Hovedmålet var å finne ut om det er mulig å skaffe informasjon om mikrobiomet basert på prøver konservert på denne måten. Dette ble studert i prøver av pasienter med Lynch syndrom som hadde utviklet tykktarmskreft, og det ble sammenlignet om det var forskjeller mellom de bakterielle DNA -sekvensene i tarmslimhinnen så vel som tumorenes.
I følge Gabriela Debesa, første undertegner, som har mottatt et doktorgradsstipend fra Spanish Association Against Cancer (AECC) i Valencia, "Det ble vist at i svulstvevet, det er en større tilstedeværelse av noen bakteriegrupper assosiert med svulster sammenlignet med det normale slimhinnen, som for eksempel Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis og Campylobacter. "
Disse resultatene var allerede oppnådd tidligere i prøver av ferskt vev, men den nye egenskapen til denne studien har vært at den trekker ut denne informasjonen fra gamle vev som er bevart i formalin og parafin som ble lagret i IBSP-CV, biobanken for biomedisinsk forskning og folkehelse i Comunitat Valenciana, som er en del av Valencias biobanknettverk.
I denne typen studier, prøvene som normalt brukes, er fra ferske eller frosne vev, som krever at prøver leveres umiddelbart eller er avhengige av komplekse fryseinfrastrukturer. Derimot, denne studien har vært i stand til å bekrefte tidligere studier, analysere ikke-ferske vevsblokker.
Andrés Moya, prosjektets hovedforsker, forklarte at "Det er en viktig utvikling fordi det er et enormt antall prøver bevart, og dermed tilgjengelig på sykehus og biobanker. Klassisk, prøver tas etter operasjonen fra det fjernede området for å konserveres i parafinblokker. Fordelen med dette konserveringsmiddelet er at det ikke krever spesielle lagringsforhold, og de varer i mange år. "
Derimot, denne typen bevaring av prøver gir noen komplikasjoner. Når jeg studerer kreft, genomisk informasjon får stadig større betydning. Denne metoden er ikke like effektiv for å innhente denne informasjonen, gitt at det skader både det menneskelige DNA og det bakterielle DNA, som er det som brukes til å analysere mikrobiomet.
Til tross for disse vanskelighetene, vi oppnådde resultater basert på tidligere studier utført med ferskt vev, der DNA er i optimale forhold for sekvensering. "
Vicente Pérez-Brocal, forsker og første som signerte studien
Denne metoden gir nye muligheter gitt at den ikke begrenser prøvene til ferskt vev som er tilgjengelig, men mange flere lagrede prøver kan brukes. Hovedapplikasjonen vil være å kunne utføre en retrospektiv analyse av mikrobiomet i våre prøver konservert i parafin, som et alternativ når ferskt vev ikke er tilgjengelig for tykktarmskreft og andre patologier.
Lege Antonio Llombart, hovedforsker for gruppen Clinical and Molecular Oncology of Fisabio og president for Technical Committee of Valencia AECC forklarte at "Denne studien er et veldig viktig skritt for å lette forskningen på hvordan tarmmikrobiota påvirker utviklingen av tykktarmskreft hos mennesker med Lynch syndrom . Dette vil tillate å ha informasjon for å kunne utvikle nye, mer effektive metoder for tidlig diagnose og forebygging, noe som er avgjørende for å behandle denne typen kreft, som er veldig vanlig. "
I tillegg, Doktor Llombart, leder for Service of Medical Oncology ved sykehuset Arnau de Vilanova, la til at "Det er viktig å fortsette utviklingen i kampen mot tykktarmskreft, som hvert år rammer over 38, 790 nye pasienter i Spania og forårsaker død av over 15, 770 mennesker. "
For studien, 98 prøver ble brukt (en fra tumorvev og en fra det sunne slimet for hver person) fra pasienter diagnostisert med Lynch syndrom, som ble behandlet kirurgisk mellom 1996 og 2017. Prøvene tilhørte 21 kvinner og 28 menn med en alder på 33 til 87 år.