MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och magcancer mottaglighet: en metaanalys

MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och magcancer mottaglighet: en metaanalys Bild Sammanfattning
Bakgrund
bevis har visat att single nucleotide polymorphism ligger i pre-miRNA eller mogna mikroRNA kan modifiera olika biologiska processer och påverka behandling av cancer. Publicerade resultat om sambandet mellan MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och human magcancer mottaglighet är ofullständiga. Syftet med denna studie var att få en mer exakt effekt av sambandet mellan Mir-146a rs2910164 polymorfism och gastric risk genom metaanalys.
Metoder
Kvalificerade genetiska associationsstudier genomsöktes från PubMed, Web of Knowledge och kinesiska biomedicin databas på människa. Kvantitativa data syntes genomfördes för sammanslutningar av MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism med mottaglighet för magsäckscancer.
Resultat
Nio berättigade studier som inkluderade totalt 3,885 gastric cancerpatienter och 5.396 kontroller som anges i denna meta-analys. Den totala eller indikeras en potentiell association mellan rs2910164 polymorfism och GC men effekten var inte statistiskt signifikant (GG mot CG /CC: OR = 1,076, 95% CI 0,925-1,251, P = 0,342). När stratifiering för befolkningen, resultatet visade att MIR-146a rs2910164 GG genotyp associerades med ökad magsäckscancer risk bland kinesiska i recessiv modell (GG mot CG /CC: OR = 1,171, 95% CI 1,050-1,306, P = 0,005) . Dessutom var ingen signifikant skillnad i kön, rökning, plats, metastas av lymfkörteln och Lauren klassificering.
Slutsatser
nuvarande meta-analys tyder på en ökad risk mellan MIR-146a rs2910164 GG genotyp och magcancer känslighet i kinesiska baserat på publicerade litteratur.
Nyckelord
mikroRNA-146a Mage tumörer Polymorfism Metaanalys analys~~POS=HEADCOMP bakgrund
Magcancer (GC) är fortfarande en av de vanligaste orsakerna till cancerrelaterad död i världen trots en totalt sett minskad incidens under de senaste 10 åren [1], [2]. Det är allmänt accepterat att enskilda genetisk mottaglighet har en viktig roll i patogenesen av tumör inklusive GC.
MicroRNAs (miRNA /MIR) är endogena 18-24 nukleotid-icke-kodande RNA som kan reglera genexpression och sekventiellt reglerar olika biologiska processer [3 ], [4]. Funktionell karakterisering av vissa mikroRNA i cancer initiering och progression anger att de kan spela en viktigare roll i patogenesen av cancer hos människa [5], [6]. Förhållandet mellan miRNA och cancer har studerats ingående sedan 2002, har den första demonstrationen av en länk mellan miRNA gener och cancer [7].
Studier visat att polymorfism i pre-miRNA eller mogna mikroRNA kan modifiera olika biologiska processer genom påverka expression och /eller mål-urval av mikroRNA [8], [9]. Under det senaste årtiondet, många studier identifierade genetiska varianter i prekursor eller mogen miRNA sekvens av MIR-146a rs2910164 (G > C), som har rapporterats vara förknippade med bröstcancer och hepatocellulär cancer [10], [11].
ett antal studier publicerades för att beskriva sambandet mellan mIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och cancerrisk under de senaste åren. En metaanalys rapporterats av Lian et al. [10] slutsatsen att CC homozygot av rs2910164 kan bidra till bröstcancer mottaglighet bland européer. En annan metaanalys visade att det inte finns någon signifikant korrelation mellan har-MIR-146a rs2910164 polymorfism och bröstcancerrisk [12]. En enorm metaanalys 2013 misslyckades med att finna någon signifikant samband mellan rs2910164 polymorfism och risken för bröstcancer [13]. Baserat på systematisk genomgång, Chen et al. [14] rapporterade att kvaliteten på bevis var låg för rs2910164 SNP genetisk association med lungcancer. Flera metaanalyser poolade sambandet mellan rs2910164 polymorfism och cancerrisk i allmänhet [15], [16]. Några meta-analys rapporterade rs2910164 polymorfism och mag-tarmcancer mottaglighet [17] - [19].
Dock publicerade data om sambandet mellan MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och human magcancer mottaglighet är inkonsekvent och föga övertygande. Därför genomförde vi den nuvarande meta-analys för att kvantitativt uppskatta sammanslutning av MIR-146a G /C SNP med gastric cancerrisker.
Metoder
litteratur sökstrategi
Elektroniska databaser inklusive PubMed, Web of Knowledge och kinesiska biomedicin Database (CBM) genomsöktes efter relevanta studier på människa ämne fram till juli 2014. följande sökord användes: "gastric" eller "mage", "tumör" eller "cancer" eller "cancer" eller "tumör" eLLER " adenokarcinom "och" mIR-146a eller "miRNA-146a" ELLER "microRNA-146a" eller "har-mIR-146a". För att ytterligare identifiera potentiellt relevanta studier har referenslistor av artiklar som identifierats i den första sökningen också skannas manuellt. Vi kontaktade direkt författare för relaterade data som var tillgängliga i de ursprungliga publikationerna
integration och uteslutningskriterier
Studier ansågs berättigade om de uppfyller samtliga följande kriterier:. (1) undersöka sambandet mellan MIR-146a polymorfism och mänsklig GC risk, (2) design fall-kontrollstudier, (3) identifiering av magcancer fall bekräftades histologiskt eller patologiskt. Studier uteslöts baserat på något av följande skäl: (1) inte tillräckliga uppgifter som rapporterats, (2) artiklar av brev, recensioner, fallrapporter, bokkapitel, ledare eller expertutlåtande. Om serie studier av samma population från samma forskargrupp publicerades, var bara den största serien vald.
Datautvinning
sista uppsättningen artiklar bedömdes oberoende av två granskare (Zhong Xu och Lingling Zhang) enligt inklusions- kriterierna som anges ovan. Meningsskiljaktigheter löstes genom diskussion. Följande information hämtas från varje rapport. Första författare, utgivningsår, studiepopulationen, etnicitet, antal GC fall och kontroller, frekvensen av genotyper, och genotypning metod
Statistisk analys
Hardy-Weinberg jämvikt (HWE) status undersöktes av Pearson godhet-of-fit χ 2 test i varje studie (P Hotel < 0,05 ansågs som betydande obalans i kontrollgruppen). Styrkan i sambandet mellan GC och Mir-146a rs2910164 polymorfism bedömdes genom att beräkna odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (CI). De sammanslagna yttersta randområdena erhölls från kombination av enskilda studier av homozygot jämförelse (GG mot CC), heterozygot jämförelse (CG vs. CC), dominant och recessiva modeller (CG /GG mot CC och GG mot CG /CC), allelen jämförelse (G mot C), respektive. Analysen av heterogenitet mellan studierna bestämdes med hjälp av Cochrane Q test och jag
2-test (P Hotel < 0,10 eller jag
2 > 50% anses indikera statist heterogenitet) [20]. När det inte fanns någon signifikant heterogenitet existerande bland studier var poolade yttersta randområdena uppskattning av varje studie beräknas av fasta effekter modell. Annars var det slumpmässiga effekter modell som används. Subgruppsanalyser stratifierades av studien karakteristiska om det fanns tillräckligt många rapporter. Känslighetsanalys genomfördes genom att ta bort en enda studie varje gång för att undersöka påverkan av enskilda uppgifter som på de poolade yttersta randområdena. Publication bias bedömdes genom användning av metoderna enligt Begg s tratt tomter och Egger test (P
< 0,05 ansågs vara representativa för statistiskt signifikant publikation bias) [21], [22]. Statistiska analyser utförs med hjälp av programvaran Stata12.0 (Stata Corpotion, College Station, Texas).
Resultat
Studier urval och egenskaperna hos de inkluderade studierna Review, en totalt 288 artiklar identifierades från PubMed, ISI och CBM databas. Flödesschemat sammanfattar granskningsprocessen litteraturen som visas i Figur 1. Totalt nio studier med 3,885 GC fall och 5.396 kontroller slutligen samman för denna metaanalys [23] - [31]. Egenskaperna hos dessa studier är listade i tabell 1. Bland dem, sju studier utförts i Asien (inklusive patienter från Kina, Japan och Korea), två studier i Europa (inklusive patienter från Grekland, Tyskland, Litauen och Lettland). Artikel av Okubo et al. [32] uteslöts på grund av överlappning med en annan studie [23]. Samtliga ingående artiklar var sjukhusbaserade fall-kontrollstudier. Fördelningen av genotyper i kontrollerna av alla nio studier var i överensstämmelse med HWE. Figur 1 Flödesschema studierektor inkludering och exkludering.
Tabell 1 Egenskaper hos studier som ingår i metaanalysen
första författare
År
Läge
genotypning metod
Nej av fallen
Nej kontroller
Cases
Controls
PHWEfor control

CC

CG

GG

CC

CG

GG

Okubo
2010
Japan
PCR-RFLP
552
697
236
243
73
254
322
121
0.2776
Zeng
2010
China
PCR-RFLP
304
304
89
153
62
119
132
53
0.1223
Hishida
2011
Japan
PCR-CTPP
583
1637
230
271
82
633
775
229
0.7381
Zhou F
2012
Kina
TaqMan MGB
1686
1895
286
822
578
393
951
551
0,6407
Zhou Y
2012
Kina
Locus specifika PCR
299
416
107
146
46
127
215
74
0.301
Ahn
2013
Korea
PCR-RFLP
461
447
159
231
71
164
221
62
0.3618
Dikeakos
2014
Greece
PCR-RFLP
163
480
105
45
13
307
149
24
0.2892
Kupcinskas
2014
Europe
Real Time-PCR
362
347
16
94
252
16
108
223
0.5311
Pu
2014
China
PCR-RFLP
197
513
65
96
36
143
274
96
0.0801
Kvantitativa data syntes
sammanfattning av denna meta-analys för sambandet mellan MIR-146a rs2910164 G /C polymorfism och känslighet för magcancer visades i tabell 2. Totalt fanns inget signifikant samband i genotyp fördelning mellan magcancer och kontroll genom att kombinera de nio studier. Den slumpmässiga effekter modell användes för att samla dessa resultat som statist heterogenitet observerades mellan studier (P
Q-testet < 0,1, jag
2 > 50%). Den sammanslagna eller uppskattningar av de metaanalyser var ofta större än 1,00, vilket tyder på en potentiell sammanslutning av rs2910164 polymorfism och GC även om denna effekt var inte statistiskt signifikant. För recessiv modell, som P
Q-testet < 0,1 av heterogenitet analys, även slumpmässiga effekter modell användes för analys. Som visas i figur 2, det fanns ingen statistiskt ökad risk för magcancer i recessiv modell när sammanställt nio studier (recessiv modell, GG mot CG /CC: OR = 1,076, 95% CI 0,925-1,251, P = 0,342). tabell 2 Meta-analys av mIR-146a rs2910164 polymorfism med magcancer av befolkningen
population
Jämförelse
Nej Studie
Test förenings
Test av heterogenitet
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
jag
2
asiatiska
GG vs CC
7
1,016 (0,780, 1,324) katalog 0,906
0.000
75,2%
CG vs. CC
0,998 (0,847, 1,176) katalog 0,982
0,014
62,2%
CG /GG mot CC
1.005 (0,830, 1,216) katalog 0,962
0,001
75,1%
GG mot CG /CC
1,025 (0,861, 1,221) katalog 0,779
0,036
55,6%
G vs. C
1,006 (0,877, 1,153) katalog 0,935
0.000
78,7%
europeiska
GG vs CC 2
1,331 (0,802, 2,210) katalog 0,269
0,512
0,0%
CG vs. CC
0,880 (0,619, 1,253) katalog 0,478
0,973
0,0%
CG /GG vs. CC
0,994 (0,716, 1,380) katalog 0,971
0,875
0,0%
GG mot CG /CC
1,326 (0,995, 1,767) katalog 0,054
0,512
0,0%
G mot C
1,146 (0,937, 1,401) katalog 0,184
0,608
0,0%
Totalt
GG vs CC
9
1,056 (0,836, 1,334) katalog 0,649
0,001
68,1%
CG vs. CC
0,984 (0,853, 1,136) katalog 0,830
0,037
51,3 %
CG /GG mot CC
1,005 (0,852, 1,184) katalog 0,956
0,002
66,9%
GG mot CG /CC
1,076 (0,925, 1,251)
0,342
0,052
48,0%
G mot C
1,028 (0,914, 1,155) katalog 0,648
0,000
72,5%
Figur 2 Metaanalys analys~~POS=HEADCOMP av mIR-146a rs2910164 polymorfism och magcancer mottaglighet för recessiv modell (GG mot CG + CC).
Som visas i tabell 3 och figur 3, när vi utförde subgruppsanalys efter plats, det sammanlagda resultatet visade att MIR-146a rs2910164 GG genotyp associerades med ökad risk magsäckscancer i Kina för recessiv modell (GG mot CG /CC: OR = 1,193, 95% CI 1,057-1,346, P = 0,004). Dessutom har interaktioner mellan MIR-146a polymorfism och kliniskt patologiska tecken även genomförts när användbara data som erhållits. Ingen signifikant samband mellan MIR-146a genetisk variant och gastric cancerrisk hittades i skiktad analys av kön, rökning, plats, metastas av lymfkörteln och Laurens klassificering (Tabell 4) .table 3 Meta-analys av MIR-146a rs2910164 polymorfism med magcancer på kinesiska
Jämförelse
Test förenings
Test av heterogenitet
OR (95% CI)
P

vid P
(Q-test)
jag
2
GG vs CC
1,113 (0,773, 1,604) katalog 0,564
0,011
73,1%
CG vs. CC
1,045 (0,783, 1,394) katalog 0,766
0,012
72,8%
CG /GG mot CC
1,065 (0,779 , 1,457) katalog 0,692
0,002
79,4%
GG mot CG /CC
1,193 (1,057, 1,346) katalog 0,004
0,201 35,1%
G vs. C
1,055 (0,868, 1,283) katalog 0.590
0,004
77,8%
Figur 3 Meta-analys av mIR-146a rs2910164 polymorfism och magcancer känslighet på kinesiska för recessiv modell ( GG mot CG + CC).
Tabell 4 Meta-analys av rs2910164 polymorfism med GC genom kliniskt patologiska tecken
Parametrar
Jämförelse
Nej Studie
Test förenings
Test av heterogenitet
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
jag
2
Kön
CC vs GG /CG 4
0,916 (0,691, 1,215) katalog 0,542
0,201
37,7%
(Man vs. Kvinna) Review CC /CG vs. GG 4
0,939 (0,767, 1,148) katalog 0,538
0,967
0,0%
Rökning (Nej vs. Ja) katalog CC vs CG /GG 2
0,843 (0,554, 1,282) katalog 0,425
0,315
0,9%
Site (Cardic kontra icke-Cardic) katalog CC vs CG /GG 4
0,844 (0,593, 1,201) katalog 0,346
0,382
0,0%
CC /CG vs. GG 4
0,897 (0,738, 1,090) katalog 0,274
0,549
0,0%
metastas av lymfkörtel (Negativ vs. Positiv) katalog CC vs. CG /GG 2
1,211 (0,842, 1,742) katalog 0,302
0,589
0,0%
Laurens klassificering (Intestinal vs. diffus) Review CC /CG vs GG
4
0,961 (0,807, 1,145) katalog 0,658
0,655
0,0%
känslighets~~POS=TRUNC analys~~POS=HEADCOMP och publikationsbias
Vi använder envägs känslighetsanalys för att utvärdera stabiliteten av resultatet i Kina [33]. I recessiv modell, känslighetsanalys av poolade eller med 95% CI ändrats från 1,193 (1,057, 1,346) till 0,995 (0,786, 1,260) när utelämna en studie av Zhou F [26] (Figur 4). Motsvarande poolade ELLER inte väsentligt ändras andra genetiska modeller. Figur 4 Inverkan av varje studie genom utelämnande av enskilda studier i Kina för recessiv modell.
Begg s tratt plot (Figur 5) och Egger test (figur 6) visade ingen potentiell publikationsbias (P
= 1,000 och 0,355 respektive). Tratt tomter visade en viss asymmetri, vilket troligen beror på det begränsade antal studier. Figur 5 Begg s tratt tomt med pseudo 95% konfidensintervall.
figur 6 Egger publikation partiskhet tomt.
Diskussion
MiR-146a har visat sig spela en viktig roll vid cellproliferation, differentiering, apoptos och tumorigenes [34] - [37]. Studie av Jazdzewski et al. [38] under 2008 har föreslagit att rs2910164, en gemensam polymorfism i pre-MIR-146a-sekvens, skulle kunna ändra mogna MIR-146a uttryck och spela en roll i tumörbildning. Under de senaste tre åren har ett antal metaanalyser och översyn poolade sambandet mellan rs2910164 G > C polymorfism och cancerrisk inklusive gastrointestinala tumörer i stort sett [15] - [19], [39] - [43]. Nio av dem har utvärderat sambandet mellan rs2910164 polymorfism och gastric cancerrisken. Med samma resultat, alla av dem avslutades inget signifikant samband mellan rs2910164 polymorfism och magcancer.
Fortfarande varför vi utfört denna metaanalys om Mir-146a polymorfism i magcancer känslighet? För det första, såsom visas i tabell 5, var de inkluderade studierna begränsade i alla dessa metaanalyser avseende gastrisk cancer. Alla av dem uteslutas studien av Zhou Y et al. [27] på grund av frånvarodata i artikeln. Bland dem, metaanalys av Xu X et al. [19] ingår sex undersökningar [23] - [26], [28], [44] för att utvärdera sambandet mellan rs2910164 polymorfism och gastric cancerrisken. Emellertid en av de sex ingående artiklarna detekteras rs2910164 polymorfism av gastrit [44], inte magcancer. Då ingen av de nio metaanalyser utvärderat MIR-146a rs2910164 G > C polymorfism och magcancer känslighet i detalj. Dessutom är det allmänt att matstrupscancer, levercancer, magsäckscancer, livmoderhalscancer och andra maligniteter har alltför olika molekylära mekanismer och logiskt att de inte verkar hysa en gemensam polymorfism som en riskfaktor. På samma sätt, matstrupscancer, magsäckscancer och kolorektal cancer är inte alltid överensstämmer med varandra i denna term. Sist men inte minst, behövs en uppdatering för att utvärdera sambandet mellan rs2910164 G > C polymorfism och gastric cancerrisken. Därför försöker vi att få en mer exakt bedömning av sambandet mellan rs2910164 polymorfism och gastric risk.Table 5 Meta-analyser av rs2910164 polymorfism och cancerrisk (information om GC) katalog Första författare
År
vid omfattade studie om magcancer
[[24]]
[[25]]
[[26]]
vid [[28]]
[[23]]
[[44]]
Srivastava [15]
2012

• Den distinkta magsaft proteomet i magcancer avslöjar en fler biomarkör diagnostisk profile
• Förhållandet mellan vascular endothelial growth factor gen polymorfismer och kliniskt resultat hos patienter med avancerad magsäckscancer behandlas med FOLFOX: VEGF polymorfism i gastric cancer