Vzorky vírusu West Nile, nachádzajúce sa 10 míľ od seba, pochádzajú z rôznych miest,

Vedec NAU zistil Po sekvenovaní viac ako 400 rôznych genómov vírusu West Nile, vedec NAU zistil, že dve správy o víruse Západného Nílu v okrese Coconino pochádzajú z dvoch rôznych miest. Jeden migroval na sever z oblasti Phoenixu. Ten druhý je tak trochu záhadou.

Začalo sa to tým, že vzorky z celého západu USA dorazili do laboratória evolučného biológa Crystal Heppa, ktorý spolupracuje so Školou informatiky, Výpočtový, and Cyber ​​Systems (SICCS) a Institute of Pathogen and Microbiome Institute (PMI) pri Northern Arizona University. Spolupracuje s tuctom rôznych oddelení verejného zdravotníctva na Západe. Posielajú jej vzorky zo západného Nílu (WNV) nájdené v ich oblastiach, a jej tím sekvenuje vírusové genómy a analyzuje údaje na rekonštrukciu rodokmeňa každej vzorky, čo jej umožňuje určiť, ako sa vírus pohybuje v čase a v celom regióne.

V tomto prípade, Ministerstvo zdravotníctva okresu Coconino jej poslalo dve vzorky, jeden bol nájdený v komároch pri jazere Mary a jeden v oblasti Cheshire, obaja koncom augusta. Hepp sekvenoval genómy vírusových kmeňov, porovnal ich s kmeňmi vírusov, ktoré sekvenovala z iných oblastí, a zistil, že tieto dva kmene vírusov nepochádzajú z lokálneho obehu vírusu, to znamená, že neboli prenesené medzi vtáky a komáre v kraji. Kmeň Cheshire je v tesnom spojení s kmeňmi cirkulujúcimi v Maricopa County, zatiaľ čo kmeň Lake Mary je najužšie spojený s kmeňom, ktorý jej tím sekvenoval z Montany v roku 2018, hoci kmeň Lake Mary vykazoval niekoľko rôznych mutácií od kmeňa Montana.

Toto bolo nečakané, Povedal Hepp. Je to tiež pravdepodobne dobré pre okres Coconino.

Často si myslíme, že najjednoduchšia odpoveď je najpravdepodobnejšia. Dávalo by zmysel, keby tieto dva kmene, oddelených iba 10 míľ, boli spôsobené rovnakou udalosťou dovozu. Z hľadiska verejného zdravia zistenie, že tieto dva kmene pochádzajú z dvoch rôznych miest, je dobrá správa. Ak spolu úzko súvisia, znamenalo by to, že WNV pravdepodobne prechádzali cez vtáky a komáre cez 10 míľ od okresu Coconino. Dúfame, že tieto dva samostatné úvody práve jazdili na bicykli vo veľmi lokalizovaných geografických lokalitách, v ktorých boli nájdené, než na 10 míľ, a že práve miznú. “

Crystal Hepp, evolučný biológ, NAU

Heppovo laboratórium je lídrom v úsilí lepšie porozumieť tomu, ako vírus West Nile cirkuluje na americkom juhozápade. Jej partneri v oblasti verejného zdravia stanovia počiatočnú diagnózu, potom pošlite jej kmene, aby určili, či vírus pochádza. Poznanie a mapovanie týchto údajov môže vládam pomôcť lepšie predpovedať a pripraviť sa na možnosť západného Nílu v ich oblastiach. Medzi týchto partnerov patria:

• Environmentálne služby okresu Maricopa, Divízia vektorovej kontroly
• Arizona ministerstvo zdravotníckych služieb
• Okres Yuma, okres na zníženie škodcov
• Vektorové ovládanie okresu Coachella Valley
• Okres na zníženie a kontrolu komárov na juhozápade
• Ministerstvo zdravotníctva v Utahu
• Washingtonské ministerstvo zdravotníctva
• Montana Department of Public Health &Human Services
• Ministerstvo zdravotníctva okresu Coconino
• Zdravotná oblasť Južná Nevada

Tento výskum zahŕňa vysokoškolákov Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, a Veličenstvo Greer-Gipson, výskumná špecialistka Jill Cockingová, postgraduálny študent Chase Ridenour, Krystal Sheridan a Heidie O'Neill zo sekvenčného jadra PMI, ako aj Darrin Lemmer, Mike Valentine a Dave Engelthaler z Výskumného ústavu translačnej genomiky.

„Máme veľký záujem porozumieť prepojeniu medzi kmeňmi cirkulujúcimi na juhozápade, „Povedal Hepp.“ To nám umožňuje určiť, napríklad, situácia WNV v okrese Maricopa je pre iné juhozápadné polohy. WNV z okresu Maricopa sa navyše rozlialo do okresu Washington, Utah; Riverside County, Kalifornia; a Yuma County, Arizona v minulosti, a chceli by sme pokročiť v prediktívnom modeli, ktorý by mohol informovať okresy o riziku na základe historických vzorcov a environmentálnych údajov. "

Od roku 2010 neboli v okrese Coconino hlásené žiadne ľudské prípady západného Nílu.

Západný Níl je najčastejšou chorobou prenášanou komármi v štáte, aj keď je ťažké merať jej rozsah, pretože iba asi 20 percent nakazených ľudí si dokonca uvedomuje, že sú chorí. Väčšina tých, ktorí majú príznaky, má pocit, že má chrípku, ale asi u jedného zo 150 infikovaných ľudí sa vyvinie závažné ochorenie, ako je encefalitída alebo meningitída, čo môže byť smrteľné.

V roku 2018, Hepp získal grant od Arizona Biomedical Research Center na vyšetrenie obehu a zdrojov Západného Nílu v štáte.

• To, čo jete, môže zmeniť spôsob, akým antibiotiká ovplyvňujú vaše črevo
• Štúdia opisuje počiatočnú východiskovú databázu zdravých črevných mikrobiómov a profil početnosti