MIR-146a rs2910164 G /C polimorfizem in dovzetnost rak želodca: meta-analysis

MIR-146a rs2910164 G /C polimorfizem in dovzetnost rak želodca: meta-analiza
Abstract
Ozadje
Dokazi kažejo, da enotni nukleotidov polimorfizem nahaja v pre-miRNA ali zrel microRNA lahko spreminjate različne biološke procese in vplivajo na obdelavo rakotvornost. Objavljeni rezultati o povezavi med miR-146A rs2910164 G /C polimorfizem in človeške želodčne dovzetnosti za raka so sumljiva. Cilj te raziskave je bil pridobiti natančnejšo učinek povezovanja med miR-146a rs2910164 polimorfizem in tveganja želodca, ki ga meta-analizo.
Metode
Upravičeni genetsko društvo študije so iskali od PubMed, Web znanja in kitajski biomedicini Baza podatkov o človeku. Kvantitativna sinteza podatkov je bila izvedena za združenja miR-146A rs2910164 G /C polimorfizma s dovzetnosti za raka želodca.
Rezultati
Devet upravičeni študij, ki so vključevale skupno 3,885 želodčnih bolnikov z rakom in 5,396 nadzora so bile ugotovljene v sedanjosti meta-analiza. Celotna ALI navedla morebitno povezavo med rs2910164 polimorfizem in GC, vendar učinek ni bila statistično značilna (GG vs CG /CC: OR = 1.076, 95% CI 0.925-1.251, P = 0,342). Ko stratifikacije za prebivalstvo, rezultat je pokazal, da je bila miR-146a rs2910164 GG genotip povezana s povečanim želodca tveganje raka med Kitajci v recesivno modela (GG vs CG /CC: OR = 1.171, 95% interval zaupanja 1,050-1,306, P = 0,005) . Poleg tega ni bilo bistvene razlike najdemo v spol, kajenje, lokacijo, metastaze v bezgavkah in razvrščanja Lauren.
Sklepe
Ta meta-analiza kaže povečano tveganje med miR-146a rs2910164 GG genotipa in občutljivost raka želodca v kitajski temelji na objavljeni literaturi.
Ključne besede
microRNA-146A želodcem novotvorbe polimorfizma Meta-analiza ozadja
raka želodca (GC) je še vedno eden najpogostejših vzrokov smrti, povezanih z rakom po celem svetu kljub splošnemu zmanjšanju pojavnost v zadnjih 10 letih [1], [2]. Na splošno velja, da ima posameznik genska odpornost pomembno vlogo v patogenezi tumorja, vključno z GC.
MicroRNAs (miRNAs /MIR) so endogeni 18-24 nukleotidov nekodirano RNA, ki lahko uravnavajo izražanje genov in zaporedno reguliranje različnih bioloških procesov [3 ], [4]. Funkcionalna karakterizacija nekaterih microRNAs na začetku in napredovanja raka kažejo, da lahko igrajo bolj pomembno vlogo v patogenezi človeških rakih [5] [6]. Razmerje med miRNA in raka so intenzivno proučevali od leta 2002, so prvi dokaz o povezavi med miRNA genov in raka [7].
Študije so pokazale, da lahko polimorfizmi v pre-miRNA ali dospejo microRNA spreminjate različne biološke procese, ki jih vplivajo na izraz in /ali ciljni izbor microRNAs [8], [9]. V zadnjem desetletju so številne študije identificirati genetske variante na predhodnika ali zrel Mirna zaporedje miR-146A rs2910164 (G > C), ki so poročali, da so povezani z rakom dojk in karcinomom jetrnih celic [10], [11].
številne študije so bili objavljeni opisati povezavo med miR-146A rs2910164 G /C polimorfizem in tveganje za raka v zadnjih letih. Metaanaliza s Lian et al poročali. [10] je bilo ugotovljeno, da se lahko CC homozigoti za rs2910164 prispeva k dojke občutljivost raka med Evropejci. Še ena meta-analiza je pokazala, da ni statistično značilna korelacija med ima-miR-146A rs2910164 polimorfizem in tveganje za nastanek raka dojke [12]. Ogromna meta-analize v letu 2013 ni uspelo najti vse pomembne povezave med rs2910164 polimorfizma in tveganje za raka na dojki [13]. Temelji na sistematičnem pregledu, Chen et al. [14] poroča, da je kakovost dokazov nizka rs2910164 genetske zveze SNP s pljučnim rakom. Več metaanalize združiti povezavo med rs2910164 polimorfizem in tveganje za raka na splošno [15], [16]. Nekateri meta-analiza poročali rs2910164 polimorfizem in prebavila dovzetnost za raka [17] - [19].
Vendar pa je objavil podatke o pridružitvi med miR-146A rs2910164 G /C polimorfizem in človeške želodčne dovzetnosti za raka, so v neskladju in sumljiva. Zato smo izvedli sedanji meta-analize za kvantitativno oceno združenje miR-146A G /C SNP z želodčnim tveganja za nastanek raka.
Metode
literature iskanje Strategija
Elektronske baze podatkov, vključno z PubMed, Web of Knowledge in kitajski biomedicini Database (CBM) so iskali ustreznih študij, opravljenih na krvodajalcu do julija 2014 so bile uporabljene naslednje ključne besede za iskanje: 'želodca "ali" želodec "," neoplazme "ali" raka "ali" raka "ali" tumor "ali" adenokarcinom «in» mIR-146a ALI "miRNA-146a" ALI "microRNA-146a" ALI "ima-miR-146a". Za opredelitev potencialno ustreznih študij, so referenčni seznami izdelkov, opredeljenih v začetnem iskanju skenirana tudi ročno. Mi neposredno v stik avtorjev za njimi povezanih podatkov, ki so na voljo v originalnih publikacijah
vključevanja in izključevanja merila
so bile študije zdijo upravičeni, če so izpolnjeni vsi od naslednjih meril: (1). Raziskati povezavo med miR-146A polimorfizem in človeški GC tveganja, (2) oblikovanje kot študije primera za nadzor, (3) opredelitev primerov raka želodca je bila potrjena histološko ali patološko. Študije so izključeni iz katerega koli od naslednjih razlogov: (1) ni dovolj podatkov, o katerih so poročali, (2), izdelki iz pisem, mnenj, poročil o primerih, konferenčne izvlečki, uvodniki ali izvedenskega mnenja. Če so bili objavljeni serijske študije iste populacije iz iste raziskovalne skupine, smo izbrali le največji seriji.
Pridobivanje podatkov
je končni nabor člankov neodvisno oceniti dva recenzenta (Zhong Xu in Lingling Zhang) glede na merila za vključitev zgoraj navedene. Nesoglasja so razrešili razpravo. Naslednji podatki so pridobljeni iz vsakega poročila:. Prvega avtorja, leto izdaje, študija prebivalstva, narodnosti, število primerov in kontrol GC, pogostost genotipov in metode genotipizacija
Statistična analiza
Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) stanje je pregledal Pearson je dobrota-of-fit χ 2 preizkus v vsaki študiji (P
< 0,05 štela kot znatno neravnotežje v kontrolni skupini). Moč povezave med GC in miR-146A rs2910164 polimorfizma je bila ocenjena z izračunom razmerje obetov (OR) s 95% intervalom zaupanja (CI). Združena oddaljene regije so bili pridobljeni s kombinacijo posameznih študij, ki jih homozigoti primerjavo (GG vs CC), heterozigotnosti primerjava (CG vs. CC), dominantni in recesivni modeli (CG /GG vs CC, in GG vs CG /CC) alel primerjava (G vs. C) oz. Analiza heterogenosti med študijami je bila določena s pomočjo testa Cochrane je Q in I
2-testa (P
< 0,10 ali sem
2 > 50% je zdelo kaže statistično heterogenost) [20]. Ko ni bilo pomembno heterogenost obstoječih med študijah so združeni najbolj oddaljene regije ocena vsako študijo izračuna po modelu-fiksnih učinkov. Sicer pa smo uporabili model naključnih učinkov. Analize podskupine bili razdeljeni glede na študijske lastnost če ne bi bilo dovolj poročila. Analiza občutljivosti je bila izvedena z brisanjem samo eno študijo, vsakič, naj preuči vpliv posameznih podatkov, določenih na združenih oddaljenih regij. pristranskosti Objava je bila ocenjena s pomočjo metode Begg v izpušnem parcel in Egger testu (P
< 0.05 smo imeli predstavnik statistično značilno objava pristranskosti) [21], [22]. Statistični analize s pomočjo programske opreme Stata12.0 (stata Corpotion, College Station, Texas) opravili.
Rezultati
izbire in značilnosti vključenih študij študij
skupno 288 izdelkov, so bile ugotovljene iz PubMed, ISI in CBM baze podatkov. Diagram povzema postopek pregleda literature, kot je prikazano na sliki 1. skupno devetih študij, ki vključujejo 3,885 primere GC in 5,396 kontrole, na koncu združijo v tem meta-analizo [23] - [31]. Značilnosti teh študij so navedeni v tabeli 1. Med njimi je bilo sedem opravljene študije v Aziji (vključno z bolniki iz Kitajske, Japonske in Koreje), dveh študij v Evropi (vključno z bolniki iz Grčije, Nemčije, Litve in Latvije). Člen, ki ga Okubo et al. [32] je bil izključen zaradi podvajanja z drugo raziskavo [23]. Vse vključene člankov so študije primerov in kontrol, ki temeljijo v bolnišnici. Porazdelitev genotipov pri nadzoru vseh devetih študijah je bila v dogovoru z HWE. Slika 1 Diagram vključitve študije in izključevanja.
Tabela 1 Značilnosti študij, vključenih v meta-analizi
Prvi avtor
leta
Lokacija
metodo genotipizacije
No. primerov
No. za nadzor
Ohišja
Controls
PHWEfor control

CC

CG

GG

CC

CG

GG

Okubo
2010
Japan
PCR-RFLP
552
697
236
243
73
254
322
121
0.2776
Zeng
2010
China
PCR-RFLP
304
304
89
153
62
119
132
53
0.1223
Hishida
2011
Japan
PCR-CTPP
583
1637
230
271
82
633
775
229
0.7381
Zhou F
2012
Kitajske
TaqMan MGB
1686
1895
286
822
578
393
951
551
0.6407
Zhou Y
2012
Kitajska
Locus specifične PCR
299
416
107
146
46
127
215
74
0.301
Ahn
2013
Korea
PCR-RFLP
461
447
159
231
71
164
221
62
0.3618
Dikeakos
2014
Greece
PCR-RFLP
163
480
105
45
13
307
149
24
0.2892
Kupcinskas
2014
Europe
Real Time-PCR
362
347
16
94
252
16
108
223
0.5311
Pu
2014
China
PCR-RFLP
197
513
65
96
36
143
274
96
0.0801
Kvantitativna sinteza podatkov
povzetek te meta-analize za povezave med miR-146A rs2910164 G /C polimorfizma in dovzetnosti za raka želodca so prikazani v tabeli 2. Na splošno, ni bilo pomembno združenje za distribucijo genotipa med rakom želodca in nadzor, ki združuje devet študij. model naključnih učinkov je bila uporabljena za združevanje teh rezultatov, kot so opazili statistično heterogenost med študijami (P
Q-Test < 0,1, sem
2 > 50%). Je zbrana ALI ocene meta-analize so pogosto večji od 1,00, kar kaže na morebitno združenje rs2910164 polimorfizem in GC, čeprav ta učinek ni bila statistično značilna. Za recesivno modelu, kot P
Q-test < 0,1 z analizo heterogenosti, tudi model naključnih učinkov je bila uporabljena za analizo. Kot je prikazano na sliki 2, ni bilo statistično povečano tveganje za nastanek raka želodca v recesivno modelu, ko združijo devetih študij (recesivno model GG vs CG /CC: ALI = 1.076, 95% CI 0.925-1.251, P = 0,342). Tabela 2 Meta-analiza miR-146A rs2910164 polimorfizma z rakom želodca, ki ga prebivalstva
prebivalstva
Primerjava
No. študija
poskusov združevanja
test heterogenosti
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
sem
2
Asian
GG vs CC
7
1,016 (0,780, 1,324)
0,906
0,000
75,2%
CG vs. CC
0.998 (0.847, 1,176)
0,982
0.014
62,2%
CG /GG vs CC
1.005 (0,830, 1,216)
0,962
0,001
75,1%
GG vs CG /CC
1,025 (0,861, 1,221)
0.779
0,036
55,6%
G vs. C
1,006 (0,877, 1,153)
0,935
0,000
78,7%
Evropska
GG vs CC
2
1,331 (0,802, 2,210)
0,269
0,512
0,0%
CG vs. CC
0,880 (0.619, 1.253)
0.478
0,973
0,0%
CG /GG vs. CC
0.994 (0.716, 1.380)
0.971
0,875
0,0%
GG vs CG /CC
1,326 (0,995, 1,767)
0,054
0,512
0,0%
G vs. C
1,146 (0,937, 1,401)
0,184
0,608
0,0%
splošno
GG vs CC
9
1,056 (0,836, 1,334)
0,649
0,001
68,1%
CG vs. CC
0.984 (0.853, 1.136)
0.830
0.037
51.3 %
CG /GG vs CC
1,005 (0,852, 1,184)
0,956
0,002
66,9%
GG vs CG /CC
1.076 (0,925, 1.251)
0,342
0,052
48,0%
G vs. C
1,028 (0,914, 1,155)
0,648
0,000
72,5%
Slika 2 Meta-analiza miR-146A rs2910164 polimorfizem in želodca dovzetnost za raka za recesivno modela (GG vs CG + CC).
Vendar pa, kot je prikazano v tabeli 3 in sliki 3, ko smo izvedli analize podskupin glede na lokacijo, skupni rezultat je pokazal, da je bila miR-146a rs2910164 GG genotip povezana s povečanim tveganjem za raka želodca na Kitajskem za recesivno modela (GG vs CG /CC: OR = 1,193; 95% interval zaupanja 1,057-1,346, P = 0,004). Poleg tega so bile izvedene tudi interakcije med miR-146A polimorfizem in clinicopathological znakov, ko dobimo uporabne podatke. Ni pomembno povezavo med miR-146A genetsko različico in tveganje za nastanek raka želodca so našli v razslojeni analizi po spolu, kajenje, lokacijo, metastaze v bezgavkah in razvrstitvi Lauren (tabela 4) .table 3 Meta-analiza miR-146A rs2910164 polimorfizma s želodčni rak v kitajski
Primerjava
poskusov združevanja
test heterogenosti
OR (95% CI)
P


P
(Q-test)
sem
2
GG vs CC
1,113 (0,773, 1,604)
0,564
0,011
73.1%
CG vs. CC
1.045 (0,783, 1,394)
0,766
0,012
72,8%
CG /GG vs CC
1,065 (0,779 , 1,457)
0,692
0,002
79,4%
GG vs CG /CC
1.193 (1,057, 1.346)
0.004
0,201
35,1%
G vs. C
1,055 (0,868, 1,283)
0,590
0.004
77,8%
Slika 3 Meta-analiza miR-146a rs2910164 polimorfizem in občutljivost raka želodca v kitajščini za recesivno modela ( GG vs CG + CC).
Tabela 4 Meta-analiza rs2910164 polimorfizma z GC s Clinicopathological znakov
Parametri
Primerjava
No. študija
poskusov združevanja
test heterogenosti
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
sem
2
Spol
CC vs. GG /CG
4
0.916 (0.691, 1.215)
0,542
0,201
37,7%
(Moški vs. Moški)
CC /CG vs. GG
4
0,939 (0,767, 1,148)
0,538
0,967
0,0%
Smoking (št vs. Da)
CC vs. CG /GG
2
0.843 (0.554, 1.282)
0,425
0,315
0,9%
Site (Cardic vs Non-Cardic)
CC vs. CG /GG
4
0,844 (0,593, 1,201)
0,346
0.382
0,0%
CC /CG vs. GG
4
0,897 (0,738, 1,090)
0,274
0,549
0,0%
metastaze bezgavke (Negative vs. Positive)
CC vs. CG /GG
2
1.211 (0.842, 1.742)
0.302
0,589
0,0%
klasifikaciji Lauren (črevesne vs. razpršenih)
CC /CG vs. GG
4
0,961 (0,807, 1,145)
0,658
0,655
0,0%
analizo občutljivosti in objava pristranskosti
smo izkoristili enosmerno analizo občutljivosti za oceno stabilnosti rezultata na Kitajskem [33]. V recesivno modela, analiza občutljivosti združili ALI z 95% CI spremeni iz 1.193 (1,057, 1.346), na 0,995 (0.786, 1.260), če izpustimo eno študijo Zhou F [26] (slika 4). Ustrezne združeni OR ni bistveno spremenila v drugih genetskih modelov. Slika 4 Vpliv vsake študije z izpuščanjem posameznih študij na Kitajskem recesivna modelu.
Begg je lijak ploskve (slika 5) in Egger je preskus (slika 6) niso pokazali nikakršne potencialne pristranskosti objave (P
= 1,000 in 0,355, v tem zaporedju). Lijak parcele so pokazali nekaj asimetrijo, kar je verjetno posledica omejenega števila študij. Slika 5 Begg v lijak zemljišče z psevdo intervalom zaupanja 95%.
Slika 6 Egger je objava pristranskosti parcelo.
Razprava
MIR-146a Dokazano je, da igrajo pomembno vlogo v celično proliferacijo, diferenciacijo, apoptoza in tumorigeneze [34] - [37]. Študija, ki jo Jazdzewski et al. [38] leta 2008, je predlagal, da bi rs2910164, skupno polimorfizem v zaporedju pred miR-146A, spremeni zrel miR-146A izražanja in igrajo pomembno vlogo pri tumorigeneze. V zadnjih treh letih se je število meta-analiz in pregleda združiti povezavo med rs2910164 G > C polimorfizem in tveganja raka, vključno gastrointestinalnih tumorjev na splošno [15] - [19], [39] - [43]. Devet izmed njih so ocenili povezavo med rs2910164 polimorfizem in tveganje za nastanek raka želodca. Z enakimi rezultati, ki so vse sklenjene ni pomembno povezavo med rs2910164 polimorfizem in raka želodca.
Still zakaj smo izvedli to meta-analizo o miR-146A polimorfizem občutljivosti raka želodca? Prvič, kot je prikazano v tabeli 5 so bile vključene študije omejene na vseh teh metaanalizami glede rak želodca. Vsi izmed njih izključil študijo Zhou Y et al. [27] zaradi podatkov odsotnosti v članku. Med njimi, meta-analiza Xu X et al. [19], vključenih šest raziskav [23] - [26] [28] [44] oceniti povezavo med rs2910164 polimorfizem in tveganje za nastanek raka želodca. Vendar pa je eden od šestih vključenih člankov zaznali rs2910164 polimorfizem od gastritis [44], ne raka želodca. Potem, nobena od devetih meta-analiz ocenili miR-146A rs2910164 G > C polimorfizem in občutljivost želodca raka v podrobnostih. Poleg tega je na splošno, da imajo požiralnika, rak jeter, rak želodca, rak materničnega vratu in druge malignosti tudi različne molekularne mehanizme in logično ne zdi pristanišče skupen polimorfizem kot dejavnik tveganja. Podobno, ezofagealni rak, želodčni rak in rak debelega črevesa in niso vedno skladna s seboj v tem obdobju. Nenazadnje, je potrebna posodobitev oceniti povezavo med rs2910164 G > C polimorfizem in tveganje za nastanek raka na želodcu. Zato skušamo pridobiti natančnejšo oceno povezanosti med rs2910164 polimorfizem in želodca risk.Table 5 Meta-analize rs2910164 polimorfizem in tveganje za nastanek raka (podatki o GC)
prve avtorja
Leto

Vključeno študija o raku želodca

[[24]]
[[25]]
[[26]]

[[28]]
[[23]]
[[44]]
Srivastava [15]
2012
√
√
√
√
Wang J [16]
2012
√
√
√
Wang F [17]
2012
√
√
√
Wu [18]
2013
√
√
√
Xu X [19]
2014
√
√
√
√
√
√
Qiu [40]
2011
√
√
√
je [41]
2012
√
√
√
√
Xu Y [42]
2013
√
√
√
√
Yin [43]
2013
√
√
√
√
Osredotočeni na rs2910164 SNP in raka želodca, ta meta-analiza je pokazala, da je bila miR-146a GG genotip povezana z povečano tveganje za nastanek raka želodca na Kitajskem podskupini v recesivno modela (združeni OR = 1,193). Ni bilo pomembnih razlik v spolu, kajenje, lokacijo, metastaze v bezgavkah in razvrstitvi Lauren čez genotipov.
Od devetih študijah so za študije, ki jih Zeng et al. [24] Zhou F sod. [26] opisujejo razporeditev genotipa pri raku želodca s starostjo. Nekdanji je pokazala, da je imel rs2910164 GC /GG genotip je povečano tveganje za raka želodca, zlasti v mlajših posameznikov, starih (≤58 let), kasneje pokazala, da je GG genotip večja je bila nevarnost raka na želodcu bolj očitna pri mlajših osebah (≤65 let). Zhou Y sod. [27] ni našel nobene distribucije differennt na raka želodca med različne velikosti tumorja (< 5 cm vs. ≥5 cm). Poleg tega Zeng sod. [24] poroča ni statistično značilno združenje v variantnih genotipov z diferenciacijo tumorja. Skoraj vse vključene študije so bile izvedene v Aziji razen bili dve študiji v Evropi. Študija, ki jo Kupcinskas et al. V [30] Evropi analizirali genskih polimorfizmov Mir-146A pri 995 osebah, vključno z Nemčijo, Latvijo in Litvo. Analiza podatkov je pokazala, da so genski polimorfizem miR-146A ni povezana s tveganjem GC v Evropi. Poleg tega je bilo ugotovljeno, ni razlike med difuzni in črevesnih tipa želodca skupin raka.
Rezultate je treba razlagati s skrbnostjo zaradi več omejitev. Prvič, omejeno število pacientov ima lahko vplivajo na rezultate. Čeprav smo izvedli celovito literature raziskave iz različnih podatkovnih zbirk brez omejitev v jezikih objave, datumi, narodnosti in drugih dejavnikov, je bilo le skupno devetih študij, ki vključujejo 3,885 želodčni primerov raka in 5,396 kontrole za sedanje meta-analizo. Celotna ALI navedla morebitno povezavo med rs2910164 polimorfizem in GC, vendar učinek ni bila statistično značilna. Še vedno je težko, da bi dokončno odločitev o točnosti povezovanja med miR-146a rs2910164 G > C polimorfizem in dovzetnost rak želodca. Drugič, smo uporabili enosmerno analizo občutljivosti za oceno stabilnosti meta-analizo in rezultat spremenila, ko izpustimo študije z največjimi vzorcev. Tretjič, le nekaj vključeni raziskovalci poročajo podatke o interakcijah med miR-146A polimorfizem in clinicopathological znakov raka želodca in vse združeni analizi interakcije je omejena z majhnim vzorcem in pomanjkanja podatkov.
Zaključek
In sklep, ta meta-analiza kaže povečano tveganje med miR-146a rs2910164 GG genotipa in dovzetnosti za raka želodca v kitajščini, ki temelji na objavljenih literatur. so potrebne nadaljnje študije o velikem obsegu potrditi genetsko dovzetnost miR-146A rs2910164 pri raku želodca.
deklaracij
Priznanja
Ta papir je bil podprt s strani skladov Guizhou Provincial ministrstvo za znanost in tehnologijo, No.qiankehe-J-2012-2240.
Mi hvala Master Yuan Zhou za predloži ustrezne izvirne podatke.
avtorjev prvotni predložiti datoteke za slike
Spodaj so povezave do avtorjev prvotna predloženih spisov za slik. "Izvirno datoteko na sliki 1 12881_2014_117_MOESM2_ESM.gif avtorjev 12881_2014_117_MOESM1_ESM.gif avtorjev prvotne datoteke za prvotno datoteke za sliko 3 12881_2014_117_MOESM4_ESM.gif avtorjev Slika 2 12881_2014_117_MOESM3_ESM.gif avtorjev prvotne datoteke za sliko 4 prvotne datoteke 12881_2014_117_MOESM5_ESM.gif avtorjev za sliki 5 izvirna datoteka 12881_2014_117_MOESM6_ESM.gif avtorjev na sliki 6 Konkurenca interesov
avtorji izjavljajo, da nimajo konkurenčnih interesov.

• Značilen želodca proteoma tekočine v raka želodca razkriva več bio-označevalce diagnostične profil
• Odnos žilnih endotelijskih rastnih faktorjev genskih polimorfizmov in kliničnim izidom pri bolnikih z napredovalo želodca z rakom, zdravljenih s FOLFOX: VEGF polimorfizem pri raku želodca