Vzorci virusa zahodnega Nila, odkriti na razdalji 10 milj, so prihajali z različnih krajev,

Znanstvenik NAU ugotavlja Po sekvenciranju več kot 400 različnih genomov virusa zahodnega Nila, znanstvenik NAU je odkril, da sta dve poročili o virusu zahodnega Nila v okrožju Coconino prišli z dveh različnih krajev. Eden se je preselil proti severu iz območja Phoenixa. Drugi je nekoliko bolj skrivnosten.

Začelo se je z vzorci iz zahodnih ZDA, ki so prispeli v laboratorij evolucijskega biologa Crystal Hepp, ki sodeluje z obema šolo za informatiko, Računalništvo, in kibernetskih sistemov (SICCS) ter Inštituta za patogene in mikrobiome (PMI) na Univerzi v Severni Arizoni. Sodeluje z ducatom različnih oddelkov za javno zdravje po vsem Zahodu. Pošljejo ji vzorce Zahodnega Nila (WNV), najdene na njihovih območjih, in njena ekipa sekvencira virusne genome in analizira podatke, da rekonstruira družinsko drevo vsakega vzorca, ki ji omogoča, da ugotovi, kako se virus premika skozi čas in po vsej regiji.

V tem primeru, Oddelek za zdravje okrožja Coconino ji je poslal dva vzorca, enega v komarjih pri jezeru Mary in enega na območju Cheshire, oba konec avgusta. Hepp je sekvenciral genome sevov virusa, jih primerjal s sevi virusov, ki jih je sekvencirala z drugih področij, in ugotovili, da oba seva virusa nista posledica lokalnega kroženja virusa, kar pomeni, da se niso prenašali med pticami in komarji v okrožju. Sev Cheshire je tesno povezan s sevi, ki krožijo v okrožju Maricopa, medtem ko je sev Lake Mary najbolj povezan s sevom, ki ga je njena ekipa leta 2018 sekvencirala iz Montane, čeprav je sev Lake Mary pokazal več različnih mutacij iz seva Montana.

To je bilo nepričakovano, Je rekel Hepp. To je verjetno tudi dobro za okrožje Coconino.

Pogosto mislimo, da je najpreprostejši odgovor najverjetnejši odgovor. Smiselno bi bilo, če bi ti dve vrsti, ločenih le 10 milj, so bile posledica istega uvoza. Z vidika javnega zdravja, ugotovitev, da sta ta dva seva z dveh različnih krajev, je dobra novica. Če bi bili tesno povezani, to bi pomenilo, da so WNV verjetno kolesarili skozi ptice in komarje po 10 milj okrožja Coconino. Upamo, da sta dva ločena uvoda ravno kolesarila na zelo lokaliziranih geografskih lokacijah, ki sta jih našla, namesto čez 10 milj, in da preprosto izginejo. "

Kristalni Hepp, evolucijski biolog, NAU

Heppov laboratorij je vodilni v prizadevanju za boljše razumevanje, kako virus zahodnega Nila kroži po ameriškem jugozahodu. Njeni partnerji na področju javnega zdravja postavijo začetno diagnozo, nato pošljite njene seve, da ugotovijo, ali virus izvira. Poznavanje in kartiranje teh podatkov lahko vladam pomaga bolje predvideti in pripraviti se na možnost Zahodnega Nila na svojih območjih. Ti partnerji vključujejo:

• Okoljske službe okrožja Maricopa, Oddelek za nadzor vektorjev
• Oddelek za zdravstvene storitve v Arizoni
• Okrožje za uničevanje škodljivcev v okrožju Yuma
• Nadzor vektorjev v okrožju Coachella Valley
• Jugozahodno okrožje za zatiranje in zatiranje komarjev
• Ministrstvo za zdravje Utah
• Ministrstvo za zdravje Washington State
• Oddelek za javno zdravje in človeške storitve v Montani
• Oddelek za zdravje okrožja Coconino
• Zdravstveno okrožje Južna Nevada

Ta raziskava vključuje dodiplomske študente Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, in veličanstvo Greer-Gipson, specialistka za raziskave Jill Cocking, podiplomski študent Chase Ridenour, Krystal Sheridan in Heidie O'Neill iz jedra za sekvenciranje PMI ter Darrin Lemmer, Mike Valentine in Dave Engelthaler z raziskovalnega inštituta za translacijsko genomiko.

"Zelo nas zanima razumevanje povezljivosti med sevi, ki krožijo na jugozahodu, "Je rekel Hepp." To nam omogoča, da ugotovimo, na primer položaj WNV v okrožju Maricopa velja za druge jugozahodne lokacije. WNV iz okrožja Maricopa se je dodatno prelil v okrožje Washington, Utah; Okrožje Riverside, Kalifornija; in okrožje Yuma, Arizona v preteklosti, in radi bi napredovali s modelom napovedovanja, ki bi lahko občine obveščal o tveganjih na podlagi zgodovinskih vzorcev in okoljskih podatkov. "

Od leta 2010 v okrožju Coconino niso poročali o človeških primerih zahodnega Nila.

Zahodni Nil je najpogostejša bolezen, ki jo prenašajo komarji v državi, čeprav je njegov obseg težko izmeriti, saj se le približno 20 odstotkov okuženih sploh zaveda, da je bolno. Večina tistih, ki doživijo simptome, se počutijo kot da imajo gripo, vendar približno eden od 150 okuženih ljudi razvije resno bolezen, kot je encefalitis ali meningitis, kar je lahko usodno.

Leta 2018, Hepp je od Centra za biomedicinske raziskave v Arizoni prejel štipendijo za preiskavo obtoka in virov Zahodnega Nila v državi.

• Kar jeste, lahko spremeni način, kako antibiotiki vplivajo na črevesje
• Študija opisuje začetno bazo zdravih črevesnih mikrobiomov in profil številčnosti