L'obiettivo principale era capire se è possibile ottenere informazioni sul microbioma sulla base di campioni così conservati. Questo è stato studiato in campioni di pazienti con sindrome di Lynch che avevano sviluppato un cancro al colon ed è stato confrontato se c'erano differenze tra le sequenze di DNA batterico della mucosa intestinale e quelle dei tumori.
Secondo Gabriela Debesa, primo firmatario, che ha ricevuto una borsa di studio pre-dottorato dall'Associazione spagnola contro il cancro (AECC) a Valencia, "È stato dimostrato che nei tessuti tumorali, vi è una maggiore presenza di alcuni gruppi batterici associati a tumori rispetto alla mucosa normale, come Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis e Campylobacter. "
Questi risultati erano già stati ottenuti in precedenza in campioni di tessuti freschi, ma la nuova caratteristica di questo studio è stata che estrae queste informazioni da vecchi tessuti conservati in formalina e paraffina che sono stati conservati nell'IBSP-CV, la Biobanca per la Ricerca Biomedica e la Sanità Pubblica nella Comunitat Valenciana, che fanno parte della rete di biobanche valenciane.
In questo tipo di studi, i campioni normalmente utilizzati provengono da tessuti freschi o congelati, che richiede la fornitura immediata di campioni o dipende da complesse infrastrutture di congelamento. Però, questo studio è stato in grado di corroborare studi precedenti, analisi di blocchi di tessuto non fresco.
Andrés Moya, ricercatore principale del progetto, ha spiegato che "Si tratta di uno sviluppo importante perché c'è un numero enorme di campioni conservati, e quindi disponibile negli ospedali e nelle biobanche. Classicamente, i campioni vengono prelevati dopo l'intervento chirurgico dall'area rimossa per essere conservati in blocchi di paraffina. Il vantaggio di questo mezzo di conservazione è che non richiede particolari condizioni di conservazione e dura per molti anni."
Però, questo tipo di conservazione dei campioni presenta alcune complicazioni. Nello studio del cancro, l'informazione genomica sta acquisendo sempre più importanza. Questo metodo non è così efficace per ottenere queste informazioni, dato che danneggia sia il DNA umano che il DNA batterico, che è ciò che viene utilizzato per analizzare il microbioma.
Nonostante queste difficoltà, abbiamo ottenuto risultati sulla base degli studi precedenti effettuati con tessuto fresco, dove il DNA è in condizioni ottimali per il suo sequenziamento."
Vicente Pérez-Brocal, ricercatore e primo firmatario dello studio
Questo metodo offre nuove possibilità dato che non limita i campioni ai tessuti freschi disponibili, ma è possibile utilizzare molti più campioni memorizzati. L'applicazione principale sarà quella di poter effettuare un'analisi retrospettiva del microbioma nei nostri campioni conservati in paraffina, come alternativa quando non è disponibile tessuto fresco per il cancro del colon-retto e altre patologie.
Dottor Antonio Llombart, ricercatore principale del gruppo di Oncologia Clinica e Molecolare di Fisabio e presidente del Comitato Tecnico di Valencia AECC ha spiegato che "Questo studio è un passo molto importante per facilitare la ricerca su come il microbiota intestinale influenza lo sviluppo del cancro del colon nelle persone con sindrome di Lynch Ciò consentirà di disporre di informazioni per poter sviluppare nuove, metodi più efficaci di diagnosi precoce e prevenzione, qualcosa che è essenziale nel trattamento di questo tipo di cancro, che è molto comune."
Inoltre, Dottor Llombart, capo del Servizio di Oncologia Medica presso l'Ospedale Arnau de Vilanova, ha aggiunto che "è importante continuare ad avanzare nella lotta contro il cancro del colon-retto, che ogni anno colpisce oltre 38, 790 nuovi pazienti in Spagna e provoca la morte di oltre 15, 770 persone".
Per lo studio, Sono stati utilizzati 98 campioni (uno da tessuti tumorali e uno dal muco sano per ogni persona) da pazienti con diagnosi di sindrome di Lynch, che sono stati trattati chirurgicamente tra il 1996 e il 2017. I campioni appartenevano a 21 donne e 28 uomini con una fascia di età compresa tra 33 e 87 anni.