Identificación de las firmas proteoma suero de cáncer gástrico localmente avanzado y metastásico: un piloto de identificación de firmas study

proteoma séricos de cáncer gástrico localmente avanzado y metastásico: un estudio piloto
Resumen Antecedentes
Francia El cáncer gástrico es una de las más común y mortal cáncer en todo el mundo. El desarrollo inicial y asintomática más síntomas inespecíficos como resultado el diagnóstico en la etapa avanzada con mal pronóstico. Sin embargo, clínicamente biomarcadores útiles están disponibles para este tipo de cáncer, y la endoscopia gastrointestinal invasivo sigue siendo la única opción fiable en el momento. Por lo tanto, hay una necesidad para el descubrimiento de la herramienta de diagnóstico y /o pronóstico no invasiva clínicamente útil como una alternativa (o complemento) para herramientas de diagnóstico actuales. Aquí el objetivo fue la búsqueda de proteínas de suero característicos para el cáncer gástrico invasivo local y
Métodos
muestras de sangre pre-tratamiento se recogieron de pacientes con adenocarcinoma gástrico diagnosticado en las diferentes etapas de la enfermedad:. 35 pacientes con cáncer localmente avanzado y 18 pacientes con cáncer metastásico; 50 donantes sanos también se incluyeron como un grupo de control. La fracción de bajo peso molecular del proteoma de suero (es decir, peptidome endógena) fue perfilado por la espectrometría de masas MALDI-TOF, y se identificaron los componentes integrales del proteoma y cuantificar por el acercamiento de la escopeta LC-MS /MS.
Resultados
firmas peptidome multicomponentes se revelaron que permitió una buena discriminación entre controles sanos y pacientes de cáncer, así como entre los pacientes con cáncer localmente avanzado y metastásico. Además, un enfoque de LC-MS /MS reveló 49 proteínas de suero con diferentes abundancias entre donantes sanos y pacientes de cáncer (predominantemente proteínas asociadas con la inflamación y la respuesta de fase aguda). Además, se identificaron 19 proteínas de suero con diferentes abundancias entre los pacientes con cáncer localmente avanzado y metastásico (incluyendo proteínas asociadas con citoquinas de respuesta /quimioquinas y el metabolismo de los ácidos nucleicos). Sin embargo, ni la proteómica de perfiles peptidome ni escopeta enfoque permitió la detección de los componentes del suero que discriminan entre los dos subgrupos de pacientes con enfermedad local que, o bien desarrollados o no desarrollaron metástasis durante el seguimiento.
Conclusiones
Las diferencias moleculares entre localmente avanzado y metastásico cáncer gástrico, así como las diferencias más obvias entre individuos sanos y pacientes de cáncer, han marcado la reflexión en el nivel de proteoma suero. Sin embargo, no tenemos pruebas de que las características del proteoma en suero antes del tratamiento podría predecir un riesgo de diseminación del cáncer en los pacientes tratados debido a la enfermedad local. Sin embargo, presentan datos confirman el potencial aplicabilidad de un biomarcador basado en firmas proteoma sérica en el diagnóstico de cáncer gástrico.
Palabras clave
El diagnóstico precoz del cáncer de estómago Neoplasias Proteómica Biológica marcadores Antecedentes
El cáncer gástrico es el cuarto cáncer más común y la segunda causa de muerte por cáncer en todo el mundo. Este tipo de cáncer afecta en especial las poblaciones de Asia oriental, Europa del Este, y partes de América Central y del Sur, y la tasa de morbilidad es dos veces mayor en los hombres que en las mujeres [1]. La neoplasia se asocia con síntomas inespecíficos o de desarrollo, incluso asintomática en sus primeras etapas, que a menudo se traduce en el diagnóstico en etapas avanzadas. Etapa del cáncer gástrico se correlaciona fuertemente con mal pronóstico. De acuerdo con el informe National Cancer Data Base, la tasa de supervivencia a los 5 años para el estadio IA fue del 78% y se redujo sustancialmente en cada etapa a aproximadamente el 7% de los pacientes diagnosticados con la enfermedad en estadio IIIB o IV [2]. Por lo tanto, el diagnóstico precoz del cáncer gástrico podría aumentar radicalmente la eficacia del tratamiento y mejorar el pronóstico de esta enfermedad mortal. En la actualidad la herramienta de diagnóstico más eficaz para la detección de cáncer gástrico sigue siendo una endoscopia gastrointestinal, sin embargo, esta técnica invasiva no es adecuado para el cribado a gran escala. Por desgracia, no hay biomarcadores alternativas no invasivas disponibles, debido a que los marcadores tumorales gastrointestinales comúnmente utilizados como CEA, CA 19-9 o 72-4 CA son insuficientes para el diagnóstico precoz de este cáncer debido a su baja sensibilidad y especificidad (20-30 %) [3-5]. La mayoría de los casos de cáncer gástrico (por encima del 90%) se clasifican como adenocarcinomas. Más recientemente cuatro subtipos moleculares de adenocarcinoma gástrico fueron distinguidos basan en el perfil genómico entregados gracias al proyecto Atlas del Genoma del Cáncer [6]. Sin embargo, el conocimiento sobre la heterogeneidad molecular y la biología de este tipo de cáncer, incluyendo su desarrollo y los mecanismos de progresión, sigue siendo bastante limitada todavía. Por lo tanto, una necesidad urgente para la identificación de biomarcadores clínicamente relevantes se refiere no sólo el diagnóstico precoz, sino también el pronóstico y la predicción del resultado del tratamiento.
Proteómica clínica es un enfoque importante para el descubrimiento de biomarcadores de cáncer gástrico [7]. En general se acepta que proteoma sangre es una fuente prometedora de nuevos biomarcadores de este cáncer, incluyendo marcadores particularmente valiosos para la detección temprana de la enfermedad y el seguimiento de la respuesta al tratamiento [8]. Masa de perfiles basados ​​en espectrometría de la fracción de bajo peso molecular de proteoma suero, denominado peptidome endógeno, reveló firmas multi-péptido con aplicabilidad potencial en la clasificación y diagnóstico de diferentes tipos de cáncer [9-13]. Unos trabajos han sido publicados que exploró MALDI /perfiles basados ​​en SELDI de petidome suero /plasma para el diagnóstico de cáncer gástrico, que propuso la firma de péptidos que permitieron discriminar los donantes sanos y pacientes con cáncer gástrico, o firmas asociadas a un curso de una enfermedad [ ,,,0],14-22]. Varios componentes de tales firmas se identificaron más como fragmentos de KNG1 [18], y APOC1 APOA2 [19], SAA [20], y TBB5 TYB4 [22] o FIBA ​​[23, 24]. Más recientemente, un panel de biomarcadores compuestas de proteínas de suero pre-seleccionado basado en el modelo de ratón preclínico (afamina, clusterina, VDBP y haptoglobina) ha sido validado para discriminar entre pacientes con cáncer gástrico y los pacientes con enfermedades gástricas benignas [25]. Sin embargo, ninguna de las firmas propuestas proteoma séricos de cáncer gástrico ha sido ampliamente aceptado y aplicado en la práctica clínica todavía.
Aquí el objetivo fue caracterizar el proteoma características de suero antes del tratamiento asociado con el riesgo de metástasis de cáncer gástrico. Se realizaron dos tipos de análisis proteómicos: (1) la fracción de bajo peso molecular de proteoma suero se perfila por la espectrometría de masas MALDI-TOF, (2) se identificaron y cuantificaron mediante LC-MS /MS después de la digestión enteros los componentes proteoma con tripsina (un enfoque de "proteómica escopeta"). Grupos de pacientes no tratados previamente con cáncer gástrico localmente avanzado y enfermedad metastásica se inscribieron para este estudio (un grupo de referencia de individuos sanos se analizó como referencia); tales análisis proteómico completa se realizó en un grupo de pacientes caucásicos con cáncer gástrico por primera vez. la firma de suero proteoma que diferenciaba entre los pacientes con cáncer localmente avanzado y metastásico del cáncer fue detectado en este estudio piloto, sin embargo, características específicas para los pacientes con enfermedad localmente avanzada en el momento del diagnóstico que no se observaron metástasis que pudieran elaborarse en este nivel.
Métodos
Características de los grupos de pacientes
Cincuenta y tres pacientes con adenocarcinoma gástrico confirmado por biopsia no tratados previamente fueron calificados en este estudio: 35 pacientes con cáncer localmente avanzado, incluyendo 16 pacientes con metástasis desarrolladas durante el tratamiento o seguimiento y 19 pacientes con no detectado metástasis durante el seguimiento, y 18 pacientes con cáncer metastásico. Este último grupo estaba formado por cuatro pacientes con diseminación a distancia de solo órgano y 14 pacientes con diseminación a múltiples órganos; órganos afectados incluyen el peritoneo (13 casos), hígado (ocho casos), pulmón (tres casos), otros lugares (ocho casos). En general, los criterios de inclusión involucrados: el estado del Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) la ejecución de 0-2, edad 20-85 años, nivel de creatinina en suero < 1,5 mg /dl, nivel de bilirrubina en suero < 2,0 mg /dl, un recuento de granulocitos > 1500 células /l y un recuento de plaquetas > 100.000 células /l, mientras que los criterios de exclusión implicados: malignidad anterior, cirugía previa, radioterapia o quimioterapia. La puesta en escena pretratamiento con base en el examen físico, esofagogastroscopia con biopsias, una TAC de abdomen y el pecho examen por rayos X o tomografía computarizada. Cincuenta donantes libres de la enfermedad por sexo y de la misma edad se incluyeron como un grupo de control. Todos los participantes en el estudio eran de raza blanca (~ 65% hombres) con la edad en el rango de 34-74 años. La Tabla 1 muestra una información más detallada acerca de los grupos analizados. El estudio fue aprobado por el Comité de Ética apropiada, y todas las personas que estaban tomando parte en este estudio dieron su consentimiento informado indicando su participation.Table consciente y voluntaria 1 Características de los grupos de donantes incluidos en el estudio
Grupo /parámetro


de control sanos
los pacientes con cáncer (todos los casos)
los pacientes con cáncer localmente avanzado
los pacientes con cáncer metastásico

no hay propagación

Spread
número (N)
50
53 página 19
16
18
Sexo (M /F)
30/20
37/16 12/7

13/3 12/6

Edad (años): perfil del 28-60 (mediana 50)
34 a 74 (mediana 59)
36-70 (mediana 59)
34-73 (mediana 58)
35-74 (mediana 60)
Localización del tumor
tercio superior
- 15 (28%) página 3 (16%) página 6 (37%) página 6 (33%)
tercio medio
- 31 (59%) página 13 (68%)
9 (57%) página 9 (50%)
tercio inferior
- 7 (13%) página 3 (16%)
1 (6%)
3 (17%) del tour histológico
G1-G2
- 16 (30%)
10 (53%) página 3 (19%) página 3 ( 17%)
G3
- 29 (55%) página 8 (42%) página 11 (69%)
10 (56%): perfil No se ha especificado
- página 8 (15%)
1 (5%) página 2 (12%) página 5 (27%)
tumor primario
cT1-T3 CD -
50 (94%) página 19 (100%)
16 (100%)
15 (83%)
cT4
- 3 (6%)
0 (0%)
0 (0%) página 3 (17%) de los ganglios linfáticos

cN0
- 20 (38%) página 13 (68%) página 5 (31%) página 2 (11%)
cN1-N3
- 33 (62%) página 6 (32%) página 11 (69%)
16 (89%)
Metástasis (inicial)
cM0
- 35 (66%) página 19 (100%): perfil 16 (100%)
0 (0%)
CM1
- 18 (34%)
0 (0%)
0 (0%)
18 (100%)
Grupo de pacientes con cáncer localmente avanzado en el momento del diagnóstico fueron dividen además en subgrupos, donde sea que no se propague (control) o cáncer de difusión /difusión consecutiva (metástasis a distancia) se detectó
se recogió Preparación de muestras de suero sanguíneo
Pre-tratamiento en un 5 ml tubo Vacutainer (Becton-Dickinson), se incubaron durante 30 min a temperatura ambiente para permitir la coagulación y después se centrifugó a 1000 g
durante 10 min para eliminar el coágulo. El suero se dividió en alícuotas y se almacenó a -70 ° C hasta su uso
de perfiles de la fracción de bajo peso molecular de proteoma suero
Antes de muestras de análisis se diluyeron 1:. 5 con tampón que contenía 20% de acetonitrilo (ACN) y bicarbonato 25 mM de amonio, y después se filtró por centrifugación a través de unidades Ultra Amicon (50 kDa de corte) para la eliminación de las proteínas de alto peso molecular abundantes, en particular la albúmina. Inmediatamente antes de las muestras de análisis se desalaron y se concentraron por la carga en microcolumnas ZipTip C18 (EMD Millipore), y después se eluyó con 1 l de solución de matriz (solución saturada de alfa-ciano-4-hidroxi-cinámico ácido en 30% ACN /H <sub>2O y 0,1% de TFA) directamente sobre la placa de 800 micras AnchorChip ™ (Bruker Daltonics). El análisis se realizó utilizando un espectrómetro de masas MALDI-ToF UltrafleXtreme (Bruker Daltonics); el analizador trabajó en el modo lineal, y los iones positivos se registran en el rango de masa entre 1000 y 12.000 Da. Las muestras fueron vistos por duplicado y para cada mancha se adquirieron dos espectros. La calibración de masa se realizó después de cada cuatro muestras usando proteína estándar de calibración I (Bruker Daltonics). La asignación al azar en bloques se utilizó en el registro de espectros para evitar un posible efecto lote. Después los datos sin procesar se exportó a archivos TXT y los componentes espectrales se preprocesa uso de la bioinformática algoritmos creados en nuestro grupo, que incluye la alineación, la detección y eliminación de los perfiles de valores atípicos mediante la prueba Q de Dixon (espectros individuales se retiraron de alrededor de 5% de las muestras), promedio de repeticiones técnicas, la eliminación de línea de base y la normalización de la corriente total de iones. El suavizado de espectros, búsqueda de pico, hurgar en la basura y análisis estadísticos se realizaron utilizando el software Spectrolyzer (versión 1.0.21.3590, MedicWave).
LC-MS /MS análisis de los componentes del proteoma de suero
Las muestras de suero se redujeron con ditiotreitol 5 mM durante 5 min a 95 ° C, después se alquila con 10 mM yodoacetamida durante 20 minutos en la oscuridad a temperatura ambiente, y después se digirió durante la noche a 37 ° C con tripsina (Promega). El análisis se realizó en Dionex UltiMate 3000 RSLC Sistema nanoLC conectado a espectrómetro de masas Q Exactive Orbitrap (Thermo Fisher Scientific); Cada muestra se analizó por separado. Los péptidos trípticos (2,5 g de péptidos) se separaron en columna de fase inversa Acclaim PepMap RSLC nanoViper C18 (75 m x 25 cm, 2 micras de granulación), utilizando el gradiente de acetonitrilo (4-60%, en 0,1% de ácido fórmico) a 30 ° C y una velocidad de flujo de 250 nl /min (para 230 min). El espectrómetro estaba operando en el modo MS /MS dependiente de los datos con las exploraciones de la encuesta adquiridos a una resolución de 70.000 a m /z 200 Da en el modo de MS y 17.500 a m /z 200 Da en el modo de MS2, respectivamente. Los espectros se registraron en el rango de exploración m /z 300 hasta 2000 en el modo de ion positivo. colisional fragmentación de iones de energía más alto de disociación (HCD) se realizó con energías de colisión normalizados establecidos a 25. Identificación de proteínas se realizó utilizando la base de datos Swiss-Prot humano con una tolerancia de precisión de 10 ppm para las masas de péptidos y 0,05 Da de masas de iones fragmento. Las abundancias de proteínas identificadas se estimaron usando el software MaxQuant 1.4.1.1.
Estadística y bioinformática
análisis para cada componente de la masa MALDI perfiles de la comparación entre los grupos de donantes se ha realizado mediante la prueba t de Student después de la transformación logarítmica de los datos. clasificadores de múltiples componentes fueron construidos y probados con el enfoque basado en SVM utilizando el software Spectrolyzer (versión 1.0.21.3590, MedicWave). Importancia de las diferencias en las abundancias de proteínas cuantificadas por LC-MS /MS se evaluó mediante la prueba de la t o la prueba de Mann-Whitney en función de la normalidad de los datos (tipo de distribución se estimó mediante la prueba de Shapiro-Wilk, la prueba Lilliefors y el F prueba de homogeneidad de las varianzas), y la prueba Nemenyi para las comparaciones por pares. En general, p = 0,05 fue seleccionado como un umbral de significación estadística a excepción de perfiles MALDI donde se aplicó la corrección de Bonferroni para múltiples pruebas. La Proteómica Ontología Knowledge Base empírica (EPO-KB), que anota los valores registrados m /z de péptidos /proteínas conocidas [26], fue empleado para asignar hipotética identificación de los componentes de los espectros (se dejó un 0,5% Límite de precisión en masa). Lista de los genes correspondientes a las proteínas identificadas fue anotado en los términos de GO utilizando gProfiler (http: //BIIT cs ut ee /gprofiler /...); el significado del término sobrerrepresentación se evaluó mediante la prueba de distribución hipergeométrica. Con el fin de visualizar las relaciones funcionales entre las proteínas identificadas genes correspondientes fueron anotados en el plugin de Cytoscape GeneMANIA de las redes de interacción vía (http:. //Páginas genemania org /plugins /.)
Resultados
misa. perfiles de la peptidome endógena en suero (la fracción de bajo peso molecular del proteoma suero) se caracterizaron por MALDI-TOF espectrometría de todo el grupo de 53 pacientes con cáncer gástrico y 50 donantes sanos. Este análisis permitió para evaluar el grado global de las diferencias y similitudes entre los subgrupos de individuos analizados. En general, 255 componentes espectrales (iones peptídicos) se distinguieron en el rango de masas analizados (Fig. 1a), y la abundancia de 101 componentes revelaron variación estadísticamente significativa entre los grupos comparados (después de la corrección de Bonferroni contra múltiples pruebas). Tabla 2 se presentan los números de componentes peptidome suero que diferenciaban a determinados grupos de donantes. Se observaron las grandes diferencias en la abundancia de los componentes del suero específicos entre los pacientes con cáncer y donantes sanos (alrededor del 39% de los componentes registrados deleitaba diferencias estadísticamente significativas). También se observaron grandes diferencias entre los pacientes con cáncer localmente avanzado (todos los casos) y en pacientes con cáncer metastásico (alrededor del 9% de los componentes registrados deleitaba diferencias estadísticamente significativas); esto es digno de mención que se observó un número similar de elementos diferenciadores cuando los pacientes con cáncer metastásico se compararon con los dos subgrupos con enfermedad local por separado (es decir, grupo en el que se detectó la diseminación a distancia del cáncer durante el seguimiento y el grupo sin evidencia de enfermedad). Coherentemente, clasificadores buen rendimiento podrían construirse sobre la base de características de peptidome suero que separaban a los grupos de comparación de donantes sanos y pacientes con cáncer localmente avanzado o metastásico (la medida AUC para clasificador basado en SVM fue superior al 90% en cada caso). En marcado contraste, no se detectaron diferencias estadísticamente significativas cuando se compararon dos subgrupos de pacientes con cáncer localmente avanzado (que la metástasis durante el seguimiento desarrollado o no desarrollados) (el ABC de clasificador basado en SVM fue inferior a 50%). Figura 1b presenta ejemplos de componentes de suero con peptidome significativamente diferentes abundancias entre los grupos comparados. Esto es digno de mención que entre petidome componentes que diferenciaban ambos controles sanos de pacientes con cáncer y pacientes con cáncer localmente avanzado de pacientes con enfermedad metastásica había varios componentes que supuestamente correspondían a fragmentos de fibrinopéptido A (FIBA). Estos componentes incluidos con el valor registrado m /z 1088.7, 5903.5 y 5916.6 Da significativamente downregulated en el suero de pacientes con cáncer, y los componentes 1469.9 y 1626.0 Da con abundancias marcadamente más elevados en el suero de los pacientes con enfermedad metastásica que en los pacientes con cáncer localmente avanzado (ver figura . 1b; la disposición 1: Tabla S1). Hemos llegado a la conclusión de que las diferencias moleculares entre cáncer gástrico localmente avanzado y metastásico (así como las diferencias entre los individuos sanos y pacientes con cáncer gástrico en general) tienen la reflexión en el nivel de peptidome suero. Sin embargo, las características de peptidome de suero pre-tratamiento se podrían aplicar poco probable para el pronóstico de la enfermedad se propagó durante /después del tratamiento. Higo. 1 Perfil de peptidome suero endógeno de los pacientes con cáncer gástrico. un espectro de masas medio en el intervalo de 1000-10.000 Da. b Ejemplos de componentes peptidome suero, que abundancias eran diferentes entre las muestras de controles sanos y diferentes grupos de pacientes con cáncer de estómago. Boxplots
muestran mínimo, el cuartil inferior, la mediana, el cuartil superior, valores máximos y los valores extremos; asteriscos
marcó diferencias significativas (p < 0,05 con la corrección de Bonferroni) guía Tabla 2 Los números de componentes peptidome suero con abundancias diferentes entre los grupos de comparación de individuos Barcelona Grupos /diferencias
vs. Control cáncer (todos los casos) guía empresas vs cáncer metastásico localmente avanzado
local /que no se propague vs cáncer metastásico
local /difusión vs cáncer metastásico
local /sin diseminación del cáncer vs /diseminación local
n
50 frente a 53
35 vs. 18 página 19 vs. 18 vs. 18
16 página 19 vs . 16
p < 0.05
182
88
74
75 página 11
FDR página 7%
14%
17%
17%
100%
p < 0,05 /Bonferroni
101
23 página 11
16
0
AUC (SVM)
0,94 0,91

0,92
0,97 0,48

se muestran los números de la diferenciación de los componentes que alcanzaron el umbral de significación estadística p = 0,05 (con la correspondiente estimación de FDR) o umbral reforzado con la corrección de Bonferroni, y el poder del clasificador SVM fabricadas con componentes de peptidome (caracterizada por el valor AUC)
en el segundo paso se seleccionaron muestras de 12 donantes sanos y diez pacientes de cada subgrupo cáncer para garantizar edad similar (medianas aproximadamente 56 años) y proporción de sexos (ca. 80% de los hombres) en los subgrupos comparados. Estas muestras se utilizaron para análisis adicionales basados ​​en el enfoque LC-MS /MS escopeta. En general, alrededor de 450 proteínas se identificaron en muestras de suero analizadas. Los niveles de 234 proteínas de suero se cuantificaron en muestras tomadas de cada uno de 42 individuos, incluyendo 129 proteínas únicas de suero no relacionadas con inmunoglobulinas (105 inmunoglobulinas y proteínas relacionadas con Ig, así como las proteínas no putativos, fueron excluidos de análisis adicionales); datos completos se presentan en el archivo adicional 1: Tabla S2. Había 49 proteínas de suero con abundancias diferentes entre los donantes sanos y pacientes con cáncer gástrico (valor de p < 0,05; valor estimado FDR = 13%): 41 proteínas se upregulated mientras que ocho proteínas se downregulated en la sangre de pacientes con cáncer (proteínas enumeradas en la tabla 3;. ejemplos en la figura 2). Esto es digno de mención que se observó un patrón similar de la regulación positiva o regulación a la baja de las proteínas de suero por cáncer en todo lo que hay subgrupos de pacientes con cáncer (a pesar de que el tamaño más pequeño de los grupos analizados podría reducir la significación estadística de las diferencias; véase la disposición 1: Tabla S3). Por otra parte, hubo 19 proteínas de suero con abundancias diferentes entre los pacientes con cáncer localmente avanzado y metastásico (valor de p < 0,05; valor estimado FDR = 34%): tres proteínas fueron regulados al alza, mientras que 16 proteínas fueron regulados a la baja en la sangre de los pacientes con enfermedad metastásica. Esto es digno de mención que la abundancia de la proteína C reactiva y la angiogenina generalmente upregulated en los cánceres de muestras a aumentar en metastásico muestras, mientras que la abundancia de la anhidrasa carbónica 1 generalmente downregulated en muestras de cáncer se redujo aún más en metastásico muestras (Tabla 3). Por otra parte, los patrones de diferencias entre las muestras de pacientes con cáncer metastásico y todos los pacientes con enfermedad local fueron retenidos cuando dos subgrupos más pequeños de pacientes con cáncer localmente avanzado fueron parejas en comparación con el cáncer metastásico (véase la disposición 1: Tabla S4). Por otro lado, la abundancia de una sola proteína (antitrombina-3) no mostró diferencias estadísticamente significativas cuando se compararon los dos subgrupos de pacientes con cáncer localmente avanzado (abundancia de esta proteína fue la más alta en el grupo de pacientes con enfermedad local que no se propagan durante Seguir). Llegamos a la conclusión de que la firma de múltiples proteínas podría ser identificado para la clasificación de las muestras de suero pre-tratamiento de pacientes con cáncer gástrico, que sufría de la enfermedad, ya sea localmente avanzado o metastásico. Sin embargo, las características del proteoma de suero no podían distinguir a los pacientes con enfermedad local que se extendieron durante el seguimiento después de que las proteínas del suero treatment.Table 3 Diferenciación
nombre de la proteína
proteína nombre completo
Gen
control /cáncer metastásico

Relación
valor local /p
Relación
valor de p

A1AG1
glicoproteína alfa-1-ácido 1 | ORM1
0,67
0,0008
1.00
0,5824
A1AG2
alfa- 1-glicoproteína ácida 2
ORM2
0,68
0,0006
1.00
0,7414
A1AT
alfa-1-antitripsina
SERPINA1
0.50
< 0,0001
1,03
0,6441
A1BG
alfa-1B-glicoproteína
A1BG
0,76
0,0072

1,04
0,5824
A2GL
ricos en leucina alfa-2-glicoproteína
LRG1
0,46
0,0016
0,80 0,4414

AACT
alfa-1-antiquimotripsina
SERPINA3
0,54
0,0007
0,97
0.9124
ADIPO
adiponectina
ADIPOQ
0,41
0,0092
1.60
0,3442
AFAM
afamina
AFM
1.30
0,0355

1,06
0,5824
ANGI
angiogenina
ANG
0,30
0,0465
0,24
0,0294
APOA1 La apolipoproteína AI

APOA1
0,47
< 0,0001
1,31
0,0235
APOC1
apolipoproteína CI
APOC1
0,25
< 0,0001
1,52
0,1183
APOC3
apolipoproteína C-III
APOC3
1,82

0,0108
1.20
0,5824
APOE
apolipoproteína E APOE

0,62
0,0040
1.01
0,6441
APOF
apolipoproteína C
APOF
0,64
0,0085
0,80
0,5235
APOM
apolipoproteína M
APOM
0,92
0,4275
1,51
0,0263
C1S
Complemento C1s subcomponente
C1S
0,70
0,0016 1,22

0,0748
CAH1
La anhidrasa carbónica 1 | CA1
2,96
0,0173
2,41
0,0143
CBG globulina de unión a corticosteroides

SERPINA6
0,53
0,0117
1,08
0,7749
CD14 de monocitos
antígeno CD14 CD14

0,56
0,0033
1,21
0,1658
CERU
ceruloplasmina
CP
0,67
0,0013
1,05
0,6129
CFAB
factores de Complemento B Opiniones CFB
0,61
0,0006
1.11
0,6441
CO2
Complemento C2
C2
0,64
0,0475
1,57
0,0679
CO4A
Complemento C4-A
C4A
0,87 0,0435

0,94
0,7749
CO4B
Complemento C4-B Opiniones C4B
0,73
0,0127
0.99
0,5526
CO5
C5 del complemento C5

0,77
0,0085
0,91
0,8776
CO6
el componente del complemento C6 C6

0,64
0,0013
0,97
0,8431
CO8G
el componente del complemento C8 gamma
C8G
0,66
0,0137

1.12
0,4679
CO9
el componente del complemento C9 C9

0,42
< 0,0001
0,93
0.9124
CRP
C reactiva CRP
Hotel < 0,01
0,0389
0,15
0,0414
CXCL7
proteína básica de plaquetas
PPBP
0,83
0,1516
1,53
0,0030
FETUA
alfa-2-HS-glicoproteína
AHSG
0.90
0,3095
1,34
0,0068
FHR1
factores de Complemento prot relacionados H-. 1 | CFHR1
0,66
0,0725
1.30
0,0366
GPX3
glutatión peroxidasa 3
GPX3
0,92
0,6065</sub>