Glavni cilj je bil ugotoviti, ali je mogoče pridobiti informacije o mikrobiomu na podlagi tako ohranjenih vzorcev. To so preučevali pri vzorcih bolnikov z Lynchovim sindromom, pri katerih je prišlo do raka debelega črevesa, in primerjali, če obstajajo razlike med zaporedji bakterijske DNA črevesne sluznice in tumorji.
Po besedah Gabriele Debesa, prvi podpisnik, ki je prejel doktorsko štipendijo španskega združenja za boj proti raku (AECC) v Valenciji, "Pokazalo se je, da v tumorskih tkivih obstaja večja prisotnost nekaterih bakterijskih skupin, povezanih s tumorji, v primerjavi z normalno sluznico, kot naprimer Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis in Campylobacter. "
Ti rezultati so bili že prej pridobljeni v vzorcih svežih tkiv, nova značilnost te študije pa je, da te informacije črpa iz starih tkiv, shranjenih v formalinu in parafinu, shranjenih v življenjepisu IBSP, Biobank za biomedicinske raziskave in javno zdravje v Comunitat Valenciana, ki so del Valencijske mreže za bančništvo.
V tej vrsti študij je vzorci, ki se običajno uporabljajo, so iz svežih ali zamrznjenih tkiv, kar zahteva takojšnje predložitev vzorcev ali je odvisno od zapletene infrastrukture za zamrzovanje. Vendar pa ta študija je lahko potrdila prejšnje študije, analiza ne svežih tkivnih blokov.
Andrés Moya, glavni raziskovalec projekta, pojasnil:"To je pomemben razvoj, ker je ohranjeno ogromno število vzorcev, in tako na voljo v bolnišnicah in biobankah. Klasično, vzorci se po operaciji odvzamejo z odstranjenega območja in se shranijo v parafinske bloke. Prednost tega načina shranjevanja je, da ne zahteva posebnih pogojev skladiščenja in trajajo več let. "
Vendar pa ta vrsta konzerviranja vzorcev predstavlja nekatere zaplete. Pri preučevanju raka, genomske informacije postajajo vse pomembnejše. Ta metoda ni tako učinkovita pri pridobivanju teh informacij, glede na to, da poškoduje tako človeško kot bakterijsko DNK, ki se uporablja za analizo mikrobioma.
Kljub tem težavam je smo dobili rezultate na podlagi prejšnjih študij, izvedenih s svežim tkivom, kjer je DNA v optimalnih pogojih za njeno sekvenciranje. "
Vicente Pérez-Brocal, raziskovalec in prvi podpisnik študije
Ta metoda ponuja nove možnosti, saj ne omejuje vzorcev na sveža razpoložljiva tkiva, vendar je mogoče uporabiti veliko več shranjenih vzorcev. Glavna aplikacija bo lahko izvedla retrospektivno analizo mikrobioma v naših vzorcih, shranjenih v parafinu, kot alternativo, kadar za kolorektalni rak in druge patologije ni na voljo svežega tkiva.
Zdravnik Antonio Llombart, glavni raziskovalec skupine za klinično in molekularno onkologijo pri Fisabiu in predsednik tehničnega odbora Valencia AECC je pojasnil:"Ta študija je zelo pomemben korak za olajšanje raziskav, kako črevesna mikrobiota vpliva na razvoj raka debelega črevesa pri ljudeh z Lynchovim sindromom To bo omogočilo pridobivanje informacij za razvoj novih, učinkovitejše metode zgodnje diagnoze in preprečevanja, nekaj, kar je bistveno pri zdravljenju te vrste raka, kar je zelo pogosto. "
Poleg tega Zdravnik Llombart, vodja službe za medicinsko onkologijo v bolnišnici Arnau de Vilanova, je dodal:"Pomembno je, da še naprej napredujemo v boju proti kolorektalnemu raku, ki vsako leto prizadene več kot 38, 790 novih bolnikov v Španiji in povzroči smrt več kot 15, 770 ljudi. "
Za študij, Uporabljenih je bilo 98 vzorcev (po enega iz tumorskega tkiva in enega iz zdrave sluznice za vsako osebo) pri bolnikih z diagnozo Lynchovega sindroma, ki so bili kirurško zdravljeni med letoma 1996 in 2017. Vzorci so pripadali 21 ženskam in 28 moškim v starostnem razponu od 33 do 87 let.