MIR-146a rs2910164 G /C полиморфизм и желудка, предрасположенность к раку: мета-анализ

MIR-146a rs2910164 G /C полиморфизм и желудка, предрасположенность к раку: мета-анализ
Аннотация
Справочная информация
Фактические данные показали, что полиморфизм единичного нуклеотида находится в пре-микроРНК или зрелых микроРНК может изменять различные биологические процессы и влияют на обработка канцерогенеза. Опубликованные результаты о связи между микроРНК-146а rs2910164 G /C полиморфизма и желудочной восприимчивости рака у человека не являются окончательными. Цель данного исследования состояла в том, чтобы получить более точный эффект ассоциации между микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма и риск желудка с помощью мета-анализа.
Методы
Приемлемые исследования генетическая связь Поиск из PubMed, веб-знаний и китайский биомедицины База данных по обследуемого человека. Количественный синтез данных проводился для ассоциаций микроРНК-146а rs2910164 G /C полиморфизма с предрасположенностью к раку желудка.

Результаты Девять правомочные исследований, которые включали в общей сложности 3.885 больных раком желудка и 5,396 контроля были определены в настоящем мета-анализ. В целом или указали потенциальную связь между полиморфизмом rs2910164 и GC, но эффекта не было статистически значимым (GG по сравнению с CG /CC: OR = 1,076, 95% CI 0.925-1.251, P = 0,342). Когда расслаивая для населения, результат показал, что микроРНК-146а rs2910164 GG генотип был связан с повышенным риском развития рака желудка среди китайцев в рецессивного модели (GG по сравнению с CG /CC: OR = 1.171, 95% ДИ 1.050-1.306, P = 0,005) , Кроме того, никаких существенных различий не было обнаружено в пол, курение, местоположение, метастаз лимфатических узлов и классификации Лорена.
Выводы
Настоящий мета-анализ предполагает повышенный риск между микроРНК-146а rs2910164 GG генотипа и желудочной восприимчивости рака в китайский на основе опубликованных литератур.
Ключевые слова
микроРНК-146A Желудок новообразованиями полиморфизм Мета-анализ фона
рака желудка (GC) по-прежнему одна из самых распространенных причин рака, связанных смерти во всем мире, несмотря на общее сокращение заболеваемость за последние 10 лет [1], [2]. Принято считать, что индивидуальная генетическая предрасположенность играет важную роль в патогенезе опухоли, включая GC.
МикроРНК (миРНК /MIR) являются эндогенными 18-24 нуклеотидных некодирующие РНК, которые могут регулировать экспрессию генов и последовательно регулируют различные биологические процессы [3 ], [4]. Функциональная характеристика некоторых микроРНК в инициации рака и прогрессии указывает на то, что они могут играть более важную роль в патогенезе рака у человека [5], [6]. Отношения между микроРНК и рак хорошо изучена с 2002 года, первая демонстрация связи между генами микроРНК и рак [7].
Исследования показали, что полиморфизмы в пре-микроРНК или зрелые микроРНК может изменять различные биологические процессы, влияющие на выбор экспрессии и /или целевой микроРНК [8], [9]. За последнее десятилетие, многочисленные исследования выявили генетические варианты в предшественнике или зрелой последовательности микроРНК из микроРНК-146a rs2910164 (G &° С), которые, как сообщалось, связаны с раком молочной железы и гепатоцеллюлярной карциномы [10], [11].
ряд исследований были опубликованы, чтобы описать связь между микроРНК-146а rs2910164 G /C полиморфизма и риск развития рака в последние годы. Мета-анализ сообщил Lian и др. [10] пришли к выводу, что CC гомозиготы из rs2910164 может способствовать восприимчивости рака молочной железы среди европейцев. Другой мета-анализ показал, что не существует значительная корреляция между имеет-микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма и риском рака молочной железы [12]. Громадный мета-анализ в 2013 году не удалось найти какую-либо значимую связь между полиморфизмом rs2910164 и риском развития рака молочной железы [13]. На основе систематического обзора, Чен и др. [14] сообщили, что качество доказательств было низким для rs2910164 SNP генетической ассоциации с раком легких. Несколько мета-анализов объединяют ассоциацию между rs2910164 полиморфизма и риском развития рака в целом [15], [16]. Некоторые мета-анализ сообщили о rs2910164 полиморфизм и желудочно-кишечного тракта, предрасположенность к раку [17] - [19].
Тем не менее, опубликованные данные о связи между микроРНК-146а rs2910164 G /C полиморфизма и желудочной восприимчивости рака у человека противоречивы и неубедительны. Таким образом, мы провели настоящий мета-анализ, чтобы количественно оценить ассоциацию микроРНК-146а G /C SNP с желудочным риск развития рака.
Методы
литературы стратегия поиска
Электронные базы данных, включая PubMed, Web знаний и китайском языках были найдены биомедицины базы данных (СВМ) для соответствующих исследований, проведенных на обследуемого человека до июля 2014 г. были использованы следующие ключевые слова для поиска: "желудка" или "желудок", "новообразование" иЛИ "рак" иЛИ "рак" иЛИ "опухоль" иЛИ " аденокарциномы "и" MIR-146a ИЛИ "микроРНК-146а" ИЛИ "микроРНК-146а" ИЛИ "имеет-Mir-146a". Для дальнейшего выявления потенциально соответствующих исследований, справочные списки статей, указанных в первоначальном поиске также были отсканированы вручную. Мы напрямую связались авторов для связанных с ними данных, которые были недоступны в оригинальных публикациях
критерии включения и исключения
Исследования были сочтены приемлемыми, если они встретились все из следующих критериев:. (1) изучить связь между микроРНК-146а полиморфизма и риск человеческого GC, (2) дизайн как исследования случай-контроль, (3) выявление случаев рака желудка был подтвержден гистологически или патологически. Исследования были исключены на основании любого из следующих причин: (1) нет достаточных данных, сообщенные (2) статьи писем, обзоров, докладов, тематических конференций рефератов, редакционных или экспертного заключения. Если были опубликованы серийные исследования одного и того же населения из той же исследовательской группы, только самый большой серии были выбраны.
Извлечение данных
Окончательный набор статей было оценено независимо двумя рецензентами (Zhong Сюй и Lingling Zhang) в соответствии с критерии включения перечисленных выше. Разногласия были урегулированы путем обсуждения. Следующая информация была извлечена из каждого отчета:. Первого автора, года издания, изучение населения, этнического происхождения, число случаев GC и контроля, частоты генотипов и метода генотипирования
Статистический анализ
Харди-Вайнберга (HWE) статус был рассмотрен Пирсона доброкачественность-оф-приступе χ 2 теста в каждом исследовании (P &
л; 0,05 рассматривалось как существенное нарушение равновесия в контрольной группе). Сила связи между GC и микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма оценивали путем расчета отношения шансов (ОШ) с 95% доверительный интервал (ДИ). Объединенные ОШ были получены из комбинации отдельных исследований путем сравнения гомозиготном (GG vs. CC), сравнение гетерозигот (CG против CC), доминантные и рецессивные модели (CG /GG по сравнению с CC и GG vs. CG /CC), Сравнение аллель (G по сравнению с C), соответственно. Анализ гетерогенности между исследованиями определяли с использованием Q теста по Кокрановсому, и я
2-тест (P &
л; 0,10, или я
2 > 50% считается показателем статистически гетерогенности) [20]. Когда не было никаких существенных гетерогенность существующих среди исследований, суммарная оценка ОШ каждого исследования рассчитывали с помощью модели с фиксированными эффектами. В противном случае, была использована модель случайных эффектов. Анализы Подгруппа стратифицировали по исследуемой характеристики, если было достаточно отчетов. Анализ чувствительности проводился путем удаления одного одного исследования, каждый раз, чтобы исследовать влияние отдельных набора данных на объединенных ОШ. предвзятость публикации оценивали с использованием методов воронки участков Begg и протестируйте Эггера (P &
л; 0,05 считался представителем статистически значимой систематической ошибки) [21], [22]. Статистический анализ проводили с использованием программного обеспечения Stata12.0 (Stata Corpotion, College Station, Texas).

Результаты отбора исследований и характеристик включенных исследований
В общей сложности 288 статей были идентифицированы из PubMed, ISI и CBM базы данных. Блок-схема обобщает процесс обзора литературы, как показано на рисунке 1. В общей сложности девять исследований с участием 3885 дел ГХ и 5,396 управления были в конечном счете объединены для настоящего мета-анализа [23] - [31]. Характеристики этих исследований приведены в таблице 1. Среди них семь исследований были проведены в Азии (в том числе пациентов из Китая, Японии и Кореи), два исследования, в Европе (в том числе пациентов из Греции, Германии, Литвы и Латвии). Статья Окубо и др. [32] был исключен из-за дублирования с другом исследовании [23]. Все статьи были исследования случай-контроль на базе больниц. Распределение генотипов в контроле всех девяти исследований был в согласии с HWE. Рисунок 1 Технологическая схема включения исследований и исключения.
Таблица 1. Характеристики исследований, включенных в мета-анализ
Первый автор

год

Место

метод генотипирования

No. случаев

No. контролей

Случаи

Controls

PHWEfor control

CC

CG

GG

CC

CG

GG

Okubo
2010
Japan
PCR-RFLP
552
697
236
243
73
254
322
121
0.2776
Zeng
2010
China
PCR-RFLP
304
304
89
153
62
119
132
53
0.1223
Hishida
2011
Japan
PCR-CTPP
583
1637
230
271
82
633
775
229
0.7381
Zhou F
2012
Китай
TaqMan MGB
1686
1895 г.
286
822
578
393
951
551
0.6407
Чжоу Y
2012
Китай
Локус-специфичные PCR
299
416
107
146
46
127
215
74
0.301
Ahn
2013
Korea
PCR-RFLP
461
447
159
231
71
164
221
62
0.3618
Dikeakos
2014
Greece
PCR-RFLP
163
480
105
45
13
307
149
24
0.2892
Kupcinskas
2014
Europe
Real Time-PCR
362
347
16
94
252
16
108
223
0.5311
Pu
2014
China
PCR-RFLP
197
513
65
96
36
143
274
96
0.0801
Количественный синтез данных
резюме этого мета-анализа для ассоциации между микроРНК-146а rs2910164 G /C полиморфизма и восприимчивости рака желудка были приведены в таблице 2. В целом, не было никакой существенной ассоциации в распределении генотипов между раком желудка и контроль путем объединения девяти исследований. Модель случайных эффектов использовали для объединения этих результатов как статистически гетерогенность наблюдалась между исследованиями (P
<суб> Q-тест &л; 0,1, I
2 > 50%). Объединенную ИЛИ оценки мета-анализов часто были больше, чем 1,00, что указывает на потенциальную ассоциацию rs2910164 полиморфизма и GC, хотя этот эффект не был статистически значимым. Для рецессивного модели, как P
<югу> Q-тест &ЛТ; 0,1 путем анализа гетерогенности, а также модель случайных эффектов была использована для анализа. Как показано на рисунке 2, не было статистически повышенный риск развития рака желудка в рецессивной модели, когда объединили девять исследований (рецессивный модель, GG по сравнению с CG /CC: OR = 1.076, 95% ДИ 0.925-1.251, P = 0,342). Таблица 2 Мета-анализ микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма с раком желудка населением
населения

Сравнение

No. исследования

Test ассоциации

Test гетерогенности

OR (95% ДИ)

P


P
(Q-тест)

I
2
Азиатский
GG по сравнению с CC
7
1,016 (0,780, 1,324)
0,906
0,000
75,2%
CG vs. CC
0,998 (0,847, 1,176)
0,982
0,014
62,2%
CG /GG по сравнению с CC
1,005 (0,830, 1,216)
0,962
0.001
75,1%
GG vs. CG /CC
1,025 (0,861, 1,221)
0.779
0,036
55,6%
G по сравнению с C
1,006 (0,877, 1,153)
0,935
0,000
78,7%
Европейский
GG по сравнению с CC страница 2 1,331 (0,802, 2,210)
0,269
0,512
0,0%
CG против CC
0,880 (0,619, 1,253)
0,478
0,973
0,0%
CG /GG по сравнению с CC
0,994 (0,716, 1,380)
0,971
0,875
0,0%
GG по сравнению с CG /CC
1,326 (0,995, 1,767)
0,054
0,512
0,0%
G по сравнению с C
1,146 (0,937, 1,401)
0,184
0,608
0,0%
Общий
GG по сравнению с CC
9
1,056 (0,836, 1,334)
0,649
0,001
68,1%
CG vs. CC
0,984 (0,853, 1,136)
0,830
0,037
51,3 %
CG /GG по сравнению с CC
1,005 (0,852, 1,184)
0,956
0,002
66,9%
GG vs. CG /CC
1.076 (0.925, 1.251)
0,342
0,052
48,0%
G против C
1,028 (0,914, 1,155)
0,648
0,000
72,5%
Рисунок 2 Мета-анализ из микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма и желудочной восприимчивости рака для рецессивного модели (GG против CG + CC).
Однако, как показано в таблице 3 и на рисунке 3, когда мы провели анализ подгрупп по местоположению, комбинированный результат показал, что микроРНК-146а rs2910164 GG генотип был связан с повышенным риском развития рака желудка в Китае для рецессивного модели (GG против CG /CC: OR = 1,193, 95% ДИ 1.057-1.346, P = 0,004). Кроме того, взаимодействие между микроРНК-146а полиморфизма и клинико-патологическими символы были также проведены, когда получены пригодные для использования данных. Ни одна значимая связь между микроРНК-146а генетического варианта желудка и риск развития рака не были найдены в стратифицированной анализе по признаку пола, курения, местоположение, метастаз лимфатических узлов и классификации Lauren (таблица 4) .table 3 Мета-анализ микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма с рак желудка в китайских
Сравнение

Test ассоциации

Test гетерогенности

OR (95% CI)

P
<бр>
P
(Q-тест)

I
2
GG vs. CC
1,113 (0,773, 1,604)
0,564
0,011
73,1%
CG vs. CC
1,045 (0,783, 1,394)
0,766
0,012
72,8%
CG /GG по сравнению с CC
1,065 (0,779 , 1,457)
0,692
0,002
79,4%
GG vs. CG /CC
1.193 (1.057, 1.346)
0,004
0,201
35,1%
G по сравнению с C
1,055 (0,868, 1,283)
0,590
0,004
77,8%
Рисунок 3 Мета-анализ микроРНК-146а rs2910164 полиморфизма и желудочной восприимчивости рака на китайском языке для рецессивного модели ( GG vs. CG + CC).
Таблица 4 Мета-анализ полиморфизма rs2910164 с GC по клинико-патологическими символами
Параметры

Сравнение

No. исследования

Test ассоциации

Test гетерогенности

OR (95% ДИ)

P


P
(Q-тест)

I
2
Пол
CC vs. GG /CG 4
0,916 (0,691, 1,215)
0,542
0,201
37,7%
(мужскую и женскую)
CC /CG vs. GG 4
0,939 (0,767, 1,148)
0,538
0,967
0,0%
Курение (Нет Да против)
CC vs. CG /GG страница 2 0,843 (0,554, 1,282)
0,425
0,315
0,9%
Сайт (Cardic vs. Non-Cardic)
CC vs. CG /GG 4
0,844 (0,593, 1,201)
0,346
0,382
0,0%
CC /CG vs. GG 4
0,897 (0,738, 1,090)
0,274
0,549
0,0%
метастазы лимфатического узла (отрицательный vs. Позитивный)
CC vs. CG /GG страница 2 1.211 (0.842, 1.742)
0,302
0,589
0,0%
классификации Лорена (кишечная против диффузная)
CC /CG vs. GG
4
0,961 (0,807, 1,145)
0,658
0,655
0,0%
анализ чувствительности и смещения публикации
Мы используем анализ чувствительности в одну сторону, чтобы оценить стабильность результата в Китае [33]. В рецессивного модели, анализ чувствительности объединенных ОР с 95% ДИ изменяется от 1.193 (1.057, 1.346) до 0,995 (0,786, 1,260) при опуская одно исследование Чжоу F [26] (рис 4). Соответствующие объединены или не был существенно изменен в других генетических моделей. Рисунок 4 Влияние каждого исследования бездействием отдельных исследований в Китае для рецессивного модели.
Begg в воронкообразный график (рисунок 5) и тест Egger (рисунок 6) указывает на отсутствие потенциальной систематической ошибки (P
= 1.000 и 0,355, соответственно). Воронка участки показали некоторую асимметрию, которая, вероятно, из-за ограниченного количества исследований. Рисунок 5 Begg в воронку участок с псевдо 95% предельных величин. Рисунок 6
смещения публикации сюжет Эггера.
Обсуждение
MIR-146a было показано, играют важную роль в клеточной пролиферации, дифференцировки, апоптоза и онкогенеза [34] - [37]. Исследование по Jazdzewski и др. [38] в 2008 году предположил, что rs2910164, общий полиморфизм в последовательности предварительно микроРНК-146а, может изменять экспрессию микроРНК-146а зрелой и играть определенную роль в онкогенеза. За последние три года, ряд мета-анализов, а также анализа объединяют ассоциацию между rs2910164 G > C полиморфизм и риск развития рака желудочно-кишечного тракта, включая опухоли в целом [15] - [19], [39] - [43]. Девять из них оценили связь между полиморфизмом rs2910164 и риском развития рака желудка. С теми же результатами, все они не пришли к выводу, нет существенной ассоциации между rs2910164 полиморфизма и рака желудка.
Тем не менее, почему мы провели этот мета-анализ, касающийся микроРНК-146а полиморфизм в желудочном восприимчивости рака? Во-первых, как показано в таблице 5, включенные в обзор исследования были ограничены во всех этих мета-анализов по поводу рака желудка. Все они исключены исследования Чжоу Y и др. [27] из-за отсутствия данных в статье. Среди них, мета-анализ Сюй X и др. [19] включены шесть исследований [23] - [26], [28], [44], чтобы оценить связь между полиморфизмом rs2910164 и риском развития рака желудка. Тем не менее, один из шести включенных статей обнаружены rs2910164 полиморфизм от гастрита [44], а не рак желудка. Тогда ни один из девяти мета-анализов не оценивали микроРНК-146а rs2910164 G ≫ C полиморфизм и желудка, предрасположенность к раку в деталях. Более того, это вообще, что рак пищевода, рак печени, рак желудка, рак шейки матки и других злокачественных опухолей имеют слишком разные молекулярные механизмы и логически они, похоже, не питают общий полиморфизм как фактор риска. Аналогичным образом, рак пищевода, рак желудка и рак толстой кишки не всегда совместимы друг с другом в этом плане. И последнее, но не в последнюю очередь, обновление необходимо, чтобы оценить связь между rs2910164 G > C полиморфизм и риск развития рака желудка. Таким образом, мы пытаемся получить более точную оценку ассоциации между rs2910164 полиморфизма и желудочной risk.Table 5 Мета-анализ полиморфизма rs2910164 и риском развития рака (информация о GC)
Первый автор

год <бр>
Включено исследование о раке желудка:

[[24]]

[[25]]

[[26]] <бр>
[[28]]

[[23]]

[[44]]

Шривастава [15]
2012
√
√
√ √

Ван J [16]
2012
√
√ √

Ван F [17]
2012
√
√ √

Ву [18]
2013
√
√ √

Сюй X [19]
2014
√ <бр> √ √

√
√ √

Цю [40]
2011
√ √

√
Он [41] <бр> 2012
√ √

√ √

Xu Y [42]
2013
√ √

√ √

Инь [43]
2013
√ √

√ √

ориентированные на rs2910164 SNP и рака желудка, настоящее мета-анализ показал, что микроРНК-146а GG генотип был связан с повышенный риск развития рака желудка в Китае подгруппы в рецессивного модели (складочный OR = 1,193). Там не было никаких существенных различий в пол, курение, местоположение, метастаз лимфатических узлов и классификации Лорена через генотипов.
Из девяти исследований, включенных, исследования, проведенные Zeng и др. [24] и Чжоу F и др. [26] описывают распределение генотипа в развитии рака желудка по возрасту. Первый показал, что rs2910164 GC /GG генотипа имели повышенный риск развития рака желудка, особенно у молодых людей в возрасте (≤58 лет), позже показал, что генотип GG увеличился риск развития рака желудка было более очевидным в более молодых пациентов (≤65 лет). Чжоу Y и др. [27] не обнаружили каких-либо распределение differennt при раке желудка между различными размерами опухоли (< 5 см по сравнению с ≥5 см). Кроме того, Zeng и др. [24] сообщили об отсутствии статистически значимой ассоциации в варианте с генотипами дифференцировки опухоли. Почти все включенные исследования были проведены в Азии, за исключением двух исследований были в Европе. В исследовании, проведенном Купчинскас и соавт. в Европе [30] проанализировали генные полиморфизмы MIR-146а в 995 предметов, включая Германию, Латвию и Литву. Анализ полученных данных показал, что ген полиморфизмы MIR-146а не связаны с риском GC в Европе. Кроме того, никакой разницы между диффузной и кишечно-желудочного типа групп рака обнаружено не было.
Результаты следует интерпретировать с осторожностью из-за ряда ограничений. Во-первых, ограниченное число пациентов может оказывать влияние на результаты. Хотя мы провели всестороннее исследование литературы из нескольких баз данных без ограничений на языках публикации, дат, этнических групп и других факторов, были только в общей сложности девять исследований с участием 3885 случаев заболевания раком желудка и 5,396 управления для настоящего мета-анализа. В целом или указали потенциальную связь между полиморфизмом rs2910164 и GC, но эффекта не было статистически значимым. Это все еще трудно сделать твердый вывод о точности связи между микроРНК-146а rs2910164 G > C полиморфизм и желудка, предрасположенность к раку. Во-вторых, мы используем анализ чувствительности в одну сторону, чтобы дать оценку стабильности мета-анализа и результат измененную при опуская исследование с крупнейшими образцами. В-третьих, лишь немногие включены исследования представили данные о взаимодействии между микроРНК-146а полиморфизма и клинико-патологическими персонажей рака желудка, и все обобщенном анализе взаимодействий была ограничена небольшим размером выборки и дефицита данных.
Заключение
In заключение, настоящее мета-анализ предполагает повышенный риск между микроРНК-146а rs2910164 GG генотипа и желудочной восприимчивости рака на китайском языке на основе опубликованных литератур. Дальнейшие исследования в больших масштабах могут быть необходимы, чтобы подтвердить генетическую восприимчивость микроРНК-146a rs2910164 в развитии рака желудка.
Декларациях
Подтверждения
Эта статья была поддержана фондов Гуйчжоу провинциального департамента науки и техники, No.qiankehe-J-2012-2240.
Мы благодарим Мастер Юань Чжоу для предоставить соответствующие исходные данные.
Авторы 'оригинальные представлены файлы для изображений изображения Ниже приведены ссылки на авторов оригинала, представленных файлов для изображений. 'Исходный файл для Рисунок 1 12881_2014_117_MOESM2_ESM.gif Авторского 12881_2014_117_MOESM1_ESM.gif авторов исходного файла для "исходного файла для фигурного 3 12881_2014_117_MOESM4_ESM.gif Авторского Рисунок 2 12881_2014_117_MOESM3_ESM.gif Авторского исходного файла для фигурного 4 исходного файла 12881_2014_117_MOESM5_ESM.gif Авторского на рисунке 5 Исходный файл 12881_2014_117_MOESM6_ESM.gif авторов для фигурного 6 конкурирующие интересы
авторы заявляют, что у них нет конкурирующих интересов.

• Отличительная желудка протеом жидкости при раке желудка показывает диагностический profile
• Взаимосвязь полиморфизмов гена фактора роста эндотелия сосудов и клинического исхода у больных распростран…