Des chercheurs explorent le lien entre le microbiote intestinal et le cancer du côlon chez les patients atteints du syndrome de Lynch

La chercheuse Gabriela Debesa, membre du groupe de recherche à Simbiosis dirigé par Andrés Moya à la Fondation pour la promotion de la santé et de la recherche biomédicale de la Région de Valence (Fisabio), ont étudié la relation du microbiote intestinal avec le cancer du côlon chez des patients atteints du syndrome de Lynch (une maladie héréditaire qui prédispose au développement du cancer) en utilisant des échantillons de tissus dans le formol et conservés dans la paraffine.

L'objectif principal était de déterminer s'il est possible d'obtenir des informations sur le microbiome à partir d'échantillons ainsi conservés. Ceci a été étudié dans des échantillons de patients atteints du syndrome de Lynch qui avaient développé un cancer du côlon et il a été comparé s'il y avait des différences entre les séquences d'ADN bactérien de la muqueuse intestinale ainsi que celles des tumeurs.

Selon Gabriela Debesa, premier signataire, qui a reçu une bourse pré-doctorale de l'Association espagnole contre le cancer (AECC) à Valence, « Il a été montré que dans les tissus tumoraux, il y a une plus grande présence de certains groupes bactériens associés aux tumeurs par rapport à la muqueuse normale, tel que Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis et Campylobacter. "

Ces résultats avaient déjà été obtenus auparavant dans des échantillons de tissus frais, mais la nouveauté de cette étude a été qu'elle extrait cette information à partir d'anciens tissus conservés dans le formol et la paraffine qui ont été stockés dans l'IBSP-CV, la Biobanque pour la Recherche Biomédicale et la Santé Publique de la Comunitat Valenciana, qui font partie du Réseau Valencien de Biobanques.

Dans ce type d'études, les échantillons qui sont normalement utilisés proviennent de tissus frais ou congelés, ce qui nécessite de fournir des échantillons immédiatement ou dépendent d'infrastructures de congélation complexes. Cependant, cette étude a pu corroborer des études antérieures, analyser les blocs de tissus non frais.

Andrés Moya, chercheur principal du projet, a expliqué que "C'est un développement important car il y a un nombre énorme d'échantillons conservés, et donc disponible dans les hôpitaux et les biobanques. Classiquement, des prélèvements sont effectués après chirurgie sur la zone prélevée pour être conservés dans des blocs de paraffine. L'avantage de ce moyen de conservation est qu'il ne nécessite pas de conditions de stockage particulières et qu'il dure de nombreuses années."

Cependant, ce type de conservation des échantillons présente quelques complications. En étudiant le cancer, l'information génomique prend de plus en plus d'importance. Cette méthode n'est pas aussi efficace pour obtenir ces informations, étant donné qu'il endommage à la fois l'ADN humain et l'ADN bactérien, c'est ce qui est utilisé pour analyser le microbiome.

Malgré ces difficultés, nous avons obtenu des résultats basés sur les études précédentes réalisées avec des tissus frais, où l'ADN est dans des conditions optimales pour son séquençage."

Vicente Pérez Brocal, chercheur et premier signataire de l'étude

Nouveaux horizons

Cette méthode offre de nouvelles possibilités car elle ne limite pas les prélèvements aux tissus frais disponibles, mais beaucoup plus d'échantillons stockés peuvent être utilisés. L'application principale sera de pouvoir réaliser une analyse rétrospective du microbiome dans nos échantillons conservés en paraffine, comme alternative lorsque les tissus frais ne sont pas disponibles pour le cancer colorectal et d'autres pathologies.

Docteur Antonio Llombart, chercheur principal du groupe d'oncologie clinique et moléculaire de Fisabio et président du comité technique de Valence AECC a expliqué que "Cette étude est une étape très importante pour faciliter la recherche sur la façon dont le microbiote intestinal affecte le développement du cancer du côlon chez les personnes atteintes du syndrome de Lynch Cela permettra d'avoir des informations pour pouvoir développer de nouvelles, des méthodes plus efficaces de diagnostic précoce et de prévention, quelque chose qui est essentiel dans le traitement de ce type de cancer, ce qui est très courant."

En outre, Docteur Llombart, chef du service d'oncologie médicale de l'hôpital Arnau de Vilanova, a ajouté qu'« il est important de continuer à avancer dans la lutte contre le cancer colorectal, qui touche chaque année plus de 38, 790 nouveaux patients en Espagne et provoque la mort de plus de 15, 770 personnes."

Pour l'étude, 98 échantillons ont été utilisés (un de tissus tumoraux et un de muqueuse saine pour chaque personne) de patients diagnostiqués avec le syndrome de Lynch, qui ont été traités chirurgicalement entre 1996 et 2017. Les échantillons appartenaient à 21 femmes et 28 hommes âgés de 33 à 87 ans.

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