Associatiounen vun engem PTPN11 VerfÜgung G /A polymorphism um intron 3 mat Helicobactor pylori VerfÜgung seropositivity, gastric atrophy an gastric Kriibs an japanesch VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung virdrun Studien hunn der Bedeitung vun Helicobacter pylori VerfÜgung (H. pylori VerfÜgung) Wonn als Risk Faktor vun gastric Kriibs verroden. Cytotoxin-verbonne Gentherapie A (cagA VerfÜgung) komm, huet bewisen gouf de Medeziner Resultat vum H. pylori VerfÜgung Wonn an der Präsenz vun SHP-2 (src homology 2 Domain-haltege FAQ tyrosine phosphatase-2) ze bestëmmen. Dës Etude fir d'fréier gemellt Associatioun vun G /A PTPN11 (FAQ-tyrosine phosphatase, nonreceptor-Typ 11) VerfÜgung polymorphism (rs2301756) mat gastric atrophy, souwéi d'Associatioun mat gastric Kriibs zu enger japanescher Populatioun ze iwwerpréifen, mat engem grouss Echantillonen Gréisst. VerfÜgung Method VerfÜgung Sujeten Studéiert huet 583 histologically festgestallte Patienten mat gastric Kriibs (429 Männercher an 154 Weibchen) an age- a Sex-Frequenz-stemmt 1.636 Net-Kriibs outpatients (1,203 Männercher an 433 Weibchen), agravéiert Aichi Cancer Center Hospital tëscht 2001-2005. Serum anti-H. pylori VerfÜgung IgG antibody an pepsinogens waren gemooss H. pylori VerfÜgung Wonn an gastric atrophy ze diskutéieren, respektiv. Chance nennen (Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) vun engem Logistikzenter Modell berechent huet. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Dorënner H. pylori VerfÜgung seropositive Net-Kriibs outpatients, déi age- a Sex-seng ODER vun gastric atrophy war 0.82 (95% CI 0.62-1.10, P VerfÜgung = 0.194) fir G /A VerfÜgung, 0.84 (95% CI 0.39-1.81, P VerfÜgung = 0.650) fir E /A VerfÜgung, an 0.83 (95% CI 0.62-1.09, P VerfÜgung = 0.182) fir G /a VerfÜgung + a /a VerfÜgung, relativ zu G /G VerfÜgung genotype, an dat vun schwéieren gastric atrophy war 0,70 (95% CI 0.47-1.04, P VerfÜgung = 0.079), 0.56 (95% CI 0.17-1.91, P VerfÜgung = 0.356), a 0.68 (95% CI 0.46-1.01, P VerfÜgung = 0.057) bzw.. Dorënner H. pylori Krankheet Sujeten VerfÜgung (H. pylori seropositive Sujeten an seronegative Sujeten mat gastric atrophy VerfÜgung), war d'Taktik ODER vun schwéieren gastric atrophy weider reduzéiert; 0.62 (95% CI 0.42-0.90, P VerfÜgung = 0,012) fir G /A VerfÜgung + A /A VerfÜgung. Der Verdeelung vun de genotype zu Patiente mat gastric Kriibs net vill anescht aus, datt den H. pylori Krankheet Sujeten ouni gastric atrophy VerfÜgung. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Eis studéieren Resultater bekannt datt déi mat der E /A VerfÜgung genotype vun PTPN11 VerfÜgung rs2301756 polymorphism sinn um ënneschten Risiko vun Donnerwiederen gastric atrophy, mä sinn net mat engem ofgeholl Risiko vun gastric Kriibs verbonnen, déi deelweis eis virdrun Opklärung ënnerstëtzt, datt d'polymorphism vun der Gentherapie Zeechesaatz SHP-2 VerfÜgung PTPN11 war verbonne mat dem Risiko gastric atrophy zu H. pylori VerfÜgung japanesch infizéiert. Der biologescher Rollen vun dëser PTPN11 VerfÜgung polymorphism Chinesen weider Enquête. VerfÜgung Background VerfÜgung Helicobacter pylori VerfÜgung (H. pylori VerfÜgung) Krankheet ass eng gutt etabléiert Risk Faktor vun gastric Kriibs duerch d'Entwécklung vun gastric atrophy a Kierzunge precancerous lesions. Besonnesch sinn, H. pylori VerfÜgung analyséieren mat der cytotoxin-verbonne Gentherapie A (cagA VerfÜgung) zu engem staarke Associatioun mat fräi gastric adenocarcinoma riskéieren [1]. Streng gastric atrophy an Corpus-predominant gastritis zesumme mat intestinal metaplasia sinn och predominant predispositions zu gastric Kriibs gegrënnt [2]. Provider proinflammatory genetesch Faktoren a Kombinatioun mat bakteriell virulence Facteure wéi CagA gemellt goufen d'Gravitéit vun gastric Schued an der eventual Medeziner Resultat vum H. pylori VerfÜgung Wonn [3, 4] ze bestëmmen. De Risiko vun gastric Kriibs ass e puer fantastesch doubelt wann de Provider souwuel vun deene Facteure Häfe [5, 6]. Am Oste asiatësch Populatiounen, pylori grouss Majoritéit vun H. sinn VerfÜgung cagA VerfÜgung -positive analyséieren. CagA ass ënnerdeelt an zwéi gréisst bestemmt, Osten asiatësch Aart a Western Zort [7]. D'Schouljoer vun gastric atrophy an gastric Kriibs Risiko ass héich an Patienten mat Ost asiatësch cagA VerfÜgung -positive analyséieren wéi an deene mat cagA VerfÜgung -negative oder Western cagA VerfÜgung -positive analyséieren [8]. VerfÜgung CagA FAQ ass translocated aus verbonnen H. pylori VerfÜgung an Provider gastric epithelial Zellen via eng bakteriell secretion Staatsapparat Typ IV, an awer tyrosine phosphorylation zu Gaascht Zellen [9]. Et induces d'Streeung phenotypes zu gastric epithelial Zellen, genannt de "hummingbird phenotype," wat gemengt ass eng wichteg Roll an der pathogenesis vun cagA VerfÜgung -positive H. pylori VerfÜgung Wonn ze spillen, schliisslech zu gastric carcinoma Haaptfiguren. An dëser CagA-ofhängeg morphological Transformatioun vun gastric epithelial Zellen, d'Existenz vun SHP-2 (src homology 2 Domain-haltege FAQ tyrosine phosphatase-2) ass essentiel [10]. SHP-2 spillt eng wichteg Roll an intracellular sécher afgerappt vun enger Zuel vu Wuesstem Faktoren, liicht, an cytokines [11, 12]. D'translocated CagA Formen engem physeschen Komplex mat SHP-2 domat säin phosphatase Aktivitéit Spannend [10]. Kierzunge Erk (extracellular Signal-reegelen kinase) Aktivitéiten dréit och zu der CagA-entschlof "hummingbird phenotype" [13]. Sou, CagA /SHP-2 komplex Opstellung Manque Prolifératioun, Bewegung vun gastric epithelial Zellen a bewosst Ännerunge kënnen induce datt conclusively zu gastric atrophy an gastric carcinoma Féierung kéint. VerfÜgung Zanter SHP-2 enk mat der CagA FAQ openee, ass et natierlech déi funktionell schiefgang an der PTPN11 (FAQ-tyrosine phosphatase, nonreceptor-Typ 11) VerfÜgung Gentherapie Zeechesaatz SHP-2 kann Afloss schlussendlech den Ofschloss vun gastric atrophy an Transformatioun zu gastric Kriibs am Krankheet Sujeten ze spekuléieren. Et sinn 9 eenzel Nukleotid schiefgang (SNPs) op minor allele Frequenz > 0,05 an PTPN11 VerfÜgung Gentherapie zu Japanesch op HapMap, all vun deem an Net-coding Regiounen etabléiert sinn, an déi meescht vun hinne sinn an absolute linkage disequilibrium (LD) (D 'VerfÜgung = 1 an r VerfÜgung
2 = 1) oder komplett linkage disequilibrium (d 'VerfÜgung = 1 an r VerfÜgung 2 &Si besteet; 1) fir all aner. Fënnef vun den 9 SNPs sinn zu komplett LD ginn dës Distanz an 3 vun hinne sinn an absolute LD oder bal absolute LD (D 'VerfÜgung = 1 an r VerfÜgung 2 > 0,9) gin gewisen an Caucasians wéi an Dorënner 1 gewisen, baséiert op HapMap Homepage http:. //www hapmap org.. Eis leschte Rapport verroden, datt ee PTPN11 G /A VerfÜgung SNP am intron 3 (rs2301756) war an komplett LD anert PTPN11 G /A VerfÜgung SNP am intron 10 (rs12229892) [14]. An dëser Etude, war de G /A VerfÜgung SNP am intron 3 (rs2301756), eent vun den 3 SNPs an absolute LD als Vertrieder vun deene Hausnummeren SNPs ausgewielt. Figur 1 Linkage disequilibrium (LD) tëscht dem 9. Single Nukleotid schiefgang (SNPs) mat engem mannerjäregen allele Frequenz > 0,05 an der PTPN11 Gentherapie Regioun ënnert Caucasians (CEU: Utah Awunner mat Racinen vum nërdlechen a Westeuropa). (: Utah Awunner mat Racinen vum nërdlechen a Westeuropa CEU) LD Kaarten sinn déi zwee Punkten, r zu 2 an D VerfÜgung 'fir Caucasians gewisen. SNP Zuelen an der LD Kaarten sëlwecht fir den RS Zuelen an der ieweschter Recht vun de Kaarten beschriwwen VerfÜgung Am H. pylori VerfÜgung gastric Kriibs ze dinn, de Prozess ze Krankheet Virwaat huet dräi Schrëtt. H. pylori VerfÜgung Wonn, gastric atrophy Entwécklung an carcinogenesis. Bei all Schrëtt, genetesch Spure an hir Interaktioune mat Liewensstil kann de Prozess Afloss [15]. Fir genetesch Spure, bedeitendst Associatiounen vun interleukin VerfÜgung (IL VerfÜgung) -1B VerfÜgung C-31T an C-511T schiefgang [16, 17], entholl necrosis Faktor (TNF) -α VerfÜgung C-857T an T-1031C schiefgang [18], an engem Nad (P) H dehydrogenase, quinone 1 (NQO1) VerfÜgung C609T polymorphism [19] mat H. pylori VerfÜgung Wonn, an Associatiounen vun engem G /a VerfÜgung intron polymorphism bei 2 vun Grb2-verbonne Bindemëttel 1 VerfÜgung (Gab1 VerfÜgung) [20], interleukin VerfÜgung (IL VerfÜgung) 2 T-330G, an IL-13 VerfÜgung C-1111T [21 ] mat gastric atrophy muss Datum gemellt ginn. Verännerleche Zuel vun zwee Widerhuelung (VNTR) schiefgang vun mucin 1 (MUC1) VerfÜgung och gewise goufen un Afloss H. pylori VerfÜgung Wonn [22, 23]. Obwuel et e puer Studien sinn der schiefgang vill mat der Gefor vun gastric Kriibs, nëmmen e puer Etuden fir d'Etapp vu gastric atrophy zu gastric Kriibs [15] évaluéiert de Risiko verbonnen ze beweisen. VerfÜgung An eiser leschter Studien ënnert Japanesch an Japanesch Brasilianer , war den AA VerfÜgung genotype zu intron 3 dës Distanz de Risiko vun gastric atrophy Entwécklung ze reduzéieren [24, 25]. Kuerzem, war aneren PTPN11 VerfÜgung SNP (rs11066322 um intron 10 an komplett linkage disequilibrium zu rs2301756) fonnt vill mat serum apoB Niveau vun enger britescher Bevëlkerung [26] verbonne ginn, d'Hypothes ënnerstëtz, datt dës PTPN11 VerfÜgung polymorphism funktionell ass . Dës Etude fir d'fréier gemellt Associatioun tëscht der PTPN11 VerfÜgung polymorphism (rs2301756) an gastric atrophy mat serum pepsinogens zu enger grousser Zuel vu japaneschen Sujeten, wéi och ënnersicht d'Associatioun mat gastric Kriibs Risiko gemooss ze confirméieren. VerfÜgung Method VerfÜgung Themen VerfÜgung Themen goufen Participanten vun HERPACC (Hospital-baséiert Epidemiologic Research plangen um Aichi Cancer Center) studéieren, an déi éischt-fueren outpatients noeneen invitéiert waren Liewensstil Daten a Blutt Prouf ze bidden der Awëllegung Maîtrise [27]. Ënnert de Participanten, déi vun 2001 Aichi Cancer Center Spidol besicht - 2005, 583 Fäll wéi gastric Kriibs diagnostizéiert an age- a Sex-Frequenz-stemmt 1.638 Kriibs gratis outpatients als Kontroll Grupp anerer waren, ënnert deenen zwou outpatients sech ausgeschloss, well si hätt net ginn genotyped, 583 Fäll an 1.636 Kontrollen beliwwert fir d'Analysë geklappt. Awëllegung war vun all de Sujeten kritt an der Etude Protokoll war vun der Ethik Aarbecht vun Aichi Cancer Center an Nagoya University CSL School vun Medezin virausgesat. VerfÜgung Echantillonen an diagnostic Critèren VerfÜgung Hir serum Echantillon waren direkt bei -20 ° gespäichert C bis Analyse. Anti-H. pylori VerfÜgung IgG antibody war mat enger Aktivitéit immunoassay (EIA) Kit "E Plack 'Eiken" H. pylori VerfÜgung Antibody "(Eiken Kagaku, Tokyo, Japan) gemooss. Laut der Uweisungen mat deem Kit gëtt, 10.0 Unitéiten oder méi héich war, wéi seropositive erauskoum. Serum pepsinogens (PG) waren déi chemiluminescence Aktivitéit immunoassay (CLEIA) gemooss. Gastric mucosal atrophy war an "keng" gruppéiere (PG sin > 70 Dummeldéng /ml oder PG sin /PG II > 3), "mëll" (PG sin ≤ 70 Dummeldéng /ml an PG sin /PG II ≤ 3, ausser "staarkt" Fäll), oder "staarkt" (PG sin ≤ 30 Dummeldéng /ml an PG sin /PG II ≤ 2). Zanter serum Echantillon vun Fäll gastric Kriibs geplangt huet fir eng Etude mat héijer Prioritéit benotzt gin, waren d'antibody an PGs vun de Fäll net gemooss. VerfÜgung Genotyping VerfÜgung DNA aus Buffy Mantel ofgebaut gouf de QIAGEN DNeasy Mini Kit benotzt ( QIAGEN, Hilden, Däitschland). D'PTPN11 VerfÜgung G /A polymorphism (rs2301756) war mat weess zwee-Pair primers (Hinnen alleguer-CTPP) mat engem polymerase Kette Reaktioun genotyped [28]. D'primers sech F1: GGA TTA CAG GCA TAA GCC AC, R1: GAC CAC TAA ACT TCT TAA ATG AGC, F2: CAT TTG TCT cta AAG GAC TGT GGA, an R2: CTC TGG CTC TCT CGT ACA Agées. Amplification ware 10 min vu initial denaturation bei 95 ° C, gefollegt vun 30 Zykle vun 1 min bei 95 ° C, 1 min bei 64 ° C, an 1 min bei 72 ° C, dann eng 5-min Finale Extensioun bei 72 ° C. Implikatioune DNA gouf op engem 2% agarose gelies mat ethidium bromide staining visualized. Implikatioune DNA huet 201 BP fir G /G VerfÜgung genotype, 201 BP an 339 BP fir G /A VerfÜgung genotype, 339 BP fir E /A VerfÜgung genotype, an 490 BP fir gemeinsam Band [24]. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung D'Ënnerscheeder vun Undeeler huet mat enger Fisher d'exakt Test iwwerpréift. Déi 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) fir Prozentzuelen baséieren op binomial distributions berechent. Logistic Réckgang Analyse war fir estimating Chance nennen (Örs) an 95% Well gesuergt. Alter war wéi eng kontinuéierlech ofwiesselnd am Logistikzenter Modell ugepasst. H. pylori VerfÜgung Krankheet Sujete wéi déi mat H. pylori VerfÜgung seropositivity oder mat gastric atrophy, well zu der grousser Majoritéit vun de Fäll gastric atrophy entwéckelt no H. pylori VerfÜgung Aids definéiert war. D'Trends fir H. pylori VerfÜgung Wonn, gastric atrophy oder gastric Kriibs Entwécklung vum Geschlecht oder Altersklassen waren benotzt Verglach der χ 2 Test fir Trend. D'Berechnungen sech mat der StataLanguage Versioun 7 (StataLanguage Verletzung, College Station, Suerge) gemaach. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Charakteristiken vun de Sujeten an allele Frequenz vun der PTPN11 polymorphism VerfÜgung d'Charakteristiken vun de Sujeten am Table 1 zesummegefaasst sinn . D'mengen Alter ± normale deviation war 58,7 ± 10,6 y (Gamme: 25-84 y) fir Kontrollen a 58,8 ± 10,5 y (Gamme: 27-80 y) fir Fäll. Weibchen sech 26,5% vun Kontrollen an 26,4% vun Fäll. Iwwer dräi Véirel vun de Kontrollen waren mat H. pylori VerfÜgung Krankheet, iwwerdeems iwwer een Drëttel vun der Kontrollen gastric atrophy haten. D'genotype Frequenz vun der PTPN11 VerfÜgung polymorphism ënnert de Kontrollen war an Hardy-Weinberg d'Gläichgewiicht (χ 2 = 0.047, P VerfÜgung = 0.828). Mir getest den Trend fir H. pylori VerfÜgung Wonn, gastric atrophy oder gastric Kriibs Entwécklung vum Geschlecht oder Altersklassen, déi fir héich H. pylori zu Männercher VerfÜgung Wonn Taux bedeitendst Trend verroden (P VerfÜgung -value fir Trend &Si besteet; 0.001) an héich Altersklassen (P VerfÜgung &Si besteet; 0.001), a fir méi héich prevalence vun gastric atrophy zu héich Altersklassen (P VerfÜgung &Si besteet; 0.001) .Table 1 Charakteristiken vun de Sujeten an der PTPN11
rs2301756 polymorphism. VerfÜgung zu Kontrolle n = 1636
Cases n = 583
H. pylori (-) VerfÜgung H. pylori (+) VerfÜgung GA (-) VerfÜgung GA (+) VerfÜgung n VerfÜgung 699 zu 442 zu 495 zu 583 VerfÜgung Sex VerfÜgung Männlech VerfÜgung 479 (68.5%) VerfÜgung 363 (82.1%) VerfÜgung 361 (72.9%) VerfÜgung 429 (73.6%) VerfÜgung Weiblech VerfÜgung 220 (31.5%)
79 (17.9%) VerfÜgung 134 (27.1%) VerfÜgung 154 (26.4%) VerfÜgung Alter VerfÜgung &Si besteet; 30 VerfÜgung 6 (0,9%) VerfÜgung 1 (0,2%) VerfÜgung 1 (0,2%) VerfÜgung 2 (0.3%) VerfÜgung 30-39 VerfÜgung 67 (9.6%) VerfÜgung 11 (2,5%) VerfÜgung 3 (0,6%) VerfÜgung 31 (5.3%) VerfÜgung 40-49 VerfÜgung 138 (19.7%) 54 (12,2%)
31 (6.3% VerfÜgung) 64 (11.0%) VerfÜgung 50-59 VerfÜgung 194 (27.8%) VerfÜgung 151 (34.2%) VerfÜgung 141 (28.5%) VerfÜgung 214 (36.7%) VerfÜgung 60-69 VerfÜgung 211 (30.2%) VerfÜgung 152 (34.4%) VerfÜgung 221 (44.7%) VerfÜgung 166 (28.5%) VerfÜgung 70- bis 83 (11.9%)
(16.5%) VerfÜgung 98 (19.8%) VerfÜgung 106 (18.2%) VerfÜgung Genotype VerfÜgung G VerfÜgung /G
483 (69.1%) VerfÜgung 293 (66.3%) VerfÜgung 350 (70.7%) VerfÜgung 396 (67,9%) VerfÜgung G VerfÜgung /A
198 (28.3%) VerfÜgung 135 (30.5%)
(26.5%) VerfÜgung 174 (29.9%) VerfÜgung A VerfÜgung /A
18 (2,6%) VerfÜgung 14 (3,2%) VerfÜgung 14 (2,8%) VerfÜgung 13 (2,2%) VerfÜgung GA (-). an GA (+) ouni atrophy a mat atrophy weg, respektiv VerfÜgung PTPN11 polymorphism, H. pylori VerfÜgung seropositivity, gastric atrophy an gastric Kriibs
Et war tëscht der PTPN11 VerfÜgung polymorphism an der seropositivity kee groussen Veräin, obwuel d'oDER vun a /a VerfÜgung genotype 1.19 relativ war bis G /G VerfÜgung genotype (Table 2) .Table 2 Chance nennen (Örs ) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) vun PTPN11 VerfÜgung rs2301756 polymorphism fir H. pylori VerfÜgung seropositivity. VerfÜgung Genotype
, allele VerfÜgung n H. VerfÜgung pylori +
H. pylori + (%)
ORA
95% CI
Pvalue
G
/G
1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A
464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A
46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G
2716 bis 1552 zu 57,1 VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung A
556 zu 322 VerfÜgung 57,9 VerfÜgung 1,03 VerfÜgung 0.85-1.25 VerfÜgung 0,387 VerfÜgung aOR fir all genotype war vun Alter a Geschlecht seng Logistikzenter Réckgang Modell, an engem Brutto berechent oDER war fir all allele berechent. VerfÜgung 937 H. pylori Et waren
seropositive Sujeten, ënnert deenen 495 (52.8%) Sujeten atrophy haten. Op der enger Säit, goufen et 45 (6,4%) Sujete mat atrophy ënnert 699 seronegative Sujeten. Den Ënnerscheed zu de prevalence war statistesch relevant (P VerfÜgung &Si besteet; 0.001) VerfÜgung Table 3 weist de genotype Verdeelung no seropositivity an atrophy.. Do ware keng Sujeten mat A /A VerfÜgung genotype ënnert der seronegative atrophy matmaachen. d'Taktik ODER vun gastric atrophy ënnert der seronegative Sujete war net calculable fir den E /A VerfÜgung genotype geet; der genotype Verdeelung war net vill mat gastric atrophy vun engem 3 × 3 Fisher d'exakt Test (P VerfÜgung = 0.196) .Table 3 PTPN11 VerfÜgung rs2301756 genotype Verdeelung no H. pylori VerfÜgung seropositivity an der Schouljoer vun gastric assoziéiert atrophy. VerfÜgung Genotype
H. pylori seronegative
H. pylori seropositive VerfÜgung VerfÜgung zu GA (-)
GA (+)
GA (++)
GA (-)
GA (+)
GA (++)
G VerfÜgung /G
447 (68.3%) VerfÜgung 11 (64.7%) VerfÜgung 25 (89.3%) VerfÜgung 293 (68.4%) VerfÜgung 223 (68.2%) VerfÜgung 127 (75.6%) VerfÜgung G VerfÜgung /A
189 (28.9%)
6 (35.3%) VerfÜgung 3 (10.7%) VerfÜgung 135 (28.9%) VerfÜgung 93 (28.4%) 38 (22.6%)
A VerfÜgung /A VerfÜgung VerfÜgung 18 (2,8%) VerfÜgung 0 (0.0%) VerfÜgung 0 (0.0%) VerfÜgung 14 (2,7%) VerfÜgung 11 (3,4%) VerfÜgung 3 (1,8%)
Total VerfÜgung 654 (100%) VerfÜgung 17 (100%) 28 (100%)
442 (100%) VerfÜgung 327 (100%) VerfÜgung 168 (100%) VerfÜgung GA (-)., GA (+) an GA (++) weg kee atrophy, mëll atrophy a schwéieren atrophy, bzw. VerfÜgung D'age- a Sex-seng oDER vun gastric atrophy ënnert H. pylori
seropositive Sujete war 0.82 (95% CI 0.62-1.10, P VerfÜgung = 0.194) fir G /A VerfÜgung, 0.84 (95% CI 0.39-1.81, P VerfÜgung = 0.650) fir E /A
, a 0.83 (95% CI 0.62-1.09, P VerfÜgung = 0.182) fir G /a VerfÜgung + a /a VerfÜgung, am Verglach mat G /G VerfÜgung genotype. D'age- a Sex-seng ODER vun schwéieren gastric atrophy ënnert H. pylori VerfÜgung seropositive Sujete war 0,70 (95% CI 0.47-1.04, P VerfÜgung = 0.079) fir G /A VerfÜgung, 0.56 (95% 0.17-1.91 CI, P VerfÜgung = 0.356) fir E /a VerfÜgung, a 0.68 (95% CI 0.46-1.01, P VerfÜgung = 0.057) fir G /a VerfÜgung + a /a
wann déi ouni schwéieren gastric atrophy als Referenz (Table 4) definéiert goufen. Wann H. pylori seropositive Sujeten an seronegative Sujeten mat gastric atrophy VerfÜgung den H. erauskoum sech pylori VerfÜgung Krankheet Sujeten, déi age- a Sex-seng ODER vun schwéieren gastric atrophy ënnert dem H. pylori Krankheet VerfÜgung war weider reduzéiert; 0.62 (95% CI 0.42-0.90, P VerfÜgung = 0,012) fir G /A VerfÜgung + A /A VerfÜgung (Table 4) .Table 4 Genotype Ofstänn fir PTPN11 VerfÜgung rs2301756 polymorphism, Chance nennen ( Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) vun gastric atrophy am H. pylori VerfÜgung seropositive Sujeten (en) an Krankheet Sujeten VerfÜgung H.pylori (b) VerfÜgung (e)
zu zu zu zu zu zu zu zu zu Genotype, allele
n
all gastric atrophy (%)
ORA
95% CI
Pvalueb
streng gastric atrophy (%)
Orb
zu 95% CI
Pvalueb
G VerfÜgung /G
643 zu 350 (54.4) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz
- VerfÜgung 127 (19.8) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung G VerfÜgung /A
266 zu 131 (49.2) VerfÜgung 0,82
0.62-1.10 VerfÜgung 0,194 VerfÜgung 38 (14.3) VerfÜgung 0,70 VerfÜgung 0.47-1.04 VerfÜgung 0,079 VerfÜgung A VerfÜgung /A
28 zu 14 ( 50.0) VerfÜgung 0,84 VerfÜgung 0.39-1.81 VerfÜgung 0,650 VerfÜgung 3 (10.7) VerfÜgung 0,56 VerfÜgung 0.17-1.91 VerfÜgung 0,356 VerfÜgung G VerfÜgung /A VerfÜgung + A VerfÜgung /A
294 zu 145 (49,3) VerfÜgung 0,83 VerfÜgung 0.62-1.09 VerfÜgung 0,182 VerfÜgung 41 (13.9) VerfÜgung 0,68 VerfÜgung 0.46- 1,01 VerfÜgung 0,057 VerfÜgung G
1552 VerfÜgung 831 (53.5) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung 292 (18.8) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung A
322 zu 159 (49.4) VerfÜgung 0,85 VerfÜgung 0.66-1.08 VerfÜgung 0,097 VerfÜgung 44 (13.7) VerfÜgung 0,67 VerfÜgung 0.45-0.96 VerfÜgung 0,015 VerfÜgung (b) VerfÜgung Genotype, allele VerfÜgung n VerfÜgung All gastric atrophy (%) VerfÜgung ODER en zu 95% P Wäert b CI VerfÜgung
streng gastric atrophy (%) VerfÜgung ODER en zu 95% CI VerfÜgung P Wäert b VerfÜgung G VerfÜgung /G
677 zu 383 (56.6)
1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung 151 (22.3) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung G VerfÜgung /A
274 zu 139 ( 50.7) VerfÜgung 0,80 VerfÜgung 0.60-1.06 VerfÜgung 0,123 VerfÜgung 41 (15.0) VerfÜgung 0,63 VerfÜgung 0.43-0.93 VerfÜgung 0,019 VerfÜgung A VerfÜgung /A VerfÜgung
28 zu 14 (50.0) VerfÜgung 0.77 VerfÜgung 0.36-1.67 VerfÜgung 0,512 VerfÜgung 3 (10.7) VerfÜgung 0,49 VerfÜgung 0.14-1.67 VerfÜgung 0,254 VerfÜgung G
/A VerfÜgung + A VerfÜgung /A
302 zu 153 (50.7) VerfÜgung 0,80 VerfÜgung 0.60-1.05 VerfÜgung 0,106 VerfÜgung 44 (14.6)
0,62 VerfÜgung 0.42-0.90 VerfÜgung 0,012 VerfÜgung G
1628 VerfÜgung 905 (55.6) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung 343 (21.1) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung A
330 zu 167 (50,6) VerfÜgung 0,82 VerfÜgung 0.64-1.05 VerfÜgung 0,102 VerfÜgung 47 (14,2 ) VerfÜgung 0,62 VerfÜgung 0.44-0.87 VerfÜgung 0,005 VerfÜgung aOR fir all genotype vun Alter a Geschlecht seng Logistikzenter Réckgang Modell, an engem Brutto oDER war berechent fir all allele berechent huet. VerfÜgung BP VerfÜgung Wäerter manner wéi 0,05 sinn an Déieren VerfÜgung gewisen. VerfÜgung 2 dorënner beschreiwen der distributions vun pepsinogen ech /II Verhältnis no PTPN11 VerfÜgung rs2301756 genotype ënnert H. pylori VerfÜgung Krankheet Sujeten mat PG sin ≤ 70 Dummeldéng /ml. Am Aklang mat der Opklärung, déi mat enger VerfÜgung allele sech um bedeitend reduzéiert Risiko vun Donnerwiederen gastric atrophy Sujeten, war d'Frequenz vun Theme mat PG sin /II Verhältnis manner wéi 2 ënneschten zu Theme mat enger VerfÜgung allele wéi déi mat G /G VerfÜgung genotype. Figur 2 Distributions vun pepsinogen (PG) sin /II Verhältnis no PTPN11 rs2301756 genotype ënnert H. pylori Krankheet Sujeten mat engem PG sin Niveau vun ≤ 70 Dummeldéng /ml. VerfÜgung ze ermëttelen, wéi dës polymorphism vun PTPN11 VerfÜgung dréit zu der gastric carcinogenesis ënnert dem H. pylori VerfÜgung Sujeten Krankheet, mir och der ODER vun gastric Kriibs Verglach mat H. pylori VerfÜgung Krankheet Sujeten ouni gastric atrophy berechent. D'age- a Sex-seng ODER vun gastric Kriibs 0.97 (95% CI 0.74-1.28, P VerfÜgung = 0.839) fir G /A VerfÜgung, 0.71 (95% CI 0.33-1.53, P VerfÜgung = 0.381) fir E /a VerfÜgung, an 0,95 (95% CI 0.73-1.23, P VerfÜgung = 0.689) fir G /a VerfÜgung + a /a VerfÜgung, relativ zu G /G VerfÜgung genotype, keen vun deenen sech statistesch relevant (Table 5) .Table 5 Genotype Ofstänn fir PTPN11 VerfÜgung rs2301756 polymorphism, Alter, Geschlecht seng Chance nennen (Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) vun gastric Kriibs famill ze H. pylori VerfÜgung Krankheet Sujeten ouni gastric atrophy (ouni atrophy-HP Krankheet). VerfÜgung Genotype
HP ouni atrophy n Krankheet = 442 VerfÜgung Gastric Kriibs VerfÜgung n = 583
ODER
95% CI
P Wäert
G VerfÜgung /G
zu 293 (66.3%) VerfÜgung 396 (67,9%) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung G VerfÜgung /A
135 (30.5%)
174 (29.8%) VerfÜgung 0,97 VerfÜgung 0.74-1.28 VerfÜgung 0,839 VerfÜgung A VerfÜgung /A
14 (3,2%) 13 (2,2%) VerfÜgung
0,71 VerfÜgung 0.33-1.53 VerfÜgung 0,381 VerfÜgung G VerfÜgung /A VerfÜgung + A VerfÜgung /A
149 (33.7%) VerfÜgung 187 (32.1% ) VerfÜgung 0,95 VerfÜgung 0.73-1.23 VerfÜgung 0,689 VerfÜgung G
721 (81.6%) VerfÜgung 966 (82.8%) VerfÜgung 1 VerfÜgung Referenz VerfÜgung - VerfÜgung a
163 (18,4%) VerfÜgung 200 (17.2%) VerfÜgung 0.92 VerfÜgung 0.72-1.16 VerfÜgung 0,243 VerfÜgung aOR fir all genotype vun Alter a Geschlecht berechent huet ugepasst Logistikzenter Réckgang Modell, an engem Brutto oDER war fir all allele berechent. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung Dës Etude bekannt, datt déi 3 am intron a VerfÜgung allele vun der PTPN11 VerfÜgung rs2301756 polymorphism Hafe e wesentlech méi Risiko Équipe vun schwéieren gastric atrophy. Dëst ass am Aklang mat eisem Hypothes, datt gastric atrophy Entwécklung no cagA VerfÜgung -positive H. pylori VerfÜgung Wonn ënnert deenen VerfÜgung genotype mat E /A rar war wéi ënnert deene mat G /G VerfÜgung genotype [24 , 25], obwuel de groussen Veräin nëmmen fir schwéieren gastric atrophy an dëser Etude observéiert gouf. Well déi biologesch Prozesser an Wonn, atrophy Entwécklung, an carcinogenesis sinn verschidden [15], d'Associatioun vun dëser polymorphism mat nëmmen atrophic Entwécklung biologically plausibel war. VerfÜgung Iwwerdeems et limitéiert Informatiounen iwwert d'Potential Funktioun vun PTPN11 VerfÜgung schiefgang war, biologesch Charakteristiken vun SHP-2 hu sech ëmmer méi verstan. SHP-2 ass ee vun den zwee bestehend mammalian Net-transmembrane (intracellular) FAQ tyrosine phosphatases (PTPs) dass src homology 2 (SH2) Beräicher enthalen. Verbindlech vun tyrosine phosphorylated CagA zu der SH2 Beräicher ass ugeholl conformational Verännerung SHP-2 zu induce datt d'inhibitory Interaktioun tëscht PTP an N-Uschloss SH2 Beräicher schwächt, schliisslech Spëtzekandidat bei der Aktivatioun vun SHP-2 phosphatase [10, 29, 30] . D'G /A VerfÜgung polymorphism am intron 3 vun PTPN11 VerfÜgung ass Offloss 223 huel Puer wellkomm aus Exon 4, wou d'initial Deel vun C-Uschloss SH2 Domain encodes. Obwuel de biologeschen Roll vun den haitegen polymorphism ass nach net clearified, kann de polymorphism puer Afloss op d'Équipe vun PTPN11 hunn VerfÜgung mRNA splicing Varianten, vun deenen 8 Formen gemellt goufen zu Datum (SpliceMinor Homepage entwéckelt vun de Genomics & Bioinformatik Group (GBG) vun NCI: http: //www tigerteamconsult géiert com /SpliceMiner /)... D'LD Daten tëscht den SNPs VerfÜgung PTPN11 zu Dorënner 1 gewise gëtt, datt fir Caucasians, a keng genee Informatiounen iwwer LD an Japanesch um präsent sinn ass. Et ginn och e puer PTPN11 VerfÜgung SNPs hir LD Zoustand ass onbekannt lénks (SNP8 an SNP9 zu Dorënner 1). D'Funktioun vun der PTPN11 VerfÜgung polymorphism um Exon 3 (rs2301756) an aner PTPN11 VerfÜgung SNPs op der Interaktioun tëscht SHP-2 an CagA zu Japanesch an aner ethnicities weider Enquête verlaangt. VerfÜgung Obwuel d'G VerfÜgung allele vun PTPN11 kann zu engem Deel vun de genetesch Spure ginn ze gastric atrophy via Signal transduction aus CagA, do entwéckelen schéngt an dësem Prozess bedeelegt aner genetesch Spure ginn. CagA Photo'en puer Molekülle; Grb2, déi transduces d'Signal un Ras-MAPK Passerelle dauernd Zell Prolifératioun, c-hu hepatocyte Wuesstem Faktor (HGF) receptor, déi eng Roll vun Zell Prolifératioun an motility hunn, ZO-1, enger knapper-menaarbecht FAQ, an Par1 /Mark kinase, déi eng wesentlech Roll an epithelial Zell Polaritéit huet [31-35]. Obwuel keng Studien gehaal hunn, funktionell schiefgang vun dësen Molekülle kéint och Kandidate vun genetesch Spure vun gastric atrophy ginn. D'A
allele d'dominant allele vun PTPN11 VerfÜgung 3 ënnert Caucasians um intron polymorphism war (0.875 vun 120 chromosomes), mee net ënnert japanesch (0.178 vun 902 chromosomes) an Chinese (0.083 vun 48 choromosomes) [26]. Dës Etude erausfonnt, datt d'A VerfÜgung allele Frequenz 0,170 ënnert eiser Japanesch Kontroll Sujete war, ähnlech dem Rapport allele Frequenz an Japanesch. VerfÜgung Déi heiteg Etude verschidde Limiten huet. Obwuel de Status vun der Kontroll Sujeten VerfÜgung H. pylori mat engem serology Test iwwerpréift war, huet kontrolléieren mir net d'CagA Status. Wéi a Japan gemellt, déi bal 100% vun H. pylori VerfÜgung analyséieren engem funktionell pathogenicity Insel cag VerfÜgung (cag VerfÜgung PAI), déi de CagA FAQ encodes a produzéiert [36]. A leschter Etude och zertifizéiert, datt bal all aus eisem Japanesch Sujeten isoléiert analyséieren Osten asiatësch cagA VerfÜgung -positive analyséieren [37] huet, wat beweist, datt H. pylori VerfÜgung analyséieren an eiser Etude Sujeten leie och CagA. Aner begrenzten Dauer ass fir d'Diagnos vun gastric atrophy dinn. Dëst war ganz op der Basis vun serum pepsinogen Niveau gemaach an net duerch histological Beurteelung, well déi meescht vun der Kontroll Sujeten net gastrointestinal endoscopy mat Fro hi. Allerdéngs ass de pepsinogen Method och eng GPA Bewaacher vun gastric atrophy etabléierter [38-40]. D'validéiert Critère fir gastric atrophy ass PG sin ≤ 70 Dummeldéng /ml an PG sin /II Verhältnis vun ≤ 3.0, an dat fir schwéieren gastric atrophy ass PG sin ≤ 30 Dummeldéng /ml an PG sin /II Verhältnis vun ≤ 2.0, souwuel vun déi verléisslech gin hi well se iwwerall an der Praxis am Japan benotzt ginn [41, 42]. Iwer d'gastric Kriibs Fäll den Niveauen seropositivity an pepsinogen VerfÜgung H. pylori net iwwerpréift goufen, mä déi meescht vun de gastric Kriibs Fäll war H. pylori VerfÜgung positiv Fäll mat gastric atrophy [43, 44] gin. Que dass intestinal Typ vun gastric Kriibs, d'predominant Typ vun gastric Kriibs am Japan, aus gastric atrophy vum H. pylori VerfÜgung Wonn ëmmer Ressort, an diffusen Typ gastric Kriibs existeiert egal gastric atrophy [45], géif et schéngt spezielle un laut deenen zwee histological Zorte der Ënnergrupp Analyse Leeschtunge. Dës Analyse kënnen d'Associatioun vun dëser PTPN11 VerfÜgung polymorphism mat de Schrëtt vun gastric carcinogenesis méi kloer Streik. Allerdéngs kéint mer net Analyse Leeschtunge well vun der Bestellung fannen vun der histological Daten.