Jis prasidėjo nuo mėginių iš visos Vakarų JAV, atvykstančių į evoliucinio biologo Crystal Hepp laboratoriją, kuris dirba tiek Informatikos mokykloje, Kompiuterija, ir „Cyber Systems“ (SICCS) bei Šiaurės Arizonos universiteto Patogenų ir mikrobiomų institutas (PMI). Ji bendradarbiauja su keliolika skirtingų visuomenės sveikatos departamentų Vakaruose. Jie siunčia jai Vakarų Nilo (WNV) mėginius, esančius jų vietovėse, ir jos komanda seka viruso genomus ir analizuoja duomenis, kad atkurtų kiekvieno mėginio šeimos medį, tai leidžia jai nustatyti, kaip virusas juda laikui bėgant ir visame regione.
Tokiu atveju, Coconino apskrities sveikatos departamentas atsiuntė jai du mėginius, vienas rastas uoduose prie Marijos ežero, o kitas - Češyro rajone, tiek rugpjūčio pabaigoje. Heppas suskirstė viruso padermių genomus, palygino juos su virusų padermėmis, kurias ji sekvenavo iš kitų sričių, ir nustatė, kad abi viruso padermės atsirado ne dėl vietinės viruso cirkuliacijos, tai reiškia, kad jie nebuvo perduoti tarp paukščių ir uodų apskrityje. Cheshire padermė yra glaudžiai susijusi su padermėmis, cirkuliuojančiomis Maricopos apskrityje, o Marijos ežero padermė yra labiausiai susijusi su padermė, kurią jos komanda sekė iš Montanos 2018 m. nors Marijos ežero padermė parodė kelias skirtingas Montana padermės mutacijas.
Tai buvo netikėta, - pasakė Hepas. Tai taip pat greičiausiai yra geras dalykas Coconino apygardai.
Dažnai manome, kad paprasčiausias atsakymas yra labiausiai tikėtinas. Būtų prasminga, jei šios dvi padermės, skiria tik 10 mylių, buvo dėl to paties importo įvykio. Visuomenės sveikatos požiūriu, pastebėti, kad šios dvi padermės yra iš dviejų skirtingų vietų, yra gera žinia. Jei jie buvo glaudžiai susiję, tai reikštų, kad WNV greičiausiai buvo nuvažiuotas per paukščius ir uodus per 10 mylių nuo Coconino apskrities. Tikimės, kad dvi atskiros įžangos ką tik važiavo dviračiu tose labai lokalizuotose geografinėse vietose, kuriose jos buvo rastos, o ne per 10 mylių, ir kad jie tiesiog išnyksta “.
Crystal Hepp, evoliucijos biologas, NAU
Heppo laboratorija yra lyderė siekiant geriau suprasti, kaip Vakarų Nilo virusas cirkuliuoja Amerikos pietvakariuose. Jos visuomenės sveikatos partneriai nustato pirminę diagnozę, tada nusiųskite jai štamus, kad nustatytumėte, ar virusas atsirado. Šių duomenų žinojimas ir žemėlapių sudarymas gali padėti vyriausybėms geriau numatyti ir pasirengti Vakarų Nilo galimybei savo vietovėse. Šie partneriai apima:
Šis tyrimas apima bakalauro studentus Daryną Ericksoną, Breezy Brock, Samuelis Poidmoras, ir didenybė Greer-Gipson, tyrimų specialistas Jill Cocking, magistrantas Chase Ridenour, Krystal Sheridan ir Heidie O'Neill iš PMI sekos branduolio, taip pat Darrin Lemmer, Mike'as Valentine'as ir Dave'as Engelthaleris iš Transliacijos genomikos tyrimų instituto.
„Mums labai įdomu suprasti pietvakariuose cirkuliuojančių padermių ryšį, "Heppas sakė." Tai leidžia mums nustatyti, pavyzdžiui, WNV situacija Maricopos apskrityje yra kitose pietvakarių vietose. WNV iš Maricopos apygardos papildomai išsiliejo į Vašingtono grafystę, Juta; Riverside grafystė, Kalifornija; ir Jumos apygarda, Arizona praeityje, ir mes norėtume judėti į priekį su nuspėjamuoju modeliu, kuris, remiantis istoriniais modeliais ir aplinkos duomenimis, galėtų informuoti apskritis apie riziką “.
Nuo 2010 metų Coconino grafystėje nebuvo pranešta apie Vakarų Nilo atvejus žmonėms.
Vakarų Nilas yra labiausiai paplitusi uodų platinama liga valstijoje, nors jo mastą sunku išmatuoti, nes tik apie 20 procentų užsikrėtusių žmonių net supranta, kad serga. Dauguma tų, kurie patiria simptomus, jaučiasi sirgę gripu, bet maždaug vienam iš 150 užsikrėtusių žmonių išsivysto sunki liga, tokia kaip encefalitas ar meningitas, kuris gali būti mirtinas.
2018 m. Heppas gavo dotaciją iš Arizonos biomedicinos tyrimų centro, kad ištirtų Vakarų Nilo apyvartą ir šaltinių buvimo vietą valstijoje.