Mir-146A rs2910164 G /C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico: una meta-analisi

Mir-146A rs2910164 G /C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico: una meta-analisi
Abstract
sfondo
La prova ha dimostrato che polimorfismo a singolo nucleotide trova in pre-miRNA o Maturi microRNA può modificare vari processi biologici e influenza trasformazione di carcinogenesi. risultati pubblicati circa l'associazione tra miR-146a rs2910164 G /C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico umano sono inconcludenti. Lo scopo di questo studio è stato quello di acquisire un effetto più precisa l'associazione tra il polimorfismo del miR-146a rs2910164 e il rischio gastrica da meta-analisi.
Metodi
studi di associazione genetica ammissibili sono stati cercati da PubMed, Web of Knowledge e Database cinese biomedicina sul soggetto umano. sintesi dei dati quantitativi è stato condotto per le associazioni di miR-146a rs2910164 G /C polimorfismo con suscettibilità al cancro gastrico.
Risultati
nove studi ammissibili che hanno incluso un totale di 3.885 pazienti affetti da cancro gastrico e 5.396 controlli sono stati identificati nel presente meta-analisi. Il generale o indicati una potenziale associazione tra il polimorfismo rs2910164 e GC, ma l'effetto non era statisticamente significativa (GG contro CG /CC: OR = 1.076, 95% CI 0,925-1,251, p = 0,342). Quando stratificazione per la popolazione, il risultato ha mostrato che miR-146a rs2910164 GG genotipo era associata ad un aumento del rischio di cancro gastrico tra i cinesi nel modello recessivo (GG contro CG /CC: OR = 1.171, 95% CI 1,050-1,306, p = 0,005) . Inoltre, nessuna differenza significativa è stata trovata in genere, il fumo, l'ubicazione, le metastasi dei linfonodi e la classificazione di Lauren.
Conclusioni
Il presente meta-analisi suggerisce un aumento del rischio tra miR-146a rs2910164 GG genotipo e suscettibilità al cancro gastrico in cinese basata sulla letteratura pubblicata.
Parole
microRNA-146 bis stomaco neoplasie polimorfismo meta-analisi di sfondo
cancro gastrico (GC) è ancora una delle più comuni cause di morte per cancro in tutto il mondo, nonostante una diminuzione complessiva incidenza negli ultimi 10 anni [1], [2]. E 'generalmente accettato che individuo suscettibilità genetica ha un ruolo importante nella patogenesi di tumori tra cui GC.
MicroRNA (miRNA /MIR) sono endogeni 18-24 nucleotidi RNA non codificanti che potrebbe regolare l'espressione genica e sequenzialmente regolano vari processi biologici [3 ], [4]. Caratterizzazione funzionale di alcuni microRNA nel iniziazione e progressione del cancro indica che possono svolgere un ruolo più importante nella patogenesi dei tumori umani [5], [6]. Il rapporto tra miRNA e cancro è stato ampiamente studiato dal 2002, la prima dimostrazione di un legame tra i geni miRNA e il cancro [7].
Gli studi hanno dimostrato che i polimorfismi in pre-miRNA o Maturi microRNA possono modificare vari processi biologici da influenzando la selezione espressione e /o target microRNA [8], [9]. Negli ultimi dieci anni, numerosi studi identificati varianti genetiche nel precursore o maturano sequenza di miRNA di rs2910164 miR-146 bis (G > C), che sono stati segnalati per essere associato con il cancro al seno e il carcinoma epatocellulare [10], [11].
Un certo numero di studi sono stati pubblicati per descrivere l'associazione tra miR-146a rs2910164 G /C polimorfismo e rischio di cancro negli ultimi anni. Una meta-analisi riportata da Lian et al. [10] ha concluso che l'omozigote CC di rs2910164 può contribuire al cancro al seno suscettibilità tra gli europei. Un'altra meta-analisi ha dimostrato che non vi è alcuna correlazione significativa tra ha-miR-146a rs2910164 polimorfismo e rischio di cancro al seno [12]. Un enorme meta-analisi nel 2013 non è riuscito a trovare alcuna significativa associazione tra il polimorfismo rs2910164 e il rischio di cancro al seno [13]. Sulla base di una revisione sistematica, Chen et al. [14] hanno riportato che la qualità della prova era basso per rs2910164 SNP associazione genetica con il cancro ai polmoni. Diverse meta-analisi raggruppati l'associazione tra il polimorfismo rs2910164 e rischio di cancro in generale [15], [16]. Alcune meta-analisi ha riportato polimorfismo rs2910164 e suscettibilità al cancro gastrointestinale [17] - [19].
Tuttavia, i dati pubblicati sull'associazione tra miR-146a rs2910164 G /C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico umano sono incoerenti e inconcludenti. Pertanto, abbiamo eseguito la presente meta-analisi per stimare quantitativamente l'associazione di miR-146a G /C SNP con rischi di cancro gastrico.
Metodi
Literature strategia di ricerca
database elettronici tra cui PubMed, Web of Knowledge e cinese biomedicina Database (CBM) sono stati cercato studi rilevanti condotti su soggetti umani fino a luglio 2014. Le parole chiave di ricerca sono stati utilizzati: 'gastrica "o' stomaco '," neoplasia "o" carcinoma "o" cancro "o" tumore "o" adenocarcinoma "e" miR-146a o "miRNA-146A" OR "microRNA-146A" O "ha-miR-146a". Per identificare ulteriori studi potenzialmente rilevanti, le liste di riferimento di articoli individuati nella ricerca iniziale sono stati anche sottoposti a scansione manualmente. Abbiamo contattato direttamente gli autori di dati correlati che non erano disponibili nelle pubblicazioni originali
I criteri di inclusione ed esclusione
Gli studi sono stati considerati ammissibili se hanno incontrato tutti i seguenti criteri:. (1) esplorare l'associazione tra miR-146a polimorfismo e rischio GC umano, (2) design come studi caso-controllo, (3) l'individuazione dei casi di cancro gastrico è stata confermata istologicamente o patologicamente. Gli studi sono stati esclusi sulla base di uno dei seguenti motivi: (1) non ci sono dati sufficienti segnalati, (2) articoli di lettere, recensioni, casi clinici, abstract conferenze, editoriali o perizia. Se sono stati pubblicati studi seriali della stessa popolazione dallo stesso gruppo di ricerca, sono stati selezionati solo la più grande serie.
Estrazione dei dati
L'ultima serie di articoli è stata valutata in modo indipendente da due revisori (Zhong Xu e Zhang Lingling) secondo i criteri di inclusione elencati sopra. I disaccordi sono stati risolti con la discussione. Le seguenti informazioni è stato recuperato da ogni report:. Primo autore, anno di pubblicazione, studio di popolazione, etnia, numero di casi GC e controlli, la frequenza di genotipi, e il metodo di genotipizzazione Analisi statistica
Hardy-Weinberg (HWE) lo stato è stata esaminata da Pearson di bontà di adattamento χ 2 prova in ciascuno studio (P
< 0.05 è stato considerato significativo squilibrio nel gruppo di controllo). La forza dell'associazione tra GC e il miR-146a rs2910164 il polimorfismo è stata valutata calcolando odds ratio (OR) con intervallo di confidenza del 95% (CI). Gli OR pool sono stati ottenuti da combinazione di singoli studi in confronto omozigote (GG contro CC), confronto eterozigote (CG vs. CC), dominante e modelli recessivi (CG /GG contro CC, e GG contro CG /CC), confronto allele (G vs C), rispettivamente. L'analisi di eterogeneità tra gli studi è stato determinato utilizzando il test Q del Cochrane e ho
2-test (P
< 0,10 o io
2 > il 50% è stato considerato indicativo di l'eterogeneità statisticamente) [20]. Quando non vi era alcuna significativa eterogeneità esistente tra gli studi, l'OR stima aggregata di ciascuno studio è stato calcolato il modello a effetti fissi. In caso contrario, il modello a effetti casuali è stato impiegato. analisi dei sottogruppi sono stati stratificati per la caratteristica di studio se non ci fossero abbastanza rapporti. L'analisi di sensitività è stata condotta eliminando un singolo studio di volta in volta per esaminare l'influenza dei dati individuali impostati le RUP pool. bias di pubblicazione è stata valutata utilizzando i metodi di trame imbuto di Begg e il test di Egger (P
< 0,05 è stato considerato rappresentativo statisticamente significativo bias di pubblicazione) [21], [22]. Analisi statistiche eseguite utilizzando Stata12.0 software (Stata Corpotion, College Station, Texas).
Risultati
selezione e le caratteristiche degli studi inclusi Studi
un totale di 288 articoli sono stati identificati dalla PubMed, ISI e il database CBM. Il diagramma di flusso sintetizza il processo di revisione della letteratura, come mostrato in Figura 1. Un totale di nove studi che hanno coinvolto 3.885 casi GC e 5.396 controlli sono stati in ultima analisi aggregate per il presente meta-analisi [23] - [31]. Le caratteristiche di questi studi sono elencati nella tabella 1. Tra questi, sette studi sono stati condotti in Asia (compresi i pazienti provenienti da Cina, Giappone e Corea), due studi in Europa (compresi i pazienti provenienti da Grecia, Germania, Lituania e Lettonia). Articolo di Okubo et al. [32] è stata esclusa a causa della sovrapposizione con un altro studio [23]. Tutti gli articoli inclusi erano studi caso-controllo ospedaliero-based. La distribuzione dei genotipi nei controlli di tutti i nove studi era in accordo con HWE. Figura 1 Diagramma di flusso di Studi inclusione ed esclusione.
Tabella 1 Caratteristiche degli studi inclusi nella meta-analisi
primo autore
Anno
Località
metodo genotipizzazione
No. dei casi
No. di controlli

casi
Controls
PHWEfor control

CC

CG

GG

CC

CG

GG

Okubo
2010
Japan
PCR-RFLP
552
697
236
243
73
254
322
121
0.2776
Zeng
2010
China
PCR-RFLP
304
304
89
153
62
119
132
53
0.1223
Hishida
2011
Japan
PCR-CTPP
583
1637
230
271
82
633
775
229
0.7381
Zhou F
2012 Porcellana
TaqMan MGB
1686
1895
286
822
578
393
951
551
0,6407
Zhou Y
2012 Porcellana
Locus specifico PCR
299
416
107
146
46
127
215
74
0.301
Ahn
2013
Korea
PCR-RFLP
461
447
159
231
71
164
221
62
0.3618
Dikeakos
2014
Greece
PCR-RFLP
163
480
105
45
13
307
149
24
0.2892
Kupcinskas
2014
Europe
Real Time-PCR
362
347
16
94
252
16
108
223
0.5311
Pu
2014
China
PCR-RFLP
197
513
65
96
36
143
274
96
0.0801
Quantitative sintesi dei dati
La sintesi di questa meta-analisi per l'associazione tra miR-146a rs2910164 G /C polimorfismo e la suscettibilità del cancro gastrico sono stati mostrati in tabella 2. In generale, non vi era alcuna associazione significativa nella distribuzione del genotipo tra cancro gastrico e controllo combinando i nove studi. Il modello a effetti casuali è stato utilizzato per unire questi risultati, come è stato osservato eterogeneità tra gli studi statisticamente (P
Q-test < 0.1, ho
2 > 50%). Il pool o stime dei meta-analisi erano spesso maggiore di 1,00, indicando una potenziale associazione tra il polimorfismo rs2910164 e GC, anche se questo effetto non era statisticamente significativa. Per il modello recessivo, come P
Q-test < 0,1 dall'analisi eterogeneità, anche il modello a effetti casuali è stato utilizzato per l'analisi. Come illustrato nella figura 2, non vi era alcuna statisticamente aumento del rischio di cancro gastrico nel modello recessivo quando in pool i nove studi (modello recessivo, GG contro CG /CC: OR = 1.076, 95% CI 0,925-1,251, p = 0,342). Tabella 2 meta-analisi di miR-146a rs2910164 polimorfismo con cancro gastrico per popolazione
popolazione
Confronto
No. di studio
test di associazione
test di eterogeneità
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
I Pagina 2
asiatico
GG vs CC 7
1.016 (0.780, 1.324)
0,906
0.000
75,2%
CG vs CC
0.998 (0.847, 1.176)
0.982
0,014
62,2%
CG /GG contro CC
1.005 (0.830, 1.216)
0,962 0,001

75,1%
GG contro CG /CC
1,025 (0,861, 1,221)
0,779 0,036

55,6%
G vs C
1.006 (0.877, 1.153)
0.935
0.000
78,7%
europea
GG vs. CC 2
1.331 (0,802, 2.210)
0.269
0.512
0,0%
CG vs CC
0.880 (0.619, 1.253)
0.478
0,973
0,0%
CG /GG vs CC
0,994 (0,716, 1,380)
0,971 0,875

0,0%
GG contro CG /CC
1.326 (0.995, 1.767)
0,054
0.512
0,0%
G vs C
1.146 (0,937, 1,401)
0.184
0,608
0,0%
generale
GG vs CC
9
1.056 (0.836, 1.334)
0,649 0,001

68,1%
CG vs CC
0,984 (0,853, 1,136)
0.830
0.037
51,3 %
CG /GG contro CC
1.005 (0.852, 1.184)
0,956 0,002

66,9%
GG contro CG /CC
1.076 (0.925, 1.251)
0,342
0.052
48,0%
G vs C
1.028 (0.914, 1.155)
0,648
0.000
72,5%
Figura 2 meta-analisi di miR-146a rs2910164 polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico per il modello recessivo (GG vs. CG + CC).
Tuttavia, come indicato nella Tabella 3 e Figura 3, quando abbiamo effettuato analisi dei sottogruppi per posizione, il risultato combinato hanno dimostrato che miR-146a rs2910164 GG genotipo era associata ad un aumentato rischio di cancro gastrico in Cina per il modello recessivo (GG contro CG /CC: OR = 1.193, 95% CI 1,057-1,346, p = 0,004). Inoltre, le interazioni tra miR-146a polimorfismo e personaggi clinico-patologici sono state condotte anche quando i dati utilizzabili ottenuti. No significativa associazione tra miR-146a variante genetica e il rischio di cancro gastrico sono stati trovati nella analisi stratificata per sesso, il fumo, l'ubicazione, le metastasi dei linfonodi e la classificazione di Lauren (Tabella 4) .table 3 meta-analisi di miR-146a rs2910164 il polimorfismo con cancro gastrico in Cinese
confronto
test di associazione
test di eterogeneità
OR (95% CI)
P


P
(Q-test)
I
2
GG vs CC
1.113 (0,773, 1,604)
0,564
0,011
73,1%
CG vs CC
1.045 (0,783, 1,394)
0.766
0,012
72,8%
CG /GG contro CC
1.065 (0,779 , 1.457)
0,692 0,002

79,4%
GG contro CG /CC
1.193 (1.057, 1.346)
0,004 0,201

35,1%
G vs C
1.055 (0.868, 1.283)
0.590
0,004
77,8%
Figura 3 meta-analisi di miR-146a rs2910164 polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico in cinese per il modello recessivo ( GG contro CG + CC).
Tabella 4 Meta-analisi dei polimorfismi rs2910164 con GC da personaggi clinico-patologiche
Parametri
Confronto
No. di studio
test di associazione
test di eterogeneità
OR (95% CI)
P
P
(Q-test)
I
2
genere
CC vs GG /CG 4
0,916 (0,691, 1,215)
0,542 0,201

37,7%
(Uomo vs Donna)
CC /CG vs GG 4
0,939 (0,767, 1,148)
0.538
0,967
0,0%
fumare (No vs. Si)
CC vs CG /GG 2
0,843 (0.554, 1.282)
0,425 0,315

0,9%
sito (cardic vs. non cardic)
CC vs CG /GG 4
0,844 (0,593, 1.201)
0,346
0.382
0,0%
CC /CG vs GG 4
0,897 (0.738, 1.090)
0,274 0,549

0,0%
Metastasi dei linfonodi (negativo vs. positivo)
CC vs. CG /GG 2
1.211 (0,842, 1,742)
0,302 0,589

0,0%
classificazione di Lauren (intestinale vs. Diffuse)
CC /CG vs GG
4
0,961 (0,807, 1,145)
0,658 0,655

0,0%
l'analisi di sensibilità e di bias di pubblicazione
usiamo unidirezionale analisi di sensibilità per valutare la stabilità del risultato in Cina [33]. Nel modello recessivo, l'analisi di sensitività del pool O con il 95% CI cambiato da 1.193 (1.057, 1.346) a 0,995 (0,786, 1,260) quando omettendo uno studio di Zhou F [26] (Figura 4). Il corrispondente pool o non era materialmente alterato in altri modelli genetici. Figura 4 L'influenza di ciascuno studio per omissione di singoli studi in Cina per il modello recessivo. imbuto trama
di Begg (Figura 5) e il test di Egger (Figura 6) hanno indicato alcun potenziale bias di pubblicazione (P = 1.000
e 0,355, rispettivamente). Le trame imbuto mostrato una certa asimmetria, che è probabilmente a causa del numero limitato di studi. Figura 5 plot imbuto di Begg con pseudo 95% limiti di confidenza.
Figura 6 trama bias di pubblicazione di Egger.
Discussione
miR-146a ha dimostrato di giocare un ruolo importante nella proliferazione cellulare, differenziamento, l'apoptosi e tumorigenesi [34] - [37]. Studio di Jazdzewski et al. [38] nel 2008 ha suggerito che rs2910164, un comune polimorfismo nella sequenza pre-miR-146a, potrebbe alterare matura espressione del miR-146a e giocare un ruolo nella tumorigenesi. Negli ultimi tre anni, una serie di meta-analisi e revisione riunito l'associazione tra rs2910164 G > C polimorfismo e rischio di cancro tra cui tumori gastrointestinali ampiamente [15] - [19], [39] - [43]. Nove di loro hanno valutato l'associazione tra il polimorfismo rs2910164 e rischio di cancro gastrico. Con lo stesso risultato, tutti loro hanno concluso alcuna significativa associazione tra il polimorfismo rs2910164 e cancro gastrico.
Still perché abbiamo eseguito questa meta-analisi riguardante il polimorfismo di miR-146a in gastrica suscettibilità al cancro? In primo luogo, come mostrato nella tabella 5, gli studi inclusi sono stati limitati in tutti questi meta-analisi riguardo cancro gastrico. Tutti esclusi studio di Zhou Y et al. [27] a causa dei dati assenza in questo articolo. Tra questi, meta-analisi di Xu X et al. [19] comprendeva sei ricerche [23] - [26], [28], [44] per valutare l'associazione tra il polimorfismo rs2910164 e rischio di cancro gastrico. Tuttavia, uno dei sei articoli inclusi rilevato polimorfismo rs2910164 di gastrite [44], non il cancro gastrico. Poi, nessuno dei nove meta-analisi ha valutato l'rs2910164 miR-146a G > C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico nei dettagli. Inoltre, è in generale che il cancro esofageo, cancro al fegato, cancro gastrico, il cancro del collo dell'utero e di altri tumori maligni hanno meccanismi molecolari troppo distinte e logicamente non sembrano nutrire un comune polimorfismo come un fattore di rischio. Allo stesso modo, il cancro esofageo, cancro gastrico e il cancro colorettale non sono sempre coerenti tra loro in questo termine. Ultimo ma non meno importante, è necessario un aggiornamento per valutare l'associazione tra rs2910164 G > C polimorfismo e rischio di cancro gastrico. Pertanto, cerchiamo di acquisire una valutazione più precisa della associazione tra il polimorfismo rs2910164 e risk.Table gastrica 5 meta-analisi di rs2910164 polimorfismo e rischio di cancro (informazioni su GC)
Il primo autore
Anno

Incluso studio su cancro gastrico
[[24]]
[[25]]
[[26]]

[[28]]
[[23]]
[[44]]
Srivastava [15]
2012
√
√ √

√
Wang J [16]
2012
√ √

√
Wang F [17]
2012
√ √

√
Wu [18]
2013
√ √

√
Xu X [19]
2014
√
√ √

√ √

√
Qiu [40]
2011
√ √

√
Egli [41]
2012
√ √

√ √

Xu Y [42]
2013
√ √

√ √

Yin [43]
2013
√ √

√ √

Incentrato sulla rs2910164 SNP e cancro gastrico, il presente meta-analisi ha mostrato che il genotipo miR-146a GG è stato associato con aumento del rischio di cancro gastrico in Cina sottogruppo nel modello recessivo (pooled OR = 1.193). Non ci sono state differenze significative in genere, il fumo, l'ubicazione, le metastasi dei linfonodi e la classificazione di Lauren attraverso genotipi.
Dei nove studi inclusi, studi di Zeng et al. [24] e Zhou F et al. [26] descrivono la distribuzione del genotipo in cancro gastrico per età. L'ex dimostrato che rs2910164 GC /GG genotipo ha avuto un aumento del rischio di cancro gastrico in particolare negli individui più giovani di età compresa tra (≤58 anni), il più tardi ha dimostrato che il genotipo GG aumento del rischio di cancro gastrico è stato più evidente nei soggetti più giovani (≤65 anni). Zhou Y et al. [27] non ha trovato alcuna distribuzione differennt nel carcinoma gastrico tra diverse dimensioni del tumore (< 5 cm rispetto ≥5 cm). Inoltre, Zeng et al. [24] hanno riportato alcuna associazione statisticamente significativa nei genotipi variante con differenziazione del tumore. Quasi tutti gli studi inclusi sono stati condotti in Asia tranne due studi sono stati in Europa. Lo studio di Kupcinskas et al. in Europa [30] analizzati i polimorfismi del gene del miR-146a in 995 soggetti tra cui Germania, Lettonia e Lituania. L'analisi dei dati ha mostrato che i polimorfismi del gene del miR-146a non sono associati con il rischio di GC in Europa. Inoltre, è stata trovata alcuna differenza tra diffusa e intestinali di tipo gruppi di cancro gastrico.
I risultati devono essere interpretati con prudenza a causa di diverse limitazioni. In primo luogo, i numeri limitati di pazienti possono avere influenza i risultati. Anche se abbiamo condotto una ricerca approfondita della letteratura da più database senza alcuna restrizione nelle lingue di pubblicazione, le date, le etnie e di altri fattori, ci sono stati solo un totale di nove studi che hanno coinvolto 3.885 casi di cancro gastrico e 5.396 controlli per il presente meta-analisi. Il generale o indicati una potenziale associazione tra il polimorfismo rs2910164 e GC, ma l'effetto non era statisticamente significativa. E 'ancora difficile fare una conclusione definitiva circa l'esattezza di associazione tra miR-146a rs2910164 G > C polimorfismo e suscettibilità al cancro gastrico. In secondo luogo, usiamo unidirezionale analisi di sensibilità per valutare la stabilità del meta-analisi e il risultato alterato quando omettendo lo studio con i campioni più grandi. In terzo luogo, solo pochi incluso ricerche hanno riportato i dati di interazione tra miR-146a polimorfismo e personaggi clinico-patologici di cancro gastrico, e tutto il pool di analisi delle interazioni è stato limitato dalla piccola dimensione del campione e il deficit dei dati.
Conclusione
In conclusione, il presente meta-analisi suggerisce un aumento del rischio tra miR-146a rs2910164 GG genotipo e suscettibilità al cancro gastrico in cinese sulla base di letterature pubblicati. Ulteriori studi su larga scala possono essere necessari per confermare la suscettibilità genetica di rs2910164 miR-146 bis nel carcinoma gastrico.
Dichiarazioni
Ringraziamenti
Questo documento è stato supportato da fondi di Guizhou Provinciale Dipartimento di Scienza e Tecnologia, No.qiankehe-J-2012-2240.
Ringraziamo il Maestro Yuan Zhou per fornire i dati originali relativi. 'presentate originali dei file per le immagini
di seguito sono riportati i link agli autori'
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Gli autori dichiarano di non avere interessi in gioco.

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