PLOS ONE: Associations de variants génétiques dans le PSCA, MUC1 et PLCE1 Gènes avec cancer de l'estomac Susceptibilité dans un Population

Résumé

Contexte

Plusieurs variantes génétiques, y compris PSCA
rs2294008 C > T et rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, et PLCE1
rs2274223 A > G ont montré une association significative avec le risque de cancer de l'estomac dans l'association pangénomique précédente études (Gwäss).

Méthodes

Pour évaluer les associations de ces SNP dans les Chinois Han une étude hospitalière cas de contrôle sur la base indépendante a été réalisée par le génotypage de ces quatre polymorphismes dans un total de 692 estomac les cas de cancer et 774 témoins sains acquis en utilisant la fréquence correspondante pour l'âge et le sexe. Faux rapport positif probabilité (FPRP) analyse a également été réalisée pour valider tous les résultats statistiquement significatifs.

Résultats

Dans la présente étude, une association significative avec la prédisposition au cancer de l'estomac a été observée pour tous les quatre polymorphismes d'intérêt. Plus précisément, un risque accru de cancer de l'estomac importante a été associée à PSCA
rs2294008 (CT vs CC: OR ajusté = 1,37, IC à 95% = 1,07 à 1,74, et CT /TT vs.CC: OR ajusté = 1,30 , IC à 95% = 1,03 à 1,63), PSCA
rs2976392 (AG contre GG: OR ajusté = 1,30, IC à 95% = 1,02 à 1,65, et AG /AA vs GG: OR ajusté = 1,26, IC à 95% = 1,00 à 1,59), ou PLCE1 de la rs2274223 (AG vs AA: OR ajusté = 1,48, IC à 95% = 1,15 à 1,90, et AG /GG vs AA: OR ajusté = 1,45, IC à 95% = 1,14 à 1,84), respectivement. En revanche, MUC1 de la rs4072037 a été montré pour diminuer le risque de cancer (CT vs TT: OR ajusté = 0,77, IC à 95% = 0,60 au 0,98). Les patients avec plus d'un génotype à risque avaient un risque significativement accru de développer un cancer de l'estomac (OR ajusté = 1,30, IC à 95% = 1,03 à 1,64), par rapport à ceux ayant 0-1 génotypes de risque. Une analyse stratifiée a indiqué que l'augmentation du risque était plus prononcé chez les sujets plus jeunes, les hommes, jamais les fumeurs, les fumeurs avec des années pack ≤ 27, les patients ayant un IMC élevé, ou cancer de l'estomac non-cardia.

Conclusions

Cette étude a corroboré les associations entre quatre variantes génétiques rapportées précédentes et la prédisposition au cancer de l'estomac dans une population chinoise Han indépendante. D'autres études avec une plus grande taille de l'échantillon et les différentes ethnies sont garantis pour valider nos constatations

Citation:. Sun H, Wu X, Wu F, Li Y, Z Yu, Chen X, et al. (2015) Les associations de variants génétiques dans le PSCA
, MUC1
et PLCE1 de gènes avec cancer de l'estomac Susceptibilité dans une population chinoise. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10.1371 /journal.pone.0117576

Academic Editor: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, INDE

Reçu 30 Juin 2014; Accepté le 27 Décembre 2014; Publié 6 Février, 2015

Droit d'auteur: © 2015 Sun et al. Ceci est un article en accès libre distribué sous les termes de la licence Creative Commons Attribution, qui permet une utilisation sans restriction, la distribution et la reproduction sur tout support, pourvu que l'auteur et la source originelle sont crédités

Disponibilité des données: Toutes les données pertinentes sont dans le ses fichiers de renseignements à l'appui du papier et

financement:. l'étude a été soutenue par la Fondation nationale chinoise des sciences naturelles (n ° 81370563) de subvention et le Programme provincial du Zhejiang pour la culture de haut niveau talents de santé novateurs et un administration provinciale de la médecine traditionnelle chinoise de la province du Zhejiang, en Chine (No.2011ZA072) et le projet soutenu par le ministère de la santé en Chine, le projet majeur de la science et de la technologie la médecine dans la province de Zhejiang (n ° WKJ2012-2-033) de et à l'application de la technologie de protection du public projet de recherche soutenu par la science département de technologie de la province du Zhejiang (No.2012C23108) et excellent Fondation jeunesse de la province du Zhejiang en sciences naturelles (No.LR14H030001) et projet de la science et de la technologie du comté Wencheng. Les bailleurs de fonds ont joué aucun rôle dans la conception de l'étude, la collecte et l'analyse des données, la décision de publier, ou de la préparation du manuscrit

Intérêts concurrents:.. Les auteurs ont déclaré aucun conflit d'intérêts existent

Introduction

cancer de l'estomac est le quatrième cancer le plus fréquemment diagnostiqué et la deuxième cause de décès liés au cancer dans le monde, avec environ 738 000 décès liés au cancer en 2008. en général, plus de 70% des nouveaux cas de cancer de l'estomac et de décès se produire dans les pays en développement, avec un taux d'incidence le plus élevé en Asie orientale. En particulier, environ 40% des cas de cancer de l'estomac du monde ont eu lieu en Chine [1,2]. Helicobacter pylori
( H
. pylori
) l'infection est le facteur étiologique bien établi pour le cancer de l'estomac à travers le monde, avec des taux d'infection allant de 40% à 80% chez l'homme. Outre le H
. infection pylori
, salés et les aliments nitrés la consommation, et le tabagisme sont également signalés à être associé à un risque accru de cancer de l'estomac, tandis que les fruits et légumes frais apports sont reconnus comme des facteurs de protection [3]. indice de masse corporelle élevé (IMC) a également été suggéré comme un facteur de risque pour le cancer de l'estomac dans les pays occidentaux [4], mais pas en Chine [5]. Néanmoins, seule une petite fraction des individus exposés aux facteurs de risque finissent par développer un cancer de l'estomac dans la vie [6], ce qui suggère que les facteurs génétiques peuvent jouer un rôle important dans la pathogenèse du cancer de l'estomac. À ce jour, l'étiologie génétique du cancer de l'estomac, comme gène-gène, et les interactions gène-environnement, reste incertain.

Au cours des dernières années, les études d'association pangénomique (Gwäss), les technologies de génotypage à haut débit, ont été un outil solide dans la découverte de nouveaux loci de prédisposition au cancer ou à des gènes dans le génome [7]. Jusqu'à présent, des centaines, Gwäss ont réussi à identifier des marqueurs génétiques qui sont liés à la susceptibilité à des maladies telles que le cancer de l'estomac [8]. Nous avons cherché à enquêter sur les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) dans PSCA
, MUC1
et PLCE1
gènes dans cette étude. PSCA
gène (situé sur le chromosome 8q24) code pour un antigène de cellule souche prostatique (PSCA), une protéine composée de 123 résidus d'acides aminés. PSCA appartient à la LY-6 /Thy-1 famille d'antigènes de surface cellulaire. Il est fortement exprimé dans la prostate normale et en outre régulée à la hausse dans le cancer de la prostate [9], ainsi que des tumeurs malignes non prostatiques y compris le cancer gastrique [10]. PSCA joue un rôle important dans l'adhésion cellulaire, la prolifération et la survie [11]. in vitro
expériences ont indiqué que certains PSCA
variantes (par exemple, rs2294008T) pourraient diminuer la transcription du gène de l'hôte en modulant son fragment amont [10]. A deux étapes GWAS pour le cancer de l'estomac menée auprès de populations japonaises et coréennes ont démontré que PSCA
rs2976392 G > A et rs2294008 C > T SNPs augmenté de façon significative le risque de cancer de l'estomac [10]. Les associations de Les SNPs PSCA de cancer gastrique ont également été confirmés dans les populations chinoises [12-18]. En outre, une GWAS à deux étages dans une population chinoise par Abnet et al. [19] ont récemment identifié deux groupes de SNPs à 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) et 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) et leurs associations avec le cancer de l'estomac sensibilité [19]. Simultanément, GWAS en trois étapes dans une autre population chinoise par Wang et al. [20] ont également observé l'association avec rs2274223 A > G SNP. La mucine 1 (MUC1) est une protéine liée à la membrane qui peut ancrer à la surface apicale de l'épithélium gastro-intestinal par l'intermédiaire d'un domaine transmembranaire [21]. MUC1 joue un rôle important dans la lubrification des muqueuses, la protection contre les agents pathogènes, transduction du signal et de l'interaction cellule-cellule [22,23]. La fonction protectrice de MUC1 contre l'infection dans les cellules épithéliales normales a été confirmée à la fois par in vitro
et in vivo
expériences [24]. En outre, gène encode PLCE1 de la phospholipase C. Ce produit protéique peut catalyser l'hydrolyse de polyphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2) en deux seconds messagers essentiels: l'inositol 1,4,5-triphosphate (Insl, 4, 5P3) et le 4,5-diacylglycérol (DAG) [25], et ainsi réguler la motilité cellulaire, la fertilisation et la transduction sensorielle [26]. Les associations de MUC1
rs4072037 T > C et rs2274223 de A >PLCE1; G avec le risque de cancer de l'estomac ont également été reproduits dans différentes ethnies [27-31]. Néanmoins, les effets combinés de ces quatre polymorphismes sur le risque de cancer de l'estomac n'a pas été étudiée.

Dans l'étude actuelle, nous génotypés ces quatre SNP GWAS-INDENTIFIED et évalué leurs associations avec le cancer de l'estomac dans un cas en milieu hospitalier -contrôle étude, comprenant 692 cas et 774 témoins sans cancer.

Méthodes

l'étude

Ce cas de contrôle de la population d'étude comprenait 692 génétiquement indépendants ethniques Han patients chinois et 774 témoins sans cancer. Tous les cas ont été nouvellement diagnostiqués et histopathologique ont confirmé les patients atteints de cancer de l'estomac primaires, recrutés dans le département de gastro-entérologie, First Affiliated Hospital de l'Université médicale Wenzhou entre Janvier 2010 et Septembre 2013. Les patients avec interstitialoma, métastasés d'autres organes et de tumeurs récurrentes ont été exclues. Tous les contrôles ont été choisis au hasard parmi les visiteurs de l'hôpital qui accompagnaient les patients à l'hôpital, mais ne cherchent pas des soins médicaux à la même période de temps, génétiquement sans rapport avec les sujets de cas inscrits. Ils étaient la fréquence adaptée aux cas par âge (± dans les 5 ans) et le sexe. Pendant le recrutement des participants à la recherche, chaque participant a été prévue pour un entretien avec des enquêteurs formés après un consentement éclairé a été signé. Les données démographiques et de l'histoire de l'exposition environnementale ont été recueillies, telles que l'âge, le sexe, l'origine ethnique, les antécédents de tabagisme, consommation d'alcool et des antécédents familiaux de cancer. Chaque participant a donné approximativement 5 mL de sang, dont 2 ml a été utilisé pour l'extraction de l'ADN génomique. Le taux de réponse était d'environ 95% pour les sujets atteints de cancer de l'estomac et de 92% pour les contrôles. Cette étude a été approuvée par le Comité d'éthique de la recherche clinique de l'Université médicale de Wenzhou, et tous les participants ont donné un consentement éclairé pour faire don de leurs échantillons biologiques. Jamais les fumeurs visés à moins de 100 cigarettes toute la vie. Ceux qui ont bu des boissons alcoolisées au moins une fois par semaine pendant un an ou plus ou régulièrement ont été définis comme des buveurs.

Génotypage

L'ADN génomique a été extrait et traité comme décrit précédemment [32]. Nous avons adopté Taqman en temps réel méthode PCR pour génotyper les sélectionnés quatre SNP dans les cas et les contrôles à l'aide d'un système de détection de séquence 7900 HT (Applied Biosystems). Huit contrôles positifs et huit témoins négatifs ont été inclus dans chaque plaque de 384 puits pour assurer l'exactitude des résultats de génotypage. Nous avons également génotypage à plusieurs reprises 10% des échantillons, et les résultats ont été 100% concordante.

L'analyse statistique

Le χ ^{2 essai a été calculé pour évaluer les différences dans les distributions de l'allèle et les fréquences des génotypes, ainsi que démographique entre les cas et les témoins. Bonté de l'ajustement χ 2 essai a été utilisé pour tester l'équilibre de Hardy-Weinberg (HWE) dans les contrôles. ratios bruts et corrigés de cotes (OR) et leurs intervalles de confiance à 95% correspondant (IC) ont été calculés par des modèles de régression logistique univariée et multivariée, respectivement. Nous avons également effectué des analyses stratification par âge, /état potable de fumer, l'IMC, le site de la tumeur entre les sexes pack-année et le stade TNM. Nous avons également effectué rapport probabilité (FPRP) analyse de faux positifs pour tous les résultats statistiquement significatifs [33]. En bref, nous prérégler un seuil de FPRP de 0,2 et une probabilité préalable de 0,1 pour une association donnée entre sélectionnée SNP et le risque de cancer de l'estomac. La puissance statistique a été calculée pour détecter un OR de 1,50 /0,67 pour les allèles avec un effet de risque /de protection. Association avec la valeur FPRP < 0,2 a été déclarée comme remarquable [34]. Toutes les statistiques ont été effectuées en utilisant le logiciel SAS (version 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Tous les tests statistiques étaient bilatéraux, et P
< 0,05 a été considérée comme statistiquement significative}

sujets d'étude de

Résultats

Les caractéristiques démographiques des. les cas de cancer de l'estomac 692 et 774 contrôles ont été résumés dans le tableau 1. Il n'y avait pas significatif sexe différent entre les cas et les témoins ( P
= 0,944). Cependant, les contrôles étaient plus susceptibles d'être des fumeurs ( P
< 0,0001) et buveurs ( P
= 0,0006) par rapport aux patients. Les cas étaient plus susceptibles d'avoir des carences en éléments nutritifs et de réduire l'IMC ( P
< 0,0001). Par conséquent, l'usage du tabac, paquets-années, de boire le statut et l'IMC ont été ajustés dans les analyses de régression logistique multivariée ultérieure. Parmi tous les cas, 199 (28,76%) avaient un cancer du cardia et 493 (71,24%) avaient un cancer non-cardia. De plus, les cancers de l'estomac ont été organisés selon le système de classification TNM dans le 7 ^{e édition du AJCC [35]. En conséquence, 274 cas (39,60%) ont été désignés comme stade TNM I ou maladies II, tandis que 418 (60.40%) a présenté avec le stade TNM III ou IV maladies.}

Association entre certains SNP et la prédisposition au cancer de l'estomac

les distributions génotypiques des quatre SNP sélectionnés dans tous les sujets ont été présentés dans le tableau 2. toutes les distributions génotypiques observées dans les contrôles étaient en accord avec HWE ( P
= 0,105 pour rs2294008, P = 0,130
pour rs2976392, P
= 0,155 pour rs2274223 et P
= 0,735 pour rs4072037).

Comme indiqué dans le tableau 2, tous ces quatre polymorphismes sélectionnés ont été associés à la prédisposition au cancer de l'estomac. Lorsque le PSCA
rs2294008 génotype CC a été utilisé comme référence, le génotype CT et une combinaison de génotypes CT et TT ont été associés à un risque accru de cancer de l'estomac (OR ajusté = 1,37, IC à 95% = 1,07 à 1,74 pour CT, et ajusté = 1,30; IC à 95% = 1,03 à 1,63 pour CT /TT). Une association similaire avec le risque de cancer de l'estomac a également été trouvé pour la PSCA
rs2976392 G > Un polymorphisme (AG vs GG: OR ajusté = 1,30, IC à 95% = 1,02 à 1,65, et AG /AA vs GG : OR ajusté = 1,26; IC à 95% = 1,00 à 1,59). En outre, le rs2274223 de A >PLCE1; G polymorphisme a été trouvé pour augmenter de manière significative le risque de cancer de l'estomac dans le cadre du modèle homozygote (AG vs AA: OR ajusté = 1,48, IC à 95% = 1,15 à 1,90), et le modèle dominant (AG /GG vs AA: OR ajusté = 1,45, IC à 95% = 1,14 à 1,84). En revanche, MUC1
rs4072037 T > C polymorphisme a été montré à une diminution significative estomac susceptibilité au cancer dans le cadre du modèle homozygote (CT vs TT: OR ajusté = 0,77, IC à 95% = 0,60 à 0,98). En outre, nous avons constaté que les sujets avec 2-4 génotypes de risque (le génotype de risque visé à CT /TT pour rs2294008 C > T, AG /AA pour rs2976392 G > A, AG /GG pour rs2274223 A > G et TT pour rs4072037 T > C polymorphisme) avait un risque significatif accru (OR ajusté = 1,30, IC à 95% = 1,03 à 1,64) par rapport à ceux avec seulement 0-1 génotypes de risque

stratification analyse

L'association. entre génotypes variants et le risque de cancer de l'estomac a encore été évalué dans l'analyse de la stratification par âge, sexe, tabagisme, pack-année, le statut de boire, et l'IMC dans un modèle génétique dominant (tableau 3). Nous avons trouvé que le PSCA
rs2294008 CT /génotypes TT ont été associés à un risque accru de cancer de l'estomac chez les sujets plus jeunes, les fumeurs légers, et les sujets atteints d'un cancer non-cardia, par rapport aux groupes de référence respectifs. En ce qui concerne le rs2274223 de A >PLCE1; G polymorphisme, la stratification des analyses observé un risque accru de cancer de l'estomac avec les génotypes AG /GG dans les plus jeunes participants, les femmes, jamais fumeurs, jamais les buveurs, les participants ayant un IMC élevé et sujets avec cancer du cardia ou le stade TNM III + IV maladies. Alors que les génotypes de risque ont été combinés, nous avons constaté que les sujets avec 2-4 génotypes de risque étaient plus susceptibles de développer un cancer de l'estomac chez les jeunes sous-groupe, les hommes, qui ont déjà fumé, ou sous-groupes avec un IMC élevé et sujets atteints d'un cancer non-cardia, que chaque sous-groupe correspondant homologues de génotype 0-1 de risque. Les autres tests d'hétérogénéité pour analyse stratifiée ne détectent aucune différence entre les sous-groupes par différentes covariables, telles que l'âge, le sexe et le statut tabagique. De plus, il n'y avait aucune preuve statistique de l'interaction entre ces SNP sélectionnés et covariables (âge, sexe, IMC, etc.), soit.

Les valeurs de FPRP pour tous résultat statistiquement significatif sont présentés dans le Tableau 4. Faux valeurs de probabilité -positif de rapport pour les associations entre le risque de cancer de l'estomac et la fréquence des génotypes des gènes sélectionnés. 4, avec une probabilité antérieure préétablie de 0,1 et un seuil de FPRP de 0,2. analyse FPRP a indiqué que l'association significative entre PSCA
rs2294008 C > T et le cancer de l'estomac risque était remarquable sous le modèle homozygote. En outre, l'association a également digne d'attention pour les sujets plus jeunes et ceux avec des non-cardia. De même, l'association significative avec rs2274223 G >
PLCE1; A a été remarquable pour tous les sujets, ainsi que pour les sujets plus jeunes, jamais fumé, jamais buveurs, ceux avec un IMC > 24,0, le cancer du cardia ou le stade TNM III + les maladies IV. FPRP a également confirmé l'association significative avec PSCA
rs2976392 G > A sous modèles homozygotes et dominants et l'association significative avec MUC1
rs4072037 T > C sous le modèle homozygote. Quant aux génotypes combinés, nous avons confirmé l'association significative pour les sujets avec pack-année ≤27 ou d'un cancer non-cardia. Des valeurs relativement plus de FPRP ont été trouvées pour le reste des associations significatives entre certains polymorphismes et le risque de cancer de l'estomac, ce qui peut être attribué à la petite taille de l'échantillon par rapport de cette étude, ainsi que des effets modérés de SNPs sélectionnés. Ces résultats doivent encore être validés dans les enquêtes avec grande taille de l'échantillon.

Discussion

Dans l'étude actuelle de l'hôpital sur la base de cas-témoins, nous avons étudié les associations potentielles de PSCA
rs2294008 C > T et rs2976392 G > a, PLCE1
rs2274223 a > G et MUC1
rs4072037 T > C polymorphismes avec la prédisposition au cancer de l'estomac chez une population chinoise. Nous avons constaté que PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA et PLCE1
rs2274223 AG /génotypes GG ont été associés à une augmentation significative du risque de cancer de l'estomac dans un population chinoise, alors que, le MUC1
rs4072037 T > C ont été associés à une diminution de la susceptibilité au cancer de l'estomac. Nous avons également constaté que les sujets porteurs de 2-4 génotypes de risque avaient un risque accru de cancer de l'estomac pronouncedly, par rapport à ceux portant le génotype 0-1 du risque. L'effet des génotypes de risque combinés sur le risque de cancer était plus évidente chez les sujets plus jeunes, les hommes, les fumeurs jamais, les sujets avec un IMC élevé et cancer de l'estomac non-cardia. Ces résultats indiquent que les SNPs sélectionnés de Gwäss peuvent contribuer à la cancérogenèse de l'estomac.

Le risque de cancer de l'estomac Jusqu'à présent, quatre Gwäss ont étudié [10,16,19,20] tel que mentionné dans l'introduction, ce qui a conduit à la conclusion des quatre SNP d'intérêt. Le PSCA
rs2294008 C > résultats T en remplacement Met /Thr, et le PSCA
rs2976392 G > A peut modifier l'activité du site de liaison du gène [10] facteur de transcription. En outre, MUC1
rs4072037 T > C peut conduire à l'épissage altération, alors que, rs2274223 de A >PLCE1; G peut provoquer une-Arg-à Son changement qui ont été significativement associée au risque de cancer de l'estomac dans la phase initiale de balayage [19]. Lors de la numérisation et de validation phases ont été combinées, une association du génome entier a été observé que pour le rs2274223 A
PLCE1 > G polymorphisme, mais pas le MUC1
rs4072037 T > C polymorphisme [19]. En même temps, Wang et al. a également trouvé le polymorphisme rs2274223 était associée à l'estomac cardia adénocarcinome ( P
= 1,74 × 10 ^{-39) [20]. Plus récemment, GWAS par Shi et al. [16], a confirmé précédemment rapporté des associations de non-cardia susceptibilité au cancer gastrique avec non seulement PSCA
rs2294008 et rs2976392, mais aussi MUC1
rs4072037.}

Les résultats de précédent Gwäss ont été largement validé entre les différentes populations ethniques au cours des dernières années (S1) Tableau. Par exemple, Wu et al. [18] ont indiqué que l'association entre PSCA
rs2294008 et cancer de l'estomac était plus importante chez les patients atteints de non-cardia cancer de l'estomac que ceux avec le cancer du cardia de l'estomac. L'association significative a également été validé par des études menées auprès des différentes ethnies à travers le monde [14-17,19,36-40]. Cependant, l'association entre rs2294008 C > T et le cancer de l'estomac n'a pas été validé par d'autres [12,41]. Pour résoudre la controverse, six méta-analyses ont été réalisées pour évaluer la relation entre PSCA
polymorphismes et susceptibilité au cancer gastrique [42-47]. Qiao et al. [42] inclus huit études cas-témoins de sept articles et a constaté que rs2294008 T allèle et rs2976392 allèle étaient significativement associés à un risque accru de cancer de l'estomac. Ces résultats ont également été confirmés par d'autres méta-analyse [43-46]. Plus récemment, pour accéder aux contributions de ces deux largement étudiés PSCA
SNPs à la susceptibilité au cancer de l'estomac, Gu et al. [47] ont effectué une méta-analyse de 16 études avec un total de 18,820 cas et 35,756 contrôles. La mise en commun OU était de 1,46 (IC à 95% = 1,30 à 1,69) pour les PSCA
rs2294008 et 1,49 (IC à 95% = 1,22 à 1,82) pour les polymorphismes rs2976392. De plus, après découverte par Abnet et al. [19] et Wang et al. [23], le rs2274223 le polymorphisme de PLCE1 ont été largement étudiés entre les différents groupes ethniques dans différents cancers, comme le cancer de l'estomac, cancer de l'œsophage, la tête et du cou, et le cancer de la vésicule biliaire [48-60]. Cependant, les conclusions sur l'association entre le rs2274223 A
PLCE1 > G polymorphisme et le risque de cancer sont controversées. L'association significative a été observée dans certaines études [49-52,56,58], mais pas dans d'autres [48,53-55,57,59,60]. Quatre méta-analyses ont été réalisées pour réévaluer l'association [27-30]. Hao et al. [27] inclus un total de 13 études cas-témoins, dont cinq études avec 5127 cas et 5791 contrôles ont examiné le rôle de ce SNP dans le risque de cancer de l'estomac. Ils ont trouvé des associations statistiquement significatives entre le polymorphisme rs2274223 et un risque accru de cancer de l'estomac dans le cadre du modèle homozygote et hétérozygote modèle. Ces résultats sont cohérents avec ceux des trois autres méta-analyses qui incluaient moins d'études d'association sur le cancer gastrique. Quant à la MUC1
rs4072037 T > C polymorphisme, l'association entre ce polymorphisme et le cancer gastrique a été validé entre les différentes ethnies [49,53,61]. Saeki et al. [61] et Zhang et al. [49] ont montré que ce polymorphisme a été associée au cancer de l'estomac a diminué chez les Asiatiques, alors qu'aucune association significative n'a été observée chez les Caucasiens [53] .Il est seulement une méta-analyse pour MUC1
rs4072037 T > C polymorphisme [31 ], dans lequel un total de 10 études avec 6580 cas de cancers gastriques et 10324 contrôles ont été inclus. Il a été constaté que le rs4072037 G l'allèle de MUC1 était significativement associée à un risque de cancer de l'estomac a diminué (OR = 0,72, IC à 95% = 0,68 à 0,77), par rapport à l'allèle.

de nombreuses études ont été menées afin de valider les résultats GWAS sur le cancer de l'estomac. Néanmoins, aucune des études couvrait l'ensemble des quatre SNP que nous avons fait ici, à l'exception d'une étude menée par Palmer et al. chez les Caucasiens, qui a enquêté sur PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 et Les polymorphismes rs4072037 de MUC1 [53]. Ils ont constaté que le rs4072037 le polymorphisme de MUC1 a été associé à une diminution du risque de cancer de type intestinal gastrique (OR = 0,4, IC à 95% = 0,2-0,9); Cependant, aucune association n'a été trouvé à la fois avec le PLCE1
rs2274223 et C20orf54
rs13042395. Dans l'étude actuelle, nous avons trouvé tous ces quatre SNP étaient individuellement associés à la prédisposition au cancer de l'estomac chez les sujets chinois. Nous avons également constaté que 2-4 porteurs de génotypes de risque avaient un risque de cancer de l'estomac beaucoup plus élevé que les 0-1 transporteurs. Ce phénomène était plus prononcé chez les sujets plus jeunes, les hommes, jamais fumeur, ceux avec un IMC élevé, et les sujets atteints de cancer de l'estomac non-cardia. La fumée de cigarette contient environ 55 substances cancérigènes qui peuvent générer des espèces réactives de l'oxygène pour induire une variété de dommages de l'ADN. Les fumeurs jamais constamment exposés à la fumée de cigarettes peut éventuellement abriter des dommages d'ADN qui peuvent interagir avec des variations génétiques pour mener au développement du cancer. En d'autres termes, l'interaction gène-environnement peut jouer un rôle important dans le lancement et la promotion de la cancérogenèse [62]. IMC élevé a été reconnu comme un facteur de risque pour le cancer de l'estomac dans les pays occidentaux [4]. cancer de l'estomac Cardia est localisée à la jonction gastro-oesophagienne et peut différer d'un cancer non-cardia concernant les caractéristiques épidémiologiques et les caractéristiques cliniques [16] .Par conséquent, l'association avec le cancer de l'estomac non cardia semblait être la biologie plausible.

résumé, nous avons confirmé les associations entre quatre SNP GWAS-indentifiés précédents et la prédisposition au cancer de l'estomac dans cette étude cas-témoins en milieu hospitalier. Cependant, plusieurs limitations dans la présente étude devraient être abordées. Tout d'abord, le biais de sélection inhérente et le biais de l'information peuvent être inévitables dans cet hôpital à base de cas-témoins conçu étude. Deuxièmement, nous avons seulement inclus quatre SNP dans l'étude actuelle, au lieu de couvrir tous les SNP GWAS-INDENTIFIED prometteurs. En général, les études comprenant plus de SNP potentiellement liés au risque de cancer de l'estomac peut être plus capable d'éclairer le rôle exact des variants génétiques dans la carcinogenèse de l'estomac. Enfin, en raison de la nature de la conception de l'étude rétrospective, nous ne disposons pas d'informations suffisantes et fiables pour les individus sur d'autres expositions environnementales, telles que H
. infection pylori
, l'exposition alimentaire, la profession, ainsi que la classification et les sous-types, tels que le sous-type intestinal et diffus cancer estomac. Manque de toutes les informations utiles nous en a empêchés d'enquêter davantage les rôles étiologiques de ces facteurs dans la carcinogenèse de l'estomac. Malgré ces limites, les résultats de notre étude étaient d'information pour les chercheurs et les médecins dans ce domaine. Des études basées sur la population supplémentaires bien conçues prospectives sont nécessaires pour confirmer davantage nos résultats, en particulier ceux qui ont des informations détaillées sur les facteurs de risque de cancer de l'estomac et de grande taille de l'échantillon, y compris les différents groupes ethniques.

Renseignements à l'appui
S1 Données. Les données d'origine
doi:. 10.1371 /journal.pone.0117576.s001
(XLS)
S1 Table. Caractéristiques des études précédentes ont porté sur ces quatre SNP
doi: 10.1371. /Journal.pone.0117576.s002
(DOC)

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