Združenja za PTPN11 G /A polimorfizma na introna 3 z Helicobactor pyloriseropositivity, želodčne atrofije in raka želodca v Japanese

društev za PTPN11
G /A polimorfizma na introna 3 z Helicobactor pylori
seropozitivnosti, želodčne atrofije in raka želodca v Japonski
Abstract
Ozadje
Prejšnje študije so pokazale pomen Helicobacter pylori
(H. pylori
) okužbe kot dejavnik tveganja za raka želodca. -Citotoksin povezan gen A (cagA
) pozitivnost bila dokazana za določitev kliničnega rezultata H. pylori
okužbe v prisotnosti SHP-2 (src homologijo 2 vsebuje domena protein tirozin fosfataza-2). Ta študija je namenjena za pregled prej poroča združenje G /A PTPN11 (protein-tirozin fosfataze, nonreceptor-type 11)
polimorfizma (rs2301756) z želodčnim atrofija, kot tudi povezave z rakom želodca v japonski populaciji, uporabljaje velika velikost vzorca.
Metode
študijskih predmetov je bilo 583 histološko diagnozo pri bolnikih z rakom želodca (429 moških in 154 žensk) in s starostjo in frekvence ujemanjem spolnih 1636 nerakave ambulantnih bolnikov (1.203 moških in 433 samic), ki je obiskal Cancer Hospital Aichi Center med 2001-2005. Serum anti-H. pylori
protitelesa in pepsinogens IgG so bile izmerjene za oceno H. pylori
okužbe in želodčne atrofija oz. razmerja obetov (OR) in 95% intervali zaupanja (CIS) so bile izračunane z logističnega modela.
Rezultati
Med H. pylori
seropozitivnih nerakave ambulantne bolnike, je starost in spol prilagojeni ali želodca atrofija je bil 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P
= 0,194) za G /A
, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P
= 0,650) za A /A
, in 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P
= 0,182) za G /A
+ A /A
, glede na G /G
genotip, in da hude atrofije želodca je bila 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P
= 0,079), 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P
= 0,356) in 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P
= 0,057) oz. Med H. pylori
okuženih predmetov (H. pylori
seropozitivnostjo in seronegativne z želodčno atrofija), prilagojena ali hude atrofije želodčne se je dodatno zmanjšala; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P
= 0,012) za G /A
+ A /A
. Porazdelitev genotip pri bolnikih z rakom želodca ni bistveno drugačen od tistega, za H. pylori
okužene predmete brez želodčne atrofije.
Zaključek
Naši študijski Rezultati so pokazali, da so tisti z A /A
genotip PTPN11
rs2301756 polimorfizma so na manjše tveganje za hude atrofije želodca, ki pa niso povezani z manjšim tveganjem za raka želodca, ki delno podpira našo prejšnjo ugotovitev, da je polimorfizem v PTPN11
gena za MHE-2 povezana z želodčno tveganjem atrofija v H. pylori PODJETJA
okuženih japonsko. Biološke vloge te PTPN11
polimorfizma zahtevajo nadaljnje preiskave.
Ozadje
Helicobacter pylori
(H. pylori
) okužba je dobro uveljavljen dejavnik tveganja za nastanek raka želodca z razvojem želodca atrofija in poznejše predrakave lezije. Še posebej, H. pylori
sevi z-citotoksin povezan gen (cagA
) so v močni povezavi s povečanim tveganjem adenokarcinomom želodca [1]. Huda želodca atrofije in corpus-prevladujoča gastritis skupaj z intestinalno metaplazijo dobro uveljavil kot prevladujočih predispozicije za raka želodca [2]. Host provnetne genetski dejavniki v kombinaciji z Poročali so bakterijske virulence dejavniki, kot so CagA za določitev resnosti želodca škode in morebitno klinični izid H. pylori
okužbe [3, 4]. Tveganje za nastanek raka želodca se pomnoži nekajkrat če država pristanišča obeh teh dejavnikov [5, 6]. V vzhodnoazijskih prebivalstva, velika večina H. pylori
so cagA
-positive sevi. CagA je razdeljen v dve glavni podtipe, vzhodnoazijskega vrsto in zahodnega tipa [7]. Razred želodčne atrofije in tveganje za nastanek raka želodca, je večja pri bolnikih z vzhodnoazijskih cagA
-positive sevov kot pri tistih z cagA
HBeAg negativnih ali Zahodni cagA
-positive sevi [8].
CagA protein prenesen iz vezana H. pylori
v želodcu epitelnih celic gostiteljic preko izločanja aparata bakterij tipa IV, in je podvržen tirozinske fosforilacije v gostiteljskih celicah [9]. To povzroči razpršitev fenotipi v epitelijskih celic želodca, ki se imenuje "kolibri fenotip", ki je mislil, da igra ključno vlogo pri patogenezi cagA
-positive H. pylori
okužbe, sčasoma vodi do raka želodca. V tem CagA odvisni morfološko transformacijo epitelnih celic želodca, obstoj SHP-2 (src homologija 2 vsebuje domena protein tirozin fosfataza-2), je bistvena [10]. SHP-2 igra ključno vlogo pri znotrajceličnih signalnih dolvodno od številnih rastnih faktorjev, hormonov in citokinov [11, 12]. Prenesen CagA tvori fizično kompleks z SHP-2 in s tem pospešuje njegovo fosfatazo [10]. Kasnejši Erk (zunajcelični signal regulirano kinaze) aktivnost prav tako prispeva k-CagA povzroča "kolibrije fenotip" [13]. Tako lahko CagA /SHP-2 nastanek kompleksa povzroči nenormalno širjenje, gibanje želodčne epitelnih celic in celične spremembe, ki bi prepričljivo vodi do želodca atrofije in raka želodca.
Ker SHP-2 tesno sodeluje s CagA beljakovin, je naravno, špekulirati, da funkcionalnih polimorfizmov v PTPN11 (protein-tirozin fosfataze, nonreceptor-type 11)
gena SHP-2 lahko v končni fazi vpliva na stopnjo želodčne atrofije in preoblikovanja za rakom želodca v okuženih predmetov. Obstajajo 9 mononukleotidnih polimorfizmov (SNP) na manjšem alelov frekvenci > 0.05 v PTPN11
gena v japonščini na HapMap, vsi, ki se nahajajo v regijah, ki niso kodiranje, in večina od njih so v absolutnem genetsko neravnostežje (LD) (D '
= 1 in r
2 = 1) ali popoln spoj neravnotežje (D
= 1 in r
2'1) med seboj. Pet 9 SNP so pokazali, da je v popolni LD in 3 od njih so pokazali, da je v absolutnem LD ali skoraj absolutno LD (D '
= 1 in r
R2 0,9) pri belcih kot je prikazano na sliki 1, na osnovi HapMap domačo http:. //www HapMap org.. Naš nedavno poročilo pokazalo, da je bil eden PTPN11 G /A
SNP na intron 3 (rs2301756) popolnoma LD drugi PTPN11 G /A
SNP na intronu 10 (rs12229892) [14]. V tej študiji je G /A
SNP pri introna 3 (rs2301756), je bil izbran eden od 3 SNP v absolutnem LD kot predstavnik teh povezanih SNP. Slika 1 Povezava neravnovesje (LD) med 9 enojnih nukleotidnih polimorfizmov (SNP) z manjšo alelov frekvenco > 0.05 v PTPN11 gensko regijo med belci (CEU: prebivalci Utah s rodu iz severne in zahodne Evrope). LD zemljevidi so prikazani po dveh parametrov, r
2 in D
"za belcev (CEU: Utah prebivalci s rodu iz severne in zahodne Evrope). SNP številke v LD zemljevidi ustrezajo RS številke, opisane v zgornjem desnem kotu kart
V H. pylori
povezane z rakom želodca je proces, ki vodi do bolezni, ima tri korake.; H. pylori
okužbe, razvoj želodca atrofija in rakotvornost. Na vsakem koraku se lahko genetske značilnosti in njihove interakcije z načinom življenja vpliva na proces [15]. Za genetskih značilnosti, pomembnih združenj interlevkin
(IL
) -1b
C-31T in C-511T polimorfizmi [16, 17], tumor nekrotizirajočega faktorja (TNF) -α
C-857T in T-1031C polimorfizmi [18], ter NAD (P) H-dehidrogenaze, kinon 1 (NQO1)
C609T polimorfizem [19] s H. pylori
okužbe, in združenja G /A
polimorfizem v intronu 2 Grb2 povezano vezivo 1
(Gab1
) [20], interlevkin
(IL
) 2 T-330g, in IL-13
C-1111T [21 ] z želodčno atrofijo so poročali doslej. Spremenljivo število tandemskih ponovitev (VNTR) polimorfizmov mucin 1 (BRCA1)
so tudi pokazale, da vpliva na H. pylori
okužbe [22, 23]. Čeprav obstaja več študij, da se dokaže polimorfizmov močno povezana s tveganjem za raka želodca, le malo študij ocenili tveganje za korak iz želodca atrofija z rakom želodca [15].
V naših predhodnih študijah med japonskimi in japonski Brazilci je bil prikazan AA
genotip v intronu 3 za zmanjšanje tveganja za razvoj želodčnega atrofija [24, 25]. Pred kratkim je bila druge PTPN11
SNP (rs11066322 v intronu 10 v popolni genetsko neravnostežje za rs2301756) je pokazala, da je treba bistveno povezana z serumskih vrednosti ApoB v britanski prebivalstva [26], ki podpirajo hipotezo, da je to PTPN11
polimorfizem funkcionalno . Ta študija je namenjena za potrditev prej poročali pridružitvi med PTPN11
polimorfizma (rs2301756) in atrofija želodčne merjeno z serumskih pepsinogens v številnih japonskih predmetov, kot tudi, da preuči povezavo s tveganjem za nastanek raka želodca.
Metode
Predmeti
bili predmeti udeleženci HERPACC (epidemiološke raziskave Program temelji Hospital v Aichi Cancer Center) študije, v kateri so bili prvi obisk bolnike zaporedno povabljeni, da zagotovijo podatke v načinu življenja in vzorec krvi, potem ko pridobi privolitev [27]. Med udeleženci, ki so obiskali Cancer Hospital Aichi Center od leta 2001 - 2005, 583 primerov diagnozo raka želodca in starost in spol frekvence ujemanjem 1.638 raka proste bolnike so bili vzorčeni kot kontrolno skupino, med katerimi so bili izključeni dve bolnike, ker niso mogli genotipizirajo, zaradi česar 583 primerov in 1.636 kontrole upravičene za analize. Privolitev je bila pridobljena iz vseh predmetov in protokol študija je bila odobrena s Odbori za etiko v Aichi Cancer Center in Nagoya University Graduate School of Medicine.
Vzorci in diagnostični kriteriji
Njihove vzorcev seruma so bili takoj shranjeni pri -20 ° C C do analize. Anti-H. pylori
protiteles IgG je bila izmerjena z encimsko imunski test (EIA) kompleta "E ploščo" Eiken "H. pylori
protiteles" (Eiken Kagaku, Tokyo, Japonska). V skladu z navodili, ki s tem kompletu, 10.0 enote ali višje je štela seropozitivni. Serumskih pepsinogens (PG) smo merili z encimskim imunotestom kemiluminescenca (CLEIA). Želodca atrofije sluznice so združeni v "nič" (PS I > 70 ng /ml ali PG I /PG II > 3), "blagi" (PG I ≤ 70 ng /ml in PG I /PG II ≤ 3, z izjemo "hude" primere), ali "hudi" (PG I ≤ 30 ng /ml in PG I /PG II ≤ 2). Ker so bili načrtovani serumi primerov raka želodca, ki se uporabljajo za študije z višjo prioriteto, protitelo in PGS o primerih, ki niso bile izmerjene.
Genotipizacije
DNA je bila vzeta iz buffy coat pomočjo Qiagen DNeasy mini kit ( Qiagen, Hilden, Nemčija). PTPN11
G /A polimorfizem (rs2301756) smo genotipizacijo z verižno reakcijo s polimerazo s soočanjem dveh parov začetnih oligonukleotidov (PCR-CTPP) [28]. Primerji so F1: GGA TTA OAS GCA TAA GCC AC, R1: GAC CAC TAA ACT TCT TAA ATG AGC, F2: CAT TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA in R2: CTC TGG CTC TCT CGT ACA AGA. Pogoji pomnoževanja so bili 10 minut začetnega denaturacija pri 95 ° C, čemur sledi 30 ciklov po 1 min pri 95 ° C, 1 minuto pri 64 ° C in 1 minuto pri 72 ° C, nato pa 5-min končni razširitvi pri 72 ° C C. Pomnožene DNA smo vizualizirali na 2% agaroznem gelu z etidijevim bromidom barvanjem. Pomnožene DNA je 201 bp za G /g
genotipa, 201 bp in 339 bp za G /A
genotipa, 339 bp za A /A
genotipom in 490 bp za skupno pasu [24].
Statistična analiza
razlike v razmerjih, so bili pregledani z Fisherjev test. 95% intervala zaupanja (CIS) za odstotke so bili izračunani na podlagi binomska porazdelitev. Logistična regresijska analiza je bila opravljena za oceno razmerja obetov (OR) in 95% CIS. Starost je bila prilagojena kot neprekinjen spremenljivko v logistični model. H. pylori
okuženi predmeti so opredeljene kot tiste s H. pylori
seropozitivnosti ali želodca atrofijo, saj v veliki večini primerov želodca atrofija razvija po H. pylori
okužb. Trendi za H. pylori
okužbo želodčne atrofije ali razvoj raka želodca, po spolu in starostnih kategorijah smo primerjali s pomočjo χ 2 test za trend. Izračuni so bile narejene s pomočjo stata različica 7 (stata Corp, College Station, TX).
Rezultati
Značilnosti pogostosti teme in alelov v PTPN11 polimorfizma
značilnosti predmetov so zbrani v tabeli 1 . je bila 58,7 ± 10,6 y povprečna starost ± standardni odklon (razpon: 25-84 y) za nadzor in 58,8 ± 10,5 y (razpon: 27-80 y) primerih. Samice so 26,5% v kontrolni skupini in 26,4% v primerih. Približno tri četrtine kontrol so bili okuženi s H. pylori
, medtem ko je približno ena tretjina kontrol želodca atrofijo. Frekvenca genotipa na PTPN11
polimorfizma med kontrolami je v ravnovesju Hardy-Weinberg je (χ 2 = 0,047, P
= 0,828). Testirali smo trend H. pylori
okužbe, želodčne atrofijo ali razvoj raka želodca, po spolu in starostnih skupinah, ki so razkrili pomemben trend za visoko pylori
stopnjo okužbe H. pri moških (P
-vrednost za trend < 0,001) in višje starostne kategorije (P
< 0,001), in za večjo razširjenost želodčne atrofije pri višjih starostnih kategorijah (P
< 0,001) .table 1 Značilnosti predmetov in PTPN11
rs2301756 polimorfizem.

Controls n = 1636
zadevah n = 583
H. pylori (-)
H. pylori (+)
GA (-)
GA (+)
n
699
442
495
583
seks
Moški
479 (68,5%)
363 (82,1%)
361 (72,9%)
429 (73,6%)
ženski
220 (31,5%)
79 (17,9%)
134 (27,1%)
154 (26,4%)
Starost
< 30
6 (0,9%)
1 (0,2%)
1 (0,2%)
2 (0,3%)
30-39
67 (9,6%)
11 (2,5%)
3 (0,6%)
31 (5,3%)
40-49
138 (19,7%)
54 (12,2%)
31 (6,3% )
64 (11,0%)
50-59
194 (27,8%)
151 (34,2%)
141 (28,5%)
214 (36,7%)
60-69
211 (30,2%)
152 (34,4%)
221 (44,7%)
166 (28,5%)
70-
83 (11,9%)
73 (16,5%)
98 (19,8%)
106 (18,2%)
genotipa
G
/G
483 (69,1%)
293 (66,3%)
350 (70,7%)
396 (67,9%)
G
/A
198 (28,3%)
135 (30,5%)
131 (26,5%)
174 (29,9%)

/A
18 (2,6%)
14 (3,2%)
14 (2,8%)
13 (2,2%)
GA (-). in GA (+) pomeni brez atrofijo in atrofijo, oziroma
PTPN11 polimorfizem, H. pylori
seropozitivnosti, želodca atrofija in rak želodca
ni bilo signifikantne povezave med PTPN11
polimorfizem in seropozitivnosti, čeprav je bil ali z /A
genotipa 1.19 glede na G /G
genotip (tabela 2) .table 2 Kvota razmerja (najbolj oddaljene regije ) in 95% intervali zaupanja (CIS) za PTPN11
rs2301756 polimorfizma za H. pylori
seropozitivnosti.
genotip , alel
n
H. pylori +
H. pylori + (%)
ORa
95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G
2716
1552
57,1
1
Reference -

556
322
57,9
1.03
0,85-1,25
0,387
AOR za vsak genotip je bil izračunan po starosti in spolu prilagojen model logistične regresije, in surovo ali je bila izračunana za vsak alel.
je bilo 937 H. pylori
seropozitivnih predmetov, med katerimi so imeli 495 (52,8%) preiskovancev atrofijo. Na eni strani je bilo 45 (6,4%) oseb z atrofijo med 699 seronegativne. Razlika v razširjenosti je bila statistično pomembna (P
< 0,001)
Tabela 3 prikazuje porazdelitev genotip po seropozitivnosti in atrofijo.. Ni bilo oseb z A /A
genotipom med seronegativnih udeleženci atrofija. V skladu s tem prilagodi ali želodca atrofije med seronegativne ni bilo zanesljivo za A /A
genotipa; porazdelitev genotip ni bila značilno povezana z želodčno atrofijo s 3 x 3 Fisherjev natančni test (P
= 0,196) .table 3 PTPN11
rs2301756 distribucijskega genotip po H. pylori
seropozitivnosti in položaj želodca atrofija.
Genotip
H. pylori seronegativni
H. pylori seropozitivni


GA (-)
GA (+)
GA (++)
GA (-)
GA (+)
GA (++)
G
/G
447 (68,3%)
11 (64,7%)
25 (89,3%)
293 (68,4%)
223 (68,2%)
127 (75,6%)
G
/A
189 (28,9%)
6 (35,3%)
3 (10,7%)
135 (28,9%)
93 (28,4%)
38 (22,6%)

/A

18 (2,8%)
0 (0,0%)
0 (0,0%)
14 (2,7%)
11 (3,4%)
3 (1,8%)
Skupaj
654 (100%)
17 (100%)
28 (100%)
442 (100%)
327 (100%)
168 (100%)
GA (-)., GA (+) in GA (++) ne kažejo atrofijo, blago atrofijo in hudo atrofijo, oziroma
starost in spol prilagojene ALI želodčne atrofije med H. pylori
seropozitivnih predmeti je bilo 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P
= 0,194) za G /A
, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P
= 0,650) za A /A
in 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P
= 0,182) za G /A
+ A /A
, v primerjavi z G /g
genotip. V starosti in spolu prilagojene ALI hude želodčne atrofije med H. pylori
seropozitivni predmeti je bila 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P
= 0,079) za G /A
, 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P
= 0,356) za A /A
in 0,68 (95% IZ 0.46-1.01, P
= 0,057) za G /A
+ A /A
ko so tisti brez resnega atrofije želodčne definirana kot referenca (tabela 4). Ko H. pylori
seropozitivni predmeti in seronegativni bolniki z želodčno atrofije so šteti H. pylori
okuženih osebah je starost in spol prilagojene ALI hude želodčne atrofije med H. pylori PODJETJA
okuženih je nadalje zmanjšana; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P
= 0,012) za G /A
+ A A
(tabela 4) .table 4 genotipov za PTPN11
rs2301756 polimorfizma, odds razmerjih /( najbolj oddaljene regije) in 95% intervali zaupanja (CIS) iz želodca atrofijo v H. pylori
seropozitivni predmeti (a) in H. pylori
okužene osebe (b)
(a)









genotipom, alel
n
vse želodca atrofija (%)
ORa
95% CI
Pvalueb
Huda želodca atrofija (%)
ORb

95% CI
Pvalueb
G
/G
643
350 (54,4)
1
Reference
-
127 (19,8)
1
Reference -
G
/A
266
131 (49,2)
0,82
0,62-1,10
0,194
38 (14,3)
0,70
0,47-1,04
0,079

/A
28
14 ( 50.0)
0,84
0,39-1,81
0.650
3 (10,7)
0,56
0,17-1,91
0,356
G
/A
+
/A
294
145 (49,3)
0,83
0,62-1,09
0,182
41 (13,9)
0,68
0.46- 1.01
0,057
G
1552
831 (53,5)
1
Reference -
292 (18,8)
1
Reference -

322
159 (49,4)
0,85
0.66-1.08
0,097
44 (13,7)
0,67
0,45-0,96
0,015
(b)
genotip, alel
n
Vse želodca atrofija (%)
ALI
95% CI
P vrednost b
Huda želodca atrofija (%)
ALI
95% CI
P vrednost b
G
/G
677
383 (56,6)
1
Reference -
151 (22,3)
1
Reference -
G
/A
274
139 ( 50,7)
0,80
0,60-1,06
0.123
41 (15,0)
0,63
0,43-0,93
0,019

/A

28
14 (50,0)
0,77
0,36-1,67
0,512
3 (10,7)
0,49
0.14-1.67
0,254
G
/A
+ A
/A
302
153 (50,7)
0,80
0,60-1,05
0,106
44 (14,6)
0,62
0,42-0,90
0.012
G
1628
905 (55,6)
1
Reference -
343 (21,1)
1
Reference -

330
167 (50,6)
0,82
0,64-1,05
0,102
47 (14,2 )
0,62
0.44-0.87
0,005
AOR za bil vsak genotip izračunana po starosti in spolu prilagojen model logistične regresije, in surovo ali je bila izračunana za vsak alel.
BP
vrednosti manj kot 0,05 so prikazane v poševnem tisku
.
Slika 2 prikazuje porazdelitev pepsinogen I /II razmerje po PTPN11
rs2301756 genotipa med H. pylori
osebah, okuženih s PG I ≤ 70 ng /ml. V skladu z ugotovitvijo, da osebah z
alel bili v bistveno zmanjšanim tveganjem hude atrofije želodca /II razmerje manj kot 2 je bila pogostnost preiskovancev s PS I nižja pri osebah z A
alel kot tisti z G /G
genotip. Slika 2 Razdelitev pepsinogen (PG) I /II razmerje po PTPN11 rs2301756 genotip med H. pylori okuženih predmetov, raven PG I ≤ 70 ng /ml.
Da bi raziskali, kako to polimorfizem od PTPN11
prispeva k želodca nastanek raka med H. pylori PODJETJA
okuženih predmetov, smo tudi izračunali ali raka želodca v primerjavi s H. pylori
okuženih osebah brez želodca atrofijo. Starost in spol prilagojene ALI raka želodca je bila 0,97 (95% CI 0,74-1,28, P
= 0,839) za G /A
, 0,71 (95% CI 0,33-1,53, P
= 0,381) za A /A
in 0,95 (95% IZ 0.73-1.23, P
= 0,689) za G /A
+ A /A
, glede na G /G
genotip, od katerih nobena ni bila statistično pomembna (Tabela 5) .table 5 genotipov za PTPN11
rs2301756 polimorfizem, starost, spol prilagojene razmerja obetov (OR) in 95% intervali zaupanja (CIS) iz želodca raka glede na H. pylori
okuženi predmeti brez želodčne atrofije (HP-okuženi brez atrofijo).
Genotip
HP okužen brez atrofija n = 442
raka želodca n = 583
ALI
95% CI
P vrednost
G
/G

293 (66,3%)
396 (67,9%)
1
Reference -
G
/A
135 (30,5%)
174 (29,8%)
0,97
0,74-1,28
0,839

/A
14 (3,2%)
13 (2,2%)
0.71
0,33-1,53
0,381
G
/A
+ A
/A
149 (33,7%)
187 (32,1% )
0,95
0,73-1,23
0,689
G
721 (81,6%)
966 (82,8%)
1
Reference
-

163 (18,4%)
200 (17,2%)
0.92
0,72-1,16
0,243
AOR za vsak genotip je bil izračunan po starosti in spolu prilagojena logistični regresijski model, in surovo ali je bila izračunana za vsak alel.
Razprava
Ta študija je pokazala, da tisti, ki gostijo a
alel v tem PTPN11
rs2301756 polimorfizma na introna 3 je imela bistveno manjše tveganje huda želodca atrofija. To je v skladu z našo hipotezo, da je bil razvoj v želodcu atrofija po cagA
-positive H. pylori
okužbe redkejše med tistimi z A /A
genotipom, kot med tistimi, ki z g /g
genotipa [24 25], čeprav je opaziti znaten združenje samo za hude želodčne atrofije pri tej študiji. Ker bioloških procesov v okužbo, razvoj atrofija, in karcinogeneza se razlikujejo [15], združenje tega polimorfizma s samo atrofičnemu razvojem zdelo biološko verjetna.
Medtem ko je bilo malo informacij o morebitni funkciji PTPN11
polimorfizmov, biološke lastnosti SHP-2, ki so vedno bolj razumejo. SHP-2 je eden od dveh obstoječih ne-transmembranski (intracelularno) protein tirozin fosfataze sesalcev (PTP), ki vsebujejo src homoloških 2 (SH2) domen. Vezava tirozin fosforiliranega CagA s področja SH2 naj bi inducira konformacijsko spremembo v SHP-2, ki oslabi inhibitorni interakcijo med PTP in N-terminalnih SH2 domen, sčasoma vodi do aktivacije SHP-2 fosfataze [10, 29, 30] . G /A
polimorfizma v intronu 3 PTPN11
se nahaja 223 baznih parov gorvodno od eksonu 4, ki kodira začetni del SH2 domene C-terminal. Čeprav je biološka vloga sedanjega polimorfizma še ni clearified je polimorfizem ima lahko določen vpliv na oblikovanje PTPN11
mRNA spajanje variant, od katerih so bili 8 oblike poročali doslej (SpliceMinor strani The Genomics &razvit; bioinformatike Group (GBG) NKI: http: //www tigerteamconsult ing com /SpliceMiner /)... Podatki LD med na PTPN11
SNP je prikazano na sliki 1, je, da, in ni natančen podatek o LD v japonščini je za belci so trenutno na voljo. Obstaja tudi nekaj PTPN11 PODJETJA
SNP katerega LD stanje je ostalo neznano (SNP8 in SNP9 na sliki 1). Funkcija PTPN11
polimorfizma na eksonu 3 (rs2301756) in drugih PTPN11
SNP na interakcijo med MHE-2 in CagA v japonskih in drugih etnij zahteva dodatne preiskave.
Čeprav skupina G
alel od PTPN11
lahko del genske lastnosti za razvoj želodčne atrofije prek signalov iz CagA, se zdi, da tudi druge genetske lastnosti, ki sodelujejo v tem procesu. CagA veže več molekul; Grb2, ki transduces signal Ras-MAPK poti povzročajo proliferacije celic, c-met hepatocitnega rastnega faktorja (HGF) receptor, ki imajo vlogo celične proliferacije in gibljivost, ZO-1, tesno povezovalni protein, in par1 /Mark kinazo, ki ima ključno vlogo pri epitelijskega polarnosti [31-35]. Čeprav niso opravili nobene študije, lahko funkcionalni polimorfizmi teh molekul tudi kandidati genetskih lastnostih želodčne atrofije.
A
je alel dominanten alel za PTPN11
polimorfizma na introna 3, med belci (0,875 za 120 kromosomov), ne pa tudi med Japonci (0,178 od 902 kromosomi) in kitajski (0,083 od 48 choromosomes) [26]. Ta študija je pokazala, da je A
alel frekvenca 0,170 med našimi japonskimi preiskovanci iz kontrolne skupine, podobno kot se poroča alelov frekvenco v japonščini.
Ta raziskava ima nekaj omejitev. Čeprav je bila H. pylori
status kontrolnih osebah preučiti z seroloških testov, nismo preverite stanje CagA. Kot so poročali na Japonskem, kar je skoraj 100% H. pylori
sevi imajo funkcionalno OAS
patogenosti otok (OAS
PAI), ki kodira in proizvaja CagA protein [36]. Predhodna študija je tudi potrdil, da so bili skoraj vsi sevi izolirane iz japonskih predmetov vzhodnoazijskih cagA
-positive sevi [37], kar kaže, da H. pylori
napetosti v naših študijskih predmetov ima tudi CagA. Ena omejitev je povezano z diagnozo želodčnega atrofije. To je bilo storjeno v celoti na podlagi serumskih vrednosti pepsinogen in ne s histološko oceno, saj je večina kontrolnih preiskovancev ni prišlo gastrointestinalne endoskopije z biopsijo. Vendar pa je metoda pepsinogen uveljavljena kot nadomestni marker želodca atrofije [38-40]. Potrjeno merilo za želodčne atrofija PG I Â 70 ng /ml in PG I /razmerje II ≤ 3.0, in da je za hudo atrofijo želodca je PG I Â 30 ng /ml in PG I /razmerje II ≤ 2,0, oba ki naj bi bili zanesljivi, ker se pogosto uporablja v praksi, na Japonskem [41, 42]. Kar zadeva primerov želodčnega raka na H. pylori
seropozitivnosti in pepsinogen vrednosti niso bili pregledani, vendar je večina primerov želodčnega raka zdelo, da je H. pylori
pozitivni primeri z želodčno atrofijo [43, 44]. Glede na to, da črevesno vrsta raka želodca, prevladujoča oblika raka želodca na Japonskem, izhaja iz želodca atrofije s H. pylori
okužbe povzročajo, in raka želodca difuzni tip pojavi, ne glede na želodčne atrofije [45], se zdi zanimivo, da izvedbo analize podskupin po teh dveh histoloških tipov. Ta analiza bi odkril pridružitvi te PTPN11
polimorfizma s koraki želodca rakotvornosti bolj jasno. Vendar pa ne bi opravili to analizo, zaradi nerazpoložljivosti histoloških podatkov.

• CDK povezano Cullin 1 lahko spodbujajo proliferacijo celic in zavirajo-cisplatin inducirano apoptozo v AGS želodčni rak celične linije
• Analiza proteinov celičnih povezanih cikla v želodčni intramucosal raka diferencirana tipa, ki temeljijo na mucin fenotipi: nova hipoteza zgodnje želodca rakotvornost, ki temelji na mucin fenotip