I campioni di virus del Nilo occidentale trovati a 10 miglia di distanza provenivano da luoghi diversi,

Scienziato NAU trova Dopo aver sequenziato più di 400 diversi genomi del virus del Nilo occidentale, uno scienziato della NAU ha scoperto che i due rapporti sul virus del Nilo occidentale nella contea di Coconino provenivano da due luoghi diversi. Uno emigrò a nord dall'area di Phoenix. L'altro è un po' più un mistero.

È iniziato con campioni provenienti da tutti gli Stati Uniti occidentali che sono arrivati ​​al laboratorio della biologa evoluzionista Crystal Hepp, che collabora sia con la Scuola di Informatica, Informatica, e Cyber ​​Systems (SICCS) e il Pathogen and Microbiome Institute (PMI) presso la Northern Arizona University. Collabora con una dozzina di diversi dipartimenti di sanità pubblica in tutto l'Occidente. Le mandano campioni del Nilo occidentale (WNV) trovati nelle loro aree, e il suo team sequenzia i genomi virali e analizza i dati per ricostruire l'albero genealogico di ogni campione, che le consente di determinare come il virus si sta muovendo nel tempo e in tutta la regione.

In questo caso, Il dipartimento sanitario della contea di Coconino le ha inviato i due campioni, uno trovato nelle zanzare a Lake Mary e uno nella zona del Cheshire, entrambi a fine agosto. Hepp ha sequenziato i genomi dei ceppi virali, li ha confrontati con i ceppi di virus che aveva sequenziato da altre aree, e ha scoperto che i due ceppi virali non derivavano dalla circolazione locale del virus, il che significa che non sono stati trasmessi tra uccelli e zanzare nella contea. Il ceppo Cheshire è strettamente correlato ai ceppi che circolano nella contea di Maricopa, mentre il ceppo Lake Mary è più strettamente correlato a un ceppo che il suo team ha sequenziato dal Montana nel 2018, anche se il ceppo Lake Mary ha mostrato diverse mutazioni rispetto al ceppo Montana.

Questo era inaspettato, ha detto Hepp. Probabilmente è anche una buona cosa per la Contea di Coconino.

Spesso pensiamo che la risposta più semplice sia la risposta più probabile. Avrebbe avuto senso se questi due ceppi, separati da sole 10 miglia, erano dovuti allo stesso evento di importazione. Dal punto di vista della salute pubblica, scoprire che questi due ceppi provengono da due posti diversi è una buona notizia. Se fossero strettamente imparentati, significherebbe che il WNV è stato probabilmente attraversato in bicicletta da uccelli e zanzare attraverso 10 miglia della contea di Coconino. Speriamo che le due introduzioni separate abbiano appena girato in bicicletta nelle località geografiche molto localizzate in cui sono state trovate, piuttosto che attraverso 10 miglia, e che semplicemente svaniscono."

Cristallo Hepp, biologo evoluzionista, NAU

Il laboratorio di Hepp è leader nello sforzo di comprendere meglio come circola il virus del Nilo occidentale nel sud-ovest americano. I suoi partner di sanità pubblica fanno la diagnosi iniziale, quindi invia i suoi ceppi per determinare se il virus ha avuto origine. Conoscere e mappare questi dati può aiutare i governi a prevedere e prepararsi meglio per la possibilità di West Nile nelle loro aree. Questi partner includono:

• Servizi ambientali della contea di Maricopa, Divisione controllo vettoriale
• Dipartimento dei servizi sanitari dell'Arizona
• Distretto di abbattimento dei parassiti della contea di Yuma
• Controllo vettoriale del distretto di Coachella Valley
• Distretto sudoccidentale per l'abbattimento e il controllo delle zanzare
• Dipartimento della Salute dello Utah
• Dipartimento della Salute dello Stato di Washington
• Dipartimento della sanità pubblica e dei servizi umani del Montana
• Dipartimento della salute della contea di Coconino
• Distretto sanitario del Nevada meridionale

Questa ricerca include studenti universitari Daryn Erickson, Brock arioso, Samuel Poidmore, e Maestà Greer-Gipson, specialista di ricerca Jill Cocking, studente laureato Chase Ridenour, Krystal Sheridan e Heidie O'Neill del core di sequenziamento PMI e Darrin Lemmer, Mike Valentine e Dave Engelthaler del Translational Genomics Research Institute.

"Siamo molto interessati a comprendere la connettività tra i ceppi che circolano nel sud-ovest, " Ha detto Hepp. "Questo ci permette di determinare, Per esempio, la situazione del WNV nella contea di Maricopa riguarda altre località del sud-ovest. WNV dalla contea di Maricopa si è inoltre riversato nella contea di Washington, Utah; Contea di Riverside, California; e Yuma County, Arizona in passato, e vorremmo andare avanti con un modello predittivo che potrebbe informare le contee del rischio sulla base di modelli storici e dati ambientali".

Nessun caso umano di West Nile è stato segnalato nella contea di Coconino dal 2010.

Il Nilo occidentale è la malattia trasmessa dalle zanzare più comune nello stato, anche se la sua estensione è difficile da misurare perché solo il 20% circa delle persone infette si rende conto di essere malato. La maggior parte di coloro che manifestano sintomi si sente come se avesse l'influenza, ma circa una persona infetta su 150 sviluppa una malattia grave come l'encefalite o la meningite, che può essere fatale.

Nel 2018, Hepp ha ricevuto una sovvenzione dal Centro di ricerca biomedica dell'Arizona per indagare sulla circolazione e sui luoghi di origine del West Nile nello stato.

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