Die Herausforderungen, die das Gen verantwortlich für eine seltene, autosomal-dominant Magenkrebs Anfälligkeit finden syndrome

die Herausforderungen des Gens verantwortlich für eine seltene, autosomal-dominant Magenkrebsanfälligkeit Syndrom
Adenokarzinom des Magens und proximaler Polyposis des Magens (gapps) zu finden, ist ein neu beschrieben, seltene autosomal-dominant-Syndrom, von Fundusdrüsen Polyposis mit gelegentlichen hyperplastischen und adenomatösen Polypen gekennzeichnet. Wir diagnostizierten gapps in einer großen australischen (Familien-1) und zwei kleinere nordamerikanischen Familien (Family 2 und 3). Mutationen im APC
, MUTYH
, CDH1
, SMAD4
, BMPR1A
, STK11
und PTEN
in allen Familien durch Sequenzanalyse von Exons und der flankierenden Regionen ausgeschlossen wurden, sowie Assays zur Deletion oder Duplikation der Exons. Wir kartiert die gapps Gen in Familie 1 durch Kopplungsanalyse zu 20MB-Region (LOD 4.21 Score), die etwa 60 Gene enthält. Short Tandem-Repeat-Genotypisierung zeigte, dass die betroffenen Mitglieder der Familie 2 teilen sich ein Haplotyp in diesem 20Mb Region, aber die Analyse von Affymetrix SNP 6.0 Daten aus drei betroffenen Mitglieder der Familie 2 gezeigt, dass sie auch einige andere Bereiche des Genoms geteilt. beide Familie 2 und 3 zu klein sind, jedoch für die endgültige Kopplungsanalyse.
Wir haben 1 in Familie für drei betroffenen Personen voll Exoms Sequenzierung durchgeführt (und Sequenzierung des verknüpften Region in eine andere Person gezielt) und von drei betroffenen Mitglieder der 2. Familie fanden wir keine seltene Codierung oder Spleißstelle Varianten in der verknüpften Region, die 1 von allen betroffenen Mitgliedern der Familie geteilt wurden; noch ein aus der gleichen Region in beiden betroffenen Mitgliedern von Familien 2. Alle kodierenden Exons und miR-Gene in der verknüpften Region wurden mindestens 30X an jeder Base sequenziert oder durch Sanger-Sequenzierung, mit Ausnahme von sieben Exons, für die Sanger-Sequenzierung wird noch fertig sein. Wir werden auch Sanger-Sequenzierung verwenden, um die Abdeckung von Exons in der verknüpften Region in Familie 2.
jedoch unsere aktuellen Hypothese zu verbessern, ist, dass nicht-kodierenden Mutationen in der verknüpften Region sind verantwortlich für die gapps Syndrom in beiden Familien 1 und 2 und so ganze Genom-Sequenzanalyse für zwei betroffenen Mitglieder in Familie 1 wurde durchgeführt und die Analyse ist im Gange.

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