Glavni cilj bio je otkriti je li moguće dobiti podatke o mikrobiomu na temelju uzoraka konzerviranih na ovaj način. To je proučavano u uzorcima pacijenata s Lynchovim sindromom koji su razvili rak debelog crijeva i uspoređeno je postoje li razlike između sekvenci bakterijske DNA crijevne sluznice kao i sekvenci tumora.
Prema Gabrieli Debesa, prvi potpisnik, koji je primio stipendiju za doktorat od Španjolske udruge za borbu protiv raka (AECC) u Valenciji, "Pokazalo se da u tumorskim tkivima, veća je prisutnost nekih bakterijskih skupina povezanih s tumorima u usporedbi s normalnom sluznicom, kao što su Fusobacterium nucleatum , Bacteroides fragilis i Campylobacter. "
Ovi su rezultati već ranije dobiveni u uzorcima svježih tkiva, no nova značajka ove studije bila je ta što ekstrahira te podatke iz starih tkiva sačuvanih u formalinu i parafinu koji su pohranjeni u IBSP-CV-u, Biobanka za biomedicinska istraživanja i javno zdravstvo u Comunitat Valenciana, koji su dio Valencijske biobankovne mreže.
U ovoj vrsti studija, uzorci koji se normalno koriste su iz svježih ili smrznutih tkiva, što zahtijeva davanje uzoraka odmah ili ovisi o složenoj infrastrukturi za zamrzavanje. Međutim, ova studija je uspjela potvrditi prethodne studije, analizirajući nesvježe blokove tkiva.
Andrés Moya, glavni istraživač projekta, objasnio da je to "važan razvoj događaja jer je sačuvan ogroman broj uzoraka, i stoga dostupni u bolnicama i biobankama. Klasično, uzorci se uzimaju nakon operacije s uklonjenog područja radi konzerviranja u parafinskim blokovima. Prednost ovog načina čuvanja je u tome što ne zahtijeva posebne uvjete skladištenja i traju dugi niz godina. "
Međutim, ova vrsta konzerviranja uzoraka predstavlja neke komplikacije. Proučavajući rak, genomske informacije sve više dobivaju na važnosti. Ova metoda nije toliko učinkovita u prikupljanju ovih podataka, s obzirom da oštećuje i ljudsku i bakterijsku DNK, što se koristi za analizu mikrobioma.
Unatoč tim poteškoćama, dobili smo rezultate na temelju prethodnih studija provedenih sa svježim tkivom, gdje je DNK u optimalnim uvjetima za svoje sekvencioniranje. "
Vicente Pérez-Brocal, istraživač i prvi potpisnik studije
Ova metoda nudi nove mogućnosti s obzirom da ne ograničava uzorke na svježa dostupna tkiva, ali se može koristiti mnogo više pohranjenih uzoraka. Glavna će primjena biti u mogućnosti provesti retrospektivnu analizu mikrobioma u našim uzorcima sačuvanim u parafinu, kao alternativa kada svježe tkivo nije dostupno za kolorektalni karcinom i druge patologije.
Doktor Antonio Llombart, glavni istraživač grupe za kliničku i molekularnu onkologiju u Fisabiu i predsjednik Tehničkog odbora Valencia AECC -a objasnio je da je "ova studija vrlo važan korak za olakšavanje istraživanja kako crijevna mikrobiota utječe na razvoj raka debelog crijeva kod osoba s Lynchovim sindromom . To će omogućiti posjedovanje informacija za razvoj novih, učinkovitije metode rane dijagnoze i prevencije, nešto što je bitno u liječenju ove vrste raka, što je vrlo često ".
U Dodatku, Doktor Llombart, voditelj Službe medicinske onkologije u bolnici Arnau de Vilanova, dodao je da je "važno nastaviti napredovati u borbi protiv kolorektalnog karcinoma, koja svake godine pogađa preko 38, 790 novih pacijenata u Španjolskoj i uzrokuje smrt više od 15, 770 ljudi. "
Za studiju, Korišteno je 98 uzoraka (jedan iz tumorskog tkiva i jedan iz zdrave sluznice za svaku osobu) od pacijenata s dijagnozom Lynchovog sindroma, koji su kirurški liječeni u razdoblju od 1996. do 2017. Uzorci su pripadali 21 ženi i 28 muškaraca u dobi od 33 do 87 godina.