Udruge od PTPN11 G /A polimorfizma kod introna 3 s Helicobactor pyloriseropositivity, želuca atrofije i karcinoma želuca u Japanese

udruga za PTPN11
G /A polimorfizma kod introna 3 s Helicobactor pylori pregled seropozitivnosti, želuca atrofije i karcinoma želuca u japanska pregled Sažetak pregled Pozadina pregled prethodne studije su pokazale značaj Helicobacter pylori
(H. pylori
) infekcije kao faktor rizika od raka želuca. Citotoksin povezana gen A (CAGA pregled) pozitivni Pokazano je da se odredi klinički ishod H. pylori infekcije pregled u prisutnosti SHP-2 (src homologija 2 domena sadržava protein tirozin fosfataze-2). Cilj ovog rada bio je ispitati prije uočenu povezanost G /A PTPN11 (protein-tirozin fosfataza, nereceptorsku-tipa 11)
polimorfizma (rs2301756) sa želučanim atrofije, kao i povezanost s rakom želuca u japanskoj populaciji, prikazano velike veličine uzorka.
Metode pregled Ispitanici su 583 histološki dijagnosticiranih bolesnika s karcinomom želuca (429 muškaraca i 154 žena) i dobnih i spolnih frekvencije podudaraju 1.636 ambulantnih pacijenata bez raka (1.203 muškaraca i 433 žena), koji je posjetio Aichi raka KBC između 2001-2005. Serum anti-H. pylori pregled IgG antitijela i pepsinogens mjereni su za procjenu H. pylori pregled infekcije i želučane atrofije, respektivno. Tečajevi omjera (OR) i 95% intervali pouzdanosti (CIS) su izračunate pomoću logističkog modela. pregled Rezultati
Među H. pylori
seropozitivnih ambulantno bez raka, ostarjeli i seks-podešava OR želuca atrofija je 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P pregled = 0.194) za G /A Netlogu, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P pregled = 0,650) za a /a pregled, i 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P pregled = 0,182) za G /a pregled + a /a pregled, u odnosu na G /G pregled genotip i to teške želučane atrofije bio 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P pregled = 0,079), 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P pregled = 0,356) i 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P pregled = 0,057) , respektivno. Među H. pylori
om (H. pylori
seropozitivnih ispitanika i seronegativnih osobe s želučanim atrofija) je podešena ili teške želučane atrofije je dodatno smanjen; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P pregled = 0,012) za G /A pregled + A /A
. Raspodjela genotipa u bolesnika s karcinomom želuca nije bio značajno različit od onog za H. pylori
om bez želučane atrofije. Pregled Zaključak
Naši rezultati istraživanja otkrili da oni s A /A pregled genotip od PTPN11 pregled rs2301756 polimorfizma su na nižim rizikom od ozbiljnih želučane atrofije, ali nisu povezana sa smanjenim rizikom od raka želuca, koji je djelomično podržan naš prethodni nalaz da je polimorfizam u PTPN11 pregled gena koji kodira SHP-2 bio povezane sa želučanim rizik atrofije u H. pylori
zaraženo japanski. Biološke uloge ovog PTPN11 pregled polimorfizma zahtijevaju daljnje istraživanje.
Pozadina pregled, Helicobacter pylori pregled (H. pylori pregled) infekcija je uhodani faktor rizika od raka želuca kroz razvoj želuca atrofija i naknadne prekancerozne lezije. Posebno, H. pylori
sojevi s citotoksin povezana gen (CAGA
) su u jakom vezom s povećanim rizikom želučanog adenokarcinoma [1]. Teška želuca atrofija i korpus pretežni gastritis uz intestinalne metaplazije dobro uspostavljena kao dominantne predispozicije za rak želuca [2]. Domaćin proupalnih genetskih čimbenika u kombinaciji s bakterijskih čimbenika virulencije kao što su CagA su izvijestili kako bi se utvrdilo ozbiljnost oštećenja želuca i eventualni klinički ishod H. pylori
infekcije [3, 4]. Rizik od raka želuca množi nekoliko puta ako domaćin krije oba ova faktora [5, 6]. U istočno-azijskih populacija, velika većina H. pylori pregled su CagA pregled pozitivnih sojeva. CagA je podijeljen u dvije glavne podvrste, istočnoazijskog vrsti i zapadnog tipa [7]. Stupanj želučane atrofije i želučane rizik od raka veća je u bolesnika s istočnoazijske CagA pregled pozitivnih sojeva u odnosu na one s CagA
-negativno ili Western CagA pregled pozitivnih sojeva. [8] pregled CagA protein premješteni od vezan H. pylori
u domaćina epitelnim stanicama želuca preko uređaja za izlučivanje bakterijsku tipa IV i prolazi fosforilaciju tirozina u stanicama domaćina [9]. To uzrokuje raspršenje fenotipova u želučanom epitelnim stanicama, pod nazivom "ptice fenotip", koji je mislio da igraju ključnu ulogu u patogenezi CagA pregled pozitivnih H. pylori pregled, infekcije, na kraju dovodi do želučanog karcinoma. U ovom CagA ovisna morfološkog transformacije želuca epitelnih stanica, postojanje SHP-2 (src homologija 2 domena sadržava protein tirozin fosfataze-2) je bitno [10]. SHP-2 igra ključnu ulogu u unutarstanične signalizacije nizvodno od brojnih faktora rasta, hormona, i citokini [11, 12]. Premještena CagA tvori fizički kompleks s SHP-2 čime stimulirajući njegovu aktivnost fosfataze [10]. Naknadno Erk (izvanstanični signal regulirane kinaze) aktivnost također doprinosi CagA izazvanog "ptice fenotipa" [13]. Dakle, CagA /SHP-2 formiranja kompleksa može izazvati abnormalnu proliferaciju, pokret želučanog epitelnih stanica i staničnih promjena koje definitivno može dovesti do želuca atrofije i želučanog karcinoma.
Od SHP-2 blisko komunicira sa CagA proteina, to je prirodno spekulirati da funkcionalne polimorfizama u PTPN11 (protein-tirozin fosfataza, nereceptorsku-tipa 11)
gena koji kodira SHP-2 u konačnici može utjecati na stupanj želučanog atrofije i transformacije do raka želuca u inficiranim predmetima. Postoji 9 u jednom nukleotidu gena (SNP-ova) na manje frekvencije alela > 0.05 u PTPN11 pregled gena u japanskom na HapMap, svi koji se nalaze u ne-kodiranje regije, a većina od njih su u apsolutnom spojnici neravnoteže (LD) (D 'pregled = 1 i r pregled 2 = 1) ili potpuna disekvilibriju vezanosti (D 'pregled = 1, a r pregled 2 < 1) međusobno. Pet od 9 SNP su pokazala da se u potpunoj LD i prikazani su tri od njih biti u apsolutnom LD ili skoro apsolutnu LD (D 'pregled = 1 i r pregled 2 > 0,9) u bijelaca kao što je prikazano na slici 1, na temelju početne HapMap http:. //www hapmap org.. Naš nedavni izvještaj otkriva da je jedan PTPN11 G /A pregled SNP na introna 3 (rs2301756) bio je u potpunoj LD s drugim PTPN11 G /A pregled SNP na introna 10 (rs12229892) [14]. U ovom istraživanju, G /A pregled SNP na introna 3 (rs2301756), jedan od 3 SNP u apsolutnom LD je izabran kao predstavnik tih povezanih SNP. Slika 1 Povezanost ravnoteže (LD) između 9 polimorfizama (SNP-ova) s manje frekvencije alela > 0.05 u genskoj regiji PTPN11 među bijelci (CEU: Utah stanovnika s precima iz sjeverne i zapadne Europe). LD karata prikazati s dva parametra, R
2 i D Netlogu 'za bijelaca (CEU: Utah građanima podrijetlo iz sjeverne i zapadne Europe). SNP brojevi u LD karata odgovaraju RS brojeva koji su opisani u gornjem desnom dijelu karata
U H. pylori
vezane raka želuca, proces dovodi do bolesti ima tri koraka. H. pylori
infekcije, razvoj želuca atrofije i karcinogeneze. Na svakom koraku, genetske osobine i njihove interakcije s načinom života može utjecati na proces [15]. Za genetskim osobinama, kao i značajne udruge interleukina Netlogu (IL pregled) -1B pregled C-31T i C-511T polimorfizama [16, 17], faktor nekroze tumora (TNF) -α pregled C-857T i T-1031C polimorfizmi [18], i NAD (P) H dehidrogenaze, kinon 1 (Nqo1) pregled C609T polimorfizma [19] s H. pylori pregled infekcije, kao i udruge G /a
polimorfija na introna 2 Grb2 povezana vezivo 1
(Gab1
) [20], interleukin pregled (IL
) 2 T-330 g, i IL-13, C-
1111T [21 ] sa želučanom atrofije su izvijestili do danas. Varijabilni broj ponovljenih (VNTR) polimorfizama mucina 1 (MUC1) pregled, također se pokazalo da utječu na H. pylori
infekcija [22, 23]. Iako postoji nekoliko studija kako bi pokazali polimorfizma značajno povezane s rizikom od raka želuca, samo nekoliko studija procijenila rizik za korak od želučanog atrofije do rakom želuca [15].
U našim ranijim istraživanjima među japanskim i japanske Brazilaca je AA pregled genotip u intronu 3 je pokazano da se smanji rizik od razvoja želučanog atrofije [24, 25]. Nedavno je još jedan PTPN11 pregled SNP (rs11066322 na introna 10 u potpunoj spojnici neravnoteže na rs2301756) je utvrđeno da je značajno povezana s serumu apoB u britanskoj populaciji [26], podupire hipotezu da je to PTPN11 pregled polimorfizam bude funkcionalna , Ciljevi istraživanja su potvrdili ranije uočenu povezanost između PTPN11
polimorfizma (rs2301756) i želučanog atrofije mjereno sa pepsinogens seruma u velikom broju japanskih subjekata, kao i ispitati povezanost s rizikom od nastanka karcinoma želuca.
Metode pregled Subjekti pregled, ispitanici su bili sudionici HERPACC (bolnica-based epidemiološka istraživanja program u Aichi Cancer Center) studija, u kojoj je prvi posjet bolesnici na vanbolničkom liječenju su redom pozvani pružiti lifestyle podatke i uzorak krvi nakon dobivanja informirani pristanak [27]. Među sudionicima koji su posjetili Aichi Cancer Hospital Center od 2001 - 2005, 583 slučajeva dijagnosticira kao rak želuca i dobnih i 1.638 raka besplatno bolesnici na vanbolničkom liječenju uzorkovane su kao kontrolna skupina, među kojima su bili isključeni dva bolesnici na vanbolničkom liječenju uskladiti sex-frekvencije, jer oni nisu mogli se genotipiziran, ostavljajući 583 slučajeva i 1.636 kontrola koje ispunjavaju uvjete za analizu. Informirani pristanak dobiven iz svih predmeta, a postupak Istraživanje je odobreno od strane Povjerenstva za etiku u Aichi Cancer Center i Nagoya University Graduate School of Medicine.
Uzorci i dijagnostički kriteriji
Njihovi uzorci seruma su odmah pohranjeni na -20 ° C C do analize. Anti-H. pylori pregled IgG antitijela je mjeren sa enzimski imuno (EIA) kit "E tanjur 'Eiken' H. pylori pregled antitijela" (Eiken Kagaku, Tokyo, Japan). Prema uputama koje ste dobili s ovom kompletu, 10,0 jedinica ili veće je smatran seropozitivnih. Seruma pepsinogens (PG) je mjerena enzimskom imunoanalizom kemiluminescencija (CLEIA). Želučane sluznice atrofija se svrstati u "ništa" (PG I > 70 ng /ml ili PG I /PG II > 3), "blaga" (PG I ≤ 70 ng /ml i PG I /PG II ≤ 3, isključujući "teškim" slučajeva), ili "ozbiljne" (PG i ≤ 30 ng /ml i PG i /PG II ≤ 2). Budući da su planirani uzorci seruma slučajeva raka želuca koja se koristi za proučavanje s višim prioritetom, antitijela i PGS slučajeva nisu mjerene. Pregled, genotipizacija pregled DNK izolirana je iz Buffy kaput korištenjem Qiagen DNeasy mini kit ( Qiagen, Hilden, Njemačka). PTPN11 pregled G /A polimorfizma (rs2301756) je genotipiziran sa lančane reakcije polimeraze s suočavanju dvije parova početnica (PCR-CTPP) [28]. Klice su F1: GGA TTA CAG OKS TAA GCC AC, R1: GAC CAC TAA ACT TCT TAA ATG AGC, F2: mačka TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA i R2: CTC TGG CTC TCT CGT ACA AGA. Pojačanja uvjeti su 10 min u početnoj denaturacije na 95 ° C, a zatim 30 ciklusa od 1 min na 95 ° C, 1 min na 64 ° C i 1 min na 72 ° C, a zatim je 5 minuta finalna ekstenzija na 72 ° C C. Umnožena DNA se vizualizirati na 2% -tnom agaroznom gelu s etidijevim bromidom bojanja. Umnožena DNA je 201 bp za g /g pregled, genotip, 201 bp i 339 bp za G /A
genotipa, 339 bp za A /A
genotipa i 490 bp za zajednički bend [24]. pregled, Statistička analiza pregled razlike u omjerima su ispitani Fisherov egzaktni test. Intervali 95% pouzdanosti (CIS) za postotke izračunate su na osnovu binomna distribucija. Logistička regresijska analiza je provedena za procjenu omjer vjerojatnosti (OR ') i 95% CI. Starost je podešen kao kontinuirani varijable u logističkom modelu. H. pylori
om je definirano kao one s H. pylori pregled seropozitivnosti ili želuca atrofije, jer je u velikoj većini slučajeva želuca atrofija razvija nakon H. pylori pregled infekcija. Trendovi za H. pylori pregled infekcija, želučani atrofije ili razvoja raka želuca po spolu ili dobne skupine uspoređene pomoću χ 2 test za trend. Izračuni su učinili pomoću Stata verziju 7 (Stata Corp, College Station, TX). | Rezultati
Karakteristike predmeta i frekvencije alela polimorfizma PTPN11
karakteristikama ispitanika prikazani su u tablici 1 . prosječna dob ± standardna devijacija bila je 58,7 ± 10,6 y (raspon: 25-84 y) za kontrole i 58.8 ± 10.5 y (raspon: 27-80 y) za slučajeve. Ženke su 26,5% u kontrolnoj skupini i 26,4% u slučajevima. Oko tri četvrtine kontrole su zaražene s H. pylori Netlogu, a oko trećine od kontrola imao želučane atrofiju. Genotipa frekvencija PTPN11 pregled polimorfizma među kontrola je bila u Hardy-Weinberg je ravnoteže (χ 2 = 0.047, P pregled = 0,828). Testirali smo trend za H. pylori pregled infekcija, želučani atrofiju ili razvoj karcinoma želuca po spolu ili dobne kategorije, koje su pokazale značajan trend za veću H. pylori
stopa infekcije u muškaraca (P pregled-vrijednost za trendu < 0,001), te većih dobne kategorije (P izvoznici < 0,001), a za veće učestalosti želučane atrofije u višim dobnim kategorijama (P izvoznici < 0,001) .table 1 Karakteristike subjekata i PTPN11
rs2301756 polimorfizma. pregled pregled, kontrola n = 1636
slučaju n = 583
H. pylori (-) pregled H. pylori (+) pregled, GA (-) pregled, GA (+) pregled, n pregled 699 pregled 442 pregled 495 pregled 583 pregled Sex pregled Muški pregled 479 (68,5%) pregled, 363 (82,1%)
361 (72,9%)
429 (73,6%), pregled ženskih pregled, 220 (31,5%)
79 (17,9%) pregled, 134 (27,1%)
154 (26,4%) pregled Age izvoznici < 30 pregled 6 (0,9%)
1 (0,2%) pregled, 1 (0,2%) pregled 2 (0,3%)
30-39 pregled 67 (9,6%) pregled 11 (2,5%) pregled 3 (0,6%)
31 (5,3%)
40-49 pregled 138 (19,7%)
54 (12,2%)
31 (6,3% )
64 (11,0%)
50-59
194 (27,8%)
151 (34,2%)
141 (28,5%)
214 (36,7%) pregled 60-69 pregled 211 (30,2%) pregled, 152 (34,4%) pregled, 221 (44,7%) pregled, 166 (28,5%) pregled 70- pregled 83 (11,9%)
73 (16,5%)
98 (19,8%)
106 (18,2%) pregled genotipa pregled G pregled /G
483 (69,1%)
293 (66,3%) pregled, 350 (70,7%) pregled, 396 (67,9%), pregled, G pregled /A
198 (28,3%) pregled, 135 (30,5%)
131 (26,5%)
174 (29,9%) pregled pregled /A
18 (2,6%)
14 (3,2%)
14 (2,8%) pregled, 13 (2,2%) pregled, GA (-). i GA (+) upućuju bez atrofije i atrofija, odnosno
PTPN11 polimorfizam, H. pylori pregled seropozitivnosti, želučani atrofija i karcinom želuca
ne postoji značajna povezanost između PTPN11
polimorfizam i seropozitivnosti, iako je ili od /a pregled genotipa bio je 1,19 u odnosu na G /G pregled genotip (Tablica 2) .table 2 omjere (ORS ) i 95% intervali pouzdanosti (cIS) za PTPN11 pregled rs2301756 polimorfizma za H. pylori pregled seropozitivnosti. pregled genotip , alel
n
H. pylori +
H. pylori + (%)
OR
95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G
2716 pregled, 1552
57,1 pregled 1 pregled Reference
-
556 pregled 322 pregled 57,9 pregled 1.03 pregled 0,85-1,25 pregled 0387 pregled AOR za svaki genotip je izračunata prema dobi i spolu prilagoditi logističke regresije, te sirovo ili je izračunata za svaki alel.
bilo je 937 H.pylori
seropozitivnihje subjekti, među kojima je 495 (52,8%) ispitanika imali atrofiju. S jedne strane, bilo je 45 (6,4%) ispitanika s atrofijom među 699 seronegativnih subjekata. Razlika u učestalosti bila statistički značajna (P izvoznici < 0,001) pregled Tablica 3 prikazuje distribuciju genotip prema seropozitivnosti i atrofije.. Nije bilo osoba s A /A
genotipa među seronegativnih sudionika atrofiju. Prema tome, prilagoditi ili želučane atrofije među seronegativnih ispitanika nije bio izračunljivo za A /A
genotip; distribucija genotipova nije značajno povezan s želučanim atrofije u 3 × 3 Fisher točnim testa (P
= 0,196) .table 3 PTPN11 pregled rs2301756 distribucije genotipova prema H. ​​pylori pregled seropozitivnosti i razred želuca atrofija. pregled genotip
H. pylori seronegativne
H. pylori seropozitivne pregled pregled pregled, GA (-)
GA (+)
GA (++)
GA (-)
GA (+)
GA (++)
G pregled /G
447 (68,3%)
11 (64,7%)
25 (89,3%) pregled, 293 (68,4%) pregled, 223 (68,2%) pregled, 127 (75,6%) pregled G pregled /A
189 (28,9%)
6 (35,3%)
3 (10,7%)
135 (28,9%)
93 (28,4%)
38 (22,6%) pregled pregled /A pregled pregled, 18 (2,8%), pregled, 0 (0,0%)
0 (0,0%)
14 (2,7%)
11 (3,4%) pregled 3 (1,8%)
Ukupno pregled 654 (100%)
17 (100%)
28 (100%)
442 (100%)
327 (100%)
168 (100%) pregled, GA (-)., GA (+) i GA (++) ne pokazuju atrofije, blage atrofije i tešku atrofiju, odnosno
ostarjeli i seks-podešava ILI želučane atrofije među H. pylori
seropozitivnihje subjekata bila je 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P pregled = 0.194) za G /A Netlogu, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P pregled = 0,650) za A /A
i 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P pregled = 0,182) za g /a pregled + a /a pregled, u usporedbi s g /g pregled genotip. Ostarjeli i sex uz korekciju ILI teške želučane atrofije među H. pylori
seropozitivnihje subjekata bila je 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P pregled = 0,079) za G /A Netlogu 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P pregled = 0,356) za a /a
i 0,68 (95% CI 0.46-1.01, p pregled = 0,057) za G /a
+ a /a
kad oni bez teške želučane atrofije su definirani kao referenca (Tablica 4). Kad H. pylori
seropozitivnihje subjekti i seronegativnih ispitanika s želučanim atrofije su kao H. pylori pregled zaraženih predmeta, ostarjeli i seks-podešava ILI teške želučane atrofije među H. pylori
zaraženih je dalje smanjuje; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P pregled = 0,012) za G /A
+ A /A
(Tablica 4) .table 4 frekvencije genotipova za PTPN11 pregled rs2301756 polimorfizam, omjer vjerojatnosti ( ORS) i 95% intervali pouzdanosti (CI) od želučane atrofije u H. pylori
seropozitivnihje subjekti (a) i H. pylori pregled om (b) pregled (a)
pregled pregled pregled pregled pregled pregled pregled pregled pregled, genotip, alel
n
Sve želuca atrofija (%)
OR
95% CI
Pvalueb
Teška želuca atrofija (%)
ORb
pregled, 95% CI
Pvalueb
G pregled /G
643 pregled 350 (54,4) pregled, 1 pregled Reference
- pregled 127 (19,8)
1 pregled Reference
- G pregled /A
266 pregled 131 (49,2) pregled, 0,82
0,62-1,10 pregled 0,194 pregled 38 (14,3) pregled, 0,70 pregled 0,47-1,04 pregled 0,079 pregled pregled /A
28 pregled, 14 ( 50,0)
0,84 pregled 0,39-1,81 pregled 0,650 pregled 3 (10,7)
0,56 pregled 0,17-1,91 pregled 0,356 pregled G pregled /A pregled + pregled /A
294 pregled 145 (49,3)
0,83 pregled 0,62-1,09 pregled 0,182 pregled 41 (13,9)
0,68
0.46- 1.01 pregled 0,057 pregled G
1552 pregled, 831 (53,5) pregled, 1 pregled Reference
- 292 (18,8) pregled, 1 pregled Reference
-
322 pregled 159 (49,4)
0.85
0.66-1.08
0,097
44 (13,7)
0,67
0,45-0,96 pregled 0,015 pregled (b) pregled, genotip, alel pregled n pregled, Sve želuca atrofija (%) pregled OR pregled 95% CI pregled P vrijednost b
Teška želuca atrofija (%) pregled OR pregled 95% CI pregled P vrijednost b pregled G pregled /G
677 pregled 383 (56,6)
1 pregled Reference
- 151 (22,3) pregled, 1 pregled Reference
- G pregled /A
274 pregled 139 ( 50.7)
0,80 pregled 0,60-1,06 pregled 0,123 pregled 41 (15,0)
0,63 pregled 0,43 do 0,93 pregled 0,019 pregled pregled /A pregled
28 pregled, 14 (50,0)
0.77 pregled 0,36-1,67 pregled 0.512 pregled 3 (10,7)
0,49
0.14-1.67
0,254 pregled G
/A pregled + A pregled /A
302 pregled 153 (50,7) pregled, 0,80 pregled 0,60-1,05 pregled 0,106 pregled 44 (14,6)
0,62 pregled 0,42-0,90 pregled 0,012 pregled G
1628 pregled, 905 (55,6) pregled, 1 pregled Reference
- 343 (21.1) pregled 1 pregled Reference
-
330 pregled 167 (50,6)
0,82 pregled 0,64-1,05 pregled 0,102 pregled 47 (14,2 )
0,62 pregled 0.44-0.87
0.005
AOR za svaki genotip je izračunata prema dobi i spolu prilagoditi logističke regresije, te sirovo ili je izračunata za svaki alel.
BP
vrijednosti manje od 0,05 prikazani su u kurzivu pregled.
Slika 2 prikazuje raspodjelu pepsinogen I /II odnos prema PTPN11 pregled rs2301756 genotipa među H. pylori pregled zaraženih osoba sa PG i ≤ 70 ng /ml. U skladu s nalazom da je kod osoba s
alela bila u znatno smanjenim rizikom od teške želučane atrofije, frekvencija ispitanika s PG I /II omjer manji od 2 bila je niža u ispitanika s A
alela u odnosu na one s G /G
genotip. Slika 2 Raspodjela pepsinogen (PG) I /II odnos prema PTPN11 rs2301756 genotip među H. pylori infekcijom s razinom PG I. ≤ 70 ng /ml.
Da bi istražili kako se to polimorfizam PTPN11 pregled doprinosi želučani karcinogeneze među H. pylori
om, mi smo također izračunali OR karcinoma želuca u usporedbi s H. pylori pregled oboljelih ispitanika bez želuca atrofije. Ostarjeli i seks-podešava ili karcinoma želuca bila je 0,97 (95% CI 0,74-1,28, P pregled = 0,839) za G /A Netlogu, 0,71 (95% CI 0,33-1,53, P pregled = 0,381) za a /a
i 0,95 (95% CI 0.73-1.23, p pregled = 0,689) za G /a pregled + a /a pregled, u odnosu na G /G pregled genotip, nitko od kojih su statistički značajne (Tablica 5) .table 5 frekvencije genotipova za PTPN11 pregled rs2301756 polimorfizam, dobno-spolnih prilagođeni omjer vjerojatnosti (OR) i 95% intervali pouzdanosti (cIS) od raka želuca u odnosu na H. pylori pregled om bez želučane atrofije (HP-om bez atrofije). pregled genotip
HP zaražena bez atrofije n = 442
rak želuca n = 583
ILI
95% CI
P vrijednost
G pregled /G
pregled, 293 (66,3%) pregled, 396 (67,9%), pregled, 1 pregled Reference
- G pregled /A
135 (30,5%)
174 (29,8%)
0,97 pregled 0,74-1,28 pregled 0,839
pregled /A
14 (3,2%)
13 (2.2%)
0,71 pregled 0,33-1,53 pregled 0,381 pregled G pregled /A pregled + A pregled /A
149 (33,7%)
187 (32,1% ) pregled, 0,95 pregled 0,73-1,23 pregled 0.689
G
721 (81,6%) pregled, 966 (82,8%), pregled, 1 pregled Referentni pregled - pregled
163 (18,4%) pregled, 200 (17,2%), pregled, 0,92 pregled je izračunata 0,72-1,16 pregled 0,243 pregled AOR za svaki genotip po dobi i spolu je izračunata prilagođena logistička regresija model i sirova ili za svaki alel. pregled Rasprava pregled Ova studija je pokazala da su oni koji gaje
alela PTPN11 pregled rs2301756 polimorfizma na introna 3 imali su značajno niži rizik od teške želučane atrofija. To je u skladu s našim hipotezu da želučana razvoj atrofije nakon CagA pregled pozitivnih H. pylori pregled zaraze bio je rjeđi među onima s A /A
genotip nego među onima s g /g pregled genotipa [24 25], iako je značajna povezanost opažena samo za teške želučane atrofije u ovoj studiji. Od bioloških procesa u infekcije, razvoj atrofija i karcinogeneze razlikuju [15], udruga ovog polimorfizma sa samo atrofični razvoja kao biološki moguć.
Dok je ograničene informacije o potencijalnoj funkciji PTPN11 pregled polimorfizama, biološke karakteristike SHP-2 su postale sve razumio. SHP-2, jedan od dviju postojećih nisu transmembrane (intracelularna) protein tirozin fosfataze (PTP-ovi) sisavaca koji sadrže (Src homologija 2 SH2) domene. Vezanje fosforiliranog tirozina CagA na SH2 domena bi trebala pobuditi konformacijske promjene u SHP-2, koja oslabljuje inhibitorni interakciju između PTP i N-terminalnih domena SH2, na kraju dovodi do aktivacije SHP-2 fosfataze [10, 29, 30] , G /A pregled polimorfizma u intron 3 PTPN11
nalazi 223 parova baza uzvodno od eksona 4, koji kodira početni dio na C-kraju SH2 domene. Iako je biološka uloga ovog polimorfizma još nije clearified, polimorfizam može imati neki utjecaj na formiranje PTPN11 pregled mRNA varijante, od kojih je 8 oblici su izvijestili do danas (SpliceMinor početnu stranicu razvijen od strane genomiku & bioinformatiku Group (GBG) NCI: http: //www tigerteamconsult ing hr /SpliceMiner /)... Podaci LD izmeðu PTPN11 pregled, SNP je prikazano na slici 1 je da je za bijelaca, i nema preciznijih podataka o LD u japanskom dostupan je u sadašnjosti. Tu su i neke PTPN11
SNP čiji LD status je ostalo nepoznato (SNP8 i SNP9 na slici 1). Funkcija PTPN11 pregled polimorfizam na eksona 3 (rs2301756) i druge PTPN11 pregled SNP na interakciju između SHP-2 i CagA japanskih i drugih naroda zahtijeva daljnju istragu.
Iako je g pregled alela od PTPN11 pregled može biti dio genetskih osobina za razvoj želučanog atrofije putem prijenosa signala iz CagA, čini se da postoji i drugi genetske osobine su uključeni u ovaj proces. CagA veže nekoliko molekula; Grb2, koja prenosi signal Ras-MAPK putanje uzrokuje proliferaciju stanica, c-met je činitelj rasta hepatocita (HGF) receptora, koji imaju ulogu stanične proliferacije i motiliteta ZO-1, tijesno spoj proteina i Par1 /Mark kinaza, koja ima važnu ulogu u epitelnih stanica polarnosti [31-35]. Iako nema studija je provedena, funkcionalni polimorfizam tih molekula može biti i kandidati genetskih osobina želučane atrofije.
A pregled alela bio je dominantan alel PTPN11 pregled polimorfizam na introna 3 među bijelom (0,875 od 120 kromosoma), ali ne i među japanskom (0.178 od 902 kromosomi) i Kinezi (0.083 od 48 choromosomes) [26]. Ovo istraživanje je pokazalo da se 'a pregled frekvencije alela bila je 0,170 među japanskim kontrolnih ispitanika, slično prijavljen frekvencije alela u japanskom.
Ova studija ima nekoliko ograničenja. Iako je H. pylori pregled status kontrolnih ispitanika ispitan je u testu serološkog, nismo provjerili status CagA. Kao što je objavljeno u Japanu, gotovo 100% H. pylori pregled sojeva posjeduju funkcionalne CAG
patogenosti otok (CAG pregled PAI), koji kodira i proizvodi CagA proteina [36]. Prethodna studija također potvrđuje da su gotovo svi sojevi izolirani iz japanskim ispitanika bili su istočnoazijske CagA pregled pozitivnih sojeva [37], što znači da H. pylori
sojevi u našim ispitanika također posjeduje CagA. Drugo ograničenje je povezana s dijagnozom želučanog atrofije. To je učinjeno u cijelosti na temelju serumu pepsinogen, a ne kroz histološku procjenu, jer je većina kontrolnih ispitanika nije se gastrointestinalnog endoskopiju s biopsijom. Međutim, metoda pepsinogen je dobro uspostavljena kao surogat marker želučane atrofije [38-40]. Važeće kriterij za želučane atrofija je PG I ≤ 70 ng /ml i PG I /omjer II ≤ 3.0, te da je za teške želučane atrofija je PG I ≤ 30 ng /ml i PG I /omjer II ≤ 2.0, oba koja su trebala biti pouzdana, jer oni su naširoko koristi u praksi u Japanu [41, 42]. Što se tiče slučajeva raka želuca H. pylori pregled seropozitivnosti i pepsinogen razine nisu ispitani, ali većina slučajeva raka želuca se činilo da se H. pylori pregled pozitivnih slučajeva sa želučanom atrofije [43, 44]. S obzirom da je crijevna vrsta raka želuca, dominantna vrsta karcinoma želuca u Japanu, proizlazi iz želuca atrofija uzrokovanih Helicobacter pylori pregled infekcije i difuzni tip karcinoma želuca javlja bez obzira na želučane atrofije [45], čini se intrigantno obaviti analizu podskupina prema ta dva histoloških tipova. Ova analiza može otkriti povezanost ovog PTPN11
polimorfizma sa stepenicama želučane karcinogeneze jasnije. Međutim, nismo mogli obavljati ovu analizu zbog nedostupnosti histološkim podataka.

• CDK povezana Cullin 1 može pospješuju proliferaciju stanica i inhibiraju cisplatin-inducirana apoptoza u AGS rak želuca stanične linije
• Analiza proteina stanične ciklusa povezanih u želučanom intramucosal raka diferencirane tipa na temelju mucin fenotipova: roman hipoteza ranog želučane karcinogeneze na temelju mucin fenotip