Počelo je s uzorcima iz cijele zapadne Sjedinjenih Država koji su stigli u laboratorij evolucijskog biologa Crystal Hepp, koji radi i sa Školom za informatiku, Računarstvo, i Cyber Systems (SICCS) te Institut za patogene i mikrobiome (PMI) na Sveučilištu Sjeverna Arizona. Surađuje s desetak različitih odjela za javno zdravstvo diljem Zapada. Šalju joj uzorke Zapadnog Nila (WNV) pronađene u njihovim područjima, i njezin tim sekvencira virusne genome i analizira podatke kako bi rekonstruirao obiteljsko stablo svakog uzorka, što joj omogućuje da odredi kako se virus kreće s vremenom i u cijeloj regiji.
U ovom slučaju, Odjel za zdravstvo okruga Coconino poslao joj je dva uzorka, jedan pronađen kod komaraca na jezeru Mary i jedan u području Cheshirea, obojica krajem kolovoza. Hepp je sekvencirao genome sojeva virusa, usporedio ih sa sojevima virusa koje je sekvencirala iz drugih područja, i otkrili da dva soja virusa nisu rezultat lokalne cirkulacije virusa, što znači da se nisu prenosili među pticama i komarcima u županiji. Cheshire soj usko je povezan sa sojevima koji kruže u okrugu Maricopa, dok je soj Lake Mary najbliže povezan sa sojem koji je njezin tim sekvencirao iz Montane 2018. iako je soj Lake Mary pokazao nekoliko različitih mutacija iz soja Montana.
Ovo je bilo neočekivano, Rekao je Hepp. To je također vjerojatno dobra stvar za okrug Coconino.
Često mislimo da je najjednostavniji odgovor najvjerojatniji odgovor. Bilo bi logično da su ova dva soja, odvojena samo 10 milja, su nastale zbog istog uvoznog događaja. Iz perspektive javnog zdravlja, otkriće da su ova dva soja s dva različita mjesta dobra je vijest. Da su blisko povezani, to bi značilo da je WNV vjerojatno prošao kroz ptice i komarce kroz 10 milja okruga Coconino. Nadamo se da su se dva odvojena uvoda upravo biciklirala na vrlo lokaliziranim zemljopisnim lokacijama koja su pronađena, umjesto preko 10 milja, i da samo nestaju. "
Kristalni Hepp, evolucijski biolog, NAU
Heppov laboratorij lider je u nastojanju da bolje razumije kako virus Zapadnog Nila cirkulira na američkom jugozapadu. Njezini partneri u javnom zdravlju postavljaju početnu dijagnozu, zatim joj pošaljite sojeve kako biste utvrdili je li virus nastao. Poznavanje i mapiranje tih podataka može pomoći vladama da bolje predvide i pripreme se za mogućnost Zapadnog Nila u svojim područjima. Ti partneri uključuju:
Ovo istraživanje uključuje studente preddiplomskog studija Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, i veličanstvo Greer-Gipson, specijalistica za istraživanje Jill Cocking, apsolvent Chase Ridenour, Krystal Sheridan i Heidie O'Neill iz jezgre PMI sekvenciranja, kao i Darrin Lemmer, Mike Valentine i Dave Engelthaler s Translational Genomics Research Institute.
"Vrlo smo zainteresirani za razumijevanje povezanosti među sojevima koji kruže jugozapadom, "Rekao je Hepp." To nam omogućuje da utvrdimo, na primjer, situacija WNV -a u županiji Maricopa odnosi se na druga jugozapadna mjesta. WNV iz okruga Maricopa dodatno se prelio u okrug Washington, Utah; Okrug Riverside, California; i okrug Yuma, Arizona u prošlosti, i htjeli bismo krenuti naprijed s modelom predviđanja koji bi mogao obavijestiti županije o riziku na temelju povijesnih obrazaca i podataka o okolišu. "
U okrugu Coconino od 2010. nisu zabilježeni slučajevi ljudi Zapadnog Nila.
Zapadni Nil je najčešća bolest koju prenose komarci u državi, iako je njegov opseg teško izmjeriti jer samo oko 20 posto zaraženih ljudi uopće shvati da je bolesno. Većina onih koji dožive simptome osjećaju se kao da imaju gripu, ali oko jedan od 150 zaraženih razvije ozbiljnu bolest poput encefalitisa ili meningitisa, što može biti kobno.
2018. godine, Hepp je dobio grant od Centra za biomedicinska istraživanja Arizone za istraživanje cirkulacije i izvora izvora Zapadnog Nila u državi.