Haasteet löytää vastaavan geenin harvinainen, autosomaalinen dominantti mahasyövän alttius syndrome

haasteet löytää vastaavan geenin harvinainen, autosomaalinen dominantti mahasyövän alttius oireyhtymä
Mahalaukun adenokarsinooma ja proksimaalinen polypoosin mahan (GAPPS) on hiljattain on kuvattu, harvinainen autosomaalinen dominantti oireyhtymä, jolle on ominaista fundic rauhasen polypoosin satunnaiseen hyperplastic ja adenomatoottisten polyypit. Me diagnosoitu GAPPS suuri Australian (perhe 1) ja kaksi pienempää Pohjois-Amerikan perheitä (Family 2 ja 3). Mutaatiot APC
, MUTYH
, CDH1
, Smad4
, BMPR1A
, STK11
ja PTEN
jätettiin kaikkiaan perheet sekvenssianalyysillä eksonien ja reunustavat alueet, sekä määrityksiä poistettaviksi tai päällekkäistä eksonien. Me kartoittivat GAPPS geenin perhe 1 kytkemällä analyysi (LOD pisteet 4.21) on 20MB alueella, joka sisältää noin 60 geenejä. Lyhyt tandem repeat genotyypitys osoitti, että kyseinen jäsenet Family 2 osuus haplotyypin tällä 20Mb alueella, mutta analyysi Affymetrix SNP 6,0 Kolmessa vaikuttaa jäsentä Family 2 osoitti, että ne jakavat myös useita muita alueita genomin. Kuitenkin sekä perhe 2 ja 3 ovat liian pieniä lopullista kytkentäanalyysia.
Olemme tehneet täyden exome sekvensointi kolmen vaikuttaa yksilöiden Family 1 (ja kohdennettu sekvensointi linkitetyn alueen toiselle henkilölle), ja kolmen asianosaisille Family 2. Emme löytäneet harvinaisia ​​koodausta tai silmukointikohta variantteja linkitetyn alueella, joka oli yhteinen kaikille asianosaisille of Family 1; eikä samalta alueelta molemmissa vaikuttaa jäseniä Family 2. Kaikki koodaus eksonit ja miR geenien liittyy alueella on sekvensoitu vähintään 30X jokaisessa pohjan tai Sangerin sekvensoinnilla, lukuun ottamatta seitsemää eksonit joka Sangerin sekvensointia on vielä valmistuu. Tulemme myös käyttämään Sangerin sekvensoinnin parantaa kattavuutta eksonien linkitetyn alueen Family 2.
Kuitenkin nykyinen hypoteesi on, että ei-koodaavan mutaatioita liittyy alueella vastaavat GAPPS oireyhtymä sekä Perheet 1 ja 2 ja niin koko genomin analyysi kahden asianosaisille Family 1 on suoritettu ja analysointi on käynnissä.

• CHEK 2 geenimutaatioita ja mahalaukun syövän riski
• Geneettinen seulonta Familial mahasyövän