Positiv Selectioun op engem bakteriell oncoprotein mat gastric cancer

positiv Selectioun op engem bakteriell oncoprotein mat VerfÜgung gastric Kriibs verbonne verbonne Background VerfÜgung Helicobacter pylori VerfÜgung ass eng vertikal ierflecher GUT commensal datt carcinogenic ass wann et der cag VerfÜgung pathogenicity leie Insel (cag VerfÜgung PAI); Krankheet mat H.pylori VerfÜgung ass de Risk Faktor fir gastric Kriibs, den zweete Spëtzekandidat Doudesursaach vum Kriibs weltwäit (DÉI). D'cag VerfÜgung PAI nët der Gentherapie VerfÜgung cagA encodes, Produit hir FAQ ass heijen Mo. epithelial Zellen via engem Typ IV secretion System, och déi vun der cag encoded VerfÜgung PAI. Eemol do, Photo'en der cagA FAQ fir verschidde bewosst Proteinen, an dysregulation vun Zell Divisioun an carcinogenesis doraus. Aus deem Grond, kann cagA als oncoprotein beschriwwe ginn. Eng kloer Verständnis vun de Mechanismus vun Aktioun vun cagA a sengem Virdeel fir d'Bakterien ass subtil. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Hei, léist mir datt de cagA VerfÜgung Gentherapie weist staark Ënnerschrëfte vu positive Auswiel vun Bakterien aus amerindian Populatiounsschichte isoléiert, mat der Ka /KS Verhältnis. Schwaach Ënnerschrëfte sinn och an der Gentherapie aus Bakterien aus asiatësch Populatiounsschichte isoléiert fonnt, mat dem Ka /KS Verhältnis an de méi sensibel Secteuren-Siten Modell vun der PAML Pak. Wann der Gentherapie aus amerindian Populatiounsschichte isoléiert VerfÜgung cagA war méi am Detail iwwerpréift et gouf erausfonnt, datt d'Regioun ënner positive Auswiel der EPIYA Beräicher enthält, déi bekannt sinn der carcinogenicity vun der Gentherapie bis well. Dat heescht, datt d'carcinogenicity modulating Regioun vun der Gentherapie Adaptatioun ass amgaang. D'Resultater diskutéiert gi par rapport zu den héije incidences vun Mo. Kriibs zu puer Latin American an asiatesch Populatiounen. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Positiv Selectioun op cagA beweist verschiddene coevolution tëscht Provider a Bakterien, déi entscheet Foussvollek schéngt dat cagA zu der Revolutioun ass Mënsch Provider op deenen d'Bakterien of. Dëst deit drophin puer Net-exklusiv Méiglechkeet; datt gastric Kriibs ass eng grouss selektiv Drock op mënschlech Populatiounsschichte net ginn, datt cagA eng virweisen profitéiert fir de Mënsch Provider huet, oder déi horizontal Transmissioun vun H.pylori VerfÜgung tëscht Lëntgen huet zu der Entwécklung vun H.pylori méi wichteg ginn
wéi virdrun ugeholl, déi selektiv Drock loung pathogenicity vun de Bakterien ze niddreg. Déi verschidden Musteren vun Erkrankung vun der Gentherapie zu verschiddene Mënsch Populatiounsschichte beweist, datt et Populatioun spezifesch Differenzen an der mënschlecher GUT Ëmwelt -. Wéinst entweder zu Differenzen an Provider Genetik oder Ernährung an anere Liewensstil Fonctiounen VerfÜgung Schlësselwieder VerfÜgung gastric Kriibs oncogene positiv Auswiel Helicobacter pylori VerfÜgung cagA Erschléisse VerfÜgung Helicobacter pylori VerfÜgung ass engem Gramm negativ Bakterie datt an de Mënsch Mo als Deel vun der normal gastric microbiome Liewen [1], an der Regel elo zu der Majoritéit vun der erwuessener Populatioun [ ,,,0],2]. D'Bakterie huet Co-Perséinlechkeeten mat mënschlechen Populatiounsschichte [3] an ass gutt ugepasst an op de Mënsch Provider schiddene spezifesch. De Poppo vun H.pylori VerfÜgung intestinal gouf a während senger Entwécklung an de Mo. migrated, vun der Entwécklung vun enger urease vereinfacht, datt de Mo d'Seier Konditiounen combats [4, 5]. H.pylori VerfÜgung analyséieren vläicht e cag VerfÜgung pathogenicity Insel Besëtz (cag VerfÜgung PAI), datt e cagA VerfÜgung Gentherapie enthält Zeechesaatz eng 128 kDa FAQ [6, 7]. D'cag VerfÜgung PAI schéngt ze hunn der H.pylori VerfÜgung Nepgen vun lateral Gentherapie Transfermaart agin, no H.pylori aus Elteren Aarten ënnerscheet VerfÜgung [2, 8]. Vill vun de Genen vun der cag VerfÜgung PAI an br vun der cagA FAQ an epithelial Zellen de Mo. implizéieren Doropshin. Allerdéngs ass d'Funktioun vun der cagA FAQ selwer onbekannt. Krankheet mat cagA + VerfÜgung H.pylori VerfÜgung ass staark mat gastric carcinoma [9-11] verbonnen; gastric carcinoma ass den zweete Spëtzekandidat Doudesursaach vum Kriibs weltwäit [12]. Zousätzlech, cagA VerfÜgung + H.pylori VerfÜgung mat chronescher gastritis an peptic ulcers assoziéiert ass [13]. VerfÜgung De Mechanismus vun pathogenicity vun cagA + VerfÜgung H.pylori VerfÜgung ass wéi follegt . D'Bakterien leet de Mo. Mauer an der cagA FAQ ass an eng epithelial Zell vun engem bakteriell Type IV secretion System heijen, och déi vun der cag encoded VerfÜgung PAI nët [14]. Eemol an der Zell, ass cagA phosphorylated op tyrosine Reschter innerhalb EPIYA Beräicher vun de Membere vun der src kinases wéi c-src, Fyn, Jo [15], Lyn [16] an c-ABL [17]. D'cagA FAQ ass Membran assoziéiert an openee mat villen zousätzlech bewosst Proteinen, dorënner de oncoprotein Src homology 2 Domain wouvun tyrosine phosphatase (SHP-2 [18]), microtubule Affinitéit-Regulatioun kinase (MARK2 [19]), Wuesstem Faktor receptor-Deckelen 2 FAQ (Grb-2 [20]), hepatocyte Wuesstem Faktor receptor (c-hu [21]), C-Uschloss Src kinase (Csk [22]) an p38 (Crk [23]). Tyrosine cagA aarbechter phosphorylated an activéiert SHP-2, scheinbar der Aktioun vun Gab1 Wäerr [24]. Konsequent mat der mimicry Hypothesen, ass cagA VerfÜgung gebass Gab1 erhéijen Villäicht sollte VerfÜgung mutants [25] ze retten, déi entscheet interessant ass datt cagA VerfÜgung huet mat Gab1 kee Haaptrei Ähnlechkeet, Exemplar huet et kee bekannt homologs. Der Interaktioun mat SHP-2 Ursaachen inhibition vun hirer entholl suppressing Aktivitéit [18]. Epithelial Zellen datt dysregulated goufen ons de verlängerten hummingbird phenotype [26]. Zousätzlech, activéiert cagA der Transkriptiouns Faktor NF-kb op der Aféierungs- vun interleukin 8 (IL-8) a Kierzunge inflammation Virwaat [27]. Der Aktivatioun vun NF-kb existeiert via SHP-2. VerfÜgung Variant am EPIYA Beräicher vun cagA Resultater am Variant am virulences vu verschiddene cagA + VerfÜgung H.pylori VerfÜgung analyséieren [28]. D'EPIYA motifs sinn an der C-Uschloss Halschent vun der cagA FAQ a si vun Typen A-D wellkomm. D'EPIYA motifs sinn déi grouss Site vun tyrosine phosphorylation am cagA FAQ. Den ëstlechen EPIYA-D Motif, an asiatesch Populatiounsschichte fonnt, ass verbonne mat staark verbindlech bis SHP-2, iwwerdeems de westlechen EPIYA-C Motiv ass net. Der Presenz vun der EPIYA-D Motif an asiatesch cagA VerfÜgung Message ka fir déi héich Präisser vu H.pylori VerfÜgung verbonne Krankheet an asiatesch Populatiounsschichte [28]. VerfÜgung der Etude confirméiert hei Enquête déi verännert Dynamik vun responsabel gin der cagA VerfÜgung Gentherapie aus verschiddene Mënsch Populatiounen, weist an datt d'Gentherapie weist Montanten vun positive Auswiel verännerlech, Provider Populatioun genetesch Differenzen an der Äntwert op H.pylori VerfÜgung Wonn ausgeluegt, a beweist de Virdeel vun der Gentherapie bis H. pylori VerfÜgung. Der Regioun vun der cagA VerfÜgung Gentherapie ënner Auswiel enthält den EPIYA Beräicher. Dës Observatiounen ginn eng visuell Paradox, déi demokratesch gefouert Effekter vun der oncoprotein op de Mënsch Provider kritt; verschidden Zeenarie muss ënnerscheeden diskutéiert, datt d'Donnéeë erkläre kann. VerfÜgung Method VerfÜgung Message an phylogenetic Analyse VerfÜgung cagA VerfÜgung Message aus verschiddene Mënsch Populatiounsschichte Komplett sech aus der Genbank Datebank (NCBI) kritt a sinn an Table 1 opgezielt. obschonn aus engem wäisse amerikanesch aus Tennessee isoléiert, huet d'USA Haaptrei afrikanesch Originen [29], dohier ass et mat afrikanesche (USA). Et waren zwee cagA VerfÜgung Genen am Quartier Nepgen, mat Peru1 an Peru2. Et ass eng zousätzlech cagA VerfÜgung Gentherapie am Venezuela Nepgen, awer dat ass wahrscheinlech eng pseudogene well vun engem 119 Aminosaier Läschen op der N Kappgare ginn. Sicht vun der Datebank Genbank, an anere Helicobacter VerfÜgung Arten net wesentlechen homolog vun cagA opzeweisen. DNA Alignementer sech vun éischt aligning d'FAQ Message gebaut, andeems der MAFFT Programm [30], a mat dëser Formatioun als e Skelett vun engem DNA-Formatioun huet, benotzen d'PAL2NL Programm [31]. Bayesian phylogenetic Ufank ware vun der DNA Message VerfÜgung cagA war mat dem Programm MrBayes gehaal [32], e GTR Wiessel Modell an engem ESO Parameter vun 0,84 benotzt, erausgewielt jModelTest Programm benotzt [33]. D'Simulatioun war fir 90000 Generatiounen lafen, all 100 Generatiounen probéieren. A verbrennen-an vun 25% huet gehaal an de Konsens Bam aus de leschte 25% vun de flächeméisseg generations.Table 1 cagA VerfÜgung Message benotzt an der Etude VerfÜgung H gebaut. pylori Deformatioun
Zougank Zuel
Origin
26695 VerfÜgung GenBank: NC000915 VerfÜgung UK VerfÜgung J99 VerfÜgung GenBank: NC000921 VerfÜgung Afrika (USA ) VerfÜgung HPAG1 VerfÜgung GenBank: NC008086 VerfÜgung Schweden VerfÜgung Shi470 VerfÜgung Genbank: NC010698; VerfÜgung YP001910308 (Peru1), VerfÜgung YP001910294 (Peru2) VerfÜgung Peru VerfÜgung G27
GenBank: NC011333 VerfÜgung Italien VerfÜgung P12 VerfÜgung GenBank: CP001217 VerfÜgung Däitschland VerfÜgung V225 VerfÜgung GenBank: CP001582 VerfÜgung Venezuela VerfÜgung VietnamHP-No36 VerfÜgung GenBank: FJ798973
Vietnam VerfÜgung Mel-HP27 VerfÜgung GenBank: DQ306710 VerfÜgung Central China VerfÜgung F28 VerfÜgung GenBank: AB120418 VerfÜgung Japan VerfÜgung 3K VerfÜgung GenBank: DQ985738 VerfÜgung Indien
15818 VerfÜgung GenBank: VerfÜgung AF083352 Éisträich VerfÜgung 42G VerfÜgung GenBank: FJ389581 VerfÜgung Deelweis rRNA Message fir verschidde Helicobacter VerfÜgung Arten zu Hong Kong aus Genbank kritt huet; dës huet H.fennelliae VerfÜgung (GenBank: AF348747), H.acinocychis VerfÜgung (GenBank: NR_025940), H.pylori VerfÜgung (GenBank: DQ202383), H.nemestrinae VerfÜgung (GenBank: AF363064), H.heilmannii VerfÜgung (GenBank: AF506794), H.cetorum VerfÜgung (GenBank: FN565164), sp Helicobacter. "VerfÜgung solnick 9A1-T71 (GenBank: AF292381), H.bizzozeronii VerfÜgung (GenBank: NR026372), H.salomonis VerfÜgung (GenBank: NR026065) an H.felis VerfÜgung (GenBank: NR025935) . De Message huet de MAFFT Programm bilden an phylogenetic Relatiounen sech MrBayes an enger HKY Modell benotzt, déi jModelTest Programm ausgewielt benotzt. D'Simulatioun war fir 10000 Generatiounen lafen, all 100 Generatiounen probéieren. A verbrennen-an vun 25% huet gehaal an de Konsens Bam aus de leschte 25% vun de flächeméisseg Generatiounen gebaut. VerfÜgung Positiv Auswiel Analyse VerfÜgung D'cagA VerfÜgung Gentherapie Message fir d'Präsenz vu positive Auswiel analyséiert goufen duerch Bewäertung Verhältnis Testen, gemaach Modeller, automatesch an alternativ vergläichen, mat der PAML Programm [34]. Dräi Tester goufen gesuergt; der Säitelinn Test [35, 36], Siten Test [37] a Secteuren-Siten Test [38]. An unrooted Bam ouni Sparten Virsaz war fir d'Analyse, entsteet duerch d'phylogenetic Analyse, an der codon Frequenz Dësch Optioun benotzt gouf an all Analysë geheescht. Bewäertung Verhältnis Fahrt war gehaal der signficance vun 2Δl, d'Differenzen tëscht der Logbuch likelihoods vun den zwee Modeller ze bestëmmen (wou l d'Logbuch Chancen ass), andeems en χ 2 Verdeelung mat 12 Grad vun der Fräiheet fir d'Branchen Modell, eng χ 2 Verdeelung an 2 Grad vun der Fräiheet fir d'Siten Modell an engem χ 2 Verdeelung mat 1 Ofschloss vun der Fräiheet fir d'Branchen-Siten Modell. Déi automatesch Modell fir de Secteuren Test benotzt gouf e eent-Verhältnis Modell wou Ka /KS (ω) d'selwecht fir all Secteuren war, iwwerdeems de alternative Modell der fräier-Verhältnis Modell war wou ω variéieren entfale. Déi automatesch Modell fir d'Siten Test war Modell 1a (neutral; Modell = 0, NSsites = 1, fix_omega = 0), an der alternative Modell war Modell 2a (Auswiel; Modell = 0, NSsites = 2, fix_omega = 0). Déi automatesch Modell fir d'Branchen-Siten Test war no Yang geännert et al. [39] (neutral; Modell = 2, NSsites = 2, fix_omega = 1, Omega = 1). Den alternative Modell war Modell A (Auswiel; Modell = 2, NSsites = 2, fix_omega = 0). VerfÜgung Resultater an Diskussioun VerfÜgung Positiv Selectioun op cagA VerfÜgung der topology vun der phylogenetic Bam vun de komplette H.pylori VerfÜgung cagA VerfÜgung Message reproduces d'Relatiounen tëscht verschiddene Mënsch Populatiounsschichte ronderëm d'Welt (well 1), an ass konsequent mat groussen Skala Studien concatenated Message mat deem weisen dass H.pylori VerfÜgung huet mat Mënschen Co-migrated no hire Sortie aus Afrika [3]. Der Reproduktioun vun der verännert Geschicht vun der Mënschheet Populatiounen an der topology vun der cagA VerfÜgung Bam dofir ass d'Resultat vun der knapper Associatioun vun H.pylori VerfÜgung mat sengem Gaascht [3, 40, 41]. D'cagA VerfÜgung aus engem indesche eenzelne kritt Haaptrei ass déi europäesch Message, konsequent mat Resultater am clade geformt wellkomm weist, datt indesch cagA VerfÜgung Message intercalate mat europäesch Message [42] an déi meescht H.pylori VerfÜgung aus Indien si fir europäesch analyséieren Zesummenhang [43]. De Bam bedeit och, datt de Quartier cagA VerfÜgung Haaptreiestären engem rezenten Gentherapie Verdueblung weiderentwéckelt huet; dat ass an der operon Struktur (Dorënner 2) gesinn. Staark positive Selectioun op Peru2 beweist dass neofunctionalization vun der Gentherapie ass geschitt. Wahrscheinlech, der Gentherapie Verdueblung Resultater vun der Gentherapie Doséierung Effekter; wéi dat betrëfft d'pathogenicity vun de Klischee vun onkloer. D'Präsenz vun engem pseudogenized cagA VerfÜgung Gentherapie am Nepgen H.pylori VerfÜgung vun engem immens amerindian isoléiert (kuckt Method) ass interessant; de Grond fir d'disparity tëscht de Geschécker vun der verduebelt cagA VerfÜgung Genen vun de zwou wëssenschaftlech analyséieren, ass och bekannt. D'Agence Virsaz op der phylogenetic Bam weisen Ähnlechkeet all aner, mat Ausnam vun der Vietnamesesch antike; Dës Agence weist beträchtlech denke Evolutioun. Figur 1 Positiv Selectioun op cagA aus verschiddene H.pylori analyséieren. A phylogenetic Konsens Bam zu Method benotzt komplett cagA VerfÜgung Gentherapie Message ëmschriwwen gebaut. Zuelen iwwer an ënner Secteuren weg de Wäerter vun Ka /KS fir all antike berechent der PAML Secteuren Test benotzt, iwwerdeems Zuelen no slashes posterior Wahrscheinlechkeeten vun der jeweileger Wirbelen sinn. D'Skala bezitt sech op déi duerchschnëttlech Zuel vun Auswiesselungen pro Site. VerfÜgung 2 engem Ofstand vun der cag PAI aus dem Peru Deformatioun Dorënner. Uginn ass an der Figur vun der Positioun vun der verduebelt cagA VerfÜgung Gentherapie. VerfÜgung 2Δl wéi 73,6 fir déi Secteuren Test berechent gouf, déi statistesch relevant war. Ka /KS Wäerter vu méi wéi 1 sech fir 5 Branchen (Dorënner 1) observéiert; deene bedeitendste zu der Venezuela (1.56), Peru1 (1.04) an Peru2 (3.10) Message, fir d'gemeinsam Poppo vun der amerindian Message (1.03) an fir den antike aus der gemeinsamer Poppo vun der asiatësch Message Haaptfiguren (1.29). Dës Secteuren ënnerleien positive Auswiel, iwwerdeems de amerindian gemeinsam Poppo ass neutral iwwer d'Längt vun der Gentherapie. VerfÜgung 2Δl wéi 161 tëscht de automatesch an alternativ Modeller berechent gouf, fir d'Siten Test, déi statistesch relevant war. Estimatioune vun Parameteren sech wéi follegt zesummen: p 0 = 0.51, p 1 = 0.49, ω 0 = 0,03, ω 1 = 1 (neutral Modell), p 0 = 0.47 , p 1 = 0.38, p 3 = 0.14, ω 0 = 0,03, ω 1 = 1, ω 2 = 3.74 (Auswiel Modell). Siten identifizéiert wéi ënner positive Auswiel, mat statisteschen Bedeitung ass no der Bayes Empiresch Bayes Test [39], huet: 101, 206, 306, 378, 532, 542, 548, 604, 651, 774, 793, 815, 831, 834, 869, 876, 886, 892, 901, 998, 1004. d'Ofkierzung war baséiert op der Peru1 Haaptrei. VerfÜgung A Secteuren-Siten Test op all Sparten vun de Bam gehaal huet. Déi lineages fonnt positive Auswiel ze affichéieren Table zu opgezielt sinn 2. Dës abegraff d'lineages virdru vun der Säitelinn Test identifizéiert, an zousätzlech der afrikaneschen, Italienesch, schwedesch a Vietnamesesch lineages. D'Resultater weist positiv Auswiel vun cagA VerfÜgung isoléiert aus verschiddenen Populatiounsschichte sinn konsequent mat engem McDonald-Kreitman Test dat weist, datt partiell cagA VerfÜgung Message vum mexikanesche Populatioun isoléiert sinn ënner positive Auswiel [44]. Parallel Entwécklung vun Pestiziden oder verschidde Regioune vun der cagA Proteinen ass net observéiert, obwuel Reschter vun den 900 Aminosaier Regioun ënner staark diversifizéieren Selektioun sinn, wann d'Ledezma an Peru2 Genen vun enger hëlze Fënster Analyse iwwerpréift ginn (Dorënner 3). Dat ass eng interessant Resultat als dëser Regioun vun der cagA VerfÜgung Gentherapie der EPIYA encodes Widerhuelung, déi zu modulating der carcinogenicity vun der cagA VerfÜgung Gentherapie eng Roll hunn. Sou, wier et vläicht, datt d'Auswierkunge vun diversifizéieren Auswiel engem direkten Roll op Bam modulating carcinogenesis.Table 2 Statistics VerfÜgung antike vun de Branchen-Siten positive Auswiel Analyse hu vläicht VerfÜgung
2⊗ l
Reschter virausgesot ënner VerfÜgung positive Auswiel gin (p &Si besteet; 0,05)
Venezuela VerfÜgung 48,82 VerfÜgung 794, 834, 837 VerfÜgung Vietnam VerfÜgung 288,56 VerfÜgung 202, 274, 275, 277, 278, 279, 281, 282, 283, 287, 461, 834, 895, 896, 899, 900, 901, 903, 905, 908, 910, 911 , 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922 VerfÜgung Schweden VerfÜgung 25,6 VerfÜgung 1008 VerfÜgung Peru1 VerfÜgung 66,2 VerfÜgung 665, 799, 803 VerfÜgung Peru2 VerfÜgung 3,24 VerfÜgung 186, 198, 667, 808 VerfÜgung Liewe antike vun Amerindian analyséieren VerfÜgung 30 VerfÜgung 650 VerfÜgung Liewe antike vun asiatësch analyséieren VerfÜgung 21,8 VerfÜgung - VerfÜgung Afrika (USA) zu 11,42 VerfÜgung - VerfÜgung Italien VerfÜgung 9,52 VerfÜgung - VerfÜgung Lineages virausgesot ginn ënnert positive Auswiel identifizéiert sech mat der Säitelinn-Siten Test. Reschter sech d'Bayes Empiresch Bayes iwwerleen identifizéiert benotzt [43], nëmmen deenen, datt statistesch relevant waren si ugewisen. Ofkierzung ass op all respektiven Haaptrei baséiert. VerfÜgung Dorënner 3 bréngen Fënster Analyse vun zwee cagA Genen. Genen aus dem Venezuela an peruanesch analyséieren (Peru2) goufen analyséiert. Hëlze Fënster Analyse vun engem pairwise cagA VerfÜgung Formatioun huet sech mat der DNASP5.0 Programm gehaal [82], mat Hëllef vun der Nei an Gojobori [83] Method vun Paien Ka /KS. D'Formatioun huet den zu Method beschriwwen gebaut. Eng hëlze Fënster vun 100 nucleotides, mat engem Schrëtt vun 10 benotzt gouf. Thematiséieren ignoréiert huet. Bevëlkerung spezifesch Differenzen am positive Auswiel
Positiv Selectioun op cagA VerfÜgung ass wahrscheinlech wéinst ze streng Gesetzer vum Lycée immun Äntwert ze ginn, IgG, oder ze verbesseren verbindlech bis bewosst kenne wat antagonistically co sinn evoluéiert. Et ass eng staark immun Äntwert géint d'cagA FAQ (cagA ass immunodominant); Dës hunn och zu enger "Waffen Rass" tëscht Provider a Bakterien gefouert, an domat och d'Ënnerschrëft vun positive Auswiel. Dat ass oft de Fall mat extracellular Proteinen vun pathogens, entweder op der Zell Uewerfläch läit oder secreted. Et ass eng kritesch an Bakterien, mat der porB VerfÜgung porin Gentherapie vun Neisseria gonorrhoeae VerfÜgung an meningitidis VerfÜgung [45], an eng ganz Rei vun extracellular Proteinen vun Escherichia belaascht VerfÜgung [46]. Secreted slr Proteinen vun H.pylori VerfÜgung och Ënnerschrëfte vu positive Auswiel weisen [47]. Dëst Szenario wier zou, datt de Regioune vun cagA VerfÜgung ënner positive Selektioun sinn immunogenic VerfÜgung H.pylori cagA VerfÜgung aus enger Rei vu Populatiounen ronderëm d'Welt weisen Beweiser vu positive Auswiel (mat der Säitelinn-Siten Test). dës och Message vum Venezuela, Vietnam, Schweden, Peru, Afrika an Italien. Mä, wéi de Mënsch an H.pylori VerfÜgung analyséieren hunn Co-Perséinlechkeeten, hunn cagA VerfÜgung Genen aus puer analyséieren staark positive Auswiel weiderentwéckelt, besonnesch d'analyséieren mat Racinen an de Mënsch Gruppen déi meescht kuerzem migrated, déi asians an der amerindians [48, 49]. D'Ursaach vun den Differenzen am Stäerkt vun Selectioun op d'cagA VerfÜgung Genen läit viraussiichtlech zu genetesch Differenzen am Provider Niveau, mee ass och mediated potenziell duerch verschidden Äntwerte vun der cagA FAQ entschlof, déi aus funktionell Differenzen tëscht verschiddene cagA Proteinen. D'Zollformalitéiten-Bevëlkerung genetesch Distanzen ginn kleng a mënschlech Gruppen wéi se Osten eraus aus Afrika [50] migrated. Provider-spezifesch Ënnerscheeder kann Differenzen an der immun Äntwert, oder Differenzen an der Aktivitéite vun bewosst cagA bindend Proteinen gehéiert. Codon Uleedung Analyse (Table 3) weist, dass d'codon Adaptatioun index fir verschidden cagA VerfÜgung Genen ähnlech ass, suggeréiert, dass et keng staark Differenzen an respektiv Auswiel tëscht cagA VerfÜgung Genen vun verschiddenen H.pylori VerfÜgung analyséieren, wat uginn kann spigelen keng gréisser funktionell Differenzen tëscht Genen oder einfach de Mangel vun respektiv Selectioun op héich ausgedréckt Genen Nepgen-grouss [51]. Dës Donnéeë hëlleft d'hëlze Fënster Analyse ze informéieren; respektiv Auswiel huet zu falsch Indikatiounen vun positive Auswiel [52] zu Resultat gewise ginn: dat ass net wahrscheinlech gin de Fall hei wéinst dem Manktem vun respektiv Selectioun op dës genes.Table 3 Codon Uleedung Analyse vun der cagA VerfÜgung Genen
Gene
H. pylori Deformatioun
CAI
UK VerfÜgung 26695 VerfÜgung 0,699 VerfÜgung Afrika (USA)
J99
0.697
Sweden
HPAG1
0.695
Peru1
Shi470
0.712
Peru2
Shi470
0.698
Italy
G27
0.693
Germany
P12
0.690
Venezuela
V225
0.702
Vietnam
VietnamHP-No36
0.695
Central China
MEL-HP27
0.700
Japan
F28
0.700
India
3K
0.691
Austria
15818
0.686
Hong Kong VerfÜgung 42G VerfÜgung 0,701 VerfÜgung D'codon Adaptatioun index (CAI) berechent huet wéi follegt. A codon Uleedung Dësch fir déi komplett H.pylori VerfÜgung Nepgen vun Deformatioun HPAG-1, deen 1544 ORFs aus, gouf aus der Codon Verwendung Datebank http kritt:.. //Www Kazusa oder JP /codon. . Dat war fréier de CAI fir all eenzelne ORF ze berechnen. VerfÜgung schiefgang an der IL-1 Gentherapie Stärekoup gastric Kriibs Risiko änneren [53]. D'Aféierungs- vun IL-8 secretion vun der cag VerfÜgung PAI ass e wichtegen Impuls vun der immun Äntwert [49]. Soumat kënnen Differenzen an Provider interleukin genotypes zu Differenzen an Resultat fir Krankheet Werdegang an Oneenegkeet selektiv Drock op d'Genen vun verschiddenen Populatiounsschichte VerfÜgung cagA Féierung. Amerindians mécht während der Wanderung vun hire Virfueren aus Asien enger Populatioun Maximal [48]. Phenotypic Beweiser vun dëser ass d'Universalitéit vun der O Blutt Grupp Beraich amerindians [54], dëst zu engem homogeneity vun immun Äntwert gefouert hunn kann. Dat hu vläicht de analyséieren Muecht ze kruet Net O Mënsch Blutt antigens beaflosst; meeschte H.pylori VerfÜgung analyséieren kënnen d'A, B an O antigens via de Baba adhesin, iwwerdeems amerindian analyséieren aus Südamerika kruet bescht ze O antigens zu kruet [55]. Et ass interessant, dass d'Osten asiatësch Populatioun ze notéieren och relativ genetesch homogen ass [49]. VerfÜgung Béid commensal an pathogenic Bakterien besëtzen Mechanismen fir d'Majoritéit vun de Provider immun System. Puer Mechanismen goufen zu streng Gesetzer vun der immun System vun H.pylori VerfÜgung gin Équipe gewisen. Allerdéngs, cagA VerfÜgung + analyséieren dran eng verstäerkt immun Äntwert a fräi inflammation [56-58]. Inflammation vläicht e Mechanismus ginn nährstoffaarme ze kréien [59], awer wann cagA VerfÜgung ass entwéckele der immun System ze verhënneren, während gläichzäiteg dat Spannend, da schéngt dat widderspréchlech. VerfÜgung Distribution vun gastric Kriibs weltwäit an seng Relatioun mat der Stäerkt vun positive Selectioun op cagA VerfÜgung Et gi grouss Variatiounen an der Heefegkeet vu gastric Kriibs weltwäit, mat Deeler vun der East Asien a Latäinamerika héich incidences weisen, während déi aner Deeler vun der Welt, wéi Afrika an Deeler vun Europa niddereg incidences weisen (Table 4). D'Heefegkeet Tauxe vergläichen net mat Tauxe vun Wonn mat H.pylori VerfÜgung. Zum Beispill, sinn et héich Tariffer vun H.pylori VerfÜgung verbonne pathogenicity am Japan, Korea an Deeler vu China, mä héich an Thailand an Indonesien och wann se héich Wonn Tariffer hunn; dëst ass de "asiatësch Paradox" [60]. Amplaz, schéngt Heefegkeet fir d'Frequenz an genotype vun cagA VerfÜgung [61] verbonne ginn, während eng aner Faktoren och wahrscheinlech sinn eng Roll wéi Héicht, Ernährung an Provider genotype ze spillen. Ausserdeem hunn an der Aféierung schéinen rezent Wierk weist, datt rezent Migratiounen an Bevëlkerung Beweegunge vun "Net-gebierteg" H.pylori VerfÜgung analyséieren mat verschiddene cagA VerfÜgung alleles an etabléiert Mënsch Populatiounsschichte [42, 62], dat gëtt eng Zousatz Niveau vun complexity.Table 4 veruerteelt Figuren aus gastric Kriibs fir zu dëser Etude iwwerpréift Populatiounsschichte VerfÜgung Regioun
Heefegkeet vun gastric Kriibs (pro 100000) VerfÜgung
Heefegkeet vun esophageal Kriibs (pro 100000)
Peru VerfÜgung 21,2 VerfÜgung 1,1 VerfÜgung Venezuela VerfÜgung 10,4 VerfÜgung 1,5 VerfÜgung Japan VerfÜgung 31,1 VerfÜgung 5,7
Central China VerfÜgung 29,9 VerfÜgung 16,7 VerfÜgung Hong Kong
29.5
12.7
Vietnam
18.9
1.9
Austria
7
2.6
Germany
7.7
3.8
India
3.8
5.3
Italy
10.9
1.9
Sweden
4.3
2.2
U.K.
5.6
6.6
Africa
4
5
Date goufen aus der GLOBOCON Projet ofgeleet, International Agence fir Fuerschung op Cancer, Weltgesondheetsorganisatioun an Center fir Protection, Chiffer vu Gesondheet, Regierung vun der Hong Kong Special Administrativ Regioun (Hong Kong). VerfÜgung datt amerindian Bezug an d 'Liewe asiatësch cagA VerfÜgung Message weisen staarkt Zeeche vu positive Choix, an dass asiatesch an Latin American Populatiounsschichte kann héich incidences vun gastric Kriibs Collectioun, dat kéint ee Lien tëscht der Stäerkt vu positive Selectioun op der Gentherapie VerfÜgung cagA préziséiert an der oncogenicity vun der Gentherapie. D'Resultater vun der hëlze Fënster Analyse, wou de cagA Regioun de EPIYA Beräicher wou ënner positive Choix ass, gi mat dësem Hypothes konsequent. Weider Aarbecht ass néideg. Wann ubelaangt, kann dës Form vun Haaptrei Analyse hëllefen Risiko Populatiounsschichte z'identifizéieren. Verännert Virdeel vun cagA zu H.pylori
D'Ënnerschrëft vun positive Selectioun op der Gentherapie VerfÜgung cagA observéiert VerfÜgung beweist dass der cagA FAQ Lycée Evolutioun ass analyséieren an e puer Jongen, an ass op d'Nokomme virdeelhaft. Differenzen an Tariffer vun Erkrankung préziséiert spezifesch Differenzen Provider. De Virdeel fir d'Bakterien ass iwwer d'Roll vun cagA VerfÜgung am pathogenicity Insel mediated; déi spezifesch Roll vun cagA VerfÜgung, an déi vun der PAI, bleift alles ze gin. Am Allgemengen, hunn Pais eng Roll Iwwerliewe vun bakteriell pathogens doran [63]. De positiven Selectioun op d'oncogene VerfÜgung cagA observéiert ass ongewéinlech, well et am éischten Fall observéiert vu positive Choix op eng oncogene zu engem vertikal iwwerdroen pathogen ass. Positiv Selektioun ass eng Fonktioun vun verschiddene coevolution, déi schiedlech Effekter op de Provider beinhalt, mä och mutualistic coevolution, déi Virdeeler beinhalt. Positiv Auswiel huet op der Epstein Barr Virus observéiert ginn - encoded oncogene LMP1 [64] an der onwouer Typ 16 oncogene [65, 66], awer dës sinn horizontal pathogens iwwerdroen wou e Gläichgewiicht tëscht virulence an transmissibility erwaart ass [67]. Dëst kann préziséiert dass H.pylori VerfÜgung huet Horizontal zu engem gréissere Mooss iwwerdroen ginn wéi virdrun unerkannt. VerfÜgung Virulence ass e Resultat vun der coopération Reproduktioun vun enger pathogen. Fréi Modeller proposéiert datt e Luucht reduzéiert virulence ze entwéckelen viséiert wier, virausgesat, datt veruerteelt vum Provider ass en Nodeel. Allerdéngs huet dës Vue gouf als haut op Grupp Auswiel kritiséiert [68]. Allerdéngs, vertikal sinn ierflecher pathogens erwaart manner pathogenic méi Zäit ze ginn; wann der pathogen op de Provider fir Transmissioun hänkt an d'Transmissioun ass héich effizient dann ass et net am Interesse vun der pathogen ze vill de Fitness vun de Provider [69] reduzéieren. H.pylori VerfÜgung weist zwou Fonctiounen, zousätzlech zu de positiven Selectioun op cagA VerfÜgung observéiert, dass dëst Pitti zu ofschafen erschéngen. Eischtens, beweist d'Acquisitioun vun der cag VerfÜgung PAI während speciation aus Zesummenhang Net-pathogenic GUT helicobacters (Dorënner 4A), datt H.pylori VerfÜgung eng initial Erhéijung vun pathogenicity mécht. Zweet, d'Evolutioun vun de méi pathogenic EPIYA-D motifs an der cagA VerfÜgung Gentherapie zu puer asiatesch analyséieren (Dorënner 4B) weist, dass e puer cagA + VerfÜgung H.pylori VerfÜgung huet eng méi rezent zousätzlech Erhéijung vun pathogenicity weiderentwéckelt . Gewëssermoossen, kéint dat kënne vun der Propositioun erkläert ginn, dass et eigentlech e Provider - positiv Komponent ze cagA, oder datt et e genuch Liewer Effekt op d'Gaaschtland net Nofolleg huet. Eng Fro, déi deemno erfuerdert ass, ob déi analyséieren dass eng grouss Ofschloss vun positive Selektioun sinn amgaang sinn méi pathogenic réckelt. Figur 4 genetesch Facteure fir eng Erhéijung vun virulence vun Helicobacter pylori Haaptfiguren. e) Small subunit rRNA phylogenetic Konsens Bam vun bakteriell Arten vun der mënschlecher System digestive zu H.pylori VerfÜgung dinn, déi rezent Acquisitioun vun cagA VerfÜgung weist; b), de EPIYA Beräicher datt an der Gentherapie VerfÜgung cagA präsent sinn an der Evolutioun vun der EPIYA-D Domainen an der asiatësch lineages. Tree (e) gebaut gouf wéi an Method beschriwwen, numerals weg posterior Wahrscheinlechkeeten, Bam (b) den an Dorënner 1. VerfÜgung Zousätzlech, potentiell positiv Effete vun cagA VerfÜgung bei der Bevëlkerung Niveau via Eliminatioun vun den eelere Leit ass ugeholl [13] (dëser Erklärung op der Basis vun enger inklusiver fitness Nordeuropa [70]). Dësen Avis Fong cagA VerfÜgung als Gentherapie datt Ausriichtung veruerteelt an al Persounen verbessert, awer ass et net kloer, ob Ausriichtung veruerteelt an enger Ënnergrupp vun der Bevëlkerung huet schons fir ausgewielt goufen. Iwwerdeems H.pylori VerfÜgung schiddene engem pathogen considéréiert gouf, ass et Beweiser vu sengem positiven Virdeeler fir Gesondheet vum Mënsch waarden. Zum Beispill, huet VerfÜgung H.pylori eng positiv Roll esophageal Kriibs zu bedengt, déi Seier reflux reduzéieren [71, 72], awer an der Vergaangenheet dës onwahrscheinlech ass ze vill verännert Virdeel fir d'mënschlech Bevëlkerung gëtt hunn entscheet, datt iwwer 90 % vun de Patienten sinn iwwer 55 [73], während virun der 20 Jorhonnert déi duerchschnëttlech Liewenserwaardung vun de Mënscherechter Populatiounsschichte war manner wéi Q40: de stäerkste ëmgedréit, et gesäit Korrelatioun tëscht esophageal Kriibs Optriede an Wonn mat H.pylori VerfÜgung an ass East Asien, fir d'héich interaktiv (ëstlech) Form vun cagA VerfÜgung zougeschriwwen, deen pan- an corpus- predominant gastritis bewierkt a verklengert Seier Produktioun [13]. Et ass och en ëmgedréit, et gesäit Relatioun tëscht H.pylori VerfÜgung an Asthma an evitéieren [74-76], Obesitéit [77] an Keefer d`Toilette [78]. Asthma an Obesitéit si modern Krankheeten, sinn sou onwahrscheinlech eng Roll an der vergläicht Dynamik vun de Bakterien gespillt ze hunn. VerfÜgung Ulcers sinn eng modern Krankheet [79], während gastric Kriibs huet zënter antik Zäiten opgeholl gouf. Mä, ass et déi meescht verwandelt zu 55 Joer ale ass an iwwer, bedeit dat, datt historesch ass et onwahrscheinlech eng staark selektiv Drock ze hunn Nofolleg, virausgesat, dass, ier déi 20 Jorhonnert déi duerchschnëttlech Liewenserwaardung war däitlech méi niddreg. Dës Iwwerleeungen Féierung fir d'Konklusioun, datt d'cagA VerfÜgung Gentherapie ass entweder insufficiently Liewer an d'mënschlech Provider, datt d'cagA FAQ engem virdeelhaft Komponent fir de Provider huet, oder déi horizontal Transmissioun ass eng wichteg Neierung vun H.pylori VerfÜgung an der jéngster Vergaangenheet. Et gëtt ëmmer méi evident, datt an den Entwécklungslänner, horizontal Transmissioun vun H.pylori VerfÜgung wéinst schlecht sanitär Bedingungen existeiert [80, 81].

• Gastric lipoma presentéieren wéi e risege Wonner Mass an eng oligosymptomatic Patient: e Fall Rapport
• Connexioun tubing dauernd kleng bowel dogéint an colonic Erosioun wéi eng rar Komplikatiounen no laparoscopic gastric Banding: e Fall Rapport