PLoS ONE: Sammenslutning av genetiske varianter i PSCA, MUC1 og PLCE1 Gener med magekreft Følsomhet i en kinesisk Befolkning

Abstract

Bakgrunn

Flere genetiske varianter inkludert PSCA
rs2294008 C > T og rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, og PLCE1
rs2274223 A > G har vist signifikant sammenheng med magekreft risiko i de foregå genom-wide assosiasjonsstudier (GWASs)

Metoder

for å evaluere sammenslutninger av disse. SNPs i Han-kinesere, ble et selvstendig sykehus basert case-control studie utført av genotyping disse fire polymorfismer i totalt 692 mage krefttilfeller og 774 friske kontroller ervervet ved hjelp av frekvenstilpasning for alder og kjønn. False-positiv rapport sannsynlighet (FPRP) analyse ble også utført for å validere alle statistisk signifikante funn.

Resultater

I denne studien ble signifikant sammenheng med magekreft mottakelighet observert for alle de fire polymorfismer av interesse. Spesielt ble en betydelig økt magekreftrisiko forbundet med PSCA
rs2294008 (CT vs CC: justert OR = 1,37, 95% CI = 1,07 til 1,74, og CT /TT vs.CC: justert OR = 1,30 , 95% CI = 1,03 til 1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs. GG: justert OR = 1,30, 95% CI = 1,02 til 1,65, og AG /AA vs GG: justert OR = 1,26, 95% CI = 1,00 til 1,59), eller PLCE1
rs2274223 (AG vs AA: justert OR = 1,48, 95% CI = 1,15 til 1,90, og AG /GG vs AA: justert OR = 1,45, 95% CI = 1,14 til 1,84), henholdsvis. I kontrast, MUC1
rs4072037 ble vist å redusere kreftrisiko (CT vs TT: justert OR = 0,77, 95% CI = 0,60 til 0,98). Pasienter med mer enn ett risiko genotyper hadde signifikant økt risiko for å utvikle magekreft (justert OR = 1,30, 95% CI = 1,03 til 1,64), sammenlignet med de som har 0-1 risiko genotyper. Stratifisert analyse indikerte at den økte risikoen var mer uttalt hos yngre personer, menn, noensinne røykere, røykere med paknings år ≤ 27, pasienter med høy BMI, eller ikke-Cardia magekreft.

Konklusjoner

Denne studien begrunnes assosiasjoner mellom fire tidligere rapportert genetiske varianter og magekreft mottakelighet i en uavhengig Han kinesiske befolkningen. Videre studier med større utvalg og ulike etnisiteter er garantert å validere våre funn

Citation. Sun H, Wu X, Wu F, Li Y, Yu Z, Chen X, et al. (2015) Sammenslutning av genetiske varianter i PSCA
, MUC1
og PLCE1
Gener med magekreft Følsomhet i en kinesisk befolkning. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10,1371 /journal.pone.0117576

Academic Redaktør: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, INDIA

mottatt: 30 juni 2014; Godkjent: 27 desember 2014; Publisert: 06.02.2015

Copyright: © 2015 Sun et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Data Tilgjengelighet: All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer

Finansiering:. studien ble støttet av China National Natural Science Foundation (nr 81370563) stipend og Zhejiang Provincial Program for dyrking av høy level Innovative Helse talenter og en Provincial Administrasjon av tradisjonell kinesisk medisin i Zhejiang-provinsen i Kina (No.2011ZA072) og prosjektet støttes av helse~~POS=TRUNC departementet~~POS=HEADCOMP i Kina-hoved medisin vitenskap og teknologi prosjekt i Zhejiang-provinsen (nr WKJ2012-2-033) og Offentlig velferdsteknologi søknad forskningsprosjekt støttet av vitenskapen teknologi avdeling i Zhejiang-provinsen (No.2012C23108) og utmerket Youth Foundation of Zhejiang Provincial Natural Science (No.LR14H030001) og prosjektet av vitenskap og teknologi i Wencheng fylket. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

mage~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP er den fjerde mest diagnostisert kreft og den nest største årsaken til kreft-relaterte dødsfall på verdensbasis, med ca 738 000 kreftrelaterte dødsfall i 2008. Vanligvis, mer enn 70% av nye magekrefttilfeller og dødsfall skje i utviklingsland, med høyest forekomst i Øst-Asia. Spesielt har ca 40% av verdens magekrefttilfeller skjedde i Kina [1,2]. Helicobacter pylori product: ( H
. pylori
) infeksjon er veletablert etiologisk faktor for magekreft over hele verden, med infeksjon priser som spenner fra 40% til 80% hos mennesker. I tillegg til H
. pylori
infeksjon, saltet og nitrerte mat forbruk, og røyking er også blitt rapportert å være assosiert med økt magekreftrisiko, mens fersk frukt og grønnsaker inntak er anerkjent som beskyttelsesfaktorer [3]. Høy body mass index (BMI) er også foreslått som en risikofaktor for magekreft i vestlige land [4], men ikke i Kina [5]. Likevel er bare en liten brøkdel av individer eksponert mot risikofaktorer til slutt utvikle kreft i magesekken i levetiden [6], som tyder på at genetiske faktorer kan spille en viktig rolle i patogenesen av magekreft. Til dags dato, genetisk etiologi for magekreft, for eksempel gen-gen og gen-miljø interaksjoner, er fortsatt uklart.

I løpet av de siste årene, genom-wide assosiasjonsstudier (GWASs), høy gjennomstrømning genotyping teknologier, har vært et robust verktøy i oppdagelsen av nye kreft mottakelighet loci eller gener på tvers av hele genomet [7]. Hittil GWASs har blitt identifisert hundrevis av genetiske markører som er relatert til mottakelighet for sykdommer, inkludert kreft i magen [8]. Vi forsøkte å undersøke single-nukleotid polymorfismer (SNPs) i PSCA
, MUC1
og PLCE1
gener i denne studien. PSCA
gen (lokalisert på kromosom 8q24) koder for et prostata stamcelle-antigen (PSCA), et protein som består av 123 aminosyrerester. PSCA tilhører LY-6 /Thy-1 familie av celleoverflateantigener. Det er sterkt uttrykt i normal prostata og ytterligere oppregulert i prostatakreft [9], så vel som ikke-prostatiske maligniteter, inkludert magekreft [10]. PSCA spiller en avgjørende rolle i celle adhesjon, spredning og overlevelse [11]. In vitro
forsøk indikerte at noen PSCA
varianter (f.eks rs2294008T) kan redusere transkripsjonen av vert-genet ved å modulere sin oppstrøms fragment [10]. En to-trinns GWAS for magekreft gjennomført blant japanske og koreanske populasjoner viste at PSCA
rs2976392 G > A og rs2294008 C > T SNPs betydelig økt magekreft risiko [10]. De sammenslutninger av PSCA
SNPs med magekreft ble også bekreftet i kinesiske populasjoner [12-18]. Videre er en to-trinns GWAS blant en populasjon av kinesisk Abnet et al. [19] nylig identifisert to klynger av SNPs på 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) og 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) og deres foreninger med magekreft følsomhet [19]. Samtidig, en tre-trinns GWAS i en annen kinesiske befolkningen av Wang et al. [20] også observert sammen med rs2274223 A > G SNP. Mucin 1 (MUC1) er et membranbundet protein som kan forankre til den apikale overflaten av gastrointestinal epitel gjennom et transmembrandomene [21]. MUC1 spiller en viktig rolle i slimhinne smøring, beskyttelse mot patogener, signaltransduksjon, og celle-celle-interaksjon [22,23]. Den beskyttende funksjon av MUC1 mot infeksjon i normale epitelceller ble bekreftet av både in vitro Hotell og in vivo
eksperimenter [24]. I tillegg PLCE1
genet koder fosfolipase C. Dette proteinet produktet kan katalysere hydrolyse av polyphatidylinositol 4,5-bisfosfat (PIP2) i to kritiske andre budbringere: inositol 1,4,5-trisphosphate (Insl, 4, 5P3) og 4,5-diacylglycerol (DAG) [25], og dermed regulere cellemotilitet, gjødsling, og sensorisk transduksjon [26]. De sammenslutninger av MUC1
rs4072037 T > C og PLCE1
rs2274223 A > G med magekreft har også blitt kopiert i ulike etniske grupper [27-31]. Likevel har den kombinerte effekten av alle disse fire polymorfismer på magen kreftrisiko ikke undersøkt.

I denne studien har vi genotypet disse fire GWAS-identifisert SNPs og vurdert deres foreninger med magekreft i en sykehusbasert case -kontroll studie, som omfatter 692 saker og 774 kreftfrie kontroller.

Metoder

Study befolkningen

Dette case-control studien inkluderte 692 genetisk urelaterte etniske Han-kinesere pasienter og 774 kreftfrie kontroller. Alle sakene ble nylig diagnostisert og histopathologically bekreftet primære mage kreftpasienter, rekruttert fra Institutt for gastroenterologi, First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University mellom januar 2010 og september 2013. Pasienter med interstitialoma, spredning kreft fra andre organer og tilbakevendende svulster ble ekskludert. Alle kontroller ble tilfeldig valgt fra sykehuset besøkende som fulgte pasientene til sykehuset, men ikke søker for medisinsk behandling på samme tidsperiode, genetisk relatert til de registrerte saks fag. De var frekvens tilpasset sakene etter alder (± innen 5 år) og kjønn. Under rekruttering av forskningsdeltakere, ble hver deltaker planlagt for et intervju med trente intervjuere etter et skriftlig informert samtykke ble signert. Demografiske data og miljømessig eksponering historie ble samlet, for eksempel alder, kjønn, etnisitet, røyking historie, alkoholforbruk og familiens historie av kreft. Hver deltaker donert ca. 5 ml blod, hvorav 2 ml ble anvendt for ekstraksjon av genomisk DNA. Svarprosenten var omtrent 95% for magen kreft fag og 92% for kontroller. Denne studien ble godkjent av Klinisk forskningsetiske komité for Wenzhou Medical University, og alle deltakerne gitt en skriftlig informert samtykke til å donere sine biologiske prøver. Aldri røykere henvist til mindre enn 100 sigaretter alt liv. De som drakk alkohol minst en gang i uken i ett år eller mer eller regelmessig ble definert som drinkers.

Genotyping

Genomisk DNA ble ekstrahert og behandlet som tidligere beskrevet [32]. Vi vedtatt Taqman real time PCR metode for å genotype de valgte fire SNPs i saker og kontroller ved hjelp av en 7900 HT sekvens detektorsystemet (Applied Biosystems). Åtte positive kontroller og åtte negative kontroller ble inkludert i hver 384 brønners plate for å sikre nøyaktigheten av genotyping resultater. Vi har også gjentatte ganger genotypede 10% av prøvene, og resultatene var 100% konkordant.

Statistisk analyse

χ ^{2 test ble beregnet til å vurdere forskjellene i fordelingen av allelet og genotypefrekvensene, samt demografisk mellom tilfellene og kontroller. Godhet-of-fit χ 2 test ble brukt til å teste Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontrollene. Crude og justert odds ratio (ORS) og tilhørende 95% konfidensintervall (CIS) ble beregnet ved univariate og multivariate logistiske regresjonsmodeller, henholdsvis. Vi utførte ytterligere stratifisering analyser av alder, kjønn, røyking /drikking status, pakke-år, BMI, tumor nettstedet og TNM stadium. Vi utførte også falsk-positiv rapport sannsynlighet (FPRP) analyse for alle statistisk signifikante funn [33]. Kort fortalt forhånds vi en FPRP terskel på 0,2 og en tidligere sannsynlighet på 0,1 for en gitt sammenheng mellom valgt SNP og magekreftrisiko. Statistisk styrke ble beregnet for å påvise en OR på 1,50 /0,67 for lene med en risiko /beskyttende effekt. Association med FPRP verdi < 0,2 ble erklært som bemerkelsesverdig [34]. All statistikk ble utført ved hjelp av SAS programvare (versjon 9.1, SAS Institute, Cary, NC). Alle statistiske tester var tosidig, og P
< 0,05 ble ansett som statistisk signifikant}

Resultater

forsøkspersonene

De demografiske kjennetegn. de 692 magekrefttilfeller og 774 kontroller ble oppsummert i tabell 1. Det var ingen signifikant kjønns forskjellig mellom saker og kontroller ( P
= 0,944). Men kontrollene var mer sannsynlig å bli røykere ( P
< 0,0001) og drikker ( P
= 0,0006) sammenlignet med pasientene. Sakene var mer sannsynlig å ha mangel på næringsstoffer og lavere BMI ( P
< 0,0001). Derfor ble røykestatus, paknings år, drikker status og BMI justert for i den påfølgende multivariate logistiske regresjonsanalyser. Blant alle tilfeller, 199 (28,76%) hadde Cardia kreft og 493 (71,24%) hadde ikke-Cardia kreft. Videre ble magekreft iscenesatt i henhold til TNM staging system i 7 ^{th utgaven av AJCC [35]. Som et resultat ble 274 tilfeller (39.60%) utpekt som TNM stadium I eller II sykdommer, mens 418 (60,40%) presenteres med TNM stadium III eller IV sykdommer.}

Association mellom valgte SNPs og magekreft mottakelighet

genotypen distribusjoner av de fire utvalgte SNPs i alle fag ble vist i Tabell 2. alle de observerte genotypen utdelinger i kontrollene var i samsvar med HWE ( P
= 0,105 for rs2294008, P
= 0.130 for rs2976392, P
= 0,155 for rs2274223, og P
= 0,735 for rs4072037).

Som angitt i tabell 2, alle disse fire utvalgte polymorfismer ble forbundet med magekreft mottakelighet. Når PSCA
rs2294008 CC genotype ble brukt som referanse, CT genotype og en kombinasjon av CT og TT-genotyper ble assosiert med en økt magekreftrisiko (justert OR = 1,37, 95% CI = 1,07 til 1,74 for CT, og justert OR = 1,30; 95% CI = 1,03 til 1,63 for CT /TT). En lignende sammenheng med magekreft risiko ble også funnet for PSCA
rs2976392 G > En polymorfisme (AG vs. GG: justert OR = 1,30, 95% CI = 1,02 til 1,65, og AG /AA vs. GG : justert OR = 1,26; 95% CI = 1,00 til 1,59). Videre er PLCE1
rs2274223 A > G polymorfisme ble funnet å øke magekreftrisiko under homozygot modellen (AG vs AA: justert OR = 1,48, 95% CI = 1,15 til 1,90), og dominerende modellen (AG /GG vs AA: justert OR = 1,45, 95% CI = 1,14 til 1,84). I kontrast, MUC1
rs4072037 T > ble vist C polymorfisme til betydelig redusert magekreft følsomhet under homozygot modellen (CT vs TT: justert OR = 0,77, 95% CI = 0,60 til 0,98). Videre fant vi at personer med 2-4 risiko genotyper (risikoen genotype henvist til CT /TT for rs2294008 C > T, AG /AA for rs2976392 G > A, AG /GG for rs2274223 A > G, og TT for rs4072037 T >C polymorfisme) hadde signifikant økt risiko (justert OR = 1,30, 95% CI = 1,03 til 1,64) sammenlignet med de med bare 0-1 risiko genotyper

Stratifisering analyse

foreningen. mellom variant genotyper og magekreft risikoen ble videre undersøkt i stratifisering analyse av alder, kjønn, røykestatus, pakke-år, drikker status, og BMI under en dominant genetisk modell (tabell 3). Vi fant at PSCA
rs2294008 CT /TT genotyper var assosiert med økt magekreftrisiko hos yngre individer, lette røykere og personer med ikke-Cardia kreft, sammenlignet med respektive referansegrupper. Med hensyn til PLCE1
rs2274223 A > G polymorfisme, lagdeling analyserer observert økt magekreftrisiko med AG /GG genotyper i yngre deltakere, kvinner, aldri-røykere, aldri drinkers, deltakere med høy BMI, og hos pasienter med Cardia kreft eller TNM stadium III + IV sykdommer. Mens risiko genotypene ble slått sammen, fant vi at personer med 2-4 risiko genotyper var mer sannsynlig å utvikle magekreft blant yngre undergruppe, menn, noensinne røykere eller undergrupper med høy BMI og pasienter med ikke-Cardia kreft, enn hver tilsvarende undergruppe kolleger med 0-1 risiko genotype. Den videre heterogenitet tester for stratifisert analyse oppdaget ikke noen forskjell mellom undergrupper av ulike co-variates, som alder, kjønn og røykestatus. Dessuten var det ingen statistisk bevis for samspillet mellom disse utvalgte SNPs og co-variates (alder, kjønn, BMI, etc), heller.

De FPRP verdier for all statistisk signifikant resultat er vist i tabell 4. False -positive rapport sannsynlighetsverdier for assosiasjoner mellom magekreft risiko og hyppigheten av genotyper av utvalgte gener. 4, med en forhåndsinnstilt tidligere sannsynlighet på 0,1 og en FPRP terskel på 0,2. FPRP analyse viste at signifikant sammenheng mellom PSCA
rs2294008 C > T og magekreftrisiko var merke etter homozygot modell. Videre foreningen var også fortjener oppmerksomhet for yngre personer og de med ikke-Cardia. På samme måte har signifikant sammenheng med PLCE1
rs2274223 G > A var bemerkelsesverdig for alle fag, samt for yngre personer, som aldri har røykt, aldri drikker, de med BMI > 24,0, Cardia kreft eller TNM stadium III + IV sykdommer. FPRP bekreftet også signifikant sammenheng med PSCA
rs2976392 G > A under homozygot og dominerende modeller og signifikant sammenheng med MUC1
rs4072037 T > C under homozygot modell. Som den kombinerte genotyper, fikk vi bekreftet det signifikant sammenheng for pasienter med pakke-år ≤27 eller ikke-Cardia kreft. Relativt større FPRP verdiene ble funnet for resten av signifikante sammenhenger mellom utvalgte polymorfismer og magekreft risiko, som kan henføres til den relative lite utvalg av denne studien, samt moderate effekter av utvalgte SNPs. Disse funnene må ytterligere validering i undersøkelser med stor utvalgsstørrelse.

Diskusjoner

I dagens sykehusbasert case-control studie undersøkte vi de potensielle sammenslutninger av PSCA
rs2294008 C > T og rs2976392 G > A, PLCE1
rs2274223 A > G og MUC1
rs4072037 T > C polymorfismer med magekreft mottakelighet blant en kinesisk befolkning. Vi fant ut at PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA og PLCE1
rs2274223 AG /GG genotyper var assosiert med en signifikant økt magekreft risiko i et kinesiske befolkningen, mens MUC1
rs4072037 T > C ble assosiert med redusert magekreft følsomhet. Vi fant også at personer som bærer 2-4 risiko genotyper hadde en utpreget økt magekreft risiko, sammenlignet med de som bærer 0-1 risiko genotype. Effekten av kombinerte risiko genotyper på kreftrisiko var tydeligere hos yngre individer, menn, noensinne røykere, fag med høy BMI og ikke-Cardia magekreft. Disse funnene tyder på at de valgte SNPs fra GWASs kan bidra til magekreftutvikling.

Så langt, fire GWASs har undersøkt magekreft risiko [10,16,19,20] som nevnt i innledningen, noe som førte til funnet av de fire SNPs av interesse. PSCA
rs2294008 C > T resultater i Met /Thr substitusjon, og PSCA
rs2976392 G > En kan endre transkripsjonsfaktor bindingssete aktiviteten til genet [10]. Videre MUC1
rs4072037 T > C kan føre til skjøting endring, mens PLCE1
rs2274223 A > G kan føre til en Arg-til-His endring som var signifikant assosiert med risiko for magekreft i den innledende fasen skanning [19]. Mens skanning og validering faser ble kombinert, ble et genom-wide forening kun observert for PLCE1
rs2274223 A > G polymorfisme, men ikke MUC1
rs4072037 T > C polymorphism [19]. Samtidig Wang et al. Også funnet rs2274223 polymorfisme var assosiert med mage Cardia adenokarsinom ( P
= 1.74 × 10 ^{-39) [20]. Nå nylig, GWAS av Shi et al. [16], bekreftet tidligere rapportert sammenslutninger av ikke-Cardia magekreft mottakelighet med ikke bare PSCA
rs2294008 og rs2976392, men også MUC1
rs4072037.}

Resultatene fra forrige GWASs ble mye validert blant ulike etniske populasjoner i de senere år (S1 Table). For eksempel, Wu et al. [18] viste at sammenhengen mellom PSCA
rs2294008 og magekreft var mer fremtredende blant pasienter med ikke-Cardia mage kreft enn de med Cardia magekreft. Den signifikant sammenheng ble også validert av studier utført mellom ulike etniske grupper over hele verden [14-17,19,36-40]. Men sammenhengen mellom rs2294008 C > T og magekreft ble ikke validert av andre [12,41]. For å løse striden, har seks metaanalyser utført for å evaluere forholdet mellom PSCA
polymorfismer og magekreft mottakelighet [42-47]. Qiao et al. [42] inkluderte åtte case-control studier fra sju artikler og fant at rs2294008 T-allel og rs2976392 Et allel var signifikant assosiert med økt magekreftrisiko. Disse funnene ble også bekreftet av andre meta-analyse [43-46]. Flere nylig, for å få tilgang bidrag fra disse to vidt undersøkte PSCA
SNPs til magekreft mottakelighet, Gu et al. [47] utførte en meta-analyse av 16 studier med til sammen 18,820 tilfeller og 35,756 kontroller. Den sammenslåtte OR var 1,46 (95% CI = 1,30 til 1,69) for PSCA
rs2294008 og 1,49 (95% CI = 1,22 til 1,82) for rs2976392 polymorfismer. Dessuten, etter oppdaget av Abnet et al. [19] og Wang et al. [23], PLCE1
rs2274223 polymorfisme har blitt grundig undersøkt mellom ulike etniske grupper i ulike kreftformer, som magekreft, spiserørskreft, hode- og halskreft, og galleblæren kreft [48-60]. Men konklusjonene på sammenhengen mellom PLCE1
rs2274223 A > G polymorfi og kreftrisiko er kontroversielt. Den signifikant sammenheng ble observert i enkelte studier [49-52,56,58], men ikke i andre [48,53-55,57,59,60]. Fire meta-analyser ble utført for å evaluere foreningen [27-30]. Hao et al. [27] inkluderte totalt 13 kasus-kontrollstudier, hvorav fem studier med 5127 tilfeller og 5791 kontroller undersøkt hvilken rolle denne SNP i magekreftrisiko. De fant statistisk signifikante assosiasjoner mellom rs2274223 polymorfisme og økt magekreftrisiko under homozygot modell og heterozygot modell. Disse resultatene var i samsvar med de andre tre metaanalyser som omfattet færre assosiasjonsstudier på magekreft. Som til MUC1
rs4072037 T > C polymorfisme, sammenhengen mellom denne polymorfisme og magekreft ble validert mellom ulike etniske grupper [49,53,61]. Saeki et al. [61] og Zhang et al. [49] fant at dette polymorphism ble assosiert med redusert magekreft blant asiater, mens ingen signifikant sammenheng ble funnet blant kaukasiere [53] .Det var bare en meta-analyse for MUC1
rs4072037 T > C polymorfisme [31 ], hvor totalt 10 studier med 6580 magekrefttilfeller og 10324 kontroller ble inkludert. Det ble funnet at MUC1
rs4072037 G allel var signifikant assosiert med en redusert magekreftrisiko (OR = 0,72, 95% CI = 0,68 til 0,77), sammenlignet med A-allelet.

Tallrike studier har blitt utført for å validere GWAS funn på magekreft. Ikke desto mindre, ingen av studiene omfattet alle de fire SNP som vi gjorde her, bortsett fra en studie utført av Palmer et al. blant kaukasiske, som undersøkte PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 og MUC1
rs4072037 polymorfismer [53]. De fant at MUC1
rs4072037 polymorfisme var assosiert med en redusert risiko for intestinal-type magekreft (OR = 0,4, 95% KI = 0,2-0,9); Det ble imidlertid ikke assosiasjoner funnet med både PLCE1
rs2274223 og C20orf54
rs13042395. I denne studien fant vi alle disse fire SNPs ble individuelt forbundet med magekreft mottakelighet blant kinesiske fag. Vi fant også at 2-4 risikoen genotype bærere hadde en mye høyere magekreft risiko enn 0-1 bærere. Dette fenomenet var mer uttalt hos yngre personer, menn, noensinne røyker, de med høy BMI, og hos pasienter med ikke-Cardia magekreft. Sigarettrøyk inneholder rundt 55 kreftfremkallende som kan generere reaktive oksygenforbindelser for å indusere en rekke DNA-skader. Mann noensinne røykere konsekvent utsatt for sigaretter røyk kan muligens havna DNA-skader som kan samhandle med genetiske variasjoner til å føre til kreftutvikling. Med andre ord, kan gene-miljø interaksjon spiller viktige roller i å initiere og fremme kreftutvikling [62]. Høy BMI har blitt anerkjent som en risikofaktor for magekreft i vestlige land [4]. Cardia mage kreft er lokalisert til gastroøsofageal krysset og kan avvike fra ikke-Cardia kreft angående epidemiologiske egenskaper og kliniske egenskaper [16] .Derfor, foreningen med ikke-Cardia magekreft syntes å være biologi troverdige.

I sammendraget, bekreftet vi assosiasjoner mellom fire tidligere GWAS-identifisert SNPs og magekreft mottakelighet i dette sykehuset basert case-control studie. Imidlertid bør flere begrensninger i denne studien rettes. For det første kan den iboende utvalgsskjevhet og informasjon skjevhet være uunngåelig i dette sykehuset basert case-control designet studie. For det andre, vi bare tatt fire SNPs i denne studien, i stedet for å dekke alle lovende GWAS-identifisert SNPs. Vanligvis kan studier som omfatter flere SNPs potensielt relatert til magekreft risikoen være mer i stand til å belyse den eksakte rolle genetiske varianter i magen kreftutvikling. Til slutt, på grunn av beskaffenheten av retrospektiv studie design, vi hadde ikke pålitelig og tilstrekkelig informasjon for enkeltpersoner på andre miljømessige eksponeringer, for eksempel H
. pylori
infeksjon, kosttilskudd, yrke eksponering, samt magekreft klassifisering og undertyper, for eksempel intestinal og diffuse subtype. Mangel på all den verdifulle informasjonen hindret oss å ytterligere undersøke årsaks rollene til disse faktorene i magen kreftutvikling. Til tross for disse begrensningene, resultatene fra vår studie var informativt for forskere og leger i dette feltet. Ekstra godt designede potensielle populasjonsbaserte studier er nødvendig for å ytterligere bekrefte våre funn, spesielt de med detaljert informasjon om risikofaktorer for magekreft og stor utvalgsstørrelse inkludert ulike etniske grupper.

Hjelpemiddel Informasjon
S1 Data. Original data
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001 plakater (XLS)
S1 Table. Kjennetegn på tidligere studier som fokuserer på disse fire SNPs
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s002 plakater (DOC)

• PLoS ONE: Heading mot riktig retning-løsningspakke for endoskopisk submucosal Tunneling Reseksjon i Stomach
• PLoS ONE: Mage Virtual Non-Enhanced CT med andre generasjon, Dual-Energy CT: En foreløpig Study