Dans la première étude utilisant une technique appelée randomisation mendélienne pour étudier le rôle causal joué par les bactéries dans le développement du cancer de l'intestin, Dr Kaitlin Wade, de l'Université de Bristol (Royaume-Uni), a déclaré aujourd'hui (lundi) à la Conférence sur le cancer du NCRI 2019 :"Nous avons trouvé des preuves que la présence d'un type de bactérie non classé d'un groupe bactérien appelé Bacteroidales augmentait le risque de cancer de l'intestin de 2 à 15 %.
"Cela signifie que, en moyenne, les personnes atteintes de ce type de bactéries dans leur intestin peuvent avoir un risque légèrement plus élevé de cancer de l'intestin par rapport à celles qui n'en ont pas. Nous avons pu utiliser la randomisation mendélienne pour comprendre le rôle causal que ces bactéries peuvent avoir sur la maladie. Nos résultats corroborent des études antérieures qui ont montré que les bactéries Bacteroidales sont plus susceptibles d'être présentes, et en plus grande quantité, chez les personnes atteintes d'un cancer de l'intestin par rapport à celles qui n'en ont pas."
Le microbiome est une communauté de micro-organismes, bactéries dans ce cas, qui se produisent naturellement dans le corps. Il existe de plus en plus de preuves que la composition du microbiome joue un rôle dans la santé humaine et la susceptibilité du corps aux maladies.
Le microbiome intestinal humain, qui contient environ trois billions de bactéries, facilite la digestion et offre une protection contre les infections. Il est déterminé par la constitution génétique individuelle d'une personne et son environnement, est donc unique à chaque personne. Il reste également relativement stable tout au long de la vie d'une personne, sauf s'il est affecté par les antibiotiques, une maladie ou un changement de régime, entre autres.
Dr Wade, qui est un chercheur en début de carrière, mentionné:
J'étais intéressé de voir si la variation du microbiome intestinal humain, comme le nombre de bactéries ou simplement le nombre de différents types de bactéries, peut avoir un impact sur le cancer de l'intestin. De nombreuses études chez la souris et l'homme ont montré une association entre le microbiome intestinal et le cancer de l'intestin, mais très peu ont fourni des preuves convaincantes de la causalité.
En d'autres termes, il est vraiment difficile de discerner si les composants du microbiome intestinal peuvent causer le cancer de l'intestin, si la maladie elle-même entraîne une variation dans le microbiome intestinal ou si l'association est due à d'autres facteurs qui provoquent des variations dans les deux.
La randomisation mendélienne utilise une analyse statistique complexe des données de grandes populations pour fournir des preuves de cause à effet, plutôt que simplement l'existence d'une association.
« Avec la randomisation mendélienne, nous utilisons le naturel des gens, variations génétiques héritées au hasard, qui modifient les niveaux de bactéries dans le microbiome intestinal d'une manière qui imite un essai randomisé, pour voir si les personnes avec une constitution génétique différente, et donc des profils de microbiome intestinal différents, avoir un risque différent de cancer colorectal, " a expliqué le Dr Wade.
"De cette façon, nous n'avons pas besoin de modifier directement le microbiome intestinal de qui que ce soit en donnant des antibiotiques ou des probiotiques dans le cadre d'un essai randomisé ou de perdre du temps à attendre de voir si les personnes au sein de la population contractent un cancer colorectal. Nous avons juste besoin d'études qui ont déjà mesuré cette information."
Les chercheurs ont utilisé les données de 3, 890 personnes participant au projet Flemish Gut Flora, l'étude German Food Chain Plus et l'étude PopGen, et 120, 328 personnes au sein du Consortium international de génétique et d'épidémiologie du cancer colorectal.
Ces études ont recherché de petites variations dans les génomes des participants qui surviennent plus fréquemment chez les personnes atteintes d'une maladie ou d'une caractéristique particulière que chez les personnes sans cette maladie ou cette caractéristique - connues sous le nom d'études d'association pangénomique (GWAS).
Ils ont découvert que la variation génétique de la population dans certaines parties du génome était liée à la présence ou à des quantités variables de 13 types de bactéries intestinales, et que les personnes atteintes d'un type de bactérie non classé du groupe Bacteroidales avaient un risque plus élevé de cancer de l'intestin par rapport aux personnes qui n'avaient pas ces bactéries.
Le Dr Wade a déclaré que ses conclusions devaient être reproduites par d'autres études utilisant différents ensembles de données et de méthodes avant que les implications pour la santé humaine puissent être pleinement comprises.
"Nous devons classer l'espèce ou la souche exacte de bactéries dans le groupe Bacteroidales, et nous devons faire plus de travail pour comprendre comment et pourquoi la variation génétique humaine peut altérer le microbiome intestinal. Même si ces résultats montrent que ces bactéries peuvent causer le cancer de l'intestin, nous ne savons pas si essayer de les modifier dans un effort pour réduire le risque de cancer de l'intestin pourrait avoir d'autres, effets imprévus sur d'autres aspects de la santé.
Cependant, Je crois que nous sommes à la pointe de la compréhension et de l'appréciation de la complexité de ces relations - non seulement celles entre le microbiome intestinal humain et la maladie, mais aussi entre la variation génétique humaine et le microbiome intestinal lui-même - ce qui est nécessaire pour utiliser correctement ces méthodes pour évaluer causalité, " a-t-elle conclu.
Professeur Ian Tomlinson, nouveau directeur du Cancer Research UK Edinburgh Centre, Université d'Édimbourg, ROYAUME-UNI, est membre du comité scientifique de la conférence du CNRI et n'a pas participé à l'étude.
Il a déclaré:"Les méthodes de randomisation mendéliennes sont de plus en plus utilisées pour fournir des indications sur les facteurs de risque causaux en analysant les associations génétiques avec une maladie et avec des facteurs de risque. C'est l'une des premières études à utiliser les méthodes pour fournir des informations sur les raisons de les liens postulés et plausibles - mais en grande partie non prouvés - entre le microbiome et le cancer de l'intestin.
"La stabilité du microbiome intestinal est en cause et il existe des relations complexes entre les types et le nombre de bactéries présentes, et il est donc trop tôt pour attribuer une causalité aux résultats rapportés. Néanmoins, des études similaires à plus grande échelle ont le potentiel d'améliorer considérablement notre compréhension de la façon dont le cancer de l'intestin se développe."