Ploche ONE: združenie genetických variantov v PSCA, MUC1 a PLCE1 Gény sa rakovina žalúdka citlivosť u čínskej populácie

abstraktné

Pozadie

Niekoľko genetických variantov vrátane PSCA
rs2294008 C > T a rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, a PLCE1
rs2274223 a > G preukázali významnú súvislosť s rizikom rakoviny žalúdka v predchádzajúcich štúdiách asociačných genómu-široký (GWASs)

metódy

zhodnotiť združenia nich. SNP v Číňanov, nezávislý na báze case-control nemocnice štúdia bola vykonaná genotypizácia tieto štyri polymorfizmy v celkovo 692 prípadov rakoviny žalúdka a 774 zdravých kontrol získaných pomocou zachytenie frekvencie pre daný vek a pohlavie. Falošne pozitívna správa pravdepodobnosti (FPRP) analýza bola vykonaná tiež overiť všetky štatisticky významné zistenia.

Výsledky

V súčasnej štúdii bola pozorovaná významná súvislosť s náchylnosťou rakoviny žalúdka pre všetky štyri polymorfizmy zo záujmu. Konkrétne významné zvýšené riziko rakoviny žalúdka bola spojená s PSCA
rs2294008 (CT vs. CC: upraví OR = 1,37, 95% CI = 1,07 až 1,74, a CT /TT vs.CC: upraví OR = 1,30 , 95% CI = 1,03 - 1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs. GG: upraví OR = 1,30, 95% CI = 1,02 až 1,65, a AG /AA vs. GG: upraví OR = 1,26, 95% CI = 1,00 - 1,59), alebo PLCE1
rs2274223 (AG vs. AA: upraví OR = 1,48, 95% CI = 1.15-1.90 a AG /GG vs AA: upraví OR = 1,45, 95% CI = 1,14 - 1,84), v danom poradí. Na rozdiel od toho MUC1
rs4072037 bolo preukázané, že znižuje riziko rakoviny (CT vs. TT: upravená OR = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). Pacienti s viac ako jedným rizikových genotypov sa dosiahlo výrazné zvýšenie rizika vzniku rakoviny žalúdka (ďalej upraviť alebo = 1,30, 95% CI = 1,03 - 1,64), v porovnaní s tými, ktoré majú 0-1 rizikových genotypov. Stratifikovaný analýza ukázala, že zvýšené riziko bolo výraznejšie u mladších jedincov, muža, nikdy fajčiarov, fajčiarov sa zábalom rokov ≤ 27, pacienti s vysokým BMI, alebo non-kardio rakoviny žalúdka.

Závery

Táto štúdia podložené asociácia medzi štyrmi predchádzajúcimi hlásených genetických variantov a citlivosti na rakovinu žalúdka v nezávislom Han čínskej populácie. Ďalšie štúdie s väčšou veľkosťou vzorky a rôznych etník sú oprávnené na overenie naše zistenia

Citácia :. Sun H, Wu X, Wu F, Li Y, Z Yu, Chen X, et al. (2015) Združenie genetických variantov v PSCA
MUC1 stroje a PLCE1
Gény sa rakovina žalúdka citlivosť u čínskej populácie. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10,1371 /journal.pone.0117576

Akademický Editor: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, India

prijatá: 30.júna 2014; Prijaté: 27.prosince 2014; Publikované: 06.2.2015

Copyright: © 2015 Sun et al. Toto je článok o otvorenej distribuovaný pod podmienkami Creative Commons Attribution licencie, ktorá umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, že pôvodný autor a zdroj sú pripísané

Data Dostupnosť: Všetky relevantné údaje spadajú do papiera a jeho podporné informácie súbory

Financovanie :. štúdia bola podporená China National Natural Science Foundation (No. 81370563) grantu a provincia Zhejiang Program pre pestovanie na vysokej úrovni inovatívne zdravotné talenty a a provinčné správa tradičnej čínskej medicíny v provincii Zhejiang, Čína (No.2011ZA072) a projekt podporovaný Ministerstvom zdravotníctva Číny-hlavný medicíny vedy a techniky projekt v provincii Zhejiang (č WKJ2012-2-033) a aplikácií verejné blaho technológie výskumný projekt podporovaný vedy, techniky oddelenie provincie Zhejiang (No.2012C23108) a výbornou Youth Foundation z provincie Zhejiang prírodopisu (No.LR14H030001) a projekt vedy a techniky Wencheng kraja. Platcovia mal žiadnu úlohu v dizajne štúdie, zber a analýzu dát, rozhodnutie publikovať, alebo prípravu rukopisu

Konkurenčné záujmy: .. Autori vyhlásili, že žiadne konkurenčné záujmy neexistujú

Úvod
rakovina

žalúdok je štvrtým najčastejšie diagnostikovaná rakovina a druhou najčastejšou príčinou úmrtí na nádorové ochorenie na celom svete, s približne 738.000 úmrtí súvisiacich s rakovinou v roku 2008. Všeobecne platí, že viac ako 70% nových prípadov rakoviny žalúdka a úmrtí dochádza v rozvojových krajinách, pričom najvyššia miera výskytu vo východnej Ázii. Zvlášť, približne 40% prípadov rakoviny žalúdka svetových došlo v Číne [1,2]. Helicobacter pylori
( H
. pylori
) infekcie je dobre zavedená etiologickým faktorom pre rakovinu žalúdka po celom svete, s nakazených v rozmedzí od 40% do 80% u ľudí. Okrem H
. pylori
infekcie, solené a spotreba nitro potraviny a fajčenie cigariet sú tiež hlásené byť spojená so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka, zatiaľ čo čerstvé ovocie a zelenina príjem sú uznávané ako ochranných faktorov [3]. vysoký index telesnej hmotnosti (BMI) bol tiež navrhol ako rizikový faktor pre rakovinu žalúdka v západných krajinách [4], ale nie v Číne [5]. Avšak, len malý zlomok, ktorí sú vystavení riziku faktory nakoniec sa vyvinie rakovina žalúdka v priebehu životnosti [6], čo naznačuje, že môžu hrať dôležitú úlohu genetické faktory v patogenéze rakoviny žalúdka. K dnešnému dňu, genetická etiológie rakoviny žalúdka, ako je napríklad génu génom, a interakcie medzi génmi a prostredím, zostáva nejasný.

V uplynulých rokoch, genómu-široký združenia štúdie (GWASs), vysoké genotypizácia technológie priepustnosťou, ktoré majú bol robustný nástroj v objavu nových rakoviny citlivosti loci alebo génov v celej genóme [7]. Doteraz GWASs úspešne identifikovať stovky genetických markerov, ktoré sa vzťahujú k náchylnosti na ochorenia, vrátane rakoviny žalúdka [8]. Naším cieľom bolo preskúmať single-nucleotide polymorfizmy (SNP) u PSCA
MUC1 stroje a PLCE1
génov v tejto štúdii. PSCA
gén (nachádza sa na chromozóme 8q24) kóduje kmeňových buniek prostaty (PSCA) antigén, proteín zložený z 123 aminokyselinových zvyškov. PSCA patrí do LY-6 /Thy-1 rodiny antigény bunkového povrchu. Je vysoko exprimovaný v normálnej prostate a ďalej up-regulované v karcinómu prostaty [9], rovnako ako non-prostatických nádorových ochorení, vrátane rakoviny žalúdka [10]. PSCA hrá kritickú úlohu v bunkovej adhézii, proliferáciu a prežitie [11]. In vitro
experimenty ukázali, že niektorí PSCA
varianty (napríklad rs2294008T) môžu znižovať transkripciu hostiteľskej génu moduláciou svojimi autormi fragment [10]. Dvojstupňová GWAS rakoviny žalúdka vykonaný medzi japonské a kórejské populácie preukázali, že PSCA
rs2976392 G > A a rs2294008 C > T SNP významne zvýšené riziko rakoviny žalúdka [10]. Združenie PSCA
SNP s karcinómom žalúdka boli tiež potvrdené v čínskej populácie [12-18]. Navyše dvojstupňový GWAS medzi čínskeho obyvateľstva podľa Abnet et al. [19] nedávno identifikovali dva zhluky SNP v 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) a 10q23 ( PLCE1
rs2274223 a >g) a ich asociácie s vnímavosťou rakoviny žalúdka [19]. Súčasne trojstupňový GWAS v inom čínskej populácie podľa Wang et al. [20] tiež pozorovali vzťah s rs2274223 A > G SNP. Mucín 1 (MUC1) je membránovo viazaný proteín, ktorý možno ukotviť na apikálnej povrch gastrointestinálneho epitelu cez transmembránovej domény [21]. MUC1 hrá dôležitú úlohu v slizničnej mazanie, ochrana proti patogénom, transdukcie signálu a interakcie bunka-bunka [22,23]. Ochranná funkcia proti infekcii MUC1 u normálnych epitelových buniek bola potvrdená aj vitro
v a in vivo
pokusoch [24]. Navyše, PLCE1
gén kóduje fosfolipázy C. Tento proteínový produkt môže katalyzovať hydrolýzu polyphatidylinositol 4,5-bisfosfátu (PIP2) na dve kritické druhých poslov: inositol 1,4,5-trisfosfatu (Insl, 4, 5P3) a 4,5-diacylglyceroly (DAG), [25], a tým pre reguláciu pohyblivosť buniek, oplodnenie a zmyslové transdukcia [26]. Združenie MUC1
rs4072037 T > G s rizikom rakoviny žalúdka boli tiež replikované v rôznych etník [27-31]; PLCE1
rs2274223 A >C a. Napriek tomu neboli skúmané kombinovaný efekt všetkých týchto štyroch polymorfizmy na riziko vzniku rakoviny žalúdka.

V súčasnej štúdii sme genotyp tieto štyri GWAS-identifikovali SNP a hodnotená ich združenia s rakovinou žalúdka v prípade nemocničnej báze -Regulační štúdie, zahŕňajúce 692 prípadov a 774 rakovinou bez kontroly.

Metódy

Táto case-control štúdie populácie v štúdii
zahrnuté 692 geneticky nepríbuzných etnických Číňanov pacientov Han a 774 rakovinou bez kontroly. Všetky prípady boli novo diagnostikovaných a histopatologicky potvrdená pacientov primárnej rakoviny žalúdka, vybraných z oddelenia gastroenterológie, ktorá je pripojená nemocnice v prvom rade Wenzhou Lekárskej univerzity v období od januára 2010 do septembra 2013. Pacienti s interstitialoma, metastázovať rakovinu z iných orgánov a recidivujúcich nádorov boli vylúčené. Všetky ovládacie prvky boli náhodne vybrané z návštevníkov nemocnice, ktorí sprevádzali pacientov do nemocnice, ale nehľadajú za lekársku starostlivosť v rovnakom časovom období, geneticky nesúvisiace s registrovaných prípadov predmetov. Boli frekvencia uzavreté na prípady podľa veku (± do 5 rokov) a pohlavie. Pri nábore účastníkov výskumu, každý účastník bol naplánovaný na pohovor s vyškolených anketárov po tom, čo bola podpísaná písomný informovaný súhlas. Demografické údaje a história expozície životného prostredia boli zhromaždené, ako je vek, pohlavie, etnického pôvodu, história fajčenie, konzumácia alkoholu a rodinnej anamnéze rakoviny. Každý účastník venoval približne 5 ml krvi, z toho 2 ml bola použitá na extrakciu genómovej DNA. Miera reakcie bola približne 95% u jedincov s rakovinou žalúdka a 92% v kontrolnej skupine. Táto štúdia bola schválená etickou komisiou Clinical Research Wen lekárskej univerzity, a všetci účastníci poskytli písomný informovaný súhlas s darovaním svojich biologických vzoriek. Nikdy fajčiari odkazoval na menej ako 100 cigariet celý život. Tí, ktorí pili alkoholické nápoje aspoň raz týždenne po dobu jedného roka alebo dlhšie, alebo pravidelne boli definované ako napájačky.

genotypu

genómovej DNA bola extrahovaná a spracovaná ako bolo opísané skôr [32]. Prijali sme TaqMan real time PCR genotypovej vybraných štyri SNP v prípadoch a kontrol pomocou detektora sekvencie systém HT 7900 (Applied Biosystems). Osem pozitívnej kontroly a osem negatívne kontroly boli zahrnuté v každom 384 jamkové doštičky, aby zabezpečila presnosť výsledkov genotypizácia. Tiež sme opakovane genotyp 10% vzoriek, a výsledky boli 100% zhodné.

Štatistická analýza

χ ^{2 Skúška bola vypočítaná vyhodnotiť rozdiely v rozložení alely a genotypovej frekvencie, ako aj demografická medzi prípadmi a kontrolami. Dobro-of-fit χ 2 test bol použitý na testovanie rovnováhu Hardy-Weinberg (HWE) v ovládaní. Surové a upravené štatistiky pomery (ORS) a ich zodpovedajúce 95% interval spoľahlivosti (CIS) boli vypočítané jednorozmerné a viacrozmerné regresné modely logistických, resp. Ďalej sme vykonali analýzu rozvrstvenie podľa veku, pohlavia, fajčenia /pitie stave, balenie a rok, BMI, nádorové mieste a TNM štádiu. Tiež vykonáva falošne pozitívna správa pravdepodobnosť (FPRP) Analýza pre všetky štatisticky významné zistenie [33]. Stručne povedané, sme prednastavený prah FPRP 0,2 a predchádzajúce pravdepodobnosť 0,1 pre danú asociáciu medzi vybranými SNP a rizikom rakoviny žalúdka. Štatistická sila bola vypočítaná na detekciu alebo 1,50 /0,67 pre alely s rizikom /ochranný účinok. Združenie s hodnotou FPRP < 0.2 bol deklarovaný ako pozoruhodné [34]. Všetky štatistiky boli vykonané pomocou softvéru SAS (verzia 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Všetky štatistické testy boli obojstranné a P Hotel < 0,05 bola považovaná za štatisticky významný}

Výsledky

študijných predmetov

demografické charakteristiky. že prípadov rakoviny žalúdka 692 a 774 kontrol boli zhrnuté v tabuľke 1. neboli zistené žiadne významné mužov a žien líši medzi prípadmi a kontrolami ( P
= 0,944). Avšak, kontroly boli častejšie fajčiari ( P Hotel &0,0001) a napájačky ( P
= 0,0006) v porovnaní s pacientmi. Tieto prípady boli väčšia pravdepodobnosť, že nedostatky živín a nižšie BMI ( P Hotel &0,0001). Z tohto dôvodu, fajčenie, balenie rokov, status a BMI pitnej boli upravené v následnej multivariačný logistickej regresnej analýzy. Zo všetkých prípadov, 199 (28,76%) malo CARDIA rakovinu a 493 (71,24%) mal rakovinu non-Cardia. Okrem toho, karcinóm žalúdka bol predstavený v závislosti na TNM predstavovať systém v 7. ^{ročník v AJCC [35]. V dôsledku toho sa 274 prípadov (39,60%), boli označené ako TNM stupňa I alebo II ochorenie, zatiaľ čo 418 (60,40%), prezentované s TNM štádiu III alebo IV ochorení.}

asociácie medzi vybranými SNP a citlivosťou rakoviny žalúdka

genotypu rozloženie štyroch vybraných SNP boli u všetkých subjektov je uvedené v tabuľke 2. Všetky pozorované genotyp rozdelenie v kontrolách boli v súlade s HWE ( P
= 0,105 pre rs2294008, P = 0,130 pre
rs2976392, P = 0,155 pre
rs2274223 a P = 0,735 pre
rs4072037).

Ako je uvedené v tabuľke 2, všetky z nich štyri vybrané polymorfizmy boli spojené s náchylnosťou rakoviny žalúdka. Ak je PSCA
rs2294008 CC genotyp bol použitý ako referenčný, genotypom CT a kombinácie CT a TT genotypov boli spojené so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka (upravený OR = 1,37, 95% CI = 1.07-1.74 pre CT a upraví OR = 1,30, 95% CI = 1,03 - 1,63 CT /TT). Podobný vzťah s rizikom rakoviny žalúdka tiež bolo zistené PSCA
rs2976392 G > polymorfizmus (AG vs. GG: Upravené OR = 1,30, 95% CI = 1.02-1.65 a AG /AA vs. GG : nastaví OR = 1,26, 95% CI = 1,00 - 1,59). Okrem toho PLCE1
rs2274223 A > bolo zistené, G polymorfizmus výrazne zvýšiť riziko vzniku rakoviny žalúdka pod homozygotnou modelu (AG vs. AA: Upravené OR = 1,48, 95% CI = 1.15-1.90), a dominantným modelom (AG /GG vs. AA: upraví OR = 1,45, 95% CI = 1,14 - 1,84). Na rozdiel od toho MUC1
rs4072037 T > C polymorfizmus bolo preukázané, že výrazne znížil žalúdočné rakovina citlivosť pod homozygotnou modelu (CT vs. TT: upraveného OR = 0,77, 95% CI = 0.60-0.98). Ďalej sme zistili, že pacienti s 2-4 rizikové genotypom (genotypu rizika uvedeného CT /TT pre rs2294008 C > T, AG /AA pre rs2976392 G > A, AG /GG na rs2274223 A > G a TT pre rs4072037 T >C polymorfizmus) mala významné zvýšenie rizika (ďalej upraviť alebo = 1,30, 95% CI = 1.03-1.64) v porovnaní s tými, s iba 0-1 rizikových genotypov

stratifikácia analýza

združenia. medzi varianty genotypov a riziko rakoviny žalúdka bola ďalej hodnotená u vrstvenie analýza podľa veku, pohlavia, fajčenia, balenie a rok, pitnej stavu, a BMI pod dominantným genetický model (tabuľka 3). Zistili sme, že PSCA
rs2294008 CT /TT genotypy boli spojené so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka u mladších jedincov, ľahkých fajčiarov a osôb s rakovinou non-kardia, kedy v porovnaní s príslušným referenčným skupín. S ohľadom na PLCE1
rs2274223 A > G polymorfizmus, stratifikácia analyzuje pozorované zvýšené riziko rakoviny žalúdka u AG /GG genotypov u mladších účastníkov, ženám, nikdy fajčiari, nikdy pijanov účastníkov s vysokým BMI, a jedincov s rakovina kardio alebo TNM štádium III + IV ochorenia. Kým rizikové genotypy boli spojené, sme zistili, že jedinci s 2-4 rizikových genotypov bola väčšia pravdepodobnosť vzniku rakoviny žalúdka u mladších podskupiny samcov, kedy fajčiari alebo podskupiny s vysokým BMI a subjekty s rakovinou non-kardio, než každý zodpovedajúci podskupine náprotivky s 0-1 rizikovým genotypom. K ďalším heterogenity testy na rozvrstvené analýzy nebol zistený žiadny rozdiel medzi podskupinami podľa rôznych spolupracovníkov variance, ako je vek, pohlavie a fajčenie. Navyše neexistuje žiadny štatistický dôkaz o interakcii medzi týmito vybranými SNP a spolupracovníkov variance (vek, pohlavie, BMI, atď), buď.

FPRP hodnoty pre všetky štatisticky významného výsledku sú uvedené v tabuľke 4. nepravda -pozitívnych hodnoty pravdepodobnosti správa pre súvislostí medzi rizikom rakoviny žalúdka a početnosti genotypov vybraných génov. 4, s prednastavenou predchádzajúcim pravdepodobnosťou 0,1 a prah FPRP 0,2. FPRP analýza ukázala, že významná súvislosť medzi PSCA
rs2294008 C > T a rakovinou žalúdka rizika bol pozoruhodný pod homozygotnou modelu. Okrem toho združenie bolo takisto zasluhuje pozornosť mladších jedincov a pacientov s non-Cardia. Rovnako tak významná súvislosť s PLCE1
rs2274223 G > A bol pozoruhodný pre všetky subjekty, rovnako ako u mladších jedincov nikdy fajčiarov nikdy napájačky, tie s BMI > 24,0, karcinóm kardio alebo TNM štádium III + IV ochorenia. FPRP tiež potvrdila významnú súvislosť s PSCA
rs2976392 G > A pod homozygotnou a dominantným modelov a významná súvislosť s MUC1
rs4072037 T > C pod homozygotnou modelu. Čo sa týka kombinovaných genotypov, sme potvrdili významný Združenie pre pacientov s PACK-rok ≤27 alebo rakoviny non-kardio. Relatívne boli pre zvyšok významných súvislostí medzi vybranými polymorfizmy a riziko rakoviny žalúdka, ktorá by mohla byť pripočítaná relatívne malej veľkosti vzorky tejto štúdie, rovnako ako mierny vplyv vybraných SNP nájdený vyššie hodnoty FPRP. Tieto zistenia je potrebné ďalej overovanie na vyšetrovanie s veľkým veľkosti vzorky.

Diskusia

V súčasnej nemocničnej založené case-control štúdii sme skúmali potenciálne združenia PSCA
rs2294008 C >T a rs2976392 G > a, PLCE1
rs2274223 a >G a MUC1
rs4072037 T > C polymorfizmy s citlivosťou rakoviny žalúdka u čínskej populácie. Zistili sme, že PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA a PLCE1
rs2274223 AG /GG genotypy boli spojené s výrazne zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka v režime A čínska populácia, zatiaľ čo MUC1
rs4072037 T > C boli spojené so zníženou citlivosťou na rakovinu žalúdka. Tiež sme zistili, že predmety nesúce 2-4 rizikové genotypy mal výrazne zvýšené riziko rakoviny žalúdka, pri porovnaní s tými, nesúci 0-1 rizikový genotyp. Vplyv kombinovaných rizikových genotypov na riziká rakoviny bolo zreteľnejšie u mladších jedincov, muži, vôbec fajčiari, jedinci s vysokým BMI a non-kardio rakovinu žalúdka. Tieto zistenia naznačujú, že vybrané SNP od GWASs môže prispieť k žalúdočnej rakoviny.

Zatiaľ štyri GWASs skúmali riziko rakoviny žalúdka [10,16,19,20], ako je uvedené v úvode, čo viedlo k nález zo štyroch SNP záujmu. PSCA
rs2294008 C > T vedie k substitúcii Met /Thr, a PSCA
rs2976392 G > A môže meniť väzbovú aktivitu mieste génu [10] transkripčný faktor. Okrem toho, MUC1
rs4072037 T > C môže viesť k zosadzovanie zmeny, vzhľadom k tomu, PLCE1
rs2274223 A > G, môže spôsobiť, že Arg-na-jeho zmeny, ktoré boli významne spojené s rizikom rakoviny žalúdka v počiatočnej fáze skenovania [19]. Kým skenovanie a overovací fázy sa spoja, združenie genómu-široký bolo pozorované iba u PLCE1
rs2274223 A > G polymorfizmus, ale nie MUC1
rs4072037 T > C polymorfizmus [19]. Súčasne, Wang et al. tiež našiel rs2274223 polymorfizmus bol spájaný s žalúdočnej kardio adenokarcinómu ( P
= 1,74 × 10 ^{-39) [20]. V poslednej dobe, GWAS Shi et al. [16] potvrdila bolo skôr oznámené združenie non-ústí pažeráka rakoviny náchylnosťou nielen s PSCA
rs2294008 a rs2976392, ale tiež MUC1
rs4072037.}

poznatkov z predchádzajúcich GWASs boli široko overené u rôznych etnických skupinách v posledných rokoch (S1 tabuľka). Napríklad Wu a kol. [18] vyplynulo, že spojitosť medzi PSCA
rs2294008 a rakovinou žalúdka bol výraznejší u pacientov s non-kardio rakoviny žalúdka ako tí s rakovinou kardia žalúdka. Významná asociácia bola tiež potvrdená štúdií u rôznych etník po celom svete [14-17,19,36-40]. Avšak, vzťah medzi rs2294008 C > rakovinou žalúdka T a nebol overený ostatnými [12,41]. Ak chcete tento spor, už šesť meta-analýzy boli vykonané zhodnotiť vzťah medzi PSCA
polymorfizmy a rakovinou žalúdka citlivosťou [42-47]. Qiao et al. [42] obsahoval osem case-control štúdie zo siedmich článkov a zistil, že rs2294008 T alelu a rs2976392 alely boli významne spojené so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka. Tieto zistenia bola tiež potvrdená druhej metaanalýzy [43-46]. Viac nedávno, prístup k prínos týchto dvoch široko vyšetrovaných PSCA
SNP žalúdočné rakoviny citlivosti, Gu et al. [47] vykonali meta-analýzu 16 štúdií s celkom 18,820 35,756 prípadov a kontrol. Spojená OR bol 1,46 (95% CI = 1,30 - 1,69) za PSCA
rs2294008 a 1,49 (95% CI = 1,22 - 1,82) po dobu rs2976392 polymorfizmy. Navyše po objavený Abnet et al. [19], a Wang et al. [23], PLCE1
rs2274223 polymorfizmus boli rozsiahle skúmané medzi rôznymi etnikami v rôznych druhov rakoviny, ako je rakovina žalúdka, rakovina pažeráka, hlavy a krku a rakoviny žlčníka [48-60]. Avšak závery o pridružení medzi PLCE1
rs2274223 A > G polymorfizmus a riziko rakoviny sú kontroverzné. Významný asociácia bola pozorovaná v niektorých štúdiách [49-52,56,58], ale v iných nie [48,53-55,57,59,60]. Štyri meta-analýzy boli vykonané, aby prehodnotil asociáciu [27-30]. Hao et al. [27] bolo zaradených celkom 13 prípadov a kontrol štúdií, z ktorých päť skúmaných štúdie s 5127 prípadmi a 5791 kontrol role tejto SNP v žalúdku riziko rakoviny. Zistili, že štatisticky významné súvislosti medzi rs2274223 polymorfizmus a zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka pod homozygotnou modelu a heterozygotné modelu. Tieto výsledky boli zhodné s tými z ostatných troch meta-analýz, ktoré obsahovali menej asociačné štúdie o rakovine žalúdka. Čo sa týka MUC1
rs4072037 T > C polymorfizmus, vzťah medzi týmto polymorfizmom a rakoviny žalúdka boli potvrdené u rôznych etník [49,53,61]. Saeki et al. [61] a Zhang et al. [49] zistili, že tento polymorfizmus bola spojená so znížením rakoviny žalúdka u Ázijcov, zatiaľ čo žiadna významná súvislosť bola nájdená u belochov [53] .Tam bol len jeden meta-analýza MUC1
rs4072037 T > polymorfizmus C [31 ], v ktorej bolo zahrnutých celkom 10 štúdií s 6580 prípadov rakoviny žalúdka a 10324 kontrol. Bolo zistené, že MUC1
rs4072037 G alely bola významne spojené so zníženým rizikom rakoviny žalúdka (OR = 0,72, 95% CI = 0,68 - 0,77), v porovnaní s A alely.

Početné štúdie boli vykonané pre overenie zistenie GWAS na rakovinu žalúdka. Avšak, žiadny z štúdie zahrnuté všetky štyri SNP, ako sme urobili tu, s výnimkou jednej štúdie, ktorú Palmer et al. Medzi belochmi, ktorý vyšetroval PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 a MUC1
rs4072037 polymorfizmy [53]. Zistili, že MUC1
rs4072037 polymorfizmus bola spojená so zníženým rizikom rakoviny čreva typu žalúdočné (OR = 0,4, 95% CI = 0,2 do 0,9); Avšak, žiadne združenia boli nájdené ako s PLCE1
rs2274223 a C20orf54
rs13042395. V tejto štúdii sme zistili, každý z týchto štyroch SNP boli jednotlivo spojené s náchylnosťou rakoviny žalúdka u čínskych pacientov. Tiež sme zistili, že riziko 2-4 genotyp dopravcovia mali oveľa vyššie riziko rakoviny žalúdka než 0-1 nosičov. Tento jav bol výraznejší u mladších jedincov, u mužov, nikdy fajčiar, tie s vysokým BMI a predmetov s non-kardio rakovinu žalúdka. Cigaretový dym obsahuje asi 55 karcinogény, ktoré môžu viesť k reaktívne formy kyslíka vyvolať celý rad poškodenie DNA. Samce niekedy fajčiari trvalo vystavení dymu cigariet môže prípadne kryť škody DNA, ktoré môžu interagovať s genetickými variáciami viesť k vzniku rakoviny. Inak povedané, interakcie medzi génmi a prostredie môže zohrávať dôležitú úlohu v iniciácii a propagáciu karcinogenéze [62]. Vysoký BMI bol uznaný ako rizikový faktor pre rakovinu žalúdka v západných krajinách [4]. Cardia rakovina žalúdka je lokalizovaný na gastroezofageálneho spojenia a môžu sa líšiť od rakoviny non-kardio týkajúce sa epidemiologických charakteristikách a klinických príznakov [16] .Preto združenie s non-kardio rakoviny žalúdka sa zdá byť vierohodná biológie.

zhrnutie sme potvrdili asociácie medzi štyrmi predchádzajúcimi GWAS-identifikovali SNP a citlivosti na rakovinu žalúdka v tejto báze case-control štúdii nemocnice. Avšak, niekoľko obmedzení v tejto štúdie by mali byť riešené. Po prvé, vlastné výberové skreslenie a informácie zaujatosť môže byť nevyhnutné v tomto založené case-control nemocničné navrhnutý štúdii. Po druhé, sme zaradili iba štyri SNP v súčasnej štúdii, namiesto pokrývajúci všetky sľubné GWAS-indentified SNP. Všeobecne platí, že štúdie zahŕňajúce viac SNP potenciálne súvisiace s rizikom rakoviny žalúdka môže byť schopné osvetliť presnú rolu genetických variantov v žalúdku rakoviny. A nakoniec, vzhľadom na povahu retrospektívnu štúdie designu, sme nemali spoľahlivé a dostatočné informácie pre jednotlivcov na iné environmentálne expozície, napríklad H
. pylori
infekcie, expozícia diétne, povolania, ako aj žalúdok klasifikácie a podtypov, ako sú črevné a difúzne podtyp rakoviny. Nedostatok všetky cenné informácie nám bráni ďalej skúmať etiologické úloha týchto faktorov v žalúdku rakoviny. Napriek týmto obmedzeniam, poznatky z našej štúdii boli poučný pre výskumníkov a lekárov v tejto oblasti. Medzi ďalšie dobre navrhnuté prospektívnej populačnej štúdie na báze sú potrebné ďalej potvrdzujú naše zistenia, najmä tých s podrobnými informáciami o rizikových faktorov pre rakovinu žalúdka a veľké veľkosti vzorky, vrátane rôznych etnických skupín.

Podporné informácie
S1 data. Pôvodné dáta
doi :. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001
(XLS)
S1 Tab. Charakteristika predchádzajúcich štúdií zameraných na tieto štyri SNP
doi: 10,1371. /Journal.pone.0117576.s002
(DOC)

• Ploche ONE: Okruh smerom správnym smerom roztok balíček pre endoskopickú LIEKU Submukózna Tunneling resekcii v Stomach
• Ploche ONE: Žalúdok Virtuálne Non-Enhanced CT s druhou generáciou, dual-energy CT: Predbežná Study