Egyesületek a PTPN11 G /A polimorfizmus intron 3 Helicobacter pyloriseropositivity, gyomor atrófia és a gyomorrák japán

Egyesületek a PTPN11 katalógusa G /A polimorfizmus intron 3 Helicobacter pylori katalógusa szeropozitivitást, gyomor atrófia és a gyomorrák japán katalógusa Abstract Background katalógusa katalógusa Korábbi tanulmányok azt mutatták, jelentősége Helicobacter pylori
(H. pylori katalógusa) fertőzés, mint kockázati tényező a gyomorrák. Citotoxin-asszociált gén A (cagA
) pozitivitás kimutatták, hogy meghatározza a klinikai eredmények a H. pylori
fertőzés jelenlétében SHP-2 (src homológia 2 domént tartalmazó protein tirozin foszfatáz-2). Ezen tanulmány célja, hogy megvizsgálja a korábban bejelentett egyesülete G /A PTPN11 (protein-tirozin foszfatáz, nonreceptor típusú 11) hotelben polimorfizmus (rs2301756) a gyomor atrófia, valamint az egyesület gyomorrák egy japán népesség egy nagy minta mérete. katalógusa módszerek katalógusa vizsgálati alanyok voltak 583 szövettanilag diagnosztizált gyomorrákos betegeknél (429 férfi és 154 nő) és korban és nemben illesztett frekvencia-1636 nem rákos járóbetegek (1203 férfi és 433 nő), aki ellátogatott Aichi Cancer Center Hospital 2001-2005 között. Szérum anti-H. pylori IgG antitest katalógusa és pepsinogens mértük, hogy értékelje a H. pylori fertőzés katalógusa és a gyomor atrófia, ill. Esélyhányadosok (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) számoltunk logisztikus modell. Katalógusa Eredmények
közül H. pylori katalógusa szeropozitív nem rákos járóbetegek, a korban és nemben korrigált OR gyomor- sorvadás 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P katalógusa = 0,194) G /Egy fiatal, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P katalógusa = 0,650) az a /Egy fiatal, és 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P katalógusa = 0,182) G /Egy fiatal + a /Egy fiatal képest G /G genotípus katalógusa, és súlyos gyomor atrophia 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P katalógusa = 0,079), 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P katalógusa = 0,356), és 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P katalógusa = 0,057) , ill. Közül H. pylori
fertőzött betegeknél (H. pylori
szeropozitív alanyok és szeronegatív alanyok gyomor atrófia), a korrigált OR súlyos gyomor atrófia tovább csökkent; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P katalógusa = 0,012) G /Egy fiatal + A /Egy fiatal. Az eloszlás a genotípus betegeknél gyomorrák nem volt szignifikánsan különbözik a H. pylori
fertőzött alanyok nélkül gyomor sorvadás.
Következtetés
Vizsgálatunk eredményei azt mutatta, hogy azok az A /Egy fiatal genotípusa PTPN11 katalógusa rs2301756 polimorfizmus vannak kisebb a kockázata a súlyos gyomor atrophia, de nem jár a csökkent kockázatával gyomorrák, amely részben támogatta a korábbi megállapítást, hogy a polimorfizmus PTPN11 katalógusa kódoló gén SHP-2-t kapcsolódó gyomor atrófia kockázat H. pylori
fertőzött japán. A biológiai szerepe ennek PTPN11 katalógusa polimorfizmus további vizsgálatokat igényel. Katalógusa Háttér katalógusa Helicobacter pylori katalógusa (H. pylori katalógusa) fertőzés egy jól megalapozott kockázati tényező a gyomorrák fejlesztése révén a gyomor sorvadás és az azt követő rákmegelőző elváltozások. Különösen, a H. pylori
törzsek a citotoxin-asszociált gén A (cagA
) között erős asszociáció fokozott gyomor adenokarcinóma kockázat [1]. Súlyos gyomor atrófia és corpus-domináns gyomorhurut, valamint az intestinalis metaplasia jól bevált, domináns hajlammal gyomorrák [2]. Host proinflammatorikus genetikai tényezők kombinálva a bakteriális virulencia tényezők, mint például CagA leírták, hogy meghatározzák a súlyosságát gyomor károsodás és az esetleges klinikai eredmény a H. pylori katalógusa fertőzés a [3, 4]. A kockázat a gyomorrák szorozzuk többszörösére, ha a fogadó rejt mindkét tényező [5, 6]. A kelet-ázsiai populációk nagy többsége H. pylori katalógusa vannak cagA katalógusa-pozitív törzsek. CagA oszlik két nagy altípusok kelet-ázsiai típusú és a nyugati típusú [7]. Az osztály a gyomor atrófia és a gyomorrák kockázata magasabb azoknál a betegeknél kelet-ázsiai cagA katalógusa-pozitív törzsek, mint azoknál, akik cagA
-kizáró vagy nyugati cagA katalógusa-pozitív törzsek [8]. Katalógusa CagA fehérje transzlokálódik a csatlakoztatott H. pylori
gazdasejtekbe gyomor hámsejtek keresztül egy bakteriális IV típusú szekréciós apparátus, és megy át a tirozin foszforilációját a fogadó sejtekbe [9]. Ez arra készteti a szórási fenotípusok gyomornyálkahártya-sejtek, az úgynevezett "kolibri fenotípus", amely úgy gondolják, hogy döntő szerepet játszanak patogenezisében cagA katalógusa-pozitív H. pylori fertőzés katalógusa, végül vezető gyomorrák. Ebben a CagA-függő morfológiai átalakulása gyomornyálkahártya sejtek létezését SHP-2 (src homológia 2 domént tartalmazó protein tirozin foszfatáz-2) nélkülözhetetlen [10]. SHP-2 kulcsszerepet játszik a sejten belüli jelátviteli downstream számos növekedési faktorok, hormonok és a citokinek [11, 12]. A transzlokációs CagA képez fizikai komplexet SHP-2, ezáltal serkenti a foszfatáz aktivitást [10]. Későbbi Erk (extracelluláris szignál-szabályozott kináz) aktivitását szintén hozzájárul a CagA indukált "Hummingbird fenotípus" [13]. Így CagA /SHP-2 komplex képződését indukálhatja rendellenes proliferációját, mozgása gyomornyálkahártya sejtek és celluláris változásokat, amelyek meggyőzően vezethet gyomor atrófia és gyomorrák.
Mivel SHP-2 szorosan együttműködik a CagA fehérje, ez természetes a feltételezés, hogy a funkcionális polimorfizmus az PTPN11 (protein-tirozin foszfatáz, nonreceptor típusú 11) hotelben kódoló gén SHP-2-t végül fokát befolyásoló gyomor atrófia és átalakulás gyomorrák fertőzött egyénekben. Jelenleg 9 egypontos nukleotid polimorfizmusok (SNP) a minor allél frekvenciája > 0,05 PTPN11
gén japán on HapMap, melyek mindegyike található nem kódoló régiók, és a legtöbbjük abszolút kapcsolódási egyensúlyban (LD) (D '
= 1, és R
2 = 1) vagy teljes kapcsolódási egyensúlyban a (D '
= 1, és R
2 < 1) egymással. Öt a 9 SNP kimutathatóan teljes LD közülük 3 kimutathatóan abszolút LD vagy majdnem abszolút LD (D 'katalógusa = 1 és r katalógusa 2 > 0,9) a kaukázusi ahogy az 1. ábrán látható, amely a HapMap honlapja: http: //www. HapMap. org. A friss jelentés feltárta, hogy az egyik PTPN11 G /Egy fiatal SNP meg intron 3 (rs2301756) volt teljes LD másik PTPN11 G /Egy fiatal SNP meg intron 10 (rs12229892) [14]. Ebben a vizsgálatban a G /Egy fiatal SNP meg intron 3 (rs2301756), az egyik a 3 SNP abszolút LD választották képviselője összekapcsolt SNP. 1. ábra kapcsolódási egyenlőtlenség (LD) között 9 egypontos nukleotid polimorfizmusok (SNP), a minor allél frekvencia > 0.05 A PTPN11 génszakasz között kaukázusi (CEU: Utah lakosok felmenői észak és nyugat-európai). LD térképek mutatják a két paraméter, r katalógusa 2 és D katalógusa "a kaukázusi (CEU: Utah lakosok felmenői észak és nyugat-európai). SNP számok az LD térképek megfelelnek a rs számok leírt jobb felső sarkában a térképeket.
A H. pylori
kapcsolatos gyomorrák, vezető folyamat betegségnek három lépést; H. pylori fertőzés katalógusa, gyomor atrófia fejlesztés és kialakulásában. Minden lépésben genetikai jellemzőkkel és a kölcsönhatások életmód befolyásolhatja a folyamat [15]. Genetikai jellemzők, szignifikáns összefüggést az interleukin katalógusa (IL katalógusa) 1B katalógusa C-31T és a C-511T polimorfizmusok [16, 17], a tumor nekrózis faktor (TNF) -α katalógusa C-857T és T-1031C polimorfizmusának [18], és a NAD (P) H-dehidrogenáz, kinon 1 (NQO1) hotelben C609T polimorfizmus [19] H. pylori fertőzés katalógusa, és egyesületek a G /egy fiatal polimorfizmus intron 2 Grb2-asszociált kötőanyag 1
(Gab1
) [20], az interleukin
(IL
) 2 T-330g, és az IL-13
C-1111T [21 ] gyomor atrófia számoltak a mai napig. Változó számú tandem ismétlődés (VNTR) polimorfizmus mucin 1 (MUC1) katalógusa azt is kimutatták, hogy befolyásolja a H. pylori
fertőzés [22, 23]. Bár több tanulmány bizonyította a polimorfizmusok jelentős kockázatával jár gyomorrák, csak néhány tanulmány értékelte a kockázatot a lépés gyomor atrófia gyomorrák [15].
Korábbi tanulmányok között a japán és a japán brazilok , hogy az AA
genotípus intron 3-ben kimutatták, hogy csökkenti a kockázatot a gyomor atrófia fejlődés [24, 25]. Nemrég egy másik PTPN11
SNP (rs11066322 at intron 10 teljes kapcsolódási egyensúlyban az rs2301756) azt találták, hogy szignifikáns összefüggést a szérum apoB szintek egy brit populációban [26], támogatva azt a hipotézist, hogy ez a PTPN11
polimorfizmus funkcionális . Ezen tanulmány célja, hogy erősítse a korábban bejelentett közötti társulás PTPN11 katalógusa polimorfizmus (rs2301756) és a gyomor atrófia mért szérum pepsinogens nagyszámú japán tárgyak, valamint hogy vizsgálja meg a társulás gyomorrák kockázatát. Katalógusa módszerei
tárgyai katalógusa alanyok résztvevői HERPACC (Hospital-alapú epidemiológiai kutatási program Aichi Cancer Center) vizsgálatban, amelyben az első látogatása a járóbetegek voltak egymás felkérték, hogy életmód adatokat és vérmintát megszerzése után beleegyezését [27]. A résztvevők között, akik ellátogattak Aichi Cancer Center Kórház 2001 - 2005, 583 esetben diagnosztizáltak gyomorrákot és korban és nemben illesztett frekvencia-1638 rákmentesnek járóbetegek mintát vettek, mint a kontroll csoport, akik között két járóbetegek voltak zárva, mert nem tudták genotipizált, így 583 esetben, és 1636 kontroll jogosult az elemzéseket. Beleegyezését adta az összes tárgyak és a vizsgálati protokollt jóváhagyta az etikai bizottságok Aichi Cancer Center és Nagoya University Graduate School of Medicine. Katalógusa minták és diagnosztikai kritériumai
A szérum mintákat azonnal -20 ° C-elemzést. Anti-H. pylori
IgG antitestet mértük egy enzim immunoassay (EIA) készlet "E lemez" Eiken "H. pylori
Antibody" (Eiken Kagaku, Tokió, Japán). Az utasítást a készlet, 10,0 egység vagy ennél magasabb volt tekinthető szeropozitív. A szérum pepsinogens (PG) mértük kemilumineszcenciás enzim immunoassay (CLEIA). A gyomor nyálkahártya sorvadás csoportosították "none" (PG I > 70 ng /ml vagy PG-I /PG II > 3), "enyhe" (PG I ≤ 70 ng /ml és PG I /PG II ≤ 3, kivéve "súlyos" eset), vagy "súlyos" (PG I ≤ 30 ng /ml és PG I /PG II ≤ 2). Mivel a szérummintákat a gyomorrák esetek használni tervezett egy tanulmány magasabb prioritású, az ellenanyag és PG-k az esetek nem mértek.
Genotipizálás
DNS-t extraháltunk buffy coat a Qiagen DNeasy Mini Kit ( Qiagen, Hilden, Németország). A PTPN11
G /A polimorfizmus (rs2301756) volt genotipizálása egy polimeráz láncreakció szembe két párt primer (PCR-vezérelhető folyamatparaméter) [28]. A primerek F1: GGA TTA CAG GCA TAA GCC AC R1: GAC CAC TAA ACT TCT TAA ATG AGC, F2: CAT TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA és R2: CTC TGG CTC TCT CGT ACA AGA. Az amplifikációs körülmények voltak 10 perc kezdeti denaturáció 95 ° C-on, majd 30 ciklus 1 perc 95 ° C, 1 perc 64 ° C, és 1 perc 72 ° C-on, majd 5 percig végső extenzió 72 ° C. Az amplifikált DNS-t láthatóvá 2% -os agaróz gélen etídium-bromid-festéssel. Az amplifikált DNS-t a 201 bp G /G
genotípus, 201 bp és 339 bp G /A
genotípus, 339 bp A /A
genotípus, és 490 bp közös sáv [24].
Statisztikai analízis katalógusa A különbségek arányban vizsgáltuk a Fisher-féle egzakt tesztet. A 95% -os megbízhatósági intervallum (CI) a százalékok alapján számítottuk binomiális eloszlás. Logisztikus regressziós analízist becslésére esélyhányados (OR) és a 95% -os. Kor-ját folytonos változónak a logisztikus modell. H. pylori
fertőzött betegeknél definiáltuk azokat a H. pylori katalógusa szeropozitivitást vagy gyomorban sorvadás, mert az esetek nagy többségében a gyomor atrófia alakul ki a H. pylori fertőzés katalógusa. A trendek a H. pylori fertőzés katalógusa, gyomor atrófia vagy gyomorrák fejlődés nemtől és kortól kategóriák segítségével hasonlítottuk össze a χ 2 teszt trend. A számításokat végeztünk a STATA 7-es verzió (Stata Corp, College Station, TX). Katalógusa eredményei katalógusa jellemzői tárgyak és allélgyakoriságának PTPN11 polimorfizmus katalógusa jellemzőit a tárgyak foglalja össze az 1. táblázat . Az átlagéletkor ± szórás 58,7 ± 10,6 y (tartomány: 25-84 év) az ellenőrzéseket és 58,8 ± 10,5 y (tartomány: 27-80 év) az esetek. A nőstények 26,5% a kontroll és 26,4% esetekben. Mintegy háromnegyede az ellenőrzések fertőzött H. pylori katalógusa, míg körülbelül egyharmada a kontrollok gyomor sorvadás. A genotípus gyakorisága PTPN11 katalógusa polimorfizmus között az ellenőrzések volt Hardy-Weinberg egyensúly (χ 2 = 0,047, P = 0,828 katalógusa). Megvizsgáltuk a trend a H. pylori fertőzés katalógusa, gyomor atrófia vagy gyomorrák fejlesztési, nemek vagy korosztályokban szignifikáns trend a nagyobb H. pylori katalógusa fertőzés aránya a férfiaknál (P katalógusa -érték tendencia < 0,001) és a magasabb korcsoportba (P katalógusa < 0,001), és nagyobb számban előforduló gyomor atrófia magasabb korosztályokban (P katalógusa < 0,001) .table 1 jellemzői a tárgyak és a PTPN11
rs2301756 polimorfizmus. katalógusa katalógusa Controls n = 1636 Matton esetek n = 583 Matton H. pylori (-) hotelben H. pylori (+) hotelben GA (-) hotelben GA (+) hotelben n katalógusa 699 katalógusa 442 katalógusa 495 katalógusa 583 katalógusa sex katalógusa Férfi katalógusa 479 (68,5%) hotelben 363 (82,1%) hotelben 361 (72,9%) hotelben 429 (73,6%) fiatal női katalógusa 220 (31,5%)
79 (17,9%) hotelben 134 (27,1%) hotelben 154 (26,4%) hotelben Age katalógusa < 30 katalógusa 6 (0,9%) hotelben 1 (0,2%) hotelben 1 (0,2%) hotelben 2 (0.3%) hotelben 30-39 katalógusa 67 (9,6%) hotelben 11 (2,5%) hotelben 3 (0,6%) hotelben 31 (5,3%) hotelben 40-49 katalógusa 138 (19,7%) hotelben 54 (12,2%) hotelben 31 (6,3% ) hotelben 64 (11,0%) hotelben 50-59 katalógusa 194 (27,8%) hotelben 151 (34,2%) hotelben 141 (28,5%) hotelben 214 (36,7%) hotelben 60-69 katalógusa 211 (30,2%) hotelben 152 (34,4%) hotelben 221 (44,7%) hotelben 166 (28,5%) hotelben 70- katalógusa 83 (11,9%)
73 (16,5%) hotelben 98 (19,8%) hotelben 106 (18,2%) hotelben genotípus katalógusa G katalógusa /G Matton 483 (69,1%) hotelben 293 (66,3%) hotelben 350 (70,7%) hotelben 396 (67,9%) hotelben G katalógusa /A Matton 198 (28,3%) hotelben 135 (30,5%)
131 (26,5%) hotelben 174 (29,9%) hotelben Egy fiatal /A Matton 18 (2,6%) hotelben 14 (3,2%) hotelben 14 (2,8%) katalógusa 13 (2,2%) hotelben GA (-) és a GA (+) jelzi nélkül sorvadás és sorvadása, ill.
PTPN11 polimorfizmus, H. pylori katalógusa szeropozitivitást, gyomor atrófia és gyomorrák
nem volt szignifikáns összefüggés a PTPN11 katalógusa polimorfizmus és a szeropozitivitás, bár a VAGY a /Egy fiatal genotípus 1,19 képest G /G genotípus katalógusa (2. táblázat) .table 2 Odds értékeket (OR ) és a 95% -os konfidencia intervallum (CI) a PTPN11 katalógusa rs2301756 polimorfizmus a H. pylori katalógusa szeropozitivitást.
genotípus allél
n
H. pylori + Matton H. pylori + (%) Matton -ORa Matton 95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G Matton 2716 katalógusa 1552
57,1 katalógusa 1 katalógusa Referencia -
A Matton 556 katalógusa 322 katalógusa 57,9 katalógusa 1.03 katalógusa 0,85-1,25 katalógusa 0,387 katalógusa AOR minden genotípus számított kor és nem korrigált logisztikus regressziós modellben, és a nyers vagy számoltuk minden egyes allél.
voltak 937 H. pylori
szeropozitív alanyok, akik között 495 (52,8%) beteg volt sorvadás. Egyrészt voltak 45 (6,4%) beteg sorvadása között 699 szeronegatív alanyok. A különbség az előfordulási statisztikailag szignifikáns volt (P katalógusa < 0,001). Katalógusa 3. táblázat mutatja a genotípus eloszlás szerint szeropozitivitást és sorvadás. Nem voltak betegek, akik /Egy fiatal genotípus között szeronegatív sorvadás résztvevők. Ennek megfelelően, a korrigált OR gyomortartalom sorvadás között szeronegatív alanyok nem volt kiszámítható az A /Egy fiatal genotípus; A genotípus eloszlás nem szignifikáns összefüggést a gyomor atrófia egy 3 × 3-Fisher-teszt (P = 0,196 katalógusa) .table 3 PTPN11 katalógusa rs2301756 genotípus eloszlás szerint a H. pylori katalógusa szeropozitivitás és a minőség a gyomor sorvadás.
genotípus Matton H. pylori szeronegatívnak Matton H. pylori szeropozitív katalógusa
katalógusa GA (-) Matton GA (+) Matton GA (++) Matton GA (-) Matton GA (+) Matton GA (++) Matton G katalógusa /G Matton 447 (68,3%) hotelben 11 (64,7%) hotelben 25 (89,3%) hotelben 293 (68,4%) hotelben 223 (68,2%) hotelben 127 (75,6%) hotelben G katalógusa /A Matton 189 (28,9%)
6 (35.3%) hotelben 3 (10.7%) hotelben 135 (28,9%) hotelben 93 (28,4%) hotelben 38 (22,6%) hotelben Egy fiatal /Egy fiatal katalógusa 18 (2,8%) hotelben 0 (0.0%) hotelben 0 (0.0%) hotelben 14 (2,7%) hotelben 11 (3,4%) hotelben 3 (1.8%)
Teljes
654 (100%)
17 (100%)
28 (100%)
442 (100%)
327 (100%)
168 (100%)
GA (-), GA (+) és a GA (++) azt mutatják, nincs atrophia, enyhe sorvadás és súlyos sorvadása, ill.
A korban és nemben korrigált OR gyomor- sorvadás között H. pylori
szeropozitív alanyok 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P katalógusa = 0,194) G /Egy fiatal, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P katalógusa = 0,650) az a /a
, és 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P katalógusa = 0,182) G /Egy fiatal + a /Egy fiatal, míg a G /G genotípus katalógusa. A korban és nemben korrigált OR súlyos gyomor atrófia között H. pylori
szeropozitív alanyok 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P katalógusa = 0,079) G /Egy fiatal, 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P katalógusa = 0,356) az a /Egy fiatal, és 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P katalógusa = 0,057) G /Egy fiatal + a /a
ha e nélkül súlyos gyomor atrophiáját meghatározott referencia (4. táblázat). Amikor H. pylori
szeropozitív alanyok és szeronegatív alanyok gyomor atrófia tekintették H. pylori katalógusa fertőzött egyénekben a korban és nemben korrigált OR súlyos gyomor atrófia között H. pylori
fertőzött volt tovább csökkent; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P katalógusa = 0,012) G /Egy fiatal + A /Egy fiatal (4. táblázat) .table 4-es genotípus frekvenciák PTPN11 katalógusa rs2301756 polimorfizmus, esélyhányados ( OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) a gyomor sorvadás a H. pylori
szeropozitív beteg (a) és a H. pylori katalógusa fertőzött beteg (b) hotelben (a) Matton katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa katalógusa genotípus allél
n Matton minden gyomor atrófia (%) Matton -ORa Matton 95% CI Matton Pvalueb Matton súlyos gyomor atrófia (%) Matton ORb
katalógusa 95% CI Matton Pvalueb Matton G katalógusa /G Matton 643 katalógusa 350 (54,4) hotelben 1 katalógusa útmutató
- www.Booked.hu 127 (19,8) hotelben 1 katalógusa Referencia -
G katalógusa /A Matton 266 katalógusa 131 (49,2) hotelben 0,82
0,62-1,10 katalógusa 0,194 katalógusa 38 (14,3) hotelben 0,70 katalógusa 0,47-1,04 katalógusa 0,079 katalógusa Egy fiatal /A Matton 28 katalógusa 14 ( 50.0) hotelben 0,84 katalógusa 0,39-1,81 katalógusa 0,650 katalógusa 3 (10,7) hotelben 0,56 katalógusa 0,17-1,91 katalógusa 0,356 katalógusa G katalógusa /Egy fiatal + Egy fiatal /A Matton 294 katalógusa 145 (49,3) hotelben 0,83 katalógusa 0,62-1,09 katalógusa 0,182 katalógusa 41 (13,9) hotelben 0,68 katalógusa 0.46- 1.01 katalógusa 0,057 katalógusa G Matton 1552
831 (53,5) hotelben 1 katalógusa Referencia
- 292 (18,8) hotelben 1 katalógusa Referencia -
A Matton 322 katalógusa 159 (49,4) hotelben 0,85 katalógusa 0,66-1,08 katalógusa 0,097 katalógusa 44 (13,7) hotelben 0,67 katalógusa 0,45-0,96 katalógusa 0,015 katalógusa (b) hotelben genotípus allél katalógusa n Tanuld az összes gyomor atrófia (%) hotelben OR egy fiatal 95% CI katalógusa P érték b
súlyos gyomor atrófia (%) hotelben OR egy fiatal 95% CI katalógusa P érték b katalógusa G katalógusa /G Matton 677 katalógusa 383 (56,6)
1 katalógusa Reference
- 151 (22,3) hotelben 1 katalógusa Referencia -
G katalógusa /A Matton 274 katalógusa 139 ( 50,7) hotelben 0,80 katalógusa 0,60-1,06 katalógusa 0,123 katalógusa 41 (15,0) hotelben 0,63 katalógusa 0,43-0,93 katalógusa 0,019 katalógusa Egy fiatal /Egy fiatal
28 katalógusa 14 (50,0) hotelben 0,77 katalógusa 0,36-1,67 katalógusa 0,512 katalógusa 3 (10,7) hotelben 0,49 katalógusa 0,14-1,67 katalógusa 0,254 katalógusa G
/Egy fiatal + Egy fiatal /A Matton 302 katalógusa 153 (50,7) hotelben 0,80 katalógusa 0,60-1,05 katalógusa 0,106 katalógusa 44 (14,6)
0,62 katalógusa 0,42-0,90 katalógusa 0.012 katalógusa G Matton 1628
905 (55,6) hotelben 1 katalógusa Referencia
- 343 (21,1) Pg: 1
Referencia -
A Matton 330 katalógusa 167 (50,6) hotelben 0,82 katalógusa 0,64-1,05 katalógusa 0,102 katalógusa 47 (14.2 ) hotelben 0,62 katalógusa 0,44-0,87 katalógusa 0.005 katalógusa AOR minden genotípus számított kor és nem korrigált logisztikus regressziós modellben, és a nyers vagy számoltuk minden egyes allél.
bP katalógusa értékek 0,05 dőlt betűvel jelezzük katalógusa.
a 2. ábra a felosztott pepszinogén I /II arány szerint PTPN11 katalógusa rs2301756 genotípus között H. pylori katalógusa fertőzött, PG I ≤ 70 ng /ml. Összhangban azzal a megállapítással, hogy a betegek, akik katalógusa allél voltak szignifikánsan csökkentette a kockázata a súlyos gyomor atrófia gyakorisága alanyok PG I /II arány kevesebb, mint 2 alacsonyabb volt azoknál, akik katalógusa allél, mint a G /G
genotípus. 2. ábra disztribúciók pepszinogén (PG) I /II arány szerint PTPN11 rs2301756 genotípus között H. pylori-fertőzött, de a PG-I szint ≤ 70 ng /ml.
, Hogy vizsgálja meg ezt a polimorfizmus PTPN11 katalógusa hozzájárul a gyomor kialakulása között a H. pylori
fertőzött betegeknél is meghatároztuk az OR gyomorrák képest H. pylori katalógusa fertőzött alanyok nélkül gyomor sorvadás. A korban és nemben korrigált OR gyomorrák 0,97 (95% CI 0,74-1,28, P katalógusa = 0,839) G /Egy fiatal, 0,71 (95% CI 0,33-1,53, P = katalógusa 0,381) az a /Egy fiatal, és 0,95 (95% CI 0,73-1,23, P katalógusa = 0,689) G /Egy fiatal + a /Egy fiatal képest G /G katalógusa genotípus, amelyek közül egyik sem volt statisztikailag szignifikáns (5. táblázat) .table 5 genotípus frekvenciák PTPN11 katalógusa rs2301756 polimorfizmus, kor-nem korrigált esélyhányados (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) gyomorrák képest H. pylori
fertőzött alanyok nélkül gyomor atrófia (HP-fertőzött nélkül sorvadás). katalógusa genotípus Matton HP fertőzött nélkül sorvadás n = 442
Gyomorrák n = 583 Matton OR Matton 95% CI Matton P érték Matton G katalógusa /G
katalógusa 293 (66,3%) hotelben 396 (67,9%) hotelben 1 katalógusa Referencia -
G katalógusa /A Matton 135 (30,5%)
174 (29,8%) hotelben 0,97 katalógusa 0,74-1,28 katalógusa 0,839 katalógusa Egy fiatal /A Matton 14 (3,2%) hotelben 13 (2,2%)
0,71 katalógusa 0,33-1,53 katalógusa 0,381 katalógusa G katalógusa /Egy fiatal + Egy fiatal /A Matton 149 (33,7%) hotelben 187 (32,1% ) hotelben 0,95 katalógusa 0,73-1,23 katalógusa 0.689 katalógusa G Matton 721 (81,6%) hotelben 966 (82,8%) hotelben 1 katalógusa Referencia katalógusa -
a Matton 163 (18,4%) hotelben 200 (17,2%) hotelben 0,92 katalógusa 0,72-1,16 katalógusa 0,243 katalógusa AOR minden genotípus számított életkor és nem szerint korrigált logisztikus regressziós modell, és a nyers vagy számoltuk minden egyes allél. katalógusa Megbeszélés katalógusa Ez a tanulmány kimutatta, hogy azok, akik hordozzák egy fiatal allélja PTPN11 katalógusa rs2301756 polimorfizmus intron 3 szignifikánsan kisebb kockázatot súlyos gyomor sorvadás. Ez összhangban van a feltételezést, hogy a gyomor-sorvadás fejlesztés után cagA katalógusa-pozitív H. pylori fertőzés katalógusa volt ritkább körében A /Egy fiatal genotípus, mint azok között a G /G genotípus katalógusa [24 , 25], bár a szignifikáns összefüggés volt megfigyelhető csak súlyos gyomor atrófia ebben a vizsgálatban. Mivel a biológiai folyamatok fertőzés, sorvadás fejlődés, és a rákkeltő képességet különböző [15], az egyesület ezen polimorfizmus csak sorvadásos fejlesztési tűnt biológiailag kézenfekvő.
Bár nem volt korlátozott információk potenciális funkciója PTPN11 katalógusa polimorfizmusok biológiai jellemzői SHP-2 egyre érteni. SHP-2 egyike a két meglévő emlős nem transzmembrán (intracelluláris) protein-tirozin-foszfatázok (PTP-k), amelyek tartalmazzák, Src-homológ 2. (SH2) domének. Kötődése tirozin foszforilezett CagA, hogy az SH2 domének állítólag indukál konformációs változást SHP-2, amely gyengíti a gátló közötti kölcsönhatás PTP és az N-terminális SH2 domének, végül vezető aktiválását SHP-2 foszfatáz [10, 29, 30] . A G /A
polimorfizmus intron 3 PTPN11 katalógusa található 223 bázispár upstream exon 4, amely kódolja a kezdeti részét a C-terminális SH2 domén. Bár a biológiai szerepe a jelen polimorfizmus még nem clearified, a polimorfizmus van némi hatása a kialakulását PTPN11 katalógusa mRNS splicing variánsok, ebből 8 formák számoltak friss (SpliceMinor honlap által kifejlesztett Genomics & Bioinformatikai Group (GBG) NCI: http: //www. tigerteamconsult ing. com /SpliceMiner /). Az LD adat közötti PTPN11
SNP-k az 1. ábrán látható, hogy a kaukázusiak, és nem pontos információt LD japán elérhető jelenleg. Van még néhány PTPN11
SNP-k, amelyeknek az LD állapot maradt ismeretlen (SNP8 és SNP9 az 1. ábrán). A funkció a PTPN11 katalógusa polimorfizmus exon 3 (rs2301756) és egyéb PTPN11 katalógusa SNP közötti kölcsönhatás SHP-2 és CagA japán és más etnikumok további vizsgálatot igényel.
Bár a G allél katalógusa a PTPN11 katalógusa lehet része a genetikai tulajdonságok fejlesztésére gyomor atrófia jelátvitel származó CagA, úgy tűnik, hogy más genetikai jellemzők részt ebben a folyamatban. CagA kötődik számos molekula; Grb2, amely átalakítja a jelet a Ras-MAPK útvonal okozó sejtek proliferációját, a c-Met hepatocita növekedési faktor (HGF) receptor, amely szerepe van a sejtproliferáció és motilitás, ZO-1, egy feszes-csomópont fehérje, és PAR1 /Mark kináz, amely fontos szerepet hámsejt polaritás [31-35]. Bár nem végeztek vizsgálatokat, funkcionális polimorfizmus ezen molekulák lehetnek szintén jelöltek a genetikai jellegek a gyomor sorvadás.
Egy fiatal allél domináns allélja PTPN11 katalógusa polimorfizmus intron 3 közötti kaukázusi (0,875 az 120 kromoszómák), de nem szerepel a japán (0,178 902 kromoszóma) és a kínai (0,083 48 choromosomes) [26]. Ez a tanulmány megállapította, hogy a Egy fiatal allél gyakoriság 0,170 körében japán kontroll, hasonló a bejelentett allélgyakoriságát japán.
A jelen tanulmány számos korlátja van. Bár a H. pylori katalógusa állapotát kontroll vizsgáltuk a szerológiai vizsgálat, mi nem ellenőrzi a CagA állapotát. Amint arról Japánban, közel 100% A H. pylori katalógusa törzsek rendelkeznek a funkcionális CAG
patogenitási sziget (CAG
PAI), amely kódolja és gyárt a CagA fehérje [36]. Egy korábbi tanulmány is igazolta, hogy szinte az összes izolált törzsek a japánok voltak a kelet-ázsiai cagA katalógusa-pozitív törzsek [37], amely jelzi, hogy a H. pylori törzsek katalógusa mi vizsgálati alanyok is rendelkezik CagA. Egy másik korlát kapcsolódik a diagnózis gyomor sorvadás. Ez úgy történt, teljes egészében alapján a szérum pepszinogén szintek, és nem a szövettani értékelés mert a legtöbb a kontroll alanyok nem esnek át a gyomor-bél endoszkópos biopszia. Azonban a pepszinogén módszer jól bevált, mint a közbülső markere gyomor atrófia [38-40]. Az érvényesített kritériuma gyomor sorvadás PG-I ≤ 70 ng /ml és PG-I /II arány ≤ 3,0, és hogy a súlyos gyomor sorvadás PG-I ≤ 30 ng /ml és PG-I /II arány ≤ 2,0, mindkettő amelyek állítólag megbízható, mert azokat széles körben használják a gyakorlatban a Japánban [41, 42]. Ami a gyomorrák esetek H. pylori katalógusa szeropozitivitás és pepszinogén szinten nem vizsgálták, de a legtöbb esetben gyomorrák tűnt H. pylori katalógusa pozitív esetek gyomor atrófia [43, 44]. Tekintettel arra, hogy a bél típusú gyomorrák, az uralkodó típusú gyomorrák Japánban ered gyomor atrófia H. pylori által okozott fertőzés katalógusa, és a diffúz típusú gyomorrák attól függetlenül gyomor atrófia [45], úgy tűnik, érdekes, hogy végezze el az alcsoport elemzés szerint a két szövettani típus. Ez az elemzés lehet feltárni az egyesület ennek PTPN11 katalógusa polimorfizmust a következő lépéseket gyomor carcinogenesis pontosabban. Ugyanakkor nem tudtuk elvégezni az ilyen vizsgálatot, mert a hiánya a szövettani adatokra.

• CDK-asszociált Cullin 1 elősegítheti a sejtek szaporodását és gátolják a cisplatin indukálta apoptózis, a AGS gyomorrák sejt line
• Elemzés A sejtciklus kapcsolatos fehérjék gyomor intramucosalis differenciált típusú rákok alapján mucin fenotípusok: egy új hipotézist korai gyomor carcinogenesis alapján mucin fenotípus