Det startede med prøver fra hele det vestlige USA, der ankom til laboratoriet for den evolutionære biolog Crystal Hepp, der arbejder med både School of Informatics, Computere, og Cyber Systems (SICCS) og Pathogen and Microbiome Institute (PMI) ved Northern Arizona University. Hun samarbejder med en snes forskellige folkesundhedsafdelinger i hele Vesten. De sender hendes West Nile (WNV) prøver fundet i deres områder, og hendes team sekventerer de virale genomer og analyserer dataene for at rekonstruere hver prøves slægtstræ, hvilket giver hende mulighed for at bestemme, hvordan virussen bevæger sig over tid og i hele regionen.
I dette tilfælde, Coconino County Health Department sendte hende de to prøver, en fundet i myg ved Lake Mary og en i Cheshire -området, begge sidst i august. Hepp sekventerede genomerne af virusstammerne, sammenlignet dem med de virusstammer, hun havde sekventeret fra andre områder, og fandt ud af, at de to virusstammer ikke stammede fra lokal cirkulation af virussen, hvilket betyder, at de ikke blev overført blandt fugle og myg i amtet. Cheshire -stammen er tæt forbundet med stammer, der cirkulerer i Maricopa County, mens Lake Mary -stammen er mest beslægtet med en stamme, som hendes team sekventerede fra Montana i 2018, selvom Lake Mary -stammen viste flere forskellige mutationer fra Montana -stammen.
Dette var uventet, Sagde Hepp. Det er sandsynligvis også en god ting for Coconino County.
Vi tror ofte, at det enkleste svar er det mest sandsynlige svar. Det ville have været fornuftigt, hvis disse to stammer, adskilt af kun 10 miles, skyldtes den samme importbegivenhed. Set fra et folkesundhedsperspektiv, at finde ud af, at disse to stammer er fra to forskellige steder, er gode nyheder. Hvis de var nært beslægtede, det ville betyde, at WNV sandsynligvis var blevet cyklet gennem fugle og myg over 10 miles af Coconino County. Vi håber, at de to separate introduktioner netop har cyklet på de meget lokaliserede geografiske steder, de blev fundet, frem for over 10 miles, og at de bare forsvinder. "
Crystal Hepp, evolutionær biolog, NAU
Hepps laboratorium er en leder i bestræbelserne på bedre at forstå, hvordan West Nile Virus cirkulerer i det amerikanske sydvest. Hendes folkesundhedspartnere stiller den første diagnose, send derefter hendes stammer for at afgøre, om virussen stammer fra. At kende og kortlægge disse data kan hjælpe regeringerne med bedre at forudsige og forberede muligheden for West Nile i deres områder. Disse partnere omfatter:
Denne forskning omfatter bachelorstuderende Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, og Majestæt Greer-Gipson, forskningsspecialist Jill Cocking, kandidatstuderende Chase Ridenour, Krystal Sheridan og Heidie O'Neill fra PMI -sekventeringskernen samt Darrin Lemmer, Mike Valentine og Dave Engelthaler fra Translational Genomics Research Institute.
"Vi er meget interesserede i at forstå forbindelsen mellem stammer, der cirkulerer i sydvest, "Hepp sagde." Dette giver os mulighed for at bestemme, for eksempel, WNV -situationen i Maricopa County er for andre sydvestlige steder. WNV fra Maricopa County er derudover spildt over i Washington County, Utah; Riverside County, Californien; og Yuma County, Arizona i fortiden, og vi vil gerne gå videre med en forudsigelsesmodel, der kan informere amter om risiko baseret på historiske mønstre og miljødata. "
Der er ikke rapporteret om menneskelige tilfælde af West Nile i Coconino County siden 2010.
West Nile er den mest almindelige mygbårne sygdom i staten, selvom omfanget er svært at måle, fordi kun omkring 20 procent af de inficerede mennesker endda indser, at de er syge. De fleste af dem, der oplever symptomer, føler, at de har influenza, men omkring en ud af 150 smittede udvikler en alvorlig sygdom, såsom encephalitis eller meningitis, som kan være dødelig.
I 2018, Hepp modtog et tilskud fra Arizona Biomedical Research Center til at undersøge cirkulationen og kildeplaceringerne i West Nile i staten.
Undersøgelse forbinder fermenteret grøntsagsforbrug med lav dødelighed af COVID-19
Tarmmikrobiom forbundet med adfærdsproblemer hos børn
Hvis du er over 50,
Flagende potentielle molekylære forudsigere for reaktion på biologiske terapier ved ulcerøs colitis
Hvorfor du bør inkludere naturlige fiberkilder i din kost
Undersøgelse belyser årsagerne til invaliderende tarmsmerter
Søvnkvalitet kan være indikator for senere undersøgelser af Alzheimers sygdom
En ny undersøgelse fra forskerne ved University of California, Berkeley har vist, at gradvist faldende søvnkvalitet blandt dem i 50erne og 60erne kan være tegn på proteintangles i hjernen, der kan før
Foranstaltninger til at forhindre SARS-CoV-2-transmission gennem spildevand i fattige regioner
Forskere verden over bestræber sig på at forstå, hvordan coronavirus sygdom 2019 (COVID-19) og det nye patogen, der forårsager det-alvorligt akut respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-spred
Hvordan hjælper værtsfaktorer som lungemikrobiomet i SARS -CoV -2 -infektion?
Alvorligt akut respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) er en RNA-virus, der tilhører Coronaviridae-slægten og betacoronavirus-undergenus. Det er det nye og meget infektiøse patogen, der er an