Ассоциации с PTPN11 G /полиморфизм интрона 3 с Helicobactor pyloriseropositivity, атрофии желудка и рака желудка на японском языке

Ассоциации с PTPN11
G /полиморфизм интрона 3 с Helicobactor пилори
серопозитивностью, атрофии желудка и рака желудка в японском
Аннотация
Справочная информация
Предыдущие исследования выявили значимость хеликобактерной
(H. Pylori
) инфекция как фактор риска развития рака желудка. Цитотоксин-ассоциированный ген А (CagA
) положительность было продемонстрировано, чтобы определить клинический исход антихеликобактерной
инфекции в присутствии SHP-2 (ЦСИ гомологии 2 домена, содержащего протеинтирозинфосфатазы-2). Целью данного исследования являлось изучение ранее сообщались ассоциацию G /A PTPN11 (протеин-тирозин фосфатазы, nonreceptor типа 11)
полиморфизма (rs2301756) с атрофией желудка, а также ассоциации с раком желудка в японской популяции с использованием большой размер выборки.
Методы
субъектов исследования были 583 гистологически диагностированных пациентов с раком желудка (429 мужчин и 154 женщин), а также возраста и пола по частоте соответствует 1636 нераковых амбулаторных больных (1203 мужчин и 433 женщин), который посетил Айти Онкологический центр больницы между 2001-2005 гг. Сыворотка анти-Н. Pylori
IgG антитела и pepsinogens были измерены для оценки H. Pylori
инфекции и желудка атрофии, соответственно. Отношение шансов (ОШ) и 95% доверительный интервал (ДИ) рассчитывались с помощью логистической модели.

Результаты Среди H. Pylori
серопозитивных амбулаторным нераковых, то возраста и пола ОШ желудочного атрофия был 0,82 (95% ДИ 0.62-1.10, P = 0,194
) для G /A
, 0,84 (95% ДИ 0.39-1.81, P
= 0,650) для A /A
, и 0,83 (95% ДИ 0.62-1.09, P = 0,182
) для G /A
+ A /A
относительно G /G
генотип, и что тяжелой атрофии желудка была 0,70 (95% ДИ 0.47-1.04, P
= 0,079), 0,56 (95% ДИ 0.17-1.91, P
= 0,356) и 0,68 (95% ДИ 0.46-1.01, P = 0,057
) соответственно. Среди H. Pylori
зараженных предметов (H. Pylori
серопозитивных субъектов и серонегативных субъектов с желудочной атрофии), скорректированный OR тяжелой атрофии желудка был сокращен; 0,62 (95% ДИ 0.42-0.90, P = 0,012
) для G /A
+ A /A
. Распределение генотипов у больных раком желудка существенно не отличалась от таковой для H. Pylori
инфицированных субъектов без атрофии желудка.
Заключение
Наши результаты исследования показали, что люди с A /A
генотип PTPN11
rs2301756 полиморфизма на более низком риске тяжелой атрофии желудка, но не связаны с уменьшением риска рака желудка, который частично поддерживается наш предыдущий вывод о том, что полиморфизм в PTPN11
ген, кодирующий SHP-2 связанный с желудочным риска атрофии в H. Pylori
инфицированных японцев. Биологической роли этого PTPN11
полиморфизма требуют дальнейшего изучения.
Справочная информация
хеликобактер пилори
(H. Pylori
) инфекция является хорошо установленный фактор риска развития рака желудка за счет развития рака желудка атрофии и последующих предраковых поражений. В частности, H. Pylori
штаммы с цитотоксин-ассоциированный ген (CaGa
) находятся в тесной связи с повышенным риском аденокарциномы желудка [1]. Сильная желудка атрофии и Corpus преобладанием гастрита наряду с кишечной метаплазией хорошо зарекомендовали себя в качестве преобладающих предрасположенности к раку желудка [2]. Хост провоспалительных генетические факторы в сочетании с бактериальными факторов вирулентности, таких как CagA сообщалось, чтобы определить тяжесть повреждения желудка и возможного клинического исхода H. Pylori
инфекции [3, 4]. Риск развития рака желудка умножаются в несколько раз, если хозяин таит в себе оба этих фактора [5, 6]. В Восточной Азии населения, подавляющее большинство хеликобактерной
являются CaGa
-положительные штаммы. CagA делится на два основных подтипа, Восточной Азии типа и западного типа [7]. Степень атрофии желудка и желудка риск развития рака выше у пациентов с восточноазиатской CaGa
-позитивных штаммов, чем у пациентов с CaGa
-отрицательные или Западная CaGa
-положительные штаммы [8].
CagA белок транслоцируется из прилагается H. Pylori
в принимающих эпителиальных клеток желудка посредством секреции аппарата бактериального типа IV, и претерпевает фосфорилирование тирозина в клетках-хозяевах [9]. Это вызывает рассеивающие фенотипы в эпителиальных клеток желудка, называется "Колибри фенотип", который, как полагают, играют ключевую роль в патогенезе CaGa
-положительным H. Pylori
инфекции, в конечном итоге приводит к карциноме желудка. В этом CagA-зависимой морфологической трансформации эпителиальных клеток желудка, существование SHP-2 (ЦСИ гомологии 2 домена, содержащего протеин-тирозин-фосфатазы-2) имеет важное значение [10]. ШП-2 играет ключевую роль в внутриклеточной передаче сигнала ниже по потоку от ряда факторов роста, гормонов, и цитокины [11, 12]. Транслоцированы CagA образует физический комплекс с ШП-2, тем самым стимулируя его активность фосфатазы [10]. Последующее ЭРК (внеклеточной регулируемой киназы) активность также способствует CagA-индуцированной "колибри фенотип" [13]. Таким образом, CagA /SHP-2 образование комплекса может вызвать аномальную пролиферацию, перемещение эпителиальных клеток желудка и клеточных изменений, которые могут окончательно привести к атрофии желудка и рака желудка.
Поскольку SHP-2 тесно взаимодействует с белком CagA, естественно предположить, что функциональные полиморфизмы в PTPN11 (протеин-тирозин фосфатазы, nonreceptor-типа 11)
ген, кодирующий SHP-2 может в конечном счете, влияет на степень атрофии желудка и трансформации в рак желудка у инфицированных субъектов. Есть 9 одиночных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) на малой частоте аллеля > 0,05 в PTPN11
гена на японском языке на HapMap, все из которых расположены в некодирующих регионах, и большинство из них находятся в абсолютной неравновесия по сцеплению (LD) (D '
= 1 и г
<вир> 2 = 1) или полное неравновесия по сцеплению (D '
= 1 и R
2 ≪ 1) друг к другу. Пять из 9 ОНП приведены быть в полной LD и 3 из них показано, что в абсолютном LD или почти абсолютной LD (D '
= 1 и г
2 > 0,9) в кавказцев как показано на рисунке 1, основанный на HapMap домашней страницы HTTP:. //WWW HapMap орг.. Наш недавний доклад показал, что один PTPN11 G /A
SNP в интрона 3 (rs2301756) был в полном LD другому PTPN11 G /A
SNP в интроне 10 (rs12229892) [14]. В этом исследовании, G /A
SNP в интроне 3 (rs2301756), один из 3 полиморфизмов в абсолютном LD был выбран в качестве представителя этих связанных ОНП. Рисунок 1 неравновесия по сцеплению (LD) между 9 одиночных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) с незначительной частотой аллеля > 0,05 в области гена PTPN11 среди кавказцев (КЕС: жители штата Юта с родословной из Северной и Западной Европы). Карты LD представлены двумя параметрами, R
2 и D '
для кавказцев (КЕС: Юта жителей с происхождением из Северной и Западной Европы). числа SNP в картах LD соответствуют номерам Rs, описанных в верхнем правом углу карты
В хеликобактерной
связанных с раком желудка, процесс, ведущий к болезни состоит из трех этапов. Антихеликобактерную
инфекции, развитие атрофии желудка и канцерогенез. На каждом этапе, генетические особенности и их взаимодействия с образом жизни могут влиять на процесс [15]. Для генетических признаков, значимых ассоциаций интерлейкина
(IL
) -1B
C-31T и C-511T полиморфизмов [16, 17], фактор некроза опухоли (TNF) -α
C-857T и T-1031C полиморфизмов [18], и NAD (P) H-дегидрогеназы, хинон 1 (NQO1)
C609T полиморфизм [19] с хеликобактерной
инфекции, а также ассоциации а £ /A
полиморфизм в интроне 2 Grb2 ассоциированного связующего вещества 1
(Gab1
) [20], интерлейкин
(IL
) 2 T-330G, и IL-13
C-1111T [21 ] с атрофией желудка было зарегистрировано на сегодняшний день. Переменное число тандемных повторов (VNTR) полиморфизмов муцина 1 (MUC1)
также было показано влияние H. Pylori
инфекции [22, 23]. Хотя есть несколько исследований для наглядной демонстрации полиморфизмов в значительной степени связано с риском развития рака желудка, лишь несколько исследований оценивали риск на стадии от желудка атрофии до рака желудка [15]. В
наших предыдущих исследованиях среди японских и японских бразильцев , АА
генотип в интроне 3 было показано, чтобы уменьшить риск развития желудочной атрофии [24, 25]. Недавно другой PTPN11
SNP (rs11066322 на интрона 10 в полной неравновесия по сцеплению с rs2301756) было установлено, что в значительной степени связано с уровнями сыворотки APOB в британской популяции [26], что подтверждает гипотезу о том, что полиморфизм
это PTPN11 функционально , Целью данного исследования являлось подтвердить ранее сообщались ассоциацию между PTPN11
полиморфизма (rs2301756) и атрофии желудка, измеренной в сыворотке крови pepsinogens в большом количестве японских предметов, а также изучить ассоциацию с риском развития рака желудка.
Методы
Субъекты
Субъекты были участниками HERPACC (больницы на основе программы эпидемиологических исследований в Айти Cancer Center) исследования, в котором первый визит амбулаторных пациентов были последовательно предложено представить данные об образе жизни и образец крови после получения информированного согласия [27]. Среди участников, которые посетили Айти Cancer Center Hospital с 2001 - 2005, 583 случаев диагностировано как рак желудка и возраста и пола по частоте соответствует 1638 рака свободных амбулаторных пациентов были отобраны в качестве контрольной группы, среди которых были исключены два амбулаторных больных, потому что они не могли генотипировать, в результате чего 583 случаев и 1636 управления, имеющих право на анализы. Информированное согласие было получено от всех субъектов и протокол исследования был одобрен комитетами по этике Айти онкологического центра и Нагоя университета Высшая школа медицины.
Образцы и диагностические критерии
Их образцы сыворотки были немедленно хранили при -20 ° С С до анализа. Анти-Н. Pylori
IgG антитела определяли с помощью иммуноферментного анализа (ИФА) комплект "E пластины '' EIKEN H. Pylori
антитело" (Eiken Kagaku, Токио, Япония). В соответствии с инструкциями, приведенными с этим набором, 10,0 единиц или выше рассматривалось как серопозитивных. Сыворотка pepsinogens (PG) измеряли с помощью иммуноферментного анализа хемилюминесценции (CLEIA). Желудочный атрофии слизистой оболочки сгруппирована в "None" (PG I > 70 нг /мл или PG I /PG II > 3), "мягкие" (PG I ≤ 70 нг /мл и PG I /PG II ≤ 3, за исключением «тяжелые» случаи), или "тяжелой" (PG I ≤ 30 нг /мл и PG I /PG II ≤ 2). Так как планировалось образцы сыворотки желудочного случаев рака, которые будут использоваться для исследования с более высоким приоритетом, антитело и PGs этих случаев не были измерены.
Генотипирование
ДНК экстрагировали из лейкоцитарной пленки с использованием Qiagen DNeasy мини-набора ( Qiagen, Hilden, Germany). PTPN11
G /A полиморфизма (rs2301756) был генотипирование с полимеразной цепной реакцией с сопоставлением двухпарная праймеров (PCR-СТРР) [28]. Праймеры F1: GGA TTA CAG GCA ТАА GCC AC, R1: GAC CAC ТАА ACT TCT ТАА ATG AGC, F2: CAT TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA и R2: CTC TGG CTC TCT ВКТ ACA AGA. Условия амплификации были 10 мин первоначальной денатурации при 95 ° С, затем 30 циклов: 1 мин при 95 ° С, 1 мин при 64 ° С и 1 мин при 72 ° С, а затем в 5-ти мин окончательное удлинение при 72 ° C. Усиленный ДНК визуализировали на 2% -ном агарозном геле с окрашивания бромистым этидием. Усиленный ДНК 201 п.н. для G /G
генотипа, 201 пар оснований и 339 пар оснований для G /A
генотипа, 339 пар оснований для A /A
генотипа и 490 пар оснований для общей группы [24].
Статистический анализ
различия в пропорциях были исследованы с точным тестом Фишера. Рассчитаны интервалы 95% доверительный (ДИ) проценты на основе биномиальных распределений. Логистический регрессионный анализ проводился для оценки шансов (ОШ) и 95% ДИ. Возраст регулировали в качестве непрерывной переменной в логистической модели. H. пилори
зараженные предметы были определены как те, с хеликобактерной
серопозитивностью или с атрофией желудка, потому что в подавляющем большинстве случаев атрофия желудка развивается после инфекции H. Pylori
. Тенденции для H. инфекции пилори
, атрофии желудка или развития рака желудка по признаку пола или возрастным категориям сравнивали с использованием х 2 тест для тренда. Расчеты проводились с использованием версии STATA 7 (Stata Corp, College Station, TX).

Результаты Характеристики испытуемых и аллеля частоты полиморфизма PTPN11
характеристик испытуемых приведены в таблице 1 . средний возраст ± стандартное отклонение составил 58,7 ± 10,6 лет (диапазон: 25-84 лет) для управления и 58,8 ± 10,5 лет (диапазон: 27-80 лет) за исключением случаев. Женщины были 26,5% в контрольной группе и 26,4% в случаях. Около трех четвертей управления были инфицированы H. пилори
, а около одной трети контроля была атрофия желудка. Частота генотипа PTPN11
полиморфизма среди элементов управления находился в равновесии Харди-Вайнберга (χ 2 = 0,047, P = 0,828
). Мы протестировали тенденцию к H. Pylori
инфекции, атрофия желудка или развитие рака желудка по полу или возрастным категориям, которые выявили значительную тенденцию к более высокой хеликобактерной
уровнем инфекции у мужчин (P
-Value для тренда &л; 0,001) и более высокие возрастные категории (P &
л; 0,001), а также для более высокой распространенности желудочной атрофии в высших возрастных категорий (P &
л; 0,001) .table 1 Характеристики испытуемых и PTPN11 <бр> rs2301756 полиморфизм.
<й>
Controls п = 1636

случаи п = 583

H. пилори (-)
H. пилори (+)
GA (-)
GA (+)
п
699
442
495
583
Секс
Мужской
479 (68,5%)
363 (82,1%)
361 (72,9%)
429 (73,6%)
Женский
220 (31,5%)
79 (17,9%)
134 (27,1%)
154 (26,4%)
Возраст
&л; 30
6 (0,9%)
1 (0,2%)
1 (0,2%)
2 (0,3%)
30-39
67 (9,6%)
11 (2,5%)
3 (0,6%)
31 (5,3%)
40-49
138 (19,7%)
54 (12,2%)
31 (6,3% )
64 (11,0%)
50-59
194 (27,8%)
151 (34,2%)
141 (28,5%)
214 (36,7%)
60-69
211 (30,2%)
152 (34,4%)
221 (44,7%)
166 (28,5%)
70-
83 (11,9%) <бр> 73 (16,5%)
98 (19,8%)
106 (18,2%)
генотипа
G
/G

483 (69,1%)
293 (66,3%)
350 (70,7%)
396 (67,9%)
G
/A

198 (28,3%)
135 (30,5%) <бр> 131 (26.5%)
174 (29,9%)

/A

18 (2,6%)
14 (3,2%)
14 (2,8%)
13 (2,2%)
GA (-). Г.А. (+) указывают без атрофии и с атрофией, соответственно
PTPN11 полиморфизм, Н. Pylori
сероположительность, желудка атрофии и рака желудка
Там не было никакой значимой связи между полиморфизмом
и сероположительность в PTPN11, хотя ИЛИ A /A
генотип 1,19 по отношению к G /G
генотипов (таблица 2) .table 2 Отношение шансов (ОШ ) и доверительные интервалы 95% (ДИ) от PTPN11
rs2301756 полиморфизма для хеликобактерной
серопозитивностью.
генотипа , аллель

п

H. пилори +

H. пилори + (%)

ORa

95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G

2716
1552
57,1
1
Ссылка
-
управлением

556
322
57,9
1,03
0.85-1.25
0,387
AOR для каждого генотипа была рассчитана по возрасту и полу скорректированы модели логистической регрессии, и сырой нефти или рассчитывали для каждого аллеля.
были 937 H. пилори <бр> серопозитивных субъектов, среди которых 495 (52,8%) пациентов была атрофия. С одной стороны, было 45 (6,4%) пациентов с атрофией среди 699 серонегативных субъектов. Различие в распространенности было статистически значимым (P &
л; 0,001)
В таблице 3 показано распределение генотипов в соответствии с серопозитивностью и атрофии.. Там не было никаких предметов с A /A
генотипа среди серонегативных участников атрофии. Соответственно, ОШ желудочной атрофии среди серонегативных субъектов не Вычислимое для A /A
генотипа; распределение генотипов не было в значительной степени связано с атрофией желудка точным тестом 3 × 3 Фишера (P = 0,196
) .table 3 PTPN11
rs2301756 распределение генотипов в соответствии с H. серопозитивностью пилори
и степени желудка атрофия.
Генотип

H. Pylori серонегативных

H. Pylori серопозитивны

<й>
GA (-)

GA (+)

GA (++)

GA (-)

GA (+)

GA (++)

G
/G

447 (68,3%)
11 (64,7%)
25 (89,3%)
293 (68,4%)
223 (68,2%)
127 (75,6%)
G
/A

189 (28,9%) <бр> 6 (35,3%)
3 (10,7%)
135 (28,9%) 93
(28,4%)
38 (22,6%)

/A

18 (2,8%)
0 (0.0%) 0
(0,0%)
14 (2,7%)
11 (3,4%)
3 (1,8%) <бр> Total
654 (100%)
17 (100%)
28 (100%)
442 (100%)
327 (100%)
168 (100%)
GA (-)., GA (+) и GA (++) указывают на отсутствие атрофии, мягкий атрофия и тяжелой атрофии, соответственно
возраста и пола ОШ атрофии желудка среди H. Pylori <бр> предметы серопозитивных был 0,82 (95% ДИ 0.62-1.10, P = 0,194
) для G /A
, 0,84 (95% ДИ 0.39-1.81, P = 0,650
) для A /A <бр>, и 0,83 (95% ДИ 0.62-1.09, P = 0,182
) для G /A
+ A /A
, по сравнению с G /G
генотипа. В возрасту и полу ОШ тяжелой атрофии желудка среди H. Pylori
серопозитивных субъектов был 0,70 (95% ДИ 0.47-1.04, P = 0,079
) для G /A
, 0,56 (95% ДИ 0.17-1.91, P
= 0,356) для A /A
, и 0,68 (95% ДИ 0.46-1.01, P = 0,057
) для G /A
+ A /A <бр> когда те без тяжелой атрофии желудка были определены в качестве эталона (таблица 4). Когда H. Pylori
серопозитивных субъектов и серонегативных пациентов с желудочной атрофии считались H. Pylori
зараженных предметов, возраста и пола ОШ тяжелой атрофии желудка среди H. Pylori
инфицированных было дополнительно снижается; 0,62 (95% ДИ 0.42-0.90, P
= 0,012) для /A
+ A /A
(таблица 4) частот .table 4 генотипа для PTPN11
rs2301756 полиморфизма, отношения шансов G ( ОШ) и 95% доверительный интервал (ДИ) атрофии желудка в хеликобактерной
серопозитивных субъектов (а) и h.pylori
зараженные предметы (б)
(а)

<й>
<й>
<й>
<й>
<й>
<й>
<й>
<й>
<й>
Генотип, аллель

п

Все желудочной атрофии (%)

ORa

95% ДИ

Pvalueb

Тяжелая атрофия желудка (%)

ORb <бр>
95% ДИ

Pvalueb

G
/G

643
350 (54,4)
1
Ссылка <бр> -
127 (19,8)
1
Ссылка
-
G
/A

266
131 (49,2)
0,82 <бр> 0.62-1.10
0,194
38 (14.3)
0,70
0.47-1.04
0,079

/A

28
14 ( 50,0)
0,84
0.39-1.81
0,650
3 (10.7)
0,56
0.17-1.91
0,356
G
/A
+
/A

294
145 (49,3)
0,83
0.62-1.09
0,182
41 (13.9)
0,68
0.46- 1.01
0,057
G

1552
831 (53,5)
1
Ссылка
-
292 (18,8)
1
Ссылка
-
управлением

322
159 (49,4)
0.85
0.66-1.08
0,097
44 (13.7)
0,67
0.45-0.96
0,015
(б)
Генотип, аллель
п
Все желудочная атрофия (%)
ИЛИ
95% ДИ
P значение б
Тяжелая атрофия желудка (%)
ИЛИ
95% ДИ
P значение б
G
/G

677
383 (56,6) <бр> 1
Ссылка
-
151 (22,3)
1
Ссылка
-
G
/A

274
139 ( 50,7)
0,80
0.60-1.06
0,123
41 (15,0)
0,63
0.43-0.93
0,019

/A

28
14 (50,0)
0,77
0.36-1.67
0,512
3 (10.7)
0,49
0.14-1.67
0,254
G
/A + A

/A

302
153 (50,7)
0,80
0.60-1.05
0,106
44 (14,6)
0,62
0.42-0.90
0,012
G

1628
905 (55,6)
1
Ссылка
-
343 (21,1)
1
Ссылка
-
управлением

330
167 (50,6)
0,82
0.64-1.05
0,102
47 (14.2 )
0,62
0.44-0.87
0.005
AOR для каждого генотипа была рассчитана по возрасту и полу скорректированы модели логистической регрессии, и сырой нефти или рассчитывали для каждого аллеля.
Bp
значения меньше 0,05 приведены в Курсив
.
на рисунке 2 представлена ​​распределение пепсиногена I /II соотношения в соответствии с PTPN11
rs2301756 генотип среди H. Pylori
инфицированных пациентов с PG I ≤ 70 нг /мл. В соответствии с выводом, что субъекты с
аллеля имели значительно уменьшенный риск тяжелой атрофии желудка, частота больных с ГУ I /II отношение меньше 2 была ниже у пациентов с А
аллеля, чем те, с G /G
генотип. Рисунок 2 Распределение пепсиногена (PG) I /II соотношения в соответствии с PTPN11 rs2301756 генотип среди хеликобактерной инфицированных субъектов с уровнем PG I из ≤ 70 нг /мл.
Чтобы исследовать, как этот полиморфизм PTPN11
способствует желудочный канцерогенез среди хеликобактерной
зараженных предметов, мы также рассчитали или рака желудка по сравнению с H. Pylori
инфицированных субъектов без атрофии желудка. Возраста и пола ОШ рака желудка был 0,97 (95% ДИ 0.74-1.28, P = 0,839
) для G /A
, 0,71 (95% ДИ 0.33-1.53, P =
0,381) для A /A
, и 0,95 (95% ДИ 0.73-1.23, P = 0,689
) для G /A
+ A /A
относительно G /G
генотип, ни один из которых не были статистически значимыми (таблица 5) .table 5 частот генотипов для PTPN11
rs2301756 полиморфизма, половозрастные скорректированные отношения шансов (ОШ) и 95% доверительный интервал (ДИ) рака желудка по отношению к H. Pylori
инфицированных субъектов без атрофии желудка (HP-инфицированных без атрофии).
Генотип

HP заражена без атрофии п = 442

рак желудка п = 583

ИЛИ

95% ДИ

P значение

G
/G <бр>
293 (66,3%)
396 (67,9%)
1
Ссылка
-
G
/A

135 (30,5%) <бр> 174 (29,8%)
0,97
0.74-1.28
0,839

/A

14 (3,2%)
13 (2,2%)
0,71
0.33-1.53 ​​
0,381
G
/A + A

/A

149 (33,7%)
187 (32,1% )
0,95
0.73-1.23
0,689
G

721 (81,6%)
966 (82,8%)
1
Ссылка
-
управлением

163 (18,4%)
200 (17,2%)
0,92
0.72-1.16
0,243
AOR для каждого генотипа была рассчитана по возрасту и полу скорректированный модели логистической регрессии, и сырой нефти или рассчитывали для каждого аллеля.
Обсуждение
это исследование показало, что те, кто укрывает A
аллель PTPN11
rs2301756 полиморфизма на интрона 3 имели значительно меньший риск от тяжелой атрофии желудка. Это в соответствии с нашей гипотезе, что развитие желудка атрофии после CaGa
-положительным H. Pylori
инфекции был более редким среди тех, с A /A
генотипа, чем среди тех, с G /G
генотипа [24 , 25], хотя значимая связь наблюдалась только при тяжелой атрофии желудка в данном исследовании. Поскольку биологические процессы в инфекции, развитие атрофии, и канцерогенеза различны [15], объединение этого полиморфизма с только атрофический развития казались биологически правдоподобным.
Хотя была ограниченная информация о потенциальной функции PTPN11
полиморфизмов, биологические характеристики SHP-2 становятся все более понятны. ШП-2 является одним из двух существующих млекопитающих не-трансмембранный (внутриклеточный белок) тирозин фосфатаз (PTPs), которые содержат ЦСИ гомологии 2 (SH2). Связывание тирозина фосфорилированного CagA к SH2-доменов, как предполагается, индуцируют конформационные изменения в SHP-2, который ослабляет ингибирующего взаимодействие между ПКМ и N-концевых SH2-доменов, в конечном итоге приводит к активации ШП-2 фосфатазы [10, 29, 30] , G /A
полиморфизм в интроне 3 PTPN11
находится 223 пар оснований в обратном направлении от экзона 4, который кодирует начальную часть С-концевого домена SH2. Хотя биологическая роль настоящего полиморфизма пока не clearified, полиморфизм может оказывать некоторое влияние на формирование PTPN11
вариантов сплайсинга мРНК, из которых 8 форм было зарегистрировано на сегодняшний день (SpliceMinor домашнюю страницу, разработанный Genomics &Amp; биоинформатики Группа (GBG) из NCI: HTTP: //WWW tigerteamconsult ING COM /SpliceMiner /)... Данные LD между этими PTPN11
полиморфизмов, показанных на рисунке 1, что для кавказцев, и нет точной информации о LD на японском языке не имеется в настоящее время. Есть также некоторые PTPN11
ОНП которого LD статус остается неизвестным (SNP8 и SNP9 на рисунке 1). Функция PTPN11
полиморфизм в экзоне 3 (rs2301756) и другие PTPN11
ОНП на взаимодействие между SHP-2 и CagA в Японии и других этнических групп требует дальнейшего изучения.
Хотя Г
аллеля из PTPN11
может быть частью генетических признаков для развития атрофии желудка с помощью трансдукции сигнала от CagA, кажется, есть другие генетические признаки, участвующие в этом процессе. CagA связывается несколько молекул; Grb2, который преобразовывает сигнал в Рас-МАРК пути вызывая пролиферации клеток, с-Met фактор роста гепатоцитов (HGF) рецептора, которые имеют определенную роль клеточной пролиферации и подвижности сперматозоидов, ZO-1, плотно спая белок и Par1 /Mark киназы, которая играет существенную роль в полярности эпителиальных клеток [31-35]. Хотя никаких исследований не проводилось, функциональные полиморфизмы этих молекул могут быть также кандидаты генетических признаков атрофии желудка.
The A
аллель была доминирующей аллель PTPN11
полиморфизм в интроне 3 среди кавказцев (0.875 из 120 хромосом), но не среди японцев (0,178 902 хромосомах) и китайский (0.083 из 48 choromosomes) [26]. Это исследование показало, что A
частота аллеля 0,170 среди наших японских предметов контроля, аналогичные отчётный частоты аллеля на японском языке.
Настоящее исследование имеет ряд недостатков. Несмотря на то, H. Pylori
статус субъектов контроля исследовали с помощью теста серологического, мы не проверяли статус CagA. Как сообщалось в Японии, почти 100% штаммов H. Pylori
обладают функциональной CAG
острова патогенности (CAG
PAI), который кодирует и производит белок CagA [36]. Предыдущее исследование также подтвердил, что почти все штаммы, выделенные из наших японских подданных были восточноазиатской CaGa
-положительные штаммы [37], что указывает на H. Pylori
штаммы в нашем исследовании испытуемых также обладает CagA. Другое ограничение связано с диагнозом атрофия желудка. Это было сделано исключительно на основе уровней сывороточного пепсиногена, а не через гистологической оценки, потому что большинство из контрольной группы не подвергались желудочно-эндоскопию с биопсией. Тем не менее, метод пепсиногена хорошо известна в качестве суррогатного маркера атрофии желудка [38-40]. Подтверждено критерием атрофии желудка является PG I ≤ 70 нг /мл и PG I /соотношение II из ≤ 3,0, и что при тяжелой атрофии желудка является PG I ≤ 30 нг /мл и PG I /соотношение II из ≤ 2,0, оба которые должны быть надежными, поскольку они широко используются на практике в Японии [41, 42]. Что касается желудочных случаев рака в H. Pylori
уровни серопозитивности и пепсиногена не были изучены, но большинство случаев рака желудка, казалось, H. Pylori
положительных случаев с атрофией желудка [43, 44]. Учитывая, что кишечный тип рака желудка, преобладающим типом рака желудка в Японии, возникает атрофия желудка, вызванного H. Pylori
инфекции, а также диффузный типа рака желудка происходит независимо от желудочной атрофии [45], казалось бы интригующим выполнить анализ подгруппы в соответствии с этими двумя гистологических типов. Этот анализ мог бы раскрыть связь этого PTPN11
полиморфизма с этапами канцерогенеза желудка более четко. Тем не менее, мы не можем выполнить этот анализ из-за отсутствия гистологических данных.

• CDK-ассоциированной Каллин 1 может способствовать пролиферации клеток и ингибировать цисплатин-индуцированно…
• Анализ белков цикла связанных клеток в раковых заболеваний дифференцированы типа желудка intramucosal на основе м…