Associations of a PTPN11 G /A polymorfismin introni 3 kanssa Helicobacter pyloriseropositivity, mahalaukun surkastuminen ja mahasyövän Japanese

Associations of a PTPN11
G /A polymorfismin introni 3 kanssa Helicobacter pylori
seropositiivisuus, mahalaukun surkastuminen ja mahasyövän japani
tiivistelmä
tausta
Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet merkitystä Helicobacter pylori
(H. pylori
) infektion riskitekijäksi mahasyövän. Sytotoksiini liittyvän geenin A (CAGA
) positiivisuus on osoitettu määrittämiseksi kliininen tulos H. pylori
-infektion läsnä ollessa SHP-2 (src homologia 2 domeenin sisältävä proteiinityrosiinifosfataasi-2). Tämän tutkimuksen tavoitteena oli tutkia aiemmin raportoitu yhdistys G /A PTPN11 (proteiini-tyrosiini- fosfataasi, nonreceptor-tyyppinen 11) B polymorfismi (rs2301756) mahalaukun surkastuminen, sekä yhdessä mahalaukun syövän Japani väestön käyttämällä suuri otoskoko. Tool menetelmät
koehenkilöistä oli 583 histologisesti diagnosoitu potilailla mahalaukun syövän (429 miestä ja 154 naista) ja iän ja sukupuolen taajuus yhteensopivat 1636 syöpäsolujen avohoidossa (1203 miestä ja 433 naista), käyneiden Aichi Cancer Center Hospital välillä 2001-2005. Seerumin anti-H. pylori
IgG-vasta ja pepsinogeenia mitattiin arvioimaan helikobakteeri
infektion ja mahalaukun surkastuminen, vastaavasti. Kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) laskettiin logistinen malli.
Tulokset
joukossa H. pylori
seropositiivisia kuin syöpä avohoidossa, The samanikäisillä ja samaa sukupuolta vakioitu OR mahalaukun surkastuminen oli 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P
= 0,194) ja G /A
, 0,84 (95% CI ,39-+1,81, P
= 0,650) ja A /A
, ja 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P
= 0,182) ja G /A
+ A /A
suhteessa G /G
genotyyppi, ja että vakavien mahalaukun surkastuminen oli 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P
= 0,079), 0,56 (95% CI 0,17-1,91, P
= 0,356), ja 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P
= 0,057) vastaavasti. Niistä Helikobakteeri
tartunnan aiheista (helikobakteeri
seropositiivisilla koehenkilöillä ja seronegatiivisilla mahalaukun surkastuminen), oikaistu tai vaikean mahalaukun surkastuminen edelleen vähentää; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P
= 0,012) ja G /A
+ A /A
. Jakauma genotyypin potilailla, joilla on mahalaukun syöpä ei ollut merkittävästi erilainen kuin H. pylori
tartunnan aiheista ilman mahalaukun surkastuminen.
Päätelmä
Tutkimuksemme tulokset osoittivat, että ne, joilla on A /A
genotyyppi PTPN11
rs2301756 polymorfismi on pienempi riski vakavan mahalaukun atrofiaa, mutta joita ei ole liitetty vähentynyt mahalaukun syövän riski, joka osittain tukee myös aiempaan toteamukseen polymorfismi PTPN11
koodaavan geenin SHP-2 oli liittyvä mahalaukun surkastumisen riski helikobakteeri
tartunnan japani. Biologinen roolit tämän PTPN11
polymorfismi edellyttävät lisätutkimuksia.
Tausta
Helicobacter pylori
(H. pylori
) infektio on vakiintunut riskitekijä mahasyövän kehittämällä mahalaukun surkastumista ja myöhemmin syövän esiasteita. Erityisesti Helikobakteeri
kantojen kanssa Sytotoksiini liittyvän geenin A (Caga
) on vahva yhdessä lisääntynyt mahalaukun adenokarsinooman riski [1]. Vaikea mahalaukun surkastuminen ja korpuksen-hallitseva gastriitti sekä suoliston metaplasiaa ovat vakiintunut hallitseva taipumukseen mahasyövän [2]. Isäntä proinflammatoristen geneettiset tekijät yhdessä bakteerin virulenssiin tekijät, kuten CagA on raportoitu määrittämiseksi vakavuuden mahalaukun vaurioita ja lopulta kliininen tulos H. pylori
infektion [3, 4]. Riski mahalaukun syövän kerrotaan moninkertaisesti jos isäntä satamat molemmat näistä tekijöistä [5, 6]. Itä-Aasian väestön suuri enemmistö H. pylori
ovat Caga
-positiivisille kantoja. CagA on jaettu kahteen alatyyppiin, Itä-Aasian tyyppi ja Länsi type [7]. Arvosana mahalaukun surkastumisen ja mahalaukun syövän riski on suurempi potilailla, joilla Itä-Aasian Caga
positiivisia kantoja kuin niillä, joilla Caga
-negatiivinen tai Western Caga
positiivisia kantoja [8].
CagA proteiini kulkeutua liitetyistä helikobakteeri
isäntäsoluihin mahan epiteelisoluihin kautta bakteerin tyypin IV eritystä laitteessa, ja käy läpi tyrosiinifosforylaation isäntäsoluissa [9]. Se indusoi sironnan fenotyyppejä mahalaukun epiteelisolujen, nimeltään "kolibri fenotyyppi", jonka arvellaan ratkaiseva rooli patogeneesissä Caga
positiivisten helikobakteeri
infektio, joka lopulta johtaa mahalaukun syöpä. Tässä CagA riippuvainen morfologinen transformaatio mahalaukun epiteelisolujen olemassaolo SHP-2 (src homologia 2 domeenin sisältävä proteiinityrosiinifosfataasi-2) on välttämätöntä, [10]. SHP-2 on keskeinen rooli solunsisäisessä signalointi alavirtaan useita kasvutekijöitä, hormoneja, ja sytokiinit [11, 12]. Siirretyn CagA muodostaa fyysinen kompleksin SHP-2 edistää näin sen fosfataasiaktiivisuus [10]. Myöhemmät Erk (ekstrasellulaarisen signaali-säännelty kinaasi) toiminta edistää myös CagA aiheuttama "kolibri fenotyyppi" [13]. Siten CagA /SHP-2 kompleksin muodostuminen voi aiheuttaa epänormaalia proliferaatiota, liikkumista mahalaukun epiteelisolujen ja solumuutoksia, jotka saattavat ratkaisevasti johtaa mahalaukun surkastumisen ja mahalaukun syöpä.
Koska SHP-2 läheisessä vuorovaikutuksessa CagA proteiini, on luonnollista spekuloida, että toiminnallisten polymorfismien PTPN11 (proteiini-tyrosiini- fosfataasi, nonreceptor-tyyppinen 11) B koodaavan geenin SHP-2 voi lopulta vaikuttaa aste mahalaukun surkastuminen ja muunnos mahasyövän infektion saaneilla. On 9 yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) lieviin alleelifrekvensseiltään > 0.05 PTPN11
geenin Japani on HapMap, jotka kaikki sijaitsevat ei-koodaavat alueet, ja useimmat niistä ovat absoluuttisesti kytkentäepätasapainossa (LD) (D '
= 1 ja r
2 = 1) tai täydellinen kytkentäepätasapaino- (D '
= 1 ja r
2 < 1) toisiinsa. Viisi 9 SNP on osoitettu olevan täysin LD ja 3 niistä on esitetty olevan absoluuttisesti LD tai lähes absoluuttisen LD (D '
= 1 ja r
2 > 0,9) valkoihoisilla kuten on esitetty kuviossa 1, joka perustuu HapMap kotisivu http: //www. hapmap. org. Viimeaikaiset raportti paljasti, että yksi PTPN11 G /A
SNP klo intronin 3 (rs2301756) oli täysin LD toiseen PTPN11 G /A
SNP klo intronin 10 (rs12229892) [14]. Tässä tutkimuksessa G /A
SNP klo intronin 3 (rs2301756), yksi 3 SNP absoluuttisessa LD valittiin edustajana nämä liittyvät SNP. Kuva 1 Kytkentäepätasapaino (LD) välillä 9 yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), jonka pienempi alleelifrekvensseiltään > 0,05 vuonna PTPN11 geenialueen valkoihoisilla (CEU: Utah asukkaille syntyperä Pohjois- ja Länsi-Euroopassa). LD kartat esitetään kaksi parametria, r
2 ja D
"varten valkoihoisilla (CEU: Utah asukkaille syntyperä Pohjois- ja Länsi-Euroopassa). SNP numerot LD kartat vastaavat rs numerot kuvattu oikeassa yläkulmassa karttojen.
Helikobakteeri
liittyvät mahasyövän, johtava prosessi tauti on kolme vaihetta; Helikobakteeri
infektion, maha- surkastumista kehittämiseen ja syövän syntymistä. Kussakin vaiheessa, geneettiset ominaisuudet ja niiden vuorovaikutukset elämäntyyli voivat vaikuttaa prosessin [15]. Geneettisiä piirteitä, merkitseviä interleukiini
(IL
) 1B
C-31T ja C-511T polymorfismien [16, 17], tuumorinekroositekijä (TNF) -α
C-857T ja T-1031C polymorfismien [18], ja NAD (P) H dehydrogenaasi, kinoni 1 (NQO1) B C609T polymorfia [19] kanssa H. pylori
infektio, yhteenliittymät G /a
polymorfismi intronin 2 Grb2 liittyvien sideaine 1
(Gab1
) [20], interleukiini
(IL
) 2 T-330g, ja IL-13
C-1111T [21 ] mahalaukun surkastuminen on raportoitu tähän mennessä. Vaihteleva tandem-toistojen lukumäärä (VNTR) polymorfismit Musiinigeenien 1 (MUC1) B on myös osoitettu vaikuttavan H. pylori
infektion [22, 23]. Vaikka on olemassa useita tutkimuksia osoittamaan polymorfismien merkittävästi liittyvät mahalaukun syövän riski, vain muutamia tutkimuksia arvioitiin riski askel mahalaukun surkastuminen syöpään [15].
Aiemmissa tutkimuksissa keskuudessa Japani ja Japani brasilialaisia , AA
genotyypin intronin 3 osoitettiin vähentävän mahalaukun surkastumisen kehitykseen [24, 25]. Äskettäin, toinen PTPN11
SNP (rs11066322 on introni 10 täysin kytkentäepätasapainossa sen rs2301756) havaittiin merkitsevästi yhteydessä seerumin apoB tasot British väestöstä [26], tukee oletusta, että tämä PTPN11
polymorfismi on toiminnallinen . Tämän tutkimuksen tavoitteena oli vahvistaa aiemmin raportoitu assosiaatiota PTPN11
polymorfismi (rs2301756) ja mahalaukun surkastuminen mitattiin seerumin pepsinogeenia suuri määrä Japani aiheita, sekä tutkimaan yhdessä mahasyövän riskiä. Tool Menetelmät
aiheet
aiheet olivat osanottajille HERPACC (sairaala-pohjainen epidemiologinen tutkimus Program Aichi Cancer Center) tutkimuksessa, jossa ensimmäisen käynnin avohoidossa oli peräkkäin pyydetään antamaan elintapojen tiedot ja verinäyte saatuaan tietoisen suostumuksen [27]. Osallistujien joukossa, jotka kävivät Aichi Cancer Center sairaalan 2001 - 2005, 583 tapausta diagnosoitu mahasyövän ja iän ja sukupuolen taajuus-Hyväksytty 1638 syöpä vapaa avohoidossa otettiin näytteet kuin kontrolliryhmään, joiden joukossa kaksi avohoidossa suljettiin pois, koska ne eivät voineet genotyyppi, jättäen 583 tapausta ja 1636 tarkastuksia oikeutettu analyyseihin. Tietoinen suostumus saatiin kaikilta aiheista ja tutkimussuunnitelman hyväksyi eettisten toimikuntien Aichi Cancer Center ja Nagoyan yliopisto Graduate School of Medicine.
Näytteet ja diagnostiset kriteerit
Heidän seeruminäytteet varastoitiin välittömästi -20 ° C analysointiin asti. Anti-H. pylori
IgG-vasta mitattiin entsyymi-immunomääritys (EIA) kit "E levy" Eiken "H. pylori
vasta-aine" (Eiken Kagaku, Tokio, Japani). Ohjeiden mukaan varustettu tähän sarjaan, 10,0 yksikköä tai enemmän pidettiin seropositiivisia. Seerumin pepsinogeenia (PG) mitattiin kemiluminesenssi entsyymi-immunomääritys (CLEIA). Mahalaukun limakalvon surkastuminen oli ryhmitelty "none" (PG I > 70 ng /ml tai PG I /PG II > 3), "mieto" (PG I ≤ 70 ng /ml ja PG I /PG II ≤ 3, lukuun ottamatta "vakava" tapaukset) tai "vakava" (PG I ≤ 30 ng /ml ja PG I /PG II ≤ 2). Koska seeruminäytteistä mahasyövän tapaukset oli tarkoitus käyttää tutkimuksen, korkeamman prioriteetin, vasta ja PG tapauksista ei mitattu.
Genotyping
DNA uutettiin buffy coat Qiagen DNeasy mini kit ( Qiagen, Hilden, Saksa). PTPN11
G /A-polymorfismi (rs2301756) oli genotyyppi kanssa polymeraasiketjureaktiolla vastakkain kaksi paria alukkeita (PCR-CTPP) [28]. Alukkeet olivat F1: GGA TTA CAG GCA TAA GCC AC, R1: GAC CAC TAA ACT TCT TAA ATG AGC, F2: CAT TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA, ja R2: CTC TGG CTC TCT CGT ACA AGA. Monistusolosuhteet olivat seuraavat: 10 min alkudenaturaatio lämpötilassa 95 ° C: ssa, mitä seurasi 30 sykliä 1 min 95 ° C: ssa, 1 min 64 ° C: ssa, ja 1 min 72 ° C: ssa, sitten 5 min lopullinen pidentäminen 72 ° C. Monistettu DNA tehtiin näkyväksi 2% agaroosigeelillä etidiumbromidivärjäyksellä. Monistettu DNA oli 201 emäsparia G /G
genotyyppi, 201 emäsparin ja 339 emäsparin G /A
genotyyppi, 339 emäsparin A /A
genotyyppi, ja 490 emäsparin yhteisiä band [24].
tilastollinen analyysi
erot suhteissa tutkittiin kanssa Fisherin testiä. 95%: n luottamusväli (CI) ja prosentit laskettu binomijakauma. Logistinen regressioanalyysi suoritettiin arvioimalla kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% CI. Ikä säädettiin jatkuvana muuttujana logistisessa mallissa. Helikobakteeri
tartunnan aiheita määriteltiin ne, joilla helikobakteeri
seropositiivisuus tai mahalaukun surkastuminen, koska suurin osa tapauksista mahalaukun surkastuminen jälkeen kehittyy Helikobakteeri
infektioita. Suuntauk- Helikobakteeri
infektio, mahalaukun surkastuminen tai mahalaukun syövän kehitystä sukupuolen tai iän luokkia verrattiin käyttämällä χ 2 testi trendi. Laskelmat tehtiin käyttämällä STATA version 7 (Stata Corp, College Station, TX).
Tulokset
ominaisuudet aiheista ja alleelin taajuus PTPN11 polymorfismin
ominaisuudet aiheista on koottu taulukkoon 1 . keski-ikä ± keskihajonta oli 58,7 ± 10,6 y (alue: 25-84 y) kontrollille ja 58,8 ± 10,5 y (alue: 27-80 y) tapauksista. Naaraat olivat 26,5% kontrolleissa ja 26,4% tapauksissa. Noin kolme neljäsosaa valvonnan infektoitiin helikobakteeri
, kun taas noin kolmasosa valvonnan oli mahalaukun surkastuminen. Genotyyppi taajuus PTPN11
polymorfismi joukossa valvonta oli Hardy-Weinberg n tasapaino (χ 2 = 0,047, P
= 0,828). Testasimme suuntaus helikobakteeri
infektio, mahalaukun surkastuminen tai mahalaukun syövän kehitystä sukupuolen tai iän luokkia, jotka paljastivat merkittäviä suuntaus korkeampi helikobakteeri
infektioprosentti miehillä (P
-arvo muutossuunnat < 0,001) ja korkea ikä luokat (P
< 0,001), ja muita yleisemmin mahalaukun surkastuminen korkeamman ikäryhmissä (P
< 0,001) .table 1 ominaisuudet aiheiden ja PTPN11
rs2301756 polymorfismi.

Controls n = 1636
Tapaukset n = 583
H. pylori (-) B H. pylori (+) B GA (-) B-GA (+) B n
699
442
495
583
Sukupuoli
Mies
479 (68,5%) B 363 (82,1%) B 361 (72,9%) B 429 (73,6%) B Nainen
220 (31,5%)
79 (17,9%) B 134 (27,1%)
154 (26,4%) B Age
< 30
6 (0,9%)
1 (0,2%) B 1 (0,2%) B 2 (0,3%)
30-39
67 (9,6%) B 11 (2,5%) B 3 (0,6%)
31 (5,3%)
40-49
138 (19,7%)
54 (12,2%)
31 (6,3% )
64 (11,0%)
50-59
194 (27,8%) B 151 (34,2%) B 141 (28,5%) B 214 (36,7%) B 60-69
211 (30,2%) B 152 (34,4%) B 221 (44,7%) B 166 (28,5%) B 70-
83 (11,9%)
73 (16,5%)
98 (19,8%) B 106 (18,2%) B genotyyppi
G Twitter /G
483 (69,1%) B 293 (66,3%) B 350 (70,7%) B 396 (67,9%) B G
/A
198 (28,3%) B 135 (30,5%)
131 (26,5%)
174 (29,9%) B
/A
18 (2,6%)
14 (3,2%)
14 (2,8%)
13 (2,2%) B GA (-) ja GA (+) osoittavat ilman surkastumista ja surkastumista, vastaavasti.
PTPN11 polymorfismi, helikobakteeri
seropositiivisuus, mahalaukun surkastuminen ja mahasyövän
ei ollut merkittävää yhteyttä välillä PTPN11
polymorfismi ja seropositiivisuus, vaikka TAI A /A
genotyyppi oli 1,19 suhteessa G /G
genotyyppi (taulukko 2) .table 2 Kertoimet suhteet (syrjäisimmille alueille ) ja 95%: n luottamusvälit (CI) on PTPN11
rs2301756 polymorfismin H. pylori
seropositiivisuuden.
genotyyppi , alleeli
n
H. pylori +
H. pylori + (%)
ORa
95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G
2716
1552
57,1
1
Reference -

556
322
57,9
1.03
0,85-1,25
0,387
AOR kunkin genotyypin laskettiin iän ja sukupuolen mukaan säädetty logistinen regressiomalli, ja raakaa OR laskettiin kullekin alleelin.
oli 937 helikobakteeri
seropositiivisia aiheita, joiden joukossa 495 (52,8%) henkilöillä oli surkastumista. Yhtäältä oli 45 (6,4%) potilailla, joilla oli surkastuminen joukossa 699 seronegatiivisilla aiheista. Ero esiintyvyys oli tilastollisesti merkitsevä (P
< 0,001).
Taulukossa 3 on esitetty genotyypin mukainen jakauma seropositiivisuus ja atrofiaa. Ei ollut potilailla, joilla on A /A
genotyyppi kesken seronegatiivisilla surkastumista osallistujille. Näin ollen säätää tai mahalaukun surkastuminen keskuudessa seronegatiivisilla ei ollut laskettavissa A /A
genotyyppi; genotyyppijakauman ei merkittävästi liittynyt mahalaukun surkastuminen jonka 3 x 3 Fisherin testiä (P
= 0,196) .table 3 PTPN11
rs2301756 genotyyppijakauman mukaan helikobakteeri
seropositiivisuutena ja luokka mahalaukun surkastumista.
genotyyppi
helikobakteeri seronegatiivisia
helikobakteeri seropositiivisten


GA (-)
GA (+)
GA (++)
GA (-)
GA (+)
GA (++)
G Twitter /G
447 (68,3%)
11 (64,7%)
25 (89,3%) B 293 (68,4%) B 223 (68,2%) B 127 (75,6%) B G
/A
189 (28,9%)
6 (35,3%) B 3 (10,7%) B 135 (28,9%)
93 (28,4%)
38 (22,6%) B
/A

18 (2,8%) B 0 (0,0%)
0 (0,0%)
14 (2,7%)
11 (3,4%) B 3 (1,8%)
Yhteensä
654 (100%) B 17 (100%) B 28 (100%) B 442 (100%) B 327 (100%) B 168 (100%)
GA (-), GA (+) ja GA (++) eivät viittaa surkastuminen, lievä surkastuminen ja vakava surkastuminen, vastaavasti.
ikä- ja sukupuoli vakioitu OR mahalaukun surkastuminen joukossa H. pylori
seropositiivisia koehenkilöillä oli 0,82 (95% CI 0,62-1,10, P
= 0,194) ja G /A
, 0,84 (95% CI 0,39-1,81, P
= 0,650) ja A /A
, ja 0,83 (95% CI 0,62-1,09, P
= 0,182) ja G /A
+ A /A
verrattuna G /G
genotyyppi. Iän ja sukupuolen säätää tai vaikean mahalaukun surkastuminen joukossa H. pylori
seropositiivisilla koehenkilöillä oli 0,70 (95% CI 0,47-1,04, P
= 0,079) ja G /A
, 0,56 (95% CI +0,17-+1,91, P
= 0,356) ja A /A
, ja 0,68 (95% CI 0,46-1,01, P
= 0,057) ja G /A
+ A /A
kun niitä ilman vakavia mahalaukun surkastuminen määriteltiin viittaus (taulukko 4). Kun Helikobakteeri
seropositiivisilla koehenkilöillä ja seronegatiivisilla mahalaukun surkastuminen pidettiin H. pylori
tartunnan henkilöillä samanikäisillä ja samaa sukupuolta vakioitu OR vaikean mahalaukun surkastuminen joukossa H. pylori
tartunnan oli edelleen vähennetään; 0,62 (95% CI 0,42-0,90, P
= 0,012) ja G /A
+ A /A
(taulukko 4) .table 4 genotyyppi taajuudet PTPN11
rs2301756 polymorfismi, kertoimet suhdeluvut ( syrjäisimmät alueet) ja 95%: n luottamusvälit (CI) mahalaukun surkastuminen on H. pylori
seropositiivisilla koehenkilöillä (a) ja helikobakteeri
infektion saaneilla (b) b (a)









genotyyppi, alleeli
n
kaikki mahalaukun surkastuminen (%)
ORa
95% CI
Pvalueb
Vaikea mahalaukun surkastuminen (%)
OR b

95% CI
Pvalueb
G Twitter /G
643
350 (54,4) B 1
Reference
-
127 (19,8)
1
Reference
- G
/A
266
131 (49,2) B 0,82
0,62-1,10
0,194
38 (14,3) B 0,70
,47-+1,04
0,079

/A
28
14 ( 50,0)
0,84
0,39-1,81
0,650
3 (10,7) B 0,56
0,17-1,91
0,356
G
/A
+
/A
294
145 (49,3)
0,83
0,62-1,09
0,182
41 (13,9) B 0,68
0.46- 1.01
0,057
G
1552
831 (53,5) B 1
Reference
- 292 (18,8) B 1
Reference -

322
159 (49,4)
0,85
0,66-1,08
0,097
44 (13,7) B 0,67
0,45-0,96
0,015
(b) b-genotyyppi, alleeli
n
Kaikki mahalaukun surkastuminen (%) b TAI
95% CI
P-arvo b
Vaikea mahalaukun surkastuminen (%) b TAI
95% CI
P-arvo b
G Twitter /G
677
383 (56,6)
1
Reference
- 151 (22,3) B 1
Reference
- G
/A
274
139 ( 50,7)
0,80
0,60-1,06
0,123
41 (15,0) B 0,63
0,43-0,93
0,019

/A

28
14 (50,0)
0,77
,36-+1,67
0,512
3 (10,7) B 0,49
0,14-1,67
0,254
G
/A
+ A
/A
302
153 (50,7) B 0,80
0,60-1,05
0,106
44 (14,6)
0,62
0,42-0,90
0,012
G
1628
905 (55,6) B 1
Reference
- 343 (21,1)
1
Reference -

330
167 (50,6)
0,82
0,64-1,05
0,102
47 (14,2 )
0,62
0,44-0,87
0,005
AOR kunkin genotyypin laskettiin iän ja sukupuolen mukaan säädetty logistinen regressiomalli, ja raakaa OR laskettiin kullekin alleelin.
bP
arvot alle 0,05 esitetään kursiivilla
.
Kuvio 2 esittää jakaumat pepsinogeeni I /II suhde mukaan PTPN11
rs2301756 genotyyppi joukossa H. pylori
infektiota, mutta joilla PG I ≤ 70 ng /ml. Mukaisesti toteamisesta kohteita, joissa
alleeli olivat vähensi merkitsevästi riski saada vakavia mahalaukun surkastuminen, taajuus koehenkilöillä, joilla PG I /II-suhde alle 2 oli pienempi potilailla, joilla
alleeli kuin ne, joilla on G /G
genotyyppi. Kuvio 2 Distributions pepsinogeeni (PG) I /II suhde mukaan PTPN11 rs2301756 genotyypin joukossa helikobakteeri infektiota, mutta joilla PG I tason ≤ 70 ng /ml.
Tutkimiseksi, miten tämä polymorfismi PTPN11
myötävaikuttaa mahalaukun syövän synnyn joukossa H. pylori
tartunnan aiheita, myös laskenut OR mahasyövän verrattuna helikobakteeri
infektion saaneilla ilman mahalaukun surkastuminen. Iän ja sukupuolen säätää tai mahasyövän oli 0,97 (95% CI 0,74-1,28, P
= 0,839) ja G /A
, 0,71 (95% CI 0,33-1,53, P
= 0,381) ja A /A
, ja 0,95 (95% CI 0,73-1,23, P
= 0,689) ja G /A
+ A /A
suhteessa G /G
genotyyppi, joista yksikään ei ollut tilastollisesti merkitsevä (taulukko 5) .table 5 genotyyppi taajuudet PTPN11
rs2301756 polymorfismia, ikä sukupuolta odotusarvo suhteet (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) mahasyövän suhteessa helikobakteeri
tartunnan aiheita ilman mahalaukun surkastuminen (HP-tartunnan ilman surkastuminen).
genotyyppi
HP tartunnan ilman surkastuminen n = 442
Mahasyöpää n = 583
OR
95% CI
P arvo
G Twitter /G

293 (66,3%) B 396 (67,9%) B 1
Reference
- G
/A
135 (30,5%)
174 (29,8%)
0,97
0,74-1,28
0,839

/A
14 (3,2%)
13 (2,2%)
0,71
0,33-1,53
0,381
G
/A
+ A
/A
149 (33,7%)
187 (32,1% ) B 0,95
0,73-1,23
0,689
G
721 (81,6%) B 966 (82,8%) B 1
Reference
-

163 (18,4%) B 200 (17,2%) B 0,92
0,72-1,16
0,243
AOR kunkin genotyypin laskettiin iän ja sukupuolen mukaan oikaistu logistinen regressiomalli, ja raakaa OR laskettiin kullekin alleelille.
Keskustelua
tutkimus osoitti, että ne, jotka satama
alleelin PTPN11
rs2301756 polymorfismi intronin 3 oli merkitsevästi pienempi vaikean mahalaukun surkastuminen. Tämä on sopusoinnussa meidän hypoteesia, että mahalaukun surkastuminen kehitys jälkeen Caga
positiivisten helikobakteeri
infektio oli harvinaisempaa saaneiden A /A
genotyyppi kuin niillä, joilla G /G
genotyyppi [24 25], vaikka merkittävää yhteyttä havaittiin vain vakavien mahan surkastumista tässä tutkimuksessa. Koska biologisia prosesseja infektio, surkastumista kehitys, ja syövän syntymistä ovat erilaiset [15], yhdistys tämän polymorfismin vain atrofinen kehitykseen vaikutti biologisesti uskottava.
Vaikka oli vähän tietoa mahdollisista toiminta PTPN11
polymorfismien, biologisia ominaisuuksia SHP-2 ovat tulleet yhä ymmärretty. SHP-2 on yksi kahden olemassa olevan nisäkkään ei-transmembraanisen (intrasellulaarisen) proteiini tyrosiinifosfataasien (PTP: t), jotka sisältävät src homologia 2 (SH2) domeenit. Sitova tyrosiinifosforyloitunutta CagA sen SH2-domeenia on tarkoitus indusoida konformaatiomuutoksen SHP-2, joka heikentää inhibitorinen vuorovaikutus PTP ja N-pään SH2-domeenia, joka lopulta johtaa aktivoinnin SHP-2 fosfataasi [10, 29, 30] . G /A
polymorfismi intronin 3 PTPN11
sijaitsee 223 emäsparia ylävirtaan eksonin 4, joka koodaa alkuperäisen osan C-terminaalisen SH2 domeenin. Vaikka biologisen roolin nykyisen polymorfismin ei ole vielä clearified, polymorfismin voi olla vaikutusta muodostumiseen PTPN11
mRNA variantteja, joista 8 lomakkeet on raportoitu tähän mennessä (SpliceMinor kotisivu kehittämää Genomics & Bioinformatics Group (GBG) NCI: http: //www. tigerteamconsult ta. com /SpliceMiner /). LD dataa PTPN11
SNP kuvassa 1 on, että valkoihoisilla, ja ole tarkkaa tietoa LD Japani on tällä hetkellä käytettävissä. On myös joitakin PTPN11
SNP jonka LD tila jää tuntematon (SNP8 ja SNP9 kuvassa 1). Funktio PTPN11
polymorfismin eksonissa 3 (rs2301756) ja muut PTPN11
SNP vuorovaikutuksesta SHP-2 ja CagA vuonna Japanin ja muiden etnisten ryhmien vaatii lisätutkimuksia.
Vaikka G
alleeli of PTPN11
voi olla osa geneettisten ominaisuuksien kehittää mahalaukun surkastumisen kautta signaalinvälityksessä CagA, siellä näyttää olevan muita geneettisiä piirteitä mukana tässä prosessissa. CagA sitoo useita molekyylejä; Grb2, joka transdusoi signaalin Ras-MAPK-reitin aiheuttavat solujen lisääntymistä, c-Met: hepatosyyttikasvutekijän (HGF) -reseptorin, joilla on rooli solujen lisääntymisen ja liikkuvuus, ZO-1, joka on tiiviisti liitoksen proteiinia, ja par1 /Mark kinaasi, jolla on keskeinen rooli epiteelisolujen polariteetin [31-35]. Vaikka ei ole tehty tutkimuksia, toiminnallinen polymorfismit näistä molekyyleistä voi olla myös ehdokkaita geneettisten ominaisuuksien mahalaukun surkastuminen.
A
alleeli oli hallitseva alleelin PTPN11
polymorfismi intronin 3 valkoihoisilla (0,875 of 120 kromosomit), mutta ei joukossa japani (0,178 902 kromosomien) ja kiina (0,083 48 choromosomes) [26]. Tässä tutkimuksessa todettiin, että A-
alleelin frekvenssi oli 0,170 keskuudessa Japani verrokeilla, samanlainen kuin raportoitu alleelin taajuus Japani.
Tämä tutkimus on useita rajoituksia. Vaikka Helikobakteeri
tilan verrokeilla tutkittiin kanssa serologia testi, emme tarkista CagA tilan. Kuten raportoitu Japanissa, lähes 100% H. pylori
kannat omistavat toimiva CAG
patogeenisyyssaarekkeen (CAG
PAI), joka koodaa ja tuottaa CagA proteiini [36]. Aiemmassa tutkimuksessa on sertifioitu myös, että lähes kaikki eristettyjen kantojen meidän Japani koehenkilöiden Aasian Caga
positiivisia kantoja [37], mikä osoittaa, että H. pylori
kantoja tutkimuksessamme koehenkilöillä myös hallussaan CagA. Toinen rajoitus liittyy diagnoosi mahalaukun surkastuminen. Tämä tehtiin täysin perusteella seerumin pepsinogeeni tasoja ja ei läpi histologista arviointia, koska suurin osa verrokeilla ei tapahtunut ruoansulatuskanavan tähystykseen kanssa koepala. Kuitenkin pepsinogeeni menetelmä on vakiintunut korvikemarkkerina mahalaukun surkastuminen [38-40]. Vahvistetut kriteeri mahalaukun surkastuminen on PG I ≤ 70 ng /ml ja PG I /II suhde ≤ 3,0, ja että vaikean mahalaukun surkastuminen on PG I ≤ 30 ng /ml ja PG I /II suhde ≤ 2,0, molemmat joiden pitäisi olla luotettavia, koska ne ovat laajalti käytetty käytännössä Japanissa [41, 42]. Mitä tulee mahasyövän tapauksissa helikobakteeri
seropositiivisuutena ja pepsinogeeni tasoja ei tutkittu, mutta suurin osa mahasyöpä tapauksissa näytti olevan H. pylori
positiivisia tapauksia mahalaukun surkastuminen [43, 44]. Ottaen huomioon, että suoliston tyyppinen mahasyöpä, hallitseva tyyppi mahasyövän Japanissa, syntyy mahalaukun surkastuminen H. pylorin aiheuttaman
infektio, ja hajanainen tyyppi mahasyövän tapahtuu riippumatta mahalaukun surkastuminen [45], se näyttäisi kiehtova suorittamaan alaryhmäanalyysissä mukaan nämä kaksi histologisia tyyppejä. Tämä analyysi saattaa paljastaa yhdistyksen tämän PTPN11
polymorfismi kanssa vaiheet mahasyövän selvemmin. Emme kuitenkaan voi tehdä tätä analyysiä, koska ei ole saatavilla histologinen data.

• CDK-liittyvä Cullin 1 voi edistää solujen lisääntymistä ja inhiboi sisplatiinin aiheuttama apoptoosin AGS mahasyövän solulinja
• Analyysi solusyklin-sukuiset proteiinit mahalaukun intramucosal eriytettyä-tyypin syöpien perustuu musiinituoton fenotyyppejä: uusi hypoteesi varhaisen mahasyövän perustuu musiinituoton fenotyypp…