Tudo começou com amostras de todo o oeste dos Estados Unidos chegando ao laboratório da bióloga evolucionária Crystal Hepp, que trabalha tanto com a Escola de Informática, Informática, e Cyber Systems (SICCS) e o Pathogen and Microbiome Institute (PMI) da Northern Arizona University. Ela colabora com vários departamentos de saúde pública em todo o Ocidente. Eles enviam amostras do Nilo Ocidental (WNV) encontradas em suas áreas, e sua equipe sequencia os genomas virais e analisa os dados para reconstruir a árvore genealógica de cada amostra, o que lhe permite determinar como o vírus está se movendo ao longo do tempo e em toda a região.
Nesse caso, O Departamento de Saúde do Condado de Coconino enviou a ela as duas amostras, um encontrado em mosquitos no Lago Mary e um na área de Cheshire, ambos no final de agosto. Hepp sequenciou os genomas das cepas de vírus, comparou-os com as cepas de vírus que ela sequenciou de outras áreas, e descobriram que as duas cepas de vírus não resultaram da circulação local do vírus, o que significa que não foram transmitidos entre pássaros e mosquitos no município. A cepa Cheshire está intimamente relacionada às cepas que circulam no condado de Maricopa, enquanto a cepa Lake Mary está mais intimamente relacionada a uma cepa que sua equipe sequenciou de Montana em 2018, embora a cepa Lake Mary mostrou várias mutações diferentes da cepa Montana.
Isso foi inesperado, Hepp disse. Também é provável que seja uma coisa boa para o condado de Coconino.
Muitas vezes pensamos que a resposta mais simples é a resposta mais provável. Teria feito sentido se essas duas cepas, separados por apenas 10 milhas, foram devido ao mesmo evento de importação. Do ponto de vista da saúde pública, descobrir que essas duas linhagens são de dois lugares diferentes é uma boa notícia. Se eles fossem intimamente relacionados, isso significaria que o WNV provavelmente passou por pássaros e mosquitos por 16 quilômetros do condado de Coconino. Esperamos que as duas apresentações separadas tenham acabado de circular nas localizações geográficas muito localizadas em que foram encontradas, em vez de 10 milhas, e que eles simplesmente desaparecem. "
Crystal Hepp, biólogo evolucionário, NAU
O laboratório de Hepp é líder no esforço para entender melhor como o vírus do Nilo Ocidental circula no sudoeste americano. Seus parceiros de saúde pública fazem o diagnóstico inicial, em seguida, envie suas cepas para determinar se o vírus se originou. Conhecer e mapear esses dados pode ajudar os governos a prever e se preparar melhor para a possibilidade do Nilo Ocidental em suas áreas. Esses parceiros incluem:
Esta pesquisa inclui alunos de graduação Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, e Majestade Greer-Gipson, a especialista em pesquisa Jill Cocking, estudante de graduação Chase Ridenour, Krystal Sheridan e Heidie O'Neill do núcleo de sequenciamento PMI, bem como Darrin Lemmer, Mike Valentine e Dave Engelthaler, do Translational Genomics Research Institute.
"Estamos muito interessados em entender a conectividade entre as cepas que circulam no sudoeste, "Hepp disse." Isso nos permite determinar, por exemplo, a situação do WNV no condado de Maricopa é para outras localidades do sudoeste. O WNV do condado de Maricopa também se espalhou para o condado de Washington, Utah; Riverside County, Califórnia; e Yuma County, Arizona no passado, e gostaríamos de avançar com um modelo preditivo que pudesse informar os condados sobre o risco com base em padrões históricos e dados ambientais. "
Nenhum caso humano de Nilo Ocidental foi relatado no condado de Coconino desde 2010.
O Nilo Ocidental é a doença transmitida por mosquitos mais comum no estado, embora sua extensão seja difícil de medir, porque apenas cerca de 20 por cento das pessoas infectadas sequer percebem que estão doentes. A maioria das pessoas que apresentam sintomas sentem que estão com gripe, mas cerca de uma em 150 pessoas infectadas desenvolve uma doença grave, como encefalite ou meningite, o que pode ser fatal.
Em 2018, Hepp recebeu uma bolsa do Arizona Biomedical Research Center para investigar a circulação e as localizações de origem do Nilo Ocidental no estado.