit weniger Mikroorganismen, dieser Prozess ist gestört. Das Mikrobiom des Menschen verändert sich mit zunehmendem Alter auf natürliche Weise. und die Forscher schlagen vor, dass weitere Forschungen zu diesen Signalwegen Erkenntnisse darüber liefern könnten, warum ältere Erwachsene unterschiedlich auf die Grippeimpfung reagieren und warum sie insgesamt ein schwächeres Immunsystem haben.