O objetivo principal foi saber se é possível obter informações do microbioma a partir de amostras assim conservadas. Isso foi estudado em amostras de pacientes com síndrome de Lynch que desenvolveram câncer de cólon e foi comparado se havia diferenças entre as sequências de DNA bacteriano da mucosa intestinal e as dos tumores.
Segundo Gabriela Debesa, primeiro signatário, que recebeu uma bolsa de pré-doutorado da Associação Espanhola contra o Câncer (AECC) em Valência, “Foi demonstrado que nos tecidos tumorais, há uma maior presença de alguns grupos bacterianos associados a tumores em comparação com o muco normal, tal como Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis e Campylobacter. "
Esses resultados já haviam sido obtidos anteriormente em amostras de tecidos frescos, mas a nova característica deste estudo é que ele extrai essas informações de tecidos antigos preservados em formalina e parafina que foram armazenados no IBSP-CV, o Biobanco de Pesquisa Biomédica e Saúde Pública da Comunidade Valenciana, que fazem parte da Rede Valenciana de Biobancos.
Neste tipo de estudos, as amostras normalmente utilizadas são de tecidos frescos ou congelados, que exige o fornecimento imediato de amostras ou depende de infraestruturas de congelamento complexas. Contudo, este estudo foi capaz de corroborar estudos anteriores, analisar blocos de tecido não fresco.
Andrés Moya, pesquisador principal do projeto, explicou que "É um desenvolvimento importante porque há um grande número de amostras preservadas, e, portanto, disponível nos hospitais e biobancos. Classicamente, As amostras são retiradas após a cirurgia da área removida para serem conservadas em blocos de parafina. A vantagem deste meio de preservação é que não requer condições especiais de armazenamento e duram muitos anos. ”
Contudo, este tipo de conservação de amostras apresenta algumas complicações. Ao estudar o câncer, as informações genômicas estão ganhando cada vez mais importância. Este método não é tão eficaz na obtenção dessas informações, visto que danifica o DNA humano e o DNA bacteriano, que é o que é usado para analisar o microbioma.
Apesar dessas dificuldades, obtivemos resultados com base nos estudos anteriores realizados com tecido fresco, onde o DNA está em condições ideais para seu sequenciamento. "
Vicente Pérez-Brocal, pesquisador e primeiro signatário do estudo
Este método oferece novas possibilidades, uma vez que não limita as amostras aos tecidos frescos disponíveis, mas muito mais amostras armazenadas podem ser usadas. O aplicativo principal será capaz de realizar uma análise retrospectiva do microbioma em nossas amostras preservadas em parafina, como uma alternativa quando tecido fresco não está disponível para câncer colorretal e outras patologias.
Doutor Antonio Llombart, O pesquisador principal do grupo de Oncologia Clínica e Molecular da Fisabio e presidente do Comitê Técnico da AECC de Valência explicou que “Este estudo é um passo muito importante para facilitar a pesquisa de como a microbiota intestinal afeta o desenvolvimento do câncer de cólon em pessoas com Síndrome de Lynch . Isso permitirá ter informações para poder desenvolver novos, métodos mais eficazes de diagnóstico precoce e prevenção, algo que é essencial no tratamento deste tipo de câncer, o que é muito comum. "
Além disso, Doutor Llombart, chefe do Serviço de Oncologia Médica do Hospital Arnau de Vilanova, acrescentou que "É importante continuar avançando na luta contra o câncer colorretal, que a cada ano afeta mais de 38, 790 novos pacientes na Espanha e causa a morte de mais de 15, 770 pessoas. "
Para o estudo, Foram utilizadas 98 amostras (uma de tecidos tumorais e uma de mucosa saudável para cada pessoa) de pacientes com diagnóstico de Síndrome de Lynch, que foram tratados cirurgicamente entre 1996 e 2017. As amostras foram compostas por 21 mulheres e 28 homens, com faixa etária de 33 a 87 anos.