Het belangrijkste doel was om erachter te komen of het mogelijk is om informatie over het microbioom te verkrijgen op basis van op deze manier geconserveerde monsters. Dit werd onderzocht in monsters van patiënten met Lynch-syndroom die darmkanker hadden ontwikkeld en er werd vergeleken of er verschillen waren tussen de bacteriële DNA-sequenties van het darmslijmvlies en die van de tumoren.
Volgens Gabriela Debesa, eerste ondertekenaar, die een predoctorale beurs heeft ontvangen van de Spaanse Vereniging tegen Kanker (AECC) in Valencia, "Er werd aangetoond dat in de tumorweefsels, er is een grotere aanwezigheid van sommige bacteriegroepen geassocieerd met tumoren in vergelijking met het normale slijmvlies, zoals Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis en Campylobacter. "
Deze resultaten waren al eerder verkregen in monsters van verse weefsels, maar het nieuwe kenmerk van deze studie is dat deze informatie wordt geëxtraheerd uit oude weefsels die zijn bewaard in formaline en paraffine en die zijn opgeslagen in de IBSP-CV, de Biobank voor Biomedisch Onderzoek en Volksgezondheid in de Comunitat Valenciana, die deel uitmaken van het Valencian Biobanking Network.
Bij dit soort onderzoeken de monsters die normaal worden gebruikt, zijn afkomstig van verse of bevroren weefsels, waarvoor onmiddellijk monsters moeten worden verstrekt of afhankelijk zijn van complexe bevriezingsinfrastructuren. Echter, deze studie heeft eerdere studies kunnen bevestigen, het analyseren van niet-verse weefselblokken.
Andrés Moya, hoofdonderzoeker van het project, legde uit dat "het een belangrijke ontwikkeling is omdat er een enorm aantal monsters bewaard is gebleven, en dus beschikbaar in de ziekenhuizen en biobanken. klassiek, monsters worden na de operatie genomen uit het verwijderde gebied om te worden geconserveerd in paraffineblokken. Het voordeel van deze manier van conserveren is dat er geen speciale bewaarcondities voor nodig zijn en dat ze jarenlang meegaan."
Echter, dit type conservering van monsters brengt enkele complicaties met zich mee. Bij het bestuderen van kanker, genomische informatie wordt steeds belangrijker. Deze methode is niet zo effectief in het verkrijgen van deze informatie, aangezien het zowel het menselijk DNA als het bacteriële DNA beschadigt, dat is wat wordt gebruikt om het microbioom te analyseren.
Ondanks deze moeilijkheden, we hebben resultaten verkregen op basis van de eerdere onderzoeken die zijn uitgevoerd met vers weefsel, waar het DNA zich in optimale omstandigheden bevindt voor de sequentiebepaling."
Vicente Perez-Brocal, onderzoeker en eerste ondertekenaar van de studie
Deze methode biedt nieuwe mogelijkheden aangezien het de monsters niet beperkt tot verse weefsels die beschikbaar zijn, maar er kunnen nog veel meer opgeslagen monsters worden gebruikt. De belangrijkste toepassing zal zijn om een retrospectieve analyse uit te voeren van het microbioom in onze monsters bewaard in paraffine, als alternatief wanneer vers weefsel niet beschikbaar is voor colorectale kanker en andere pathologieën.
Dokter Antonio Llombart, hoofdonderzoeker van de Klinische en Moleculaire Oncologie-groep van Fisabio en voorzitter van het Technisch Comité van Valencia AECC legde uit dat "Deze studie een zeer belangrijke stap is om het onderzoek naar de invloed van de darmmicrobiota op de ontwikkeling van darmkanker bij mensen met het Lynch-syndroom te vergemakkelijken Dit zal het mogelijk maken om informatie te hebben om nieuwe, effectievere methoden voor vroege diagnose en preventie, iets dat essentieel is bij de behandeling van dit type kanker, dat is heel gebruikelijk."
In aanvulling, Dokter Llombart, hoofd van de dienst medische oncologie van het ziekenhuis Arnau de Vilanova, voegde eraan toe:"Het is belangrijk om vooruitgang te blijven boeken in de strijd tegen colorectale kanker, die elk jaar meer dan 38 treft, 790 nieuwe patiënten in Spanje en veroorzaakt de dood van meer dan 15, 770 mensen."
Voor de studie, Er werden 98 monsters gebruikt (één uit tumorweefsel en één uit het gezonde slijmvlies voor elke persoon) van patiënten met de diagnose Lynch-syndroom, die tussen 1996 en 2017 operatief zijn behandeld. De monsters waren van 21 vrouwen en 28 mannen in de leeftijd van 33 tot 87 jaar.