Pagrindinis tikslas buvo išsiaiškinti, ar galima gauti informacijos apie mikrobiomą remiantis tokiu būdu išsaugotais mėginiais. Tai buvo tiriama imant Lyncho sindromu sergančių pacientų, kuriems išsivystė gaubtinės žarnos vėžys, mėginius ir palyginama, ar buvo skirtumų tarp žarnyno gleivinės ir navikų bakterijų DNR sekų.
Pasak Gabrielės Debesos, pirmasis signataras, gavęs ikidoktorantūros stipendiją iš Ispanijos asociacijos prieš vėžį (AECC) Valensijoje, „Buvo įrodyta, kad naviko audiniuose, yra daugiau bakterijų grupių, susijusių su navikais, palyginti su įprasta gleivine, toks kaip Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis ir Kampilobakterijos. "
Šie rezultatai jau buvo gauti iš šviežių audinių mėginių, tačiau nauja šio tyrimo ypatybė yra ta, kad ji išgauna šią informaciją iš senų formalino ir parafino konservuotų audinių, kurie buvo saugomi IBSP-CV, Valensijos bendruomenės biomedicinos tyrimų ir visuomenės sveikatos biobankas, kurie yra Valensijos biologinių bankų tinklo dalis.
Šio tipo tyrimuose, paprastai naudojami mėginiai yra iš šviežių arba šaldytų audinių, tai reikalauja nedelsiant pateikti mėginius arba priklauso nuo sudėtingos šaldymo infrastruktūros. Tačiau, šis tyrimas galėjo patvirtinti ankstesnius tyrimus, analizuojant ne šviežius audinių blokus.
Andrés Moya, pagrindinis projekto tyrėjas, paaiškino, kad „tai yra svarbus įvykis, nes yra išsaugota labai daug mėginių, ir yra prieinami ligoninėse ir biobankuose. Klasikiškai, mėginiai imami po operacijos iš pašalintos vietos, kad būtų išsaugoti parafino blokuose. Šios konservavimo priemonės pranašumas yra tas, kad jai nereikia specialių laikymo sąlygų ir jos tarnauja daugelį metų “.
Tačiau, toks mėginių išsaugojimas sukelia tam tikrų komplikacijų. Studijuodamas vėžį, genomo informacija tampa vis svarbesnė. Šis metodas nėra toks efektyvus gaunant šią informaciją, atsižvelgiant į tai, kad jis pažeidžia žmogaus ir bakterijų DNR, kuris naudojamas analizuojant mikrobiomą.
Nepaisant šių sunkumų, mes gavome rezultatus, pagrįstus ankstesniais tyrimais, atliktais su šviežiais audiniais, kur DNR yra optimaliomis sąlygomis jo sekos nustatymui “.
Vicente Pérez-Brocal, tyrėjas ir pirmasis tyrimo signataras
Šis metodas suteikia naujų galimybių, nes mėginiai neapsiriboja turimais šviežiais audiniais, tačiau galima naudoti daug daugiau saugomų pavyzdžių. Pagrindinė programa galės retrospektyviai analizuoti parafine konservuotų mūsų mėginių mikrobiomą, kaip alternatyva, kai kolorektalinio vėžio ir kitų patologijų atveju nėra šviežių audinių.
Gydytojas Antonio Llombart, „Fisabio“ klinikinės ir molekulinės onkologijos grupės pagrindinis tyrėjas ir Valensijos AECC techninio komiteto pirmininkas paaiškino, kad „šis tyrimas yra labai svarbus žingsnis siekiant palengvinti tyrimą, kaip žarnyno mikrobiota veikia storosios žarnos vėžio vystymąsi žmonėms, sergantiems Lyncho sindromu“. . Tai leis turėti informacijos, kad būtų galima sukurti naują, veiksmingesnius ankstyvos diagnostikos ir prevencijos metodus, tai, kas būtina gydant šio tipo vėžį, kas yra labai įprasta “.
Papildomai, Daktaras Llombartas, Arnau de Vilanova ligoninės medicinos onkologijos tarnybos vadovas, pridūrė, kad „svarbu toliau žengti į priekį kovojant su gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu, kasmet kenčia nuo 38 metų amžiaus, 790 naujų pacientų Ispanijoje ir dėl to miršta daugiau nei 15, 770 žmonių “.
Tyrimui, Buvo naudojami 98 mėginiai (vienas iš naviko audinių ir vienas iš sveikų gleivinių kiekvienam asmeniui) iš pacientų, kuriems diagnozuotas Lyncho sindromas, kurie buvo gydomi chirurginiu būdu nuo 1996 iki 2017 m. Mėginiai priklausė 21 moteriai ir 28 vyrams, kurių amžius nuo 33 iki 87 metų.