Forskare undersöker kopplingen mellan tarmmikrobiota med tjocktarmscancer hos patienter med Lynch -syndrom

Forskaren Gabriela Debesa, medlem av forskargruppen vid Simbiosis ledd av Andrés Moya vid Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research of Valencia Region (Fisabio), studerade sambandet mellan tarmmikrobiota och tjocktarmscancer hos patienter med Lynch syndrom (en ärftlig sjukdom som predisponerar utvecklingen av cancer) med hjälp av vävnadsprover i formalin och konserverade i paraffin.

Huvudsyftet var att ta reda på om det är möjligt att få information om mikrobiomet baserat på prover som bevarats på detta sätt. Detta studerades i prover av patienter med Lynch syndrom som hade utvecklat tjocktarmscancer och det jämfördes om det fanns skillnader mellan de bakteriella DNA -sekvenserna i tarmslemhinnan såväl som tumörernas.

Enligt Gabriela Debesa, första undertecknar, som har fått ett doktorandbidrag från den spanska föreningen mot cancer (AECC) i Valencia, "Det visades att i tumörvävnaderna, det finns en större närvaro av vissa bakteriegrupper associerade med tumörer i jämförelse med det normala slemhinnan, Till exempel Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis och Campylobacter. "

Dessa resultat hade redan erhållits tidigare i prover av färska vävnader, men den nya funktionen i denna studie har varit att den extraherar denna information från gamla vävnader konserverade i formalin och paraffin som lagrades i IBSP-CV, biobanken för biomedicinsk forskning och folkhälsa i Comunitat Valenciana, som ingår i Valencias biobanknätverk.

I denna typ av studier, de prover som normalt används är från färska eller frysta vävnader, som kräver att prover omedelbart tillhandahålls eller är beroende av komplexa frysinfrastrukturer. Dock, denna studie har kunnat bekräfta tidigare studier, analysera icke-färska vävnadsblock.

Andrés Moya, projektets främsta forskare, förklarade att "Det är en viktig utveckling eftersom det finns ett enormt antal prover bevarade, och därmed tillgängligt på sjukhusen och biobankerna. Klassiskt, prover tas efter operation från det borttagna området för att bevaras i paraffinblock. Fördelen med detta konserveringsmedel är att det inte kräver speciella lagringsförhållanden och de håller i många år. "

Dock, denna typ av bevarande av prover uppvisar vissa komplikationer. När man studerar cancer, genomisk information blir allt viktigare. Denna metod är inte lika effektiv för att få denna information, med tanke på att det skadar både mänskligt DNA och bakterie -DNA, vilket är vad som används för att analysera mikrobiomet.

Trots dessa svårigheter, vi erhöll resultat baserat på tidigare studier med färsk vävnad, där DNA:t är i optimala förhållanden för dess sekvensering. "

Vicente Pérez-Brocal, forskare och första undertecknare av studien

Nya horisonter

Denna metod erbjuder nya möjligheter, eftersom den inte begränsar proverna till färska tillgängliga vävnader, men många fler lagrade prover kan användas. Huvudapplikationen kommer att kunna utföra en retrospektiv analys av mikrobiomet i våra prover konserverade i paraffin, som ett alternativ när färsk vävnad inte är tillgänglig för kolorektal cancer och andra patologier.

Doktor Antonio Llombart, huvudforskare för gruppen Fisabios kliniska och molekylära onkologi och ordförande för tekniska kommittén i Valencia AECC förklarade att "Denna studie är ett mycket viktigt steg för att underlätta forskningen om hur tarmmikrobioten påverkar utvecklingen av tjocktarmscancer hos personer med Lynch syndrom Detta gör det möjligt att ha information för att kunna utveckla nya, mer effektiva metoder för tidig diagnos och förebyggande, något som är viktigt för att behandla denna typ av cancer, vilket är mycket vanligt. "

Dessutom, Doktor Llombart, chef för tjänsten för medicinsk onkologi på sjukhuset Arnau de Vilanova, tillade att "Det är viktigt att fortsätta utvecklas i kampen mot kolorektal cancer, som varje år drabbar över 38, 790 nya patienter i Spanien och orsakar död av över 15, 770 personer. "

För studien, 98 prover användes (ett från tumörvävnader och ett från det friska slemhinnan för varje person) från patienter som diagnostiserats med Lynch syndrom, som behandlades kirurgiskt mellan 1996 och 2017. Proven tillhörde 21 kvinnor och 28 män med ett åldersintervall på 33 till 87 år.

• AGAs nya kliniska riktlinjer rekommenderar användning av IGB för överviktiga patienter
• Förödande leversjukdom klåda visar sig ha en överraskande orsak