Es begann mit Proben aus dem gesamten Westen der USA, die im Labor der Evolutionsbiologin Crystal Hepp ankamen. der sowohl mit der Fakultät für Informatik, Computer, and Cyber Systems (SICCS) und dem Pathogen and Microbiome Institute (PMI) der Northern Arizona University. Sie arbeitet mit einem Dutzend verschiedener Gesundheitsämter im ganzen Westen zusammen. Sie schicken ihr West Nile (WNV) Proben, die in ihren Gebieten gefunden wurden, und ihr Team sequenziert die viralen Genome und analysiert die Daten, um den Stammbaum jeder Probe zu rekonstruieren, Dadurch kann sie feststellen, wie sich das Virus im Laufe der Zeit und in der gesamten Region bewegt.
In diesem Fall, Das Gesundheitsamt von Coconino County schickte ihr die beiden Proben, eine in Mücken am Lake Mary und eine in der Gegend von Cheshire gefunden, beides Ende August. Hepp sequenzierte die Genome der Virusstämme, verglich sie mit den Virusstämmen, die sie aus anderen Gebieten sequenziert hatte, und stellte fest, dass die beiden Virusstämme nicht auf eine lokale Zirkulation des Virus zurückzuführen sind, Das heißt, sie wurden nicht zwischen Vögeln und Moskitos in der Grafschaft übertragen. Der Cheshire-Stamm ist eng mit den in Maricopa County zirkulierenden Stämmen verwandt. während die Lake Mary-Sorte am engsten mit einer Sorte verwandt ist, die ihr Team 2018 aus Montana sequenziert hat, obwohl der Lake Mary-Stamm mehrere verschiedene Mutationen vom Montana-Stamm aufwies.
Das war unerwartet, sagte Hepp. Es ist wahrscheinlich auch eine gute Sache für Coconino County.
Wir denken oft, dass die einfachste Antwort die wahrscheinlichste ist. Es wäre sinnvoll gewesen, wenn diese beiden Stämme, nur 10 Meilen getrennt, waren auf das gleiche Einfuhrereignis zurückzuführen. Aus Sicht der öffentlichen Gesundheit Es ist eine gute Nachricht, dass diese beiden Sorten von zwei verschiedenen Orten stammen. Wenn sie eng verwandt waren, es würde bedeuten, dass WNV wahrscheinlich durch Vögel und Moskitos über 10 Meilen von Coconino County gefahren wurde. Wir hoffen, dass die beiden separaten Einführungen gerade an den sehr lokalisierten geografischen Orten gefahren sind, an denen sie gefunden wurden. anstatt über 10 Meilen, und dass sie einfach ausblenden."
Kristall Hepp, Evolutionsbiologe, NAU
Hepps Labor ist führend in dem Bemühen, besser zu verstehen, wie das West-Nil-Virus im amerikanischen Südwesten zirkuliert. Ihre Public-Health-Partner stellen die Erstdiagnose, Senden Sie dann ihre Stämme, um festzustellen, ob das Virus stammt. Die Kenntnis und Kartierung dieser Daten kann Regierungen helfen, die Möglichkeit von West Nile in ihren Gebieten besser vorherzusagen und sich darauf vorzubereiten. Zu diesen Partnern gehören:
Diese Forschung umfasst Bachelor-Studenten Daryn Erickson, Luftiger Rock, Samuel Poidmore, und Majestät Greer-Gipson, Forschungsspezialistin Jill Cocking, Doktorandin Chase Ridenour, Krystal Sheridan und Heidie O'Neill vom PMI-Sequenzierungskern sowie Darrin Lemmer, Mike Valentine und Dave Engelthaler vom Translational Genomics Research Institute.
„Wir sind sehr daran interessiert, die Konnektivität zwischen den im Südwesten zirkulierenden Stämmen zu verstehen. " sagte Hepp. "Damit können wir feststellen, zum Beispiel, die WNV-Situation in Maricopa County gilt für andere südwestliche Standorte. WNV aus Maricopa County ist zusätzlich in Washington County übergelaufen, Utah; Riverside County, Kalifornien; und Landkreis Yuma, Arizona in der Vergangenheit, und wir möchten mit einem Vorhersagemodell vorankommen, das Landkreise auf der Grundlage von historischen Mustern und Umweltdaten über Risiken informieren könnte."
Seit 2010 wurden in Coconino County keine Fälle von West Nile bei Menschen gemeldet.
West Nile ist die häufigste durch Mücken übertragene Krankheit im Bundesstaat. obwohl das Ausmaß schwer zu messen ist, denn nur etwa 20 Prozent der Infizierten merken überhaupt, dass sie krank sind. Die meisten Patienten, bei denen Symptome auftreten, haben das Gefühl, eine Grippe zu haben. aber etwa einer von 150 Infizierten entwickelt eine schwere Erkrankung wie Enzephalitis oder Meningitis, was tödlich sein kann.
Im Jahr 2018, Hepp erhielt ein Stipendium vom Arizona Biomedical Research Center, um die Zirkulation und die Quellen von West Nile im Bundesstaat zu untersuchen.