Päätavoitteena oli selvittää, onko mahdollista saada tietoa mikrobiomista tällä tavalla säilytettyjen näytteiden perusteella. Tätä tutkittiin Lynchin oireyhtymää sairastavien potilaiden näytteissä, joille oli kehittynyt paksusuolen syöpä, ja sitä verrattiin, jos suoliston limakalvon ja kasvainten bakteeri -DNA -sekvenssien välillä oli eroja.
Gabriela Debesan mukaan ensimmäinen allekirjoittaja, joka on saanut pre-tohtorin apurahan Espanjan syövän vastaiselta yhdistykseltä (AECC) Valenciassa, "On osoitettu, että kasvainkudoksissa joitakin kasvaimiin liittyviä bakteeriryhmiä esiintyy enemmän verrattuna normaaliin limakalvoon, kuten Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis ja Campylobacter. "
Nämä tulokset oli jo saatu tuoreiden kudosten näytteistä, mutta tämän tutkimuksen uusi piirre on ollut se, että se poimii nämä tiedot IBSP-CV:hen tallennetuista formaliiniin ja parafiiniin tallennetuista vanhoista kudoksista, biopankki biolääketieteellistä tutkimusta ja kansanterveyttä varten Valencian osavaltiossa, jotka ovat osa Valencian biopankkiverkostoa.
Tämän tyyppisissä tutkimuksissa normaalisti käytetyt näytteet ovat tuoreista tai jäädytetyistä kudoksista, joka edellyttää näytteiden toimittamista välittömästi tai riippuu monimutkaisista jäädytysinfrastruktuureista. Kuitenkin, tämä tutkimus on voinut vahvistaa aiemmat tutkimukset, ei-tuoreiden kudoslohkojen analysointi.
Andrés Moya, hankkeen päätutkija, "Tämä on tärkeä kehitys, koska näytteitä on säilynyt valtava määrä, ja siten saatavilla sairaaloissa ja biopankkeissa. Klassisesti, Näytteet otetaan leikkauksen jälkeen poistetulta alueelta parafiinilohkoihin. Tämän säilytysmenetelmän etuna on, että se ei vaadi erityisiä säilytysolosuhteita ja kestää useita vuosia. "
Kuitenkin, tämäntyyppinen näytteiden säilyttäminen aiheuttaa joitakin komplikaatioita. Tutkiessaan syöpää, genomitiedon merkitys kasvaa. Tämä menetelmä ei ole yhtä tehokas näiden tietojen saamisessa, koska se vahingoittaa sekä ihmisen DNA:ta että bakteerien DNA:ta, jota käytetään mikrobiomin analysointiin.
Näistä vaikeuksista huolimatta saimme tuloksia tuoreiden kudosten aikaisempien tutkimusten perusteella, jossa DNA on optimaalisissa olosuhteissa sen sekvensointia varten. "
Vicente Pérez-Brocal, tutkija ja tutkimuksen ensimmäinen allekirjoittaja
Tämä menetelmä tarjoaa uusia mahdollisuuksia, koska se ei rajoita näytteitä käytettävissä oleviin tuoreisiin kudoksiin, mutta paljon muita tallennettuja näytteitä voidaan käyttää. Pääsovellus voi tehdä retrospektiivisen analyysin parafiiniin säilötyistä näytteistämme peräisin olevasta mikrobiomista, vaihtoehtona, kun tuoretta kudosta ei ole saatavilla paksusuolen syöpään ja muihin sairauksiin.
Lääkäri Antonio Llombart, Fisabion kliinisen ja molekulaarisen onkologian ryhmän päätutkija ja Valencian AECC:n teknisen komitean puheenjohtaja selitti, että "Tämä tutkimus on erittäin tärkeä askel helpottamaan tutkimusta siitä, miten suoliston mikrobiota vaikuttaa paksusuolen syövän kehittymiseen Lynchin oireyhtymässä Tämä mahdollistaa tiedon saamisen, jotta voidaan kehittää uusia, tehokkaampia varhaisen diagnoosin ja ennaltaehkäisyn menetelmiä, jotain, joka on välttämätöntä tämän tyyppisen syövän hoidossa, mikä on hyvin yleistä. "
Lisäksi, Tohtori Llombart, Arnau de Vilanovan sairaalan lääketieteellisen onkologian osaston johtaja, "On tärkeää jatkaa etenemistä kolorektaalisyövän torjunnassa, joka vaikuttaa vuosittain yli 38, 790 uutta potilasta Espanjassa ja aiheuttaa yli 15 ihmisen kuoleman 770 ihmistä. "
Tutkimusta varten Käytettiin 98 näytettä (yksi kasvainkudoksista ja yksi terveestä limakalvosta kullekin henkilölle) potilailta, joilla oli diagnosoitu Lynchin oireyhtymä, joita hoidettiin kirurgisesti vuosina 1996–2017. Näytteet kuuluivat 21 naiselle ja 28 miehelle, joiden ikä oli 33–87 vuotta.