PLoS ONE: udruga genetičkih varijanti u PSCA, MUC1 i PLCE1 Geni s želuca osjetljivošću kineskog stanovništva

Sažetak pregled

Pozadina pregled

Nekoliko genetske varijante uključujući i PSCA pregled rs2294008 C > T i rs2976392 G > A, MUC1 pregled rs4072037 T &C, i PLCE1 pregled rs2274223 a > G pokazale značajnu povezanost s rizikom od raka želuca u prethodnim studijama udruge genoma širom (GWASs) pregled

Metode pregled

Da bi se procijenila udruženja tih. SNP u Han Kineza, samostalna bolnica temelji case-control studija je provedena od strane genotipa ove četiri polimorfizama u ukupno 692 slučajeva raka želuca i 774 zdravih osoba stekla pomoću frekvencije odgovara za dob i spol. Lažno pozitivan izvještaj vjerojatnosti (FPRP) analiza provedena je za provjeru svih statistički značajne rezultate. Pregled

Rezultati

U trenutnoj studiji, značajna povezanost s osjetljivošću od raka želuca uočeno je za sve četiri polimorfizama od interesa. Naime, znatan povećani rizik od karcinoma želuca bila je povezana s PSCA
rs2294008 (CT vs CC: korigirani OR = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74, a CT /TT vs.CC: korigirani OR = 1,30 , 95% CI = 1,03-1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs GG: korigirani OR = 1,30, 95% CI = 1,02-1,65, a AG /AA vs GG: korigirani OR = 1,26, 95% CI = 1,00-1,59) ili PLCE1 pregled rs2274223 (AG vs AA: korigirani OR = 1,48, 95% CI = 1.15-1.90, a AG /GG vs AA: korigirani OR = 1,45, 95% CI = 1,14-1,84), redom. Za razliku od toga, MUC1 pregled rs4072037 je pokazala da smanjuju rizik od raka (CT naspram TT: korigirani OR = 0,77, 95% CI = ,60-,98). Bolesnici s više od genotipova rizika imali su značajnu povećani rizik za razvoj raka želuca (prilagoditi ili = 1,30, 95% CI = 1,03-1,64), u usporedbi s onima koji imaju 0-1 genotipova rizika. Slojevito analiza je pokazala da je povećan rizik bio izraženiji kod mlađih ispitanika, muškaraca, ikad pušačima, pušači s tovarnim godina ≤ 27, bolesnici s visokim indeksom tjelesne mase, ili raka želuca ne cardia. Pregled

Zaključci pregled

Ova studija potkrijepiti povezanost između četiri prethodna prijavljenih genetskih varijanti i rak želuca osjetljivosti na neovisan Han kineskog stanovništva. Daljnje studije s većim uzorkom i različitih nacionalnosti imaju jamstvo za provjeru valjanosti naše rezultate pregled

Izvor:. Sunce H, Wu X, Wu F, Li Y, Yu Z, Chen X, et al. (2015) Udruge genetičkih varijanti u PSCA Netlogu, MUC1 Netlogu i PLCE1 pregled gena raka želuca osjetljivošću kineskog stanovništva. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10,1371 /journal.pone.0117576 pregled

Akademska Urednik: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, Indija pregled

Primljeno: 30. lipnja 2014. Prihvaćeno: 27. prosinca 2014. Objavljeno: 6. veljače 2015 pregled

Copyright: © 2015 Sun et al. Ovo je otvoreno pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan pregled

Podaci Dostupnost: sve relevantne podatke su u radu i njegove popratne podatke datoteka pregled

Financiranje:. Ova studija je podržana od strane China National Natural Science Foundation (br 81370563) potpore i Zhejiang Provincial programu za uzgoj visoke razine inovativnih zdravstvenih talenata i a Pokrajinski uprava tradicionalne kineske medicine provincije Zhejiang, Kina (No.2011ZA072) i projekt podržan od strane ministarstva zdravstva Kine-glavni lijek znanosti i tehnologije projekta u pokrajini Zhejiang (br WKJ2012-2-033) i javne dobrobiti tehnologije primjene istraživački projekt podržan od strane znanosti tehnologije odjelu pokrajine Zhejiang (No.2012C23108) i odličan su temelj za mlade Zhejiang Provincial prirodne znanosti (No.LR14H030001) i projekt znanosti i tehnologije WenCheng županije. U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled rak

želudac je četvrti najčešće dijagnosticiran rak i drugi vodeći uzrok raka povezanih smrti u svijetu, s oko 738.000 smrtnih slučajeva vezanih za rak u 2008. Općenito, više od 70% novih slučajeva raka želuca i smrti javlja se u zemljama u razvoju, s najvećom stopom incidencije u istočnoj Aziji. Posebno, približno 40% slučajeva raka želuca svjetskih dogodile su se u Kini [1,2]. Helicobacter pylori pregled ( H pregled. pylori pregled) infekcija je dobro uspostavljena etiološki čimbenik za rak želuca u svijetu, sa stopom infekcije u rasponu od 40% do 80% u ljudi. Osim H Netlogu. pylori pregled infekcija, slani i nitratni hrana potrošnje i pušenje također su izvijestili da je povezan s povećanim rizikom od raka želuca, dok su svježe voće i povrće za dovod prepoznat kao zaštitnih faktora [3]. Indeks mase visoke tijela (BMI) je također bio predložen kao faktor rizika za rak želuca u zapadnim zemljama [4], ali ne u Kini. [5] Ipak, samo mali dio ljudi izloženi riziku faktori vremenom razviti rak želuca kod trajanja [6], što sugerira da genetski faktori mogu igrati važnu ulogu u patogenezi raka želuca. Do danas, genetski Etiologija raka želuca, kao što je gen-gen i interakcije gena okruženju, ostaje nejasno.

Tijekom proteklih godina, Genome-wide strukovna udruga (GWASs), visoki genotipiziranje tehnologije propusnosti, imaju bio robustan alat u otkrivanju novih raka osjetljivosti lokusa ili gena preko cijelog genoma [7]. Do sada, GWASs su uspješno identificirali stotine genetskih markera koji se odnose na osjetljivost na bolesti, uključujući rak želuca [8]. Svrha istraživanja bila je single-polimorfizama (SNP) u PSCA
, MUC1 Netlogu i PLCE1 pregled gena u ovoj studiji. PSCA pregled gen (koji se nalazi na kromosomu 8q24) kodira prostate matičnih stanica antigena (PSCA), protein koji se sastoji od 123 aminokiselinskih ostataka. PSCA pripada LY-6 /Thy-1, obitelj površinskih antigena. To je visoko izražen u normalnoj prostati i dalje uređeno up-u karcinom prostate [9], kao i non-prostate malignoma uključujući gastričku rak [10]. PSCA igra ključnu ulogu u staničnoj adheziji, proliferaciju i preživljavanje [11]. In vitro
eksperimenti su pokazali da su neki PSCA
varijante (na primjer, rs2294008T) može smanjiti transkripciju gena domaćina modulacijom njegovog uzvodnog fragment [10]. Dvorazinski GWAS za rak želuca provedeno među japanskim i korejskim populacija pokazala da PSCA pregled rs2976392 G > A i rs2294008 C > T SNP značajno povećan rizik raka želuca [10]. Udruge PSCA pregled SNP s rakom želuca također su potvrdili u kineskoj populaciji [12-18]. Štoviše, dvostupanjski GWAS među kineske populacije Abnet et al. [19] Nedavno identificirali su dva klastera SNP na 1q22 ( MUC1 pregled rs4072037 T &C) i 10q23 ( PLCE1 pregled rs2274223 A > g) i njihova povezanost s karcinomom želuca osjetljivosti [19]. Istovremeno, trostupanjski GWAS u drugoj kineskog stanovništva Wang i sur. [20] Također je uočio povezanost s rs2274223 A > G SNP. Mucina 1 (MUC1) je membranski protein koji se može sidriti na apikalnu površinu gastrointestinalne sluznice kroz transmembransku domenu [21]. MUC1 igra važnu ulogu u sluznice podmazivanje, zaštitu protiv patogena, prijenosa signala i interakcije stanica-stanica [22,23]. Zaštitna funkcija MUC1 protiv infekcije u normalnim epitelnim stanicama je potvrdio i In vitro pregled i in vivo
eksperimentima [24]. Osim toga, PLCE1 pregled gen kodira fosfolipaze C. Ovaj proteinski produkt može kataliziraju hidrolizu polyphatidylinositol 4,5-bifosfat (PIP2) u dva kritična drugih glasnika: inozitol 1,4,5-trifosfata (Insl, 4, 5P3) i 4,5-diacilglicerol (DAG) [25], i time regulira staničnu pokretljivost, gnojidba i senzorne transdukcij [26]. Udruge MUC1 pregled rs4072037 T &C i PLCE1 pregled rs2274223 A > G s rizikom od raka želuca su također replicirati u različitih nacionalnosti [27-31]. Ipak, nisu istraženi kombinirani učinci svih tih četiriju polimorfizama na rizik od raka želuca. Pregled

U trenutnoj studiji, genotipiziran smo ove četiri GWAS-akcionara SNP-ova i ocijeniti njihovu povezanost s rakom želuca u bolnici temelji predmetu kontrole mogu studija, koji obuhvaća 692 slučajeva i 774 raka bez kontrole. pregled

Metode pregled

ispitivanoj populaciji pregled

Ovaj case-control studija uključila 692 genetski nepovezanih etničkih Han Kineza pacijenata i 774 raka bez kontrole. Svi predmeti su nedavno dijagnosticiran i patohistološki potvrdio pacijenata primarni karcinom želuca, regrutirati iz Odjela za gastroenterologiju, prvi SRODNE bolnici Wenzhou Medicinskom fakultetu Sveučilišta u razdoblju od siječnja 2010. do rujna 2013. godine bolesnika s interstitialoma, metastazirao rak od drugih organa i povratnih tumora su isključeni. Sve kontrole su nasumce odabrani iz bolničkih posjetitelja koji su pratili pacijente u bolnicu, ali ne traže za medicinsku njegu u istom vremenskom razdoblju, genetski nema veze s upisanih slučaju subjekata. Bili su frekvencije podudaraju s predmetima po starosti (± 5 godina) i spol. Tijekom pronalazak sudionika istraživanja, svaki sudionik je bio zakazan za razgovor s obučenih anketara nakon potpisivanja pisani informirani pristanak. Demografski podaci i povijest izloženost okoliša su prikupljeni, kao što su dob, spol, nacionalnost, povijest pušenja, konzumacije alkohola i obiteljsku povijest raka. Svaki sudionik je donirao oko 5 ml krvi, od kojih su 2 mL se koristi za genomske DNA ekstrakcije. Odziv je otprilike 95% za želučane ispitanika oboljelih od raka, a 92% za kontrole. Ova studija je odobren od strane kliničkih istraživanja Etičkog povjerenstva Wenzhou medicinskog sveučilišta, a svi sudionici pod uvjetom pismeni informirani pristanak za doniranje svojih bioloških uzoraka. Nikad pušači tekstu manje od 100 cigareta sav život. Oni koji su pili alkoholna pića, barem jednom tjedno za godinu dana ili više, ili redovito su definirani kao alkoholičara. Pregled

genotipa pregled

Genska DNA je izvađen i tretira kao što je prethodno opisano [32]. Mi usvojen Taqman Real Time PCR metoda za genotip odabrane četiri SNP-ova u slučajevima i kontrola pomoću sustava za detekciju slijeda u 7900 HT (Applied Biosystems). Osam pozitivnih kontrola i osam negativnih kontrola su uključeni u svaku ploču s 384 jažica kako bi se osigurala točnost rezultata genotipizacije. Također smo u više navrata genotipiziran 10% uzoraka, a rezultati su bili 100% podudaraju. Pregled

Statistička analiza pregled

χ ^{2 test je izračunata procijeniti razlike u distribucijama alela i frekvencije genotipova, kao i demografske između predmeta i kontrole. Dobrota-of-fit χ 2 test je korišten za testiranje Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) u kontrolama. Sirove i prilagođen omjer vjerojatnosti (OR) i njihovi odgovarajući interval pouzdanosti 95% (CIS) su izračunate univarijatne i multivarijatne logističke regresije modela, respektivno. Mi i dalje obavlja raslojavanje analize, dob, spol, pušenje /piće status, paket godine, BMI, tumora stranice i TNM fazi. Također smo proveli lažno-pozitivnih izvješća vjerojatnosti (FPRP) analize za sve statistički značajnih nalaza [33]. Ukratko, mi unaprijed prag FPRP od 0,2 i prije vjerojatnost 0.1 za određenu povezanost između odabrane SNP i rizika od karcinoma želuca. Statistička snaga je izračunata za otkrivanje OR 1,50 /0,67 za alela s rizikom /zaštitni učinak. Udruga sa FPRP vrijednost < 0,2 proglašen je vrijedan spomena [34]. Sve statistike su izvedene pomoću SAS softvera (verzija 9.1, SAS Institute, Cary, NC). Svi statistički testovi bili obostrani, i P izvoznici < 0,05 smatrala se statistički značajna}

Rezultati

ispitanika

demografska obilježja. slučajevi raka 692 želuca i 774 kontrola sažeti su u tablici 1. nije bilo značajne rodne razlikuje između slučajeva i kontrola ( P pregled = 0,944). Međutim, kontrole su više vjerojatno da će biti pušači ( P izvoznici < 0.0001) i piju ( P pregled = 0,0006) u usporedbi s pacijentima. Slučajevi su više vjerojatno da će imati hranjiva nedostatke i niži indeks tjelesne mase ( P izvoznici < 0.0001). Dakle, pušenje, pakiranje godina, status i BMI za piće su prilagođena za naknadno multivarijatne logističke regresijske analize. Među svim slučajevima, 199 (28,76%) je imalo kardija rak i 493 (71,24%) je imala rak ne-kardija. Štoviše, raka želuca su stupili u skladu sa sustavom TNM u 7 ^{th Edition od AJCC [35]. Kao rezultat toga, 274 slučajeva (39.60%) bili su označeni kao TNM stadij I ili II bolesti, a 418 (60.40%), predstavljen s TNM faze III ili IV bolesti. Pregled}

Association između odabranih SNP-ova i raka želuca podložnosti

genotipa distribucija četiri odabranih SNP u svim predmetima su prikazani u tablici 2. Sve promatrane genotip distribucije u kontrolama bili u dogovoru s HWE ( p pregled = 0,105 za rs2294008, p pregled = 0.130 za rs2976392, p pregled = 0,155 za rs2274223 i p pregled = 0.735 za rs4072037). pregled

Kao što je navedeno u tablici 2, sve je to četiri odabrana polimorfizmi povezani s osjetljivošću od raka želuca. Kad je PSCA pregled rs2294008 CC genotipa bio je korišten kao referenca, CT genotipa i kombinacije CT i TT genotipova povezanih s povećanim rizikom od nastanka karcinoma želuca (prilagođen OR = 1,37, 95% CI = 1.07-1.74 za CT i korigirani OR = 1,30; 95% CI = 1,03-1,63 za CT /TT). Slična povezanost s rizikom od nastanka karcinoma želuca Također je utvrđeno za PSCA pregled rs2976392 G > polimorfizma (AG vs GG: prilagođena OR = 1,30, 95% CI = 1.02-1.65, a AG /AA vs GG : korigirani OR = 1,26; 95% CI = 1,00-1,59). Štoviše, PLCE1 pregled rs2274223 A > G polimorfizma je utvrđeno da je značajno povećati rizik od raka želuca pod homozigotni modela (AG vs AA: prilagođena OR = 1,48, 95% CI = 1.15-1.90) i dominantnog modela (AG /GG vs AA: korigirani OR = 1,45, 95% CI = 1,14-1,84). Nasuprot tome, MUC1 pregled rs4072037 T C polimorfija pokazuje značajno smanjeni raka želuca osjetljivost prema homozigotni modelu (CT naspram TT: podesi OR = 0,77, 95% CI = 0.60-0.98). Nadalje, utvrdili smo da ispitanici s 2-4 genotipova rizika (genotipa rizika iz CT /TT za rs2294008 C > T, AG /AA za rs2976392 G > A, Ag /GG za rs2274223 A > G i TT za rs4072037 T >C polimorfizam) je imao značajnu povećani rizik (prilagoditi ili = 1,30, 95% CI = 1.03-1.64) u usporedbi s onima koji su sa svega 0-1 genotipova rizika pregled

Stratifikacija analiza pregled

Udruge. između varijanta genotipova i rizika od raka želuca i dalje je procijenjena u stratifikacije analizi dob, spol, pušenje, paket godine, pitke statusa, i BMI pod dominantnim genetskom modelu (Tablica 3). Otkrili smo da je PSCA pregled rs2294008 CT /TT genotipova bile su povezane s povećanim rizikom od raka želuca kod mlađih ispitanika, svjetlo pušača i osoba s karcinomom ne-cardia, u odnosu na odgovarajućim referentnim skupinama. S obzirom na PLCE1 pregled rs2274223 A > G polimorfizma, slojevitost analizira primijetio povećan rizik od raka želuca sa genotipova AG /GG u mlađih ispitanika, žene, nikad pušači, nikad alkoholičara, sudionici s visokim indeksom tjelesne mase, i objekata s rak kardija ili TNM stadij III + IV bolesti. Dok su genotipovi rizika u kombinaciji, otkrili smo da su ispitanici s 2-4 genotipova rizika su veću vjerojatnost za razvoj raka želuca kod mlađe podskupine, muškarci nikada pušači, ili podskupina s visokim indeksom tjelesne mase i subjekti s rakom ne cardia, nego svako odgovara podgrupe kolege s 0-1 rizika genotipa. Daljnje heterogenosti testovi za slojevite analize nisu zabilježene razlike između podskupina po različitim suradnicima variates, kao što su dob, spol, i status pušenja. Osim toga, nije bilo statistički dokaz interakcije između tih odabranih SNP i ko-variates (dob, spol, BMI, itd), bilo. Pregled

FPRP vrijednosti za sve statistički značajan rezultat prikazani su u tablici 4. False pozitivnih vrijednosti vjerojatnosti izvješće za povezanost između rizika od raka želuca i učestalost genotipova odabranih gena. 4, s unaprijed prethodne vjerojatnosti 0.1 i praga FPRP od 0,2. FPRP analiza je pokazala da je značajna povezanost između PSCA
rs2294008 C > T i raka želuca rizik bio vrijedan spomena ispod homozigotni modelu. Osim toga, udruga je također zaslužuje pozornost za mlađe ispitanika i onih s ne-kardija. Isto tako, značajna povezanost s PLCE1 pregled rs2274223 G > A bio je značajan za sve predmete, kao i za mlađe temi, ne pušači, nikad ne piju, one s BMI > 24.0, rak kardija ili TNM stadij III + IV bolesti. FPRP također potvrdio značajnu povezanost s PSCA pregled rs2976392 G > u homozigota i dominantnih modela i značajna povezanost s MUC1 pregled rs4072037 T &C pod homozigotni modelu. Što se kombiniranim genotipova, potvrdili smo značajnu povezanost za ispitanika s ≤27 paket godine ili rak ne-cardia. Relativno veća vrijednost FPRP pronađene su za ostatak značajnih povezanosti odabranih polimorfizama i rizik od raka želuca, što se može pripisati relativnom malom uzorku ovog istraživanja, kao i umjerene učinke odabranih SNP-ova. Ovi rezultati potrebno daljnje validacije istraživanja s velikom uzorku. Pregled

Rasprava pregled

U trenutnom bolničkom temelji case-control studiji istraživali smo potencijalne udruge PSCA pregled rs2294008 C >T i rs2976392 G > PLCE1 pregled rs2274223 a > G i MUC1 pregled rs4072037 T &C polimorfizmi rak želuca osjetljivosti među kineskog stanovništva. Otkrili smo da je PSCA pregled rs2294008 CT /TT, PSCA pregled rs2976392 AG /AA i PLCE1 pregled rs2274223 AG /genotipova GG bili povezani sa značajno povećanim rizikom od raka želuca u Kineska populacija, dok je MUC1 pregled rs4072037 T &C su povezani sa smanjenim osjetljivosti raka želuca. Također smo otkrili da osobe koje nose 2-4 genotipova rizika imali su izrazito povećan rizik od raka želuca, u usporedbi s onima koji nosi 0-1 rizika genotip. Učinak kombinirane genotipova rizika na rizik od raka je očitije kod mlađih ispitanika, muškaraca, ikad pušači, predmetima s visokim BMI i raka želuca ne cardia. Ovi rezultati ukazuju na to da su odabrane SNP iz GWASs može doprinijeti želuca karcinogeneze. Pregled

Do sada su četiri GWASs su istražili rizik od raka želuca [10,16,19,20] kao što je spomenuto u uvodu, što je dovelo do nalaz od četiri SNP interesa. PSCA pregled rs2294008 C > T rezultati u Met /Thr zamjenu, i PSCA pregled rs2976392 G > A mogu mijenjati faktor transkripcije na mjestu vezivanja aktivnost gena [10]. Štoviše, MUC1 pregled rs4072037 T &C može dovesti do srastanje promjene, dok je, PLCE1 pregled rs2274223 A > G može uzrokovati Arg-to-Njegove promjene koje su značajno povezana s rizikom od raka želuca u početnoj fazi skeniranja [19]. Dok su skeniranje i validacije faze spoje, genom-wide udruga zabilježena je samo za PLCE1 pregled rs2274223 A > G polimorfizma, ali ne i MUC1 pregled rs4072037 T &C polimorfizma [19]. Istovremeno, Wang et al. Također je pronašao polimorfizma rs2274223 je bio povezan s želučanim cardia adenokarcinom ( P pregled = 1,74 × 10 ^{-39) [20]. Nedavno, GWAS Shi i sur. [16], potvrdio je ranije izvijestili udruge nisu cardia želučane osjetljivost raka ne samo s PSCA
rs2294008 i rs2976392, ali i MUC1 pregled rs4072037.}

Nalazi iz prethodnog GWASs su široko potvrđene među različitim etničkim populacijama u posljednjih nekoliko godina (S1 tablicu). Na primjer, Wu i sur. [18] pokazuju da je povezanost između PSCA
rs2294008 i raka želuca je izraženije kod bolesnika s ne-cardia raka želuca od onih s rakom kardija želuca. Značajna povezanost također je potvrđen od strane studija provedenih između različitih etničkih skupina širom svijeta [14-17,19,36-40]. Međutim, povezanost između rs2294008 C > T i raka želuca nije potvrđena i od ostalih [12,41]. Da biste riješili spor, šest meta-analize su provedene procijeniti odnos između PSCA
polimorfizama i rak želuca osjetljivosti [42-47]. Qiao i sur. [42] uključuje osam case-control studija iz sedam članaka i otkrili da rs2294008 T alel i rs2976392 A alel značajno su povezane s povećanim rizikom od raka želuca. Ovi rezultati su također potvrđeni druge meta-analizu [43-46]. U novije vrijeme, pristup doprinosa tih dviju široko ispitivanih PSCA pregled SNP na želučanu osjetljivosti raka, Gu i sur. [47] provedena meta-analiza 16 studija s ukupno 18,820 slučajeva i 35,756 kontrola. Izvučeni Ili je 1,46 (95% CI = 1,30-1,69) za PSCA
rs2294008 i 1.49 (95% CI = 1,22-1,82) za rs2976392 polimorfizama. Štoviše, nakon što je otkrio Abnet et al. [19] i Wang et al. [23], PLCE1 pregled rs2274223 polimorfizma su intenzivno istraživali između različitih etničkih skupina u različite oblike raka, poput raka želuca, raka jednjaka, karcinomom glave i vrata, i rak žučnog mjehura [48-60]. Međutim, zaključci o povezanosti između PLCE1 pregled rs2274223 A > G polimorfizam i rizika od karcinoma su kontroverzne. Značajna povezanost uočena je u nekim studijama [49-52,56,58], ali ne u drugima [48,53-55,57,59,60]. Četiri meta-analize provedene su ponovno procijeniti povezanost [27-30]. Hao et al. [27] uključuje ukupno 13 case-control studije, od kojih je pet studija s 5127 slučajeva i 5791 kontrola ispituje ulogu tog SNP rizika od raka želuca. Otkrili su statistički značajne povezanost između polimorfizma rs2274223 i povećanog rizika od raka želuca pod homozigotni model i heterozigotnom model. Ovi rezultati su u skladu s onima drugih tri meta-analize koja je uključivala manje studije udruženja, raka želuca. Što se MUC1
rs4072037 T &C polimorfizam, povezanost između ovog polimorfizma i raka želuca je potvrđen kod različitih nacionalnosti [49,53,61]. Saeki et al. [61] i Zhang et al. [49] je utvrdio da ovaj polimorfizam bio povezan sa smanjenom raka želuca među Azijatima, dok postoji značajna povezanost nađena između bijelaca [53] .There je samo jedna meta-analiza za MUC1
rs4072037 T &C polimorfizma [31 ], u kojoj je bilo uključeno ukupno 10 studija s 6580 slučajeva raka želuca i 10324 kontrola. Utvrđeno je da je MUC1 pregled rs4072037 G alela bila je značajno povezana sa smanjenim rizikom od raka želuca (OR = 0,72, 95% CI = 0,68 - 0,77), u usporedbi s A alela. Pregled

Brojne studije su provedena za provjeru nalaza GWAS na rak želuca. Ipak, niti jedan od studija pokriveni sve četiri SNP kao što smo učinili ovdje, osim jednog istraživanja provedenog od strane Palmer i sur. među bijelaca, koji ispitivanih PLCE1 pregled rs2274223, C20orf54 pregled rs13042395 i MUC1 pregled rs4072037 polimorfizmi [53]. Otkrili su da je MUC1 pregled rs4072037 polimorfizma je povezana sa smanjenim rizikom od crijevna tipa karcinoma želuca (OR = 0,4, 95% CI = 0,2 do 0,9); Međutim, nema udruge su pronađeni s obje PLCE1 pregled rs2274223 i C20orf54 pregled rs13042395. U trenutnoj studiji, pronašli smo sve ove četiri SNP-ova su pojedinačno povezani s rakom želuca osjetljivosti među kineskim temama. Također smo otkrili da 2-4 rizik genotip prijevoznici imali mnogo veći rizik od raka želuca nego 0-1 nosača. Ova pojava je izraženija kod mlađih ispitanika, muškaraca, uvijek pušač, one s visokim BMI i subjekti koji cardia raka želuca. Dim cigarete sadrži oko 55 karcinogeni koje mogu generirati reaktivnih kisikovih inducirati različite DNA oštećenja. Muški ikada pušači stalno izloženi cigarete dima eventualno luka DNK štete koje mogu biti u interakciji s genetskim varijacijama dovesti do razvoja raka. Drugim riječima, interakcija gena okoliš može igrati važnu ulogu u pokretanju i promicanju karcinogeneze [62]. Visoki BMI je prepoznata kao faktor rizika za rak želuca u zapadnim zemljama [4]. Kardija karcinoma želuca je lokaliziran na gastroezofagealnog spoja i mogu se razlikovati od raka ne-cardia vezi epidemiološkim karakteristikama i kliničke slike [16] .Stoga, povezanost s ne-cardia raka želuca čini se da je biologija uvjerljivo. Pregled

sažetak, utvrdili smo povezanost između četiri prethodna GWAS-akcionara SNP-ova i raka želuca osjetljivosti u ovoj bolnici se temelji case-control studija. Međutim, nekoliko ograničenja u ovom istraživanju treba rješavati. Prvo, svojstvena izbor pristranost i informacije pristranosti može biti neizbježan u bolnici na temelju sudske kontrole dizajniran studiju. Drugo, uključeni su samo četiri SNP u trenutnoj studiji, umjesto da pokriva sve obećavajuće GWAS-akcionara SNP-ova. Općenito, studije koje obuhvaćaju više SNP-ova potencijalno vezanih za rizik od raka želuca može biti sposoban za osvjetljavanje točnu ulogu genetskih varijanti u želucu karcinogeneze. Konačno, s obzirom na prirodu retrospektivnu studiju dizajna, nismo imaju pouzdane i dovoljno podataka za pojedince na drugim izloženosti okoliša, kao što su H Netlogu. pylori pregled infekcija, izloženost prehrani, zanimanje, kao i želuca klasifikacija karcinoma i podvrste, kao što su crijevne i difuznog podtipa. Nedostatak sve vrijedne informacije o nas je spriječio dalje istraživati ​​etiološke uloge tih čimbenika u želucu karcinogeneze. Unatoč ovim ograničenjima, nalaz iz naše studije su informativni za istraživače i liječnika u tom području. Dodatne dobro dizajnirane prospektivne studije za stanovništvo su potrebni kako bi dodatno potvrdili naše rezultate, osobito one s detaljnim podacima o faktorima rizika za rak želuca i velike veličine uzorka, uključujući različitih etničkih skupina. Pregled

popratne podatke
S1 Podaci. Izvorni Data pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001 pregled (XLS) pregled S1 stol. Karakteristike prethodnih studija usmjerenih na ove četiri SNP pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s002 pregled (DOC) pregled

• PLoS ONE: Na putu prema pravom smjeru-Solution paket za endoskopske submukozalnim Tunelni resekcije u Stomach
• PLoS ONE: Želudac Virtualni nepoboljšane CT s druge generacije, Dual-Energy CT: preliminarni Study