PLoS ONE: Associazioni di varianti genetiche nel PSCA, MUC1 e PLCE1 geni con cancro dello stomaco sensibilità in una popolazione cinese

Astratto

Sfondo

Diversi varianti genetiche tra cui PSCA
rs2294008 C > T e rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, e PLCE1
rs2274223 a > G hanno mostrato associazione significativa con il rischio di cancro allo stomaco nei precedenti studi di associazione genome-wide (GWASs)

Metodi

Per valutare le associazioni di questi. SNPs nei cinesi Han, uno studio caso-controllo basato ospedale indipendente è stata eseguita da genotipizzazione questi quattro polimorfismi in un totale di 692 casi di cancro allo stomaco e 774 controlli sani acquisiti tramite corrispondenza frequenza per età e sesso. rapporto di probabilità di falsi positivi (FPRP) analisi è stata eseguita anche a convalidare tutti i risultati statisticamente significativi.

Risultati

Nel corso di studio, è stata osservata un'associazione significativa con suscettibilità al cancro allo stomaco per tutti i quattro polimorfismi di interesse. In particolare, un significativo aumento del rischio di cancro allo stomaco è stato associato con rs2294008 PSCA
(CT vs. CC: OR aggiustato = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74, e CT /TT vs.CC: OR aggiustato = 1.30 , 95% CI = 1,03-1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs GG: OR aggiustato = 1.30, 95% CI = 1,02-1,65, e AG /AA vs GG: OR aggiustato = 1.26, 95% CI = 1,00-1,59), o PLCE1
rs2274223 (AG vs. AA: OR aggiustato = 1.48, 95% CI = 1,15-1,90, e AG /GG vs AA: OR aggiustato = 1.45, 95% CI = 1,14-1,84), rispettivamente. Al contrario, MUC1
rs4072037 è stato mostrato per diminuire il rischio di cancro (CT vs TT: OR aggiustato = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). I pazienti con più di un genotipi di rischio avevano significativo aumento del rischio di sviluppare il cancro dello stomaco (OR aggiustato = 1.30, 95% CI = 1,03-1,64), se confrontati con quelli aventi 0-1 genotipi di rischio. analisi stratificata ha indicato che l'aumento del rischio è stato più pronunciato nei soggetti più giovani, gli uomini, mai i fumatori, i fumatori con anni pacco ≤ 27, i pazienti con alto indice di massa corporea, o cancro allo stomaco non cardias.

Conclusioni

Questo studio sostanziata le associazioni tra quattro precedenti varianti genetiche segnalati e suscettibilità al cancro allo stomaco in una popolazione autonoma cinese Han. Ulteriori studi con più grande dimensione del campione e le diverse etnie sono garantiti per convalidare i nostri risultati

Visto:. Sun H, Wu X, Wu F, Li Y, Z Yu, Chen X, et al. (2015) Associazioni di Varianti genetiche nel PSCA
, MUC1
e PLCE1
geni con cancro dello stomaco suscettibilità in una popolazione cinese. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10.1371 /journal.pone.0117576

Editor Accademico: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, INDIA

Ricevuto: June 30, 2014; Accettato: 27 dicembre 2014; Pubblicato: 6 Febbraio 2015

Copyright: © 2015 Sun et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati

disponibilità dei dati: Tutti i dati rilevanti sono all'interno del suoi file informazioni di supporto carta e

Finanziamento:. lo studio è stato sostenuto da China National Natural Science Foundation (n ° 81.370.563) concessione e Zhejiang Programma Provinciale per la coltivazione di alto livello talenti sanitari innovativi e un Amministrazione Provinciale di Medicina tradizionale Cinese della provincia di Zhejiang, Cina (No.2011ZA072) e progetto sostenuto dal Ministero della salute della Cina del grande progetto della medicina scienza e della tecnologia nella provincia di Zhejiang (n WKJ2012-2-033) e l'applicazione della tecnologia benessere pubblico progetto di ricerca sostenuto dalla scienza dipartimento di tecnologia della provincia di Zhejiang (No.2012C23108) e eccellente Youth Foundation del Zhejiang Provinciale di Scienze naturali (No.LR14H030001) e del progetto di scienza e tecnologia di Wencheng County. I finanziatori avevano alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto

Competere interessi:.. Gli autori hanno dichiarato che non esistono interessi in competizione

Introduzione
cancro

dello stomaco è il quarto tumore più frequentemente diagnosticato e la seconda causa di morte per cancro in tutto il mondo, con circa 738.000 decessi correlati al cancro nel 2008. in generale, oltre il 70% dei nuovi casi di cancro allo stomaco e morti verificarsi in paesi in via di sviluppo, con la più alta incidenza in Asia orientale. In particolare, circa il 40% dei casi di cancro allo stomaco del mondo si sono verificati in Cina [1,2]. Helicobacter pylori
( H
. pylori
) infezione è fattore eziologico ben consolidata per il cancro allo stomaco in tutto il mondo, con tassi di infezione che vanno dal 40% al 80% negli esseri umani. Oltre al H
. pylori
infezione, salati e il consumo di cibi nitrati, e il fumo di sigaretta sono stati segnalati anche ad essere associata ad un aumento del rischio di cancro allo stomaco, mentre frutta e verdura fresca prese sono riconosciuti come fattori di protezione [3]. alto indice di massa corporea (BMI) è stato anche suggerito come un fattore di rischio per il cancro dello stomaco nei paesi occidentali [4], ma non in Cina [5]. Tuttavia, solo una piccola frazione di individui esposta a fattori di rischio eventualmente sviluppare cancro dello stomaco durante la vita [6], suggerendo che fattori genetici possono svolgere un ruolo importante nella patogenesi del cancro allo stomaco. Fino ad oggi, l'eziologia genetica di cancro allo stomaco, come il gene-gene e interazioni gene-ambiente, rimane poco chiaro.

Nel corso degli ultimi anni, gli studi di associazione sull'intero genoma (GWASs), tecnologie di genotipizzazione throughput elevato, hanno stato uno strumento robusto per la scoperta di nuovi loci di suscettibilità cancro o geni in tutto il genoma [7]. centinaia Finora, GWASs hanno identificato con successo di marcatori genetici che sono legati alla predisposizione alle malattie tra cui il cancro allo stomaco [8]. Si è voluto indagare polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) in PSCA
, MUC1
, e PLCE1
geni in questo studio. PSCA
gene (localizzato sul cromosoma 8q24) codifica un antigene della prostata di cellule staminali (PSCA), una proteina composta da 123 residui di aminoacidi. PSCA appartiene alla LY-6 /Thy-1 famiglia di antigeni di superficie delle cellule. E 'altamente espressa nella prostata normale e più up-regolati nel cancro della prostata [9], così come tumori prostatici non tra cui il cancro gastrico [10]. PSCA gioca un ruolo critico nella adesione cellulare, la proliferazione e la sopravvivenza [11]. in vitro
esperimenti hanno indicato che alcuni PSCA
varianti (ad esempio, rs2294008T) potrebbero diminuire la trascrizione del gene ospite modulando il suo frammento a monte [10]. A due fasi GWAS per il cancro allo stomaco condotto tra le popolazioni giapponesi e coreani hanno dimostrato che PSCA
rs2976392 G > A e rs2294008 C > T SNP significativo aumento del rischio di cancro allo stomaco [10]. Le associazioni di PSCA
SNP con cancro gastrico sono stati confermati nelle popolazioni cinesi [12-18]. Inoltre, a due stadi GWAS tra una popolazione Cinese, Abnet et al. [19] recentemente identificato due gruppi di SNP a 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) e 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) e le loro associazioni con suscettibilità al cancro allo stomaco [19]. Allo stesso tempo, un tre fasi GWAS in un'altra popolazione Cinese, Wang et al. [20] anche osservato l'associazione con rs2274223 A > G SNP. Mucina 1 (MUC1) è una proteina di membrana che può ancorare alla superficie apicale degli epiteli gastrointestinale attraverso un dominio transmembrana [21]. MUC1 svolge un ruolo importante nella lubrificazione della mucosa, la protezione contro gli agenti patogeni, trasduzione del segnale, e l'interazione cellula-cellula [22,23]. La funzione di protezione di MUC1 contro l'infezione in cellule epiteliali normali è stata confermata sia da in vitro
e in vivo
esperimenti [24]. Inoltre, PLCE1
gene codifica la fosfolipasi C. Questo prodotto proteina può catalizzare l'idrolisi di polyphatidylinositol 4,5-bisfosfato (PIP2) in due secondi messaggeri critici: inositolo 1,4,5-trifosfato (INSL, 4, 5P3) e 4,5-diacilglicerolo (DAG) [25], e quindi regolare la motilità cellulare, la fecondazione, e trasduzione sensoriale [26]. Le associazioni di MUC1
rs4072037 T > C e PLCE1
rs2274223 A > G con il rischio di cancro allo stomaco sono anche stati replicati in diverse etnie [27-31]. Tuttavia, gli effetti combinati di tutti questi quattro polimorfismi sul rischio di cancro allo stomaco non sono state studiate.

In questo studio, abbiamo genotipizzarono questi quattro SNP GWAS-identificata e valutate le loro associazioni con cancro allo stomaco in un caso basato ospedale -Control studio, composto da 692 casi e 774 controlli privi di tumore.

Metodi

studio popolazione
studio

Questo caso-controllo comprendeva 692 pazienti geneticamente non correlati di etnia cinese Han e 774 controlli cancro-free. Tutti i casi sono stati recentemente diagnosticati e istopatologico ha confermato i malati di cancro allo stomaco primarie, reclutati da parte del Dipartimento di Gastroenterologia, Primo Ospedale Affiliato di Wenzhou Medical University tra gennaio 2010 e settembre 2013. I pazienti con interstitialoma, metastatizzato cancro da altri organi e tumori ricorrenti sono stati esclusi. Tutti i controlli sono stati selezionati in modo casuale da parte dei visitatori che hanno accompagnato in ospedale i pazienti in ospedale, ma non in cerca di cure mediche nello stesso periodo di tempo, geneticamente non correlati ai soggetti di casi arruolati. Erano frequenza abbinato ai casi per età (± entro 5 anni) e il sesso. Durante il reclutamento dei partecipanti alla ricerca, ogni partecipante è stato programmato per un colloquio con intervistatori addestrati dopo un consenso informato scritto è stato firmato. Dati demografici e la storia l'esposizione ambientale sono stati raccolti, come l'età, sesso, etnia, storia di fumo, consumo di alcol e storia familiare di cancro. Ogni partecipante ha donato circa 5 ml di sangue, di cui 2 ml è stato utilizzato per l'estrazione del DNA genomico. Il tasso di risposta è stato di circa il 95% per i soggetti il ​​cancro dello stomaco e il 92% per i controlli. Questo studio è stato approvato dal Comitato Etico Clinical Research di Wenzhou Medical University, e tutti i partecipanti hanno fornito un consenso informato scritto per la donazione dei loro campioni biologici. Mai i fumatori di cui meno di 100 sigarette tutta la vita. Coloro che hanno bevuto alcolici almeno una volta alla settimana per un anno o più o regolarmente sono stati definiti come bevitori.

La genotipizzazione

Il DNA genomico è stato estratto e trattato come descritto in precedenza [32]. Abbiamo adottato Taqman real time PCR per genotipo selezionati quattro SNPs nei casi e controlli utilizzando un 7900 HT sistema di rilevazione di sequenza (Applied Biosystems). Otto controlli positivi e otto controlli negativi sono stati inclusi in ogni piatto ben 384 per assicurare l'accuratezza dei risultati di genotipizzazione. Abbiamo anche più volte genotipizzati 10% dei campioni, ei risultati sono stati concordi al 100%.

L'analisi statistica

Il χ ^{2 di prova è stato calcolato per valutare le differenze nelle distribuzioni di allele e genotipo frequenze, nonché demografico tra i casi e controlli. La bontà di adattamento χ 2 test è stato utilizzato per testare l'equilibrio di Hardy-Weinberg (HWE) nei controlli. Grezzi e aggiustati odds ratio (OR) e le loro corrispondenti al 95% intervallo di confidenza (IC) sono stati calcolati da modelli di regressione logistica univariata e multivariata, rispettivamente. Abbiamo inoltre effettuato stratificazione analisi per età, sesso, fumo /stato potabile, pack-anno, indice di massa corporea, sede del tumore e lo stadio TNM. Abbiamo anche effettuato analisi falso-positivo rapporto di probabilità (FPRP) per tutti i risultati statisticamente significativi [33]. In breve, abbiamo preimpostare un limite FPRP di 0,2 e un probabilità a priori di 0,1 per una data associazione tra SNP selezionato e rischio di cancro allo stomaco. potenza statistica è stata calcolata per rilevare un OR di 1.50 /0.67 per alleli con un effetto di rischio /protettivi. Associazione con un valore FPRP < 0.2 è stato dichiarato come degno di nota [34]. Tutte le statistiche sono state effettuate utilizzando il software SAS (versione 9.1, SAS Institute, Cary, NC). Tutti i test statistici erano a due code, e P
< 0.05 è stato considerato come statisticamente significativa}

Risultati

materie di studio

Le caratteristiche demografiche dei. i casi di cancro allo stomaco 692 e 774 controlli sono stati riassunti nella Tabella 1. non ci sono state significative genere diverso tra casi e controlli ( P
= 0,944). Tuttavia, i controlli sono stati più probabilità di essere fumatori ( P
< 0,0001) e bevitori ( P
= 0,0006) rispetto ai pazienti. I casi sono stati più probabilità di avere carenze nutrizionali e abbassare BMI ( P
< 0,0001). Pertanto, abitudine al fumo, pacchetti-anno, bevendo stato e BMI sono stati adeguati per la successiva analisi di regressione logistica multivariata. Tra tutti i casi, 199 (28.76%) hanno avuto il cancro al cardias e 493 (71.24%) ha avuto il cancro non-cardias. Inoltre, i tumori dello stomaco sono state organizzate secondo il sistema di stadiazione TNM nel 7 ^{edizione del AJCC [35]. Di conseguenza, 274 casi (39,60%) sono stati designati come stadio TNM I o II malattie, mentre 418 (60.40%) hanno presentato con stadio TNM III o IV malattie.}

associazione tra SNPs selezionati e suscettibilità al cancro allo stomaco

la distribuzione del genotipo dei quattro SNPs selezionati in tutti i soggetti sono stati riportati nella tabella 2. tutte le distribuzioni genotipiche osservate nei controlli erano in accordo con HWE ( P = 0,105
per rs2294008, P = 0.130
per rs2976392, P = 0,155
per rs2274223, e P = 0,735
per rs4072037).

Come indicato nella tabella 2, tutti questi quattro polimorfismi selezionati sono stati associati con la suscettibilità cancro allo stomaco. Quando il PSCA
rs2294008 CC genotipo è stato utilizzato come riferimento, il genotipo CT e una combinazione di CT e TT genotipi sono stati associati ad un aumentato rischio di cancro allo stomaco (OR aggiustato = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74 per CT, e OR aggiustato = 1.30; 95% CI = 1,03-1,63 per CT /TT). Un'associazione simile al rischio di cancro allo stomaco è stato trovato anche per la PSCA
rs2976392 G > A polimorfismo (AG vs GG: OR aggiustato = 1.30, 95% CI = 1,02-1,65, e AG /AA vs GG : OR aggiustato = 1.26; 95% CI = 1,00-1,59). Inoltre, il PLCE1
rs2274223 A > G polimorfismo è stato trovato per aumentare significativamente il rischio di cancro allo stomaco con il modello omozigote (AG vs. AA: OR aggiustato = 1.48, 95% CI = 1,15-1,90), e il modello dominante (AG /GG vs AA: OR aggiustato = 1.45, 95% CI = 1,14-1,84). Al contrario, MUC1
rs4072037 T > C polimorfismo è stato mostrato al diminuito in modo significativo allo stomaco cancro suscettibilità sotto il modello omozigote (CT vs TT: OR aggiustato = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). Inoltre, abbiamo scoperto che i soggetti con 2-4 genotipi di rischio (il genotipo dei rischi di cui CT /TT per rs2294008 C > T, AG /AA per rs2976392 G > A, AG /GG per rs2274223 A > G, e TT per rs4072037 T > C polimorfismo) ha avuto significativo aumento del rischio (OR aggiustato = 1.30, 95% CI = 1,03-1,64) rispetto a quelli con solo 0-1 genotipi di rischio

La stratificazione analisi

L'associazione. tra i genotipi variante e rischio di cancro allo stomaco è stato ulteriormente valutato in analisi stratificazione per età, sesso, abitudine al fumo, pack-anno, lo stato di bere, e BMI in un modello genetico dominante (Tabella 3). Abbiamo trovato che il PSCA
rs2294008 CT /genotipi TT sono stati associati ad un aumentato rischio di cancro allo stomaco nei soggetti più giovani, i fumatori leggeri e soggetti affetti da tumore non-cardias, rispetto a rispettivi gruppi di riferimento. Per quanto riguarda il PLCE1
rs2274223 A > G polimorfismo, stratificazione analisi osservato un aumento del rischio di cancro allo stomaco con i genotipi AG /GG nei partecipanti più giovani, le donne, non avevano mai fumato, astemi, i partecipanti con alto indice di massa corporea, e soggetti con cancro cardias o stadio TNM III + IV malattie. Mentre genotipi di rischio sono stati combinati, abbiamo scoperto che i soggetti con genotipi 2-4 di rischio avevano una maggiore probabilità di sviluppare il cancro dello stomaco tra i più giovani sottogruppo, i maschi, mai i fumatori o sottogruppi ad alto indice di massa corporea e soggetti affetti da tumore non-cardias, che ciascun sottogruppo corrispondente controparti con genotipo 0-1 rischio. Gli ulteriori test di eterogeneità per l'analisi stratificata non hanno rilevato alcuna differenza tra i sottogruppi con diversi co-variates, come l'età, il sesso e abitudine al fumo. Inoltre, non vi era alcuna evidenza statistica di interazione tra questi SNP selezionati e co-variates (età, sesso, indice di massa corporea, ecc), sia.

I valori FPRP per tutti i risultato statisticamente significativo sono riportati in Tabella 4. Falso valori di probabilità di report -positive per associazioni tra rischio di cancro allo stomaco e la frequenza dei genotipi di geni selezionati. 4, con una probabilità a priori preimpostato di 0,1 e una soglia FPRP di 0,2. analisi FPRP ha indicato che la significativa associazione tra PSCA
rs2294008 C > il cancro dello stomaco T e rischio era degno di nota sotto modello omozigote. Inoltre, l'associazione è stato anche meritevole di attenzione per i soggetti più giovani e quelli con non-cardias. Allo stesso modo, l'associazione significativa con PLCE1
rs2274223 G > A è degno di nota per tutti i soggetti, così come per i soggetti più giovani, non avevano mai fumato, mai bevitori, quelli con BMI > 24,0, il cancro cardias o stadio TNM III + malattie IV. FPRP ha anche confermato l'associazione significativa con PSCA
rs2976392 G > A sotto modelli omozigoti e dominanti e l'associazione significativa con MUC1
rs4072037 T > C sotto modello omozigote. Per quanto riguarda i genotipi combinati, abbiamo confermato l'associazione significativa per i soggetti con il pacchetto-anno ≤27 o il cancro non-cardias. Relativamente maggiore valori FPRP sono stati trovati per il resto della associazioni significative tra polimorfismi selezionati e rischio di cancro allo stomaco, che potrebbero essere riconducibili alla piccola dimensione del campione relativo di questo studio così come gli effetti moderati di SNP selezionati. Questi risultati hanno bisogno di ulteriore validazione nelle indagini con le grandi dimensioni del campione.

Discussione

In questo studio caso-controllo basato ospedale corrente, abbiamo studiato le potenziali associazioni di PSCA
rs2294008 C > T e rs2976392 G > a, PLCE1
rs2274223 a > G e MUC1
rs4072037 T > polimorfismi C con suscettibilità al cancro allo stomaco tra la popolazione cinese. Abbiamo scoperto che PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA e PLCE1
rs2274223 AG /genotipi GG sono stati associati con un aumento significativo del rischio di cancro allo stomaco in un popolazione cinese, mentre il MUC1
rs4072037 T > C sono stati associati ad una ridotta suscettibilità al cancro allo stomaco. Abbiamo anche trovato che i soggetti che trasportano 2-4 genotipi di rischio avevano un aumentato rischio di cancro allo stomaco marcatamente, rispetto a quelli che trasportano il genotipo 0-1 rischio. L'effetto dei genotipi di rischio combinati sul rischio di cancro è stato più evidente nei soggetti più giovani, maschi, sempre per fumatori, i soggetti con alto BMI e cancro allo stomaco non cardias. Questi risultati indicano che i SNP selezionati da GWASs possono contribuire alla carcinogenesi stomaco.

Finora, quattro GWASs hanno studiato il rischio di cancro allo stomaco [10,16,19,20] come accennato nell'introduzione, che ha portato alla ritrovamento dei quattro SNP di interesse. Il PSCA
rs2294008 C > T risultati in sostituzione Met /Thr, e il PSCA
rs2976392 G > A può alterare fattore di trascrizione vincolante attività del sito del gene [10]. Inoltre, MUC1
rs4072037 T > C può portare a splicing alterazione, mentre, PLCE1
rs2274223 A > G può causare un Arg-to-suo cambiamento che sono stati significativamente associato al rischio di cancro allo stomaco nella fase iniziale di scansione [19]. Mentre le fasi di scansione e di validazione sono stati combinati, associazione di tutto il genoma è stato osservato solo per il PLCE1
rs2274223 A > G polimorfismo, ma non il MUC1
rs4072037 T > C polimorfismo [19]. Contemporaneamente, Wang et al. anche trovato il polimorfismo rs2274223 è stata associata con gastrica adenocarcinoma cardiale ( P
= 1.74 × 10 ^{-39) [20]. Più di recente, GWAS da Shi et al. [16], ha confermato precedentemente riportato associazioni di non-cardias suscettibilità al cancro non solo con PSCA
rs2294008 e rs2976392, ma anche MUC1
rs4072037.}

I risultati di precedenti GWASs sono stati ampiamente convalidato tra le diverse etnie negli ultimi anni (S1 tabella). Ad esempio, Wu et al. [18] ha indicato che l'associazione tra PSCA
rs2294008 e cancro allo stomaco è più prominente tra i pazienti con cancro allo stomaco non-cardias rispetto a quelli con cancro allo stomaco Cardia. L'associazione significativa è stata convalidata anche da studi condotti tra le diverse etnie in tutto il mondo [14-17,19,36-40]. Tuttavia, l'associazione tra rs2294008 C > il cancro dello stomaco e T non è stata convalidata da altri [12,41]. Per risolvere la controversia, sei meta-analisi sono state eseguite per valutare la relazione tra PSCA
polimorfismi e suscettibilità al cancro gastrico [42-47]. Qiao et al. [42] inclusi otto studi caso-controllo da sette articoli e ha scoperto che rs2294008 allele T e rs2976392 allele erano significativamente associati ad un aumentato rischio di cancro gastrico. Questi risultati sono stati confermati anche da altri meta-analisi [43-46]. Più di recente, per accedere ai contributi di questi due ampiamente indagate PSCA
SNP di suscettibilità al cancro gastrico, Gu et al. [47] effettuato una meta-analisi di 16 studi per un totale di 18,820 casi e 35.756 controlli. Il pool OR era 1,46 (95% CI = 1,30-1,69) per PSCA
rs2294008 e 1,49 (95% CI = 1,22-1,82) per polimorfismi rs2976392. Inoltre, dopo scoperto da Abnet et al. [19] e Wang et al. [23], il PLCE1
rs2274223 polimorfismo sono stati ampiamente studiati tra le diverse etnie in diversi tipi di cancro, come il cancro allo stomaco, cancro esofageo, testa e del collo, e il cancro della colecisti [48-60]. Tuttavia, le conclusioni sulla associazione tra il PLCE1
rs2274223 A > G polimorfismo e rischio di cancro sono controversi. L'associazione significativa è stata osservata in alcuni studi [49-52,56,58], ma non in altri [48,53-55,57,59,60]. Quattro meta-analisi sono state eseguite a rivalutare l'associazione [27-30]. Hao et al. [27] ha incluso un totale di 13 studi caso-controllo, di cui cinque studi con 5127 casi e 5791 controlli hanno esaminato il ruolo di questo SNP nel rischio di cancro gastrico. Hanno trovato associazioni statisticamente significative tra il polimorfismo rs2274223 e aumento del rischio di cancro gastrico con il modello omozigote e eterozigote modello. Questi risultati sono stati in linea con quelli di altri tre meta-analisi che comprendeva un minor numero di studi di associazione sul cancro gastrico. Per quanto riguarda il MUC1
rs4072037 T > C polimorfismo, l'associazione tra questo polimorfismo e cancro gastrico è stato convalidato tra le diverse etnie [49,53,61]. Saeki et al. [61] e Zhang et al. [49] ha rilevato che questo polimorfismo è stato associato con il cancro dello stomaco è diminuito tra gli asiatici, mentre nessuna associazione significativa è stata trovata tra i caucasici [53] .Non è stato solo una meta-analisi per MUC1
rs4072037 T > C polimorfismo [31 ], in cui sono stati inclusi un totale di 10 studi con 6580 casi di cancro gastrico e 10324 controlli. Si è constatato che il MUC1
allele rs4072037 G era significativamente associato con un rischio di cancro gastrico è diminuita (OR = 0,72, 95% CI = ,68-,77), se confrontato con l'allele.

Numerosi studi sono stati condotti per convalidare i risultati GWAS sul cancro allo stomaco. Tuttavia, nessuno degli studi copriva tutti i quattro SNP come abbiamo fatto qui, ad eccezione di uno studio condotto da Palmer et al. tra i caucasici, che ha indagato PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 e MUC1
polimorfismi rs4072037 [53]. Essi hanno scoperto che il MUC1
polimorfismo rs4072037 era associato ad una diminuzione del rischio di tipo intestinale cancro gastrico (OR = 0.4, 95% CI = 0,2-0,9); tuttavia, non sono state trovate associazioni sia con il PLCE1
rs2274223 e C20orf54
rs13042395. In questo studio, abbiamo trovato tutti questi quattro SNP sono stati associati individualmente con suscettibilità al cancro allo stomaco tra i soggetti cinesi. Abbiamo anche scoperto che 2-4 vettori genotipo rischio avevano un molto più elevato rischio di cancro allo stomaco rispetto ai 0-1 vettori. Questo fenomeno è stato più pronunciato nei soggetti più giovani, maschi, mai fumatore, quelli con elevato BMI, e soggetti con cancro allo stomaco non-cardias. Il fumo di sigaretta contiene circa 55 sostanze cancerogene che possono generare specie reattive dell'ossigeno per indurre una serie di danni al DNA. Maschio mai i fumatori costantemente esposti al fumo di sigarette può eventualmente ospitare danni al DNA che possono interagire con variazioni genetiche a portare allo sviluppo del cancro. In altre parole, l'interazione gene-ambiente può giocare un ruolo importante nel promuovere e promuovere la cancerogenesi [62]. Alto indice di massa corporea è stata riconosciuta come un fattore di rischio per il cancro dello stomaco nei paesi occidentali [4]. cancro allo stomaco Cardia è localizzato alla giunzione gastroesofagea e possono differire da tumore non-cardias sulle caratteristiche epidemiologiche e caratteristiche cliniche [16] .Pertanto, l'associazione con il cancro allo stomaco non-cardias sembrava essere la biologia plausibile.

Riassumendo, abbiamo confermato l'associazione tra quattro precedenti SNP GWAS-identificata e suscettibilità al cancro allo stomaco in questo studio caso-controllo basato ospedale. Tuttavia, diverse limitazioni nel presente studio dovrebbero essere affrontati. In primo luogo, il bias di selezione intrinseca e pregiudizi informazioni possono essere inevitabile in questo caso-controllo basato ospedale progettato studio. In secondo luogo, abbiamo incluso solo quattro SNPs in corso di studio, invece di coprire tutti i promettenti SNP GWAS-identificata. In generale, gli studi che comprende più SNP potenzialmente correlati al rischio di cancro allo stomaco possono essere più in grado di illuminare l'esatto ruolo di varianti genetiche nella carcinogenesi stomaco. Infine, a causa della natura del design studio retrospettivo, non abbiamo avuto informazioni affidabili e sufficienti per le persone su altre esposizioni ambientali, come ad esempio H
. pylori
infezione, l'esposizione alimentare, occupazione, così come la classificazione cancro allo stomaco e sottotipi, come sottotipo intestinale e diffuso. La mancanza di tutte le preziose informazioni ci ha impedito di approfondire il ruolo eziologico di questi fattori nella carcinogenesi stomaco. Nonostante queste limitazioni, i risultati del nostro studio sono stati informativo per i ricercatori e medici in questo campo. Ulteriori studi basati sulla popolazione prospettici ben progettati sono necessari per confermare ulteriormente i nostri risultati, in particolare quelli con informazioni dettagliate sui fattori di rischio per il cancro dello stomaco e grandi dimensioni del campione tra i diversi gruppi etnici.

Informazioni di supporto
S1 Dati. I dati originale
doi:. 10.1371 /journal.pone.0117576.s001
(XLS)
S1 Table. Caratteristiche dei precedenti studi focalizzati su queste quattro SNPs
doi: 10.1371. /Journal.pone.0117576.s002
(DOC)

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