Istraživački tim ispitao je 33 zdravih odraslih sudionika u svojoj studiji. Jedna skupina od 22 volontera proučavana je tijekom sezone gripe 2014-2015. a druga skupina s 11 volontera proučavana je tijekom sezone gripe 2015-2016. Skupina od 22 dobrovoljca imala je visok već postojeći imunitet na sojeve virusa influence sadržane u cjepivu protiv sezonske gripe 2014-2015. Skupina od 11 dobrovoljaca imala je nizak imunitet na sojeve virusa cjepiva protiv sezonske gripe 2015-2016.
Svi sudionici istraživanja primili su cjepivo protiv sezonske gripe. Polovica sudionika u svakoj skupini također je prošla petodnevni tečaj antibiotskog režima širokog spektra (koji se sastoji od neomicina, vankomicin, i metronidazol) na usta prije primanja cjepiva. Analizom uzoraka stolice i seruma krvi uzetih u različito vrijeme do godinu dana nakon cijepljenja, istraživači su pratili imunološki odgovor sudionika na cjepiva protiv gripe, kao i raznolikost i brojnost organizama u njihovim crijevnim mikrobiomima.
Očekivano, većina sudionika koji su primali antibiotike doživjela je smanjenu razinu crijevnih bakterija. U Dodatku, među sudionicima 2015.-2016. koji su imali slab imunitet na sojeve cjepiva protiv sezonske influence, tečaj antibiotika ometao je njihov imunološki odgovor na jedan od tri soja virusa influence u cjepivu, H1N1 A/California-specifičan virus. To vjerojatno ukazuje na to da bi trebali biti izloženi ovom virusu H1N1 nakon cijepljenja, ti bi sudionici bili manje zaštićeni od infekcije tim sojem od ljudi koji nisu primali antibiotike, prema autorima. Ovaj nalaz podupire ranije rezultate istraživanja na miševima.
Istraživači su također otkrili da su ljudi koji su uzimali antibiotike doživjeli promjene u imunološkom sustavu koje su promicale proupalno stanje, slično stanju kod starijih osoba koje su primile cjepiva protiv gripe. Istraživači vjeruju da je ovo proupalno stanje povezano s procesom kojim mikrobiom regulira metabolizam žučne kiseline-s manje mikroorganizama, ovaj proces je poremećen. Mikrobiomi ljudi mijenjaju se prirodno kako stare, i znanstvenici sugeriraju da bi daljnja istraživanja o tim putevima mogla dati uvid u to zašto stariji odrasli različito reagiraju na cijepljenje protiv gripe i zašto općenito imaju slabiji imunološki sustav.