Hovedformålet var at finde ud af, om det er muligt at få information om mikrobiomet baseret på prøver, der er konserveret på denne måde. Dette blev undersøgt i prøver af patienter med Lynch syndrom, der havde udviklet tyktarmskræft, og det blev sammenlignet, hvis der var forskelle mellem de bakterielle DNA -sekvenser i tarmslimhinden såvel som tumorenes.
Ifølge Gabriela Debesa, første underskriver, som har modtaget en præ-doktorgradsbevilling fra den spanske sammenslutning mod kræft (AECC) i Valencia, "Det blev vist, at i tumorvævet, der er en større tilstedeværelse af nogle bakteriegrupper forbundet med tumorer i sammenligning med det normale slimhinde, såsom Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis og Campylobacter. "
Disse resultater var allerede opnået tidligere i prøver af frisk væv, men det nye træk ved denne undersøgelse har været, at den udtrækker disse oplysninger fra gamle væv, der er konserveret i formalin og paraffin, som blev lagret i IBSP-CV, biobanken for biomedicinsk forskning og folkesundhed i Comunitat Valenciana, som er en del af Valencias biobanknetværk.
I denne type undersøgelser, prøverne, der normalt bruges, er fra friske eller frosne væv som kræver levering af prøver med det samme eller er afhængig af komplekse fryseinfrastrukturer. Imidlertid, denne undersøgelse har været i stand til at bekræfte tidligere undersøgelser, analyse af ikke-friske vævsblokke.
Andrés Moya, projektets hovedforsker, forklarede, at "Det er en vigtig udvikling, fordi der er et enormt antal prøver bevaret, og dermed tilgængelig på hospitaler og biobanker. Klassisk, prøver tages efter operationen fra det fjernede område for at blive konserveret i paraffinblokke. Fordelen ved dette konserveringsmiddel er, at det ikke kræver særlige opbevaringsforhold, og de holder i mange år. "
Imidlertid, denne type bevarelse af prøver giver nogle komplikationer. Når man studerer kræft, genomisk information får i stigende grad betydning. Denne metode er ikke så effektiv til at indhente disse oplysninger, da det skader både det menneskelige DNA og det bakterielle DNA, hvilket er det, der bruges til at analysere mikrobiomet.
På trods af disse vanskeligheder, vi opnåede resultater baseret på de tidligere undersøgelser udført med frisk væv, hvor DNA'et er i optimale betingelser for dets sekventering. "
Vicente Pérez-Brocal, forsker og første underskriver af undersøgelsen
Denne metode giver nye muligheder, da den ikke begrænser prøverne til frisk tilgængeligt væv, men mange flere lagrede prøver kan bruges. Hovedapplikationen vil være i stand til at foretage en retrospektiv analyse af mikrobiomet i vores prøver konserveret i paraffin, som et alternativ, når frisk væv ikke er tilgængeligt for tyktarmskræft og andre patologier.
Læge Antonio Llombart, hovedforsker for gruppen Fisabio Clinical and Molecular Oncology og formand for det tekniske udvalg i Valencia AECC forklarede, at "Denne undersøgelse er et meget vigtigt skridt for at lette forskningen i, hvordan tarmmikrobiota påvirker udviklingen af tyktarmskræft hos mennesker med Lynch Syndrom Dette vil gøre det muligt at have information for at kunne udvikle nye, mere effektive metoder til tidlig diagnose og forebyggelse, noget, der er vigtigt i behandlingen af denne type kræft, hvilket er meget almindeligt. "
Ud over, Læge Llombart, chef for Service of Medical Oncology på Hospital Arnau de Vilanova, tilføjede, at "Det er vigtigt at blive ved med at komme videre i kampen mod tyktarmskræft, som hvert år rammer over 38, 790 nye patienter i Spanien og forårsager død af over 15, 770 mennesker. "
Til undersøgelsen, 98 prøver blev brugt (en fra tumorvæv og en fra den sunde slim for hver person) fra patienter diagnosticeret med Lynch syndrom, som blev kirurgisk behandlet mellem 1996 og 2017. Prøverne tilhørte 21 kvinder og 28 mænd med en alder på 33 til 87 år.