MiR-146a rs2910164 G /C polymorfisme en maagkanker gevoeligheid: een meta-analyse
Abstracte achtergrond
bewijs heeft aangetoond dat enkele nucleotide polymorfisme gelegen in de pre-miRNA of volwassen microRNA kunnen verschillende biologische processen te wijzigen en de invloed op de verwerking van carcinogenese. Gepubliceerde resultaten over het verband tussen miR-146a rs2910164 G /C polymorfisme en menselijke maagkanker vatbaarheid zijn niet eenduidig. Het doel van dit onderzoek was om een meer precieze effect van de associatie tussen de miR-146a rs2910164 polymorfisme en maag risico door meta-analyse te verwerven.
Methods
aanmerking komende genetische associatiestudies werden doorzocht van PubMed, Web of Knowledge en Chinese biogeneeskunde Database op de menselijke onderwerp. Kwantitatieve gegevens synthese werd uitgevoerd voor de verenigingen van miR-146a rs2910164 G /C polymorfisme met gevoeligheid voor maagkanker.
Resultaten
Nine in aanmerking studies dat een totaal van 3885 maagkanker patiënten en 5396 controles opgenomen werden geïdentificeerd in de huidige meta-analyse. De totale OR gaf een mogelijke associatie tussen rs2910164 polymorfisme en GC maar het effect was niet statistisch significant (GG vs. CG /CC: OR = 1,076, 95% CI 0,925-1,251; p = 0,342). Bij stratificatie voor de bevolking, het resultaat bleek dat miR-146a rs2910164 GG genotype was geassocieerd met een verhoogd risico op maagkanker onder Chinese in recessief model (GG vs. CG /CC: OR = 1,171, 95% CI 1,050-1,306, P = 0,005) . Bovendien werd geen significant verschil gevonden in geslacht, roken, locatie, metastase van lymfeklieren en classificatie Lauren.
Conclusies
De huidige meta-analyse suggereert een verhoogd risico tussen miR-146a rs2910164 GG genotype en maagkanker gevoeligheid in Chinese op basis van gepubliceerde literatuur.
Trefwoorden
microRNA-146a Maag nieuwvormingen polymorfisme Meta-analyse Achtergrond
Maagkanker (GC) is nog steeds een van de meest voorkomende oorzaken van kanker-gerelateerde sterfgevallen wereldwijd, ondanks een algemene daling in incidentie in de afgelopen 10 jaar [1], [2]. Algemeen wordt aangenomen dat de individuele genetische gevoeligheid een belangrijke rol bij de pathogenese van tumoren zoals GC.
MicroRNAs (miRNAs /miR) endogeen 18-24 nucleotide coderende RNAs die genexpressie kunnen reguleren en sequentieel regelen verschillende biologische processen [3 ], [4]. Functionele karakterisatie van enkele miRNA bij kanker initiatie en progressie aangeeft dat ze een belangrijke rol spelen in de pathogenese van menselijke kankers [5], [6]. De relatie tussen miRNA en kanker is uitgebreid bestudeerd sinds 2002, de eerste demonstratie van een verband tussen miRNA genen en kanker [7].
Studies hebben aangetoond dat de polymorfismen in de pre-miRNA of volwassen microRNA verschillende biologische processen kunnen wijzigen door het beïnvloeden van de expressie en /of doelwit selectie van microRNA's [8], [9]. In het afgelopen decennium, talrijke studies geïdentificeerd genetische varianten in de voorloper of rijpe miRNA sequentie van miR-146a rs2910164 (G > C), die gemeld werden in verband gebracht met borstkanker en leverkanker [10], [11].
Een aantal studies werden gepubliceerd om de associatie tussen miR-146a rs2910164 G /C polymorfisme en risico op kanker te beschrijven in de afgelopen jaren. Een meta-analyse van Lian et al. [10] geconcludeerd dat de CC homozygote van rs2910164 kan bijdragen aan borstkanker gevoeligheid onder de Europeanen. Een andere meta-analyse toonde aan dat er geen significante correlatie tussen has-miR-146a rs2910164 polymorfisme en het risico op borstkanker [12]. Een enorme meta-analyse 2013 geen enkel significant verband tussen rs2910164 polymorfisme en het risico op borstkanker [13] vinden. Gebaseerd op systematische review, Chen et al. [14] gemeld dat de kwaliteit van het bewijsmateriaal was laag voor rs2910164 SNP genetische associatie met longkanker. Verschillende meta-analyses samengevoegd de associatie tussen rs2910164 polymorfisme en risico op kanker in het algemeen [15], [16]. Sommige meta-analyse meldde de rs2910164 polymorfisme en gastro-intestinale kanker gevoeligheid [17] - [19].
Echter gepubliceerde gegevens over het verband tussen miR-146a rs2910164 G /C polymorfisme en menselijke maagkanker vatbaarheid zijn inconsistent en niet overtuigend. Daarom voerden we de huidige meta-analyse om kwantitatief te schatten de associatie van miR-146a G /C SNP met maagkanker risico.
Methods
Literature zoekstrategie
Digitale bestanden met inbegrip van PubMed, Web of Knowledge en Chinese medische biologie Database (CBM) werden doorzocht voor relevante studies uitgevoerd op de menselijke onderwerp tot juli 2014. De volgende zoektermen werden gebruikt: 'gastric "of" maag "," gezwellen "OR" carcinoma "OR" kanker "of" gezwel "OR" adenocarcinoom "en" miR-146a OR "miRNA-146a" of "microRNA-146a" of "heeft-miR-146a". Om potentieel relevante studies verder te identificeren, werden de literatuurlijsten van de artikelen die in de initiële zoekopdracht ook handmatig gescand. We direct contact opgenomen met auteurs gerelateerde gegevens die beschikbaar zijn in de oorspronkelijke publicaties waren
In- en uitsluiting criteria
Studies werden in aanmerking komen als zij aan alle van de volgende criteria:. (1) onderzoeken het verband tussen miR-146a polymorfisme en human GC risico's, (2) design als case-control studies, (3) de identificatie van maagkanker gevallen werd bevestigd histologisch of pathologisch. Studies werden uitgesloten op basis van een van de volgende redenen: (1) geen voldoende gegevens gemeld, (2) artikelen van brieven, reviews, case reports, conference abstracts, editorials of deskundig advies. Als seriële studies van dezelfde populatie van dezelfde onderzoeksgroep werden gepubliceerd, werden alleen de grootste serie gekozen.
Data-extractie
De laatste reeks artikelen onafhankelijk werd beoordeeld door twee reviewers (Zhong Xu en Lingling Zhang) volgens de inclusiecriteria bovenstaande. Meningsverschillen werden opgelost door discussie. De volgende informatie werd opgehaald uit elk rapport:. Eerste auteur, jaar van uitgave, studiepopulatie, etniciteit, het aantal GC gevallen en controles, de frequentie van genotypes en genotyperingsmethode
Statistische analyse
Hardy-Weinberg evenwicht (HWE) status werd onderzocht door Pearson goodness-of-fit χ
2 test elke studie (P
< 0,05 werd beschouwd als significant onevenwichtigheid in de controlegroep). De sterkte van de associatie tussen GC en miR-146a rs2910164 polymorfisme werd bepaald door het berekenen van odds ratio (OR) met 95% betrouwbaarheidsinterval (CI). De gepoolde OR's werden uit combinatie van enkele studies verkregen door homozygote vergelijking (GG vs. CC), heterozygoot vergelijking (CG vs. CC), dominante en recessieve modellen (CG /GG versus CC en GG vs. CG /CC), allel vergelijking (G vs. C), respectievelijk. De analyse van heterogeniteit tussen de studies werd bepaald met behulp van de Cochrane de Q-test en ik
2-toets (P Restaurant < 0,10 of ik
2 > 50% werd beschouwd als een indicatie van statistisch heterogeniteit) [20]. Toen was er geen significante heterogeniteit bestaande tussen studies, werd de gepoolde OR's schatting van elke studie berekend door de vaste effecten model. Anders was de random-effects model toegepast. Subgroep analyses werden gestratificeerd door de studie karakteristieke als er genoeg verslagen waren. Gevoeligheidsanalyse is uitgevoerd door het verwijderen van een enkele studie telkens de invloed van die op de gepoolde UPR individuele gegevens onderzoeken uitgevoerd. Publicatiebias werd beoordeeld met behulp van de methoden van Begg's trechter plots en test Egger's (P Restaurant < 0,05 werd beschouwd als vertegenwoordiger van statistisch significant publicatie bias) [21], [22]. Statistische analyses uitgevoerd met behulp van de software Stata12.0 (Stata Corpotion, College Station, Texas).
Resultaten
Studies selectie en de kenmerken van de opgenomen studies
Een totaal van 288 artikels werden geïdentificeerd uit de PubMed, ISI en CBM database. Het stroomdiagram overzicht van de literatuur werkwijze zoals getoond in figuur 1. In totaal werden negen onderzoeken met 3885 GC gevallen en 5396 controles werden uiteindelijk samengevoegd voor de huidige meta-analyse [23] - [31]. De kenmerken van deze studies zijn vermeld in tabel 1. Onder hen werden zeven studies uitgevoerd in Azië (met inbegrip van patiënten uit China, Japan en Korea), twee studies in Europa (met inbegrip van patiënten uit Griekenland, Duitsland, Litouwen en Letland). Artikel door Okubo et al. [32] uitgesloten vanwege de overlapping met andere studie [23]. Alle opgenomen artikelen waren ziekenhuis op basis van case-control studies. De verdeling van de genotypes bij de controles van alle negen studies was in overeenstemming met HWE. Figuur 1 Stroomdiagram van Studies in- en uitsluiting.
Tabel 1 Kenmerken van de studies opgenomen in de meta-analyse
Eerste auteur
Jaar
Locatie
genotyperingsmethode
No. van de gevallen
No. van de controles
Cases
Controls
PHWEfor control
CC
CG
GG
CC
CG
GG
Okubo
2010
Japan
PCR-RFLP
552
697
236
243
73
254
322
121
0.2776
Zeng
2010
China
PCR-RFLP
304
304
89
153
62
119
132
53
0.1223
Hishida
2011
Japan
PCR-CTPP
583
1637
230
271
82
633
775
229
0.7381
Zhou F
2012
China TaqMan MGB
1686
1895
286
822
578
393
951
551
0,6407
Zhou Y
2012
China Locus-specifieke PCR
299
416
107
146
46
127
215
74
0.301
Ahn
2013
Korea
PCR-RFLP
461
447
159
231
71
164
221
62
0.3618
Dikeakos
2014
Greece
PCR-RFLP
163
480
105
45
13
307
149
24
0.2892
Kupcinskas
2014
Europe
Real Time-PCR
362
347
16
94
252
16
108
223
0.5311
Pu
2014
China
PCR-RFLP
197
513
65
96
36
143
274
96
0.0801
Kwantitatieve gegevens synthese
De samenvatting van de meta-analyse van het verband tussen miR-146a rs2910164 G /C polymorfisme en de gevoeligheid van maagkanker worden getoond in Tabel 2. Over het algemeen was er geen significante associatie tussen genotype verdeling maagkanker en controle door het combineren van de negen studies. De random-effects model werd gebruikt om deze resultaten te bundelen als statistisch heterogeniteit werd waargenomen tussen studies (P
Q-Test < 0,1, ik
2 > 50%). De gepoolde OR ramingen van de meta-analyses waren vaak groter dan 1,00, wat wijst op een mogelijke associatie van rs2910164 polymorfisme en GC hoewel dit effect niet statistisch significant. Voor recessief model, als P
Q-Test < 0,1 door heterogeniteit analyse, ook de random-effects model werd gebruikt voor de analyse. Zoals getoond in Figuur 2, was er geen statistisch verhoogd risico op maagkanker bij recessieve modellen bij gepoolde negen studies (recessief model, GG versus CG /CC: OR = 1,076, 95% CI 0,925-1,251; p = 0,342). tabel 2 Meta-analyse van miR-146a rs2910164 polymorfisme met maagkanker door de bevolking
bevolking
Vergelijking
No. studie
Test van vereniging
Test van heterogeniteit
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
ik verhuur 2
Aziatische
GG versus CC
7
1,016 (0,780, 1,324)
0,906
0.000
75,2%
CG vs. CC
0,998 (0,847, 1,176)
0,982
0,014
62,2%
CG /GG versus CC
1.005 (0,830, 1,216)
0,962
0,001
75,1%
GG vs. CG /CC
1,025 (0,861, 1,221)
0,779
0,036
55,6%
G vs C
1,006 (0,877, 1,153)
0,935
0.000
78,7%
Europese
GG versus CC 2
1,331 (0,802, 2.210)
0,269
0,512
0,0%
CG vs. CC
0,880 (0,619, 1,253)
0,478
0,973
0,0%
CG /GG vs. CC
0,994 (0,716, 1,380)
0,971
0,875
0,0%
GG vs. CG /CC
1,326 (0,995, 1,767)
0,054
0,512
0,0%
G vs C
1,146 (0,937, 1,401)
0,184
0,608
0,0%
Overall
GG versus CC
9
1,056 (0,836, 1,334)
0,649
0,001
68,1%
CG vs. CC
0,984 (0,853, 1,136)
0.830
0,037
51.3 %
CG /GG versus CC
1,005 (0,852, 1,184)
0,956
0,002
66,9%
GG vs. CG /CC
1,076 (0,925, 1,251)
0,342
0,052
48,0%
G vs C
1,028 (0,914, 1,155)
0,648
0.000
72,5%
Figuur 2 Meta-analyse van miR-146a rs2910164 polymorfisme en maagkanker vatbaarheid voor recessief model (GG vs. CG + CC).
Zoals getoond in tabel 3 en figuur 3, wanneer we subgroepanalyse op locatie, het gecombineerde resultaat toonde dat miR-146a rs2910164 GG genotype was geassocieerd met een verhoogd risico op maagkanker in China recessieve model (GG CG vs. /CC: OR = 1,193, 95% CI 1,057-1,346, P = 0,004). Bovendien werden de interacties tussen miR-146a polymorfisme en klinisch-tekens ook uitgevoerd als bruikbare gegevens verkregen. Geen significant verband tussen miR-146a genetische variant en maag risico op kanker werden gevonden in de gestratificeerde analyse naar geslacht, roken, locatie, metastase van lymfeklieren en classificatie Lauren (tabel 4) .table 3 Meta-analyse van miR-146a rs2910164 polymorfisme met maagkanker in het Chinees
Vergelijking
Test van vereniging
Test van heterogeniteit
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
I
2
GG versus CC
1,113 (0,773, 1,604)
0,564
0,011
73,1%
CG vs. CC
1,045 (0,783, 1,394)
0,766
0,012
72,8%
CG /GG versus CC
1,065 (0,779 , 1,457)
0,692
0,002
79,4%
GG vs. CG /CC
1.193 (1.057, 1.346)
0,004
0,201
35,1%
G vs C
1,055 (0,868, 1,283)
0.590
0,004
77,8%
Figuur 3 Meta-analyse van miR-146a rs2910164 polymorfisme en maagkanker gevoeligheid in het Chinees voor recessieve model ( GG vs. CG + CC).
Tabel 4 Meta-analyse van rs2910164 polymorfisme met GC door clinicopathologische tekens
Parameters
Vergelijking
No. studie
Test van vereniging
Test van heterogeniteit
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
I
2
Geslacht
CC versus GG /CG
4
0,916 (0,691, 1,215)
0,542
0,201
37,7%
(Man versus Vrouw)
CC /CG versus GG verhuur 4
0,939 (0,767, 1,148)
0,538
0,967
0,0%
Roken (No vs. Ja)
CC vs. CG /GG 2
0,843 (0,554, 1,282)
0.425
0,315
0,9%
Site (cardiale versus niet-cardiale)
CC vs. CG /GG
4
0,844 (0,593, 1,201)
0,346
0.382
0,0%
CC /CG versus GG verhuur 4
0,897 (0,738, 1,090)
0,274
0,549
0,0%
metastase van lymfeklier (negatief versus positief)
CC vs. CG /GG 2
1,211 (0,842, 1,742)
0.302
0,589
0,0%
Lauren classificatie (Intestinal vs. Diffuse)
CC /CG vs. GG
4
0,961 (0,807, 1,145)
0,658
0,655
0,0%
sensitiviteitsanalyse en publicatie vooringenomenheid
We maken gebruik van one-way gevoeligheidsanalyse om de stabiliteit van het resultaat te evalueren in China [33]. Bij recessieve model, de gevoeligheidsanalyse van gepoolde OR met 95% CI veranderd van 1,193 (1,057, 1,346) tot 0,995 (0,786, 1,260) voor het overslaan van één studie door Zhou F [26] (figuur 4). De bijbehorende gepoolde OR is niet wezenlijk veranderd in andere genetische modellen. Figuur 4 De invloed van elk onderzoek door het weglaten van individuele studies in China voor recessief model.
Begg's funnel plot (Figuur 5) en test Egger's (Figuur 6) gaf aan geen potentieel publicatie vertekening (P
= 1,000 en 0,355, respectievelijk). De trechter percelen vertoonde enige asymmetrie, wat waarschijnlijk te wijten aan het beperkte aantal studies. Figuur 5 Begg's trechter plot met pseudo 95% betrouwbaarheidsgrenzen.
Figuur 6 Egger's publicatie vooringenomenheid plot.
Discussie
MiR-146a is aangetoond dat het een belangrijke rol bij celproliferatie, differentiatie, apoptose en tumorigenese [34] spelen - [37]. Studie van Jażdżewski et al. [38] in 2008 heeft gesuggereerd dat rs2910164, een gemeenschappelijk polymorfisme in het pre-miR-146a sequentie, kunnen volwassen miR-146a expressie veranderen en een rol spelen in het ontstaan van tumoren. In de afgelopen drie jaar, een aantal meta-analyses en beoordeling samengevoegd de associatie tussen rs2910164 G > C polymorfisme en het risico op kanker waaronder gastrointestinale tumoren grotendeels [15] - [19], [39] - [43]. Negen van hen hebben de associatie tussen rs2910164 polymorfisme en maag risico op kanker geëvalueerd. Met dezelfde resultaten, allemaal gesloten geen significant verband tussen rs2910164 polymorfisme en maagkanker.
Toch waarom we deze meta-analyse van de miR-146a polymorfisme bij maagkanker gevoeligheid uitgevoerd? Ten eerste, zoals getoond in Tabel 5, werden de opgenomen studies beperkt al deze meta-analysen met betrekking maagkanker. Allen sloot de studie door Zhou Y et al. [27] bij ontstentenis gegevens in het artikel. Onder hen, meta-analyse van Xu X et al. [19] Inclusief zes onderzoeken [23] - [26], [28], [44] om de associatie tussen rs2910164 polymorfisme en maag risico op kanker te evalueren. Een van de zes opgenomen artikelen rs2910164 polymorfisme gedetecteerd van gastritis [44], niet maagkanker. Dan geen van de negen meta-analyses evalueerde de miR-146a rs2910164 G > C polymorfisme en maagkanker gevoeligheid in de details. Bovendien is het algemeen dat slokdarmkanker, leverkanker, maagkanker, baarmoederhalskanker en andere maligniteiten hebben ook verschillende moleculaire mechanismen en logisch ze lijken niet een gemeenschappelijk polymorfisme als risicofactor haven. Evenzo, slokdarmkanker, maagkanker en darmkanker niet altijd consistent met elkaar gevonden. Last but not least, is een update nodig om de associatie tussen rs2910164 G >evalueren; C polymorfisme en maag risico op kanker. Daarom proberen we een meer nauwkeurige evaluatie van de associatie tussen rs2910164 polymorfisme en maag risk.Table 5 meta-analyses van rs2910164 polymorfisme en risico op kanker (informatie over GC)
Eerste auteur
Jaar
Inclusief studie over maagkanker
[[24]]
[[25]]
[[26]]
[[28]]
[[23]]
[[44]]
Srivastava [15]
2012 | √
√
√
√
Wang J [16]
2012 | √
√
√
Wang F [17]
2012 | √
√
√
Wu [18]
2013 | √
√
√
Xu X [19]
2014
√
√
√
√
√
√
Qiu [40]
2011
√
√
√
Hij [41]
2012 | √
√
√
√
Xu Y [42]
2013 | √
√
√
√
Yin [43]
2013 | √
√
√
√
Gericht op rs2910164 SNP en maagkanker, de huidige meta-analyse toonde aan dat de miR-146a GG genotype was geassocieerd met verhoogd risico op maagkanker in China subgroep in recessief model (gepoolde OR = 1,193). Er waren geen significante verschillen in geslacht, roken, locatie, metastase van lymfeklieren en classificatie Lauren over genotypes.
Van de negen studies opgenomen, studies van Zeng et al. [24] en F Zhou et al. [26] beschrijven distributie van genotype bij maagkanker door leeftijd. De voormalige aangetoond dat rs2910164 GC /GG genotype hadden een verhoogd risico op maagkanker vooral bij jongere personen van (≤58 jaar), de later bleek dat GG genotype verhoogd risico op kanker maag was duidelijker bij jongere proefpersonen (≤65 jaar). Zhou Y et al. [27] had geen differennt distributie bij maagkanker tussen verschillende grootte van de tumor niet vinden (< 5 cm versus ≥5 cm). Bovendien, Zeng et al. [24] gemeld geen statistisch significant verband in de variant genotypes met tumor differentiatie. Bijna alle opgenomen studies werden uitgevoerd in Azië met uitzondering van twee studies waren in Europa. De studie van KUPČINSKAS et al. in [30] Europa geanalyseerd gen polymorfismen van miR-146a in 995 onderwerpen, waaronder Duitsland, Letland en Litouwen. Data-analyse toonde aan dat gen polymorfismen van miR-146a niet worden geassocieerd met het risico van GC in Europa. Trouwens, geen verschil tussen diffuse en intestinale-type maagkanker groepen werd gevonden. Ondernemingen De resultaten moeten worden geïnterpreteerd zorgvuldigheid vanwege een aantal beperkingen. Ten eerste kan het beperkte aantal patiënten invloed hebben de uitkomsten. Hoewel we uitgebreid literatuuronderzoek uitgevoerd vanuit meerdere databases met geen beperking in de publicatie talen, data, etnische groepen en andere factoren, waren er slechts een totaal van negen studies met 3885 maagkanker gevallen en 5396 controles voor de huidige meta-analyse. De totale OR gaf een mogelijke associatie tussen rs2910164 polymorfisme en GC maar het effect was niet statistisch significant. Het is nog steeds moeilijk om een stevige conclusie over de juistheid van de associatie tussen miR-146a rs2910164 G >maken; C polymorfisme en maagkanker gevoeligheid. Daarbij maken we one-way gevoeligheidsanalyse om de stabiliteit van de meta-analyse en het resultaat gewijzigd wanneer het weglaten van de studie met de grootste monsters te evalueren. Ten derde, op slechts een paar opgenomen onderzoeken gerapporteerde gegevens van interacties tussen miR-146a polymorfisme en clinicopathologische personages bij maagkanker, en al van de samengevoegde analyse van interacties werd beperkt door de kleine steekproef en het tekort van de gegevens.
Conclusie
In Kortom, de huidige meta-analyse suggereert een verhoogd risico tussen miR-146a rs2910164 GG genotype en maagkanker gevoeligheid in het Chinees op basis van gepubliceerde literatuur. Verdere studies op grote schaal kan nodig zijn om de genetische gevoeligheid van miR-146a rs2910164 bij maagkanker te bevestigen.
Verklaringen
Dankwoord Inloggen Deze paper werd ondersteund door de fondsen van Guizhou provinciale ministerie van Wetenschap en Technologie, No.qiankehe-J-2012-2240.
Wij danken Master Yuan Zhou te bieden voor de bijbehorende originele data.
Authors 'originele ingediende dossiers voor afbeeldingen
Hieronder staan de links naar de auteurs oorspronkelijke ingediende dossiers voor afbeeldingen. 'Originele bestand voor figuur 1 12881_2014_117_MOESM2_ESM.gif Authors' 12881_2014_117_MOESM1_ESM.gif Auteurs originele bestand voor 'originele bestand voor figuur 3 12881_2014_117_MOESM4_ESM.gif Authors' figuur 2 12881_2014_117_MOESM3_ESM.gif Auteurs originele bestand voor figuur 4 originele bestand 12881_2014_117_MOESM5_ESM.gif Authors 'voor figuur 5 oorspronkelijke bestand 12881_2014_117_MOESM6_ESM.gif Authors 'voor figuur 6 concurrerende belangen Ondernemingen De auteurs verklaren dat ze geen concurrerende belangen.