PLoS ONE: asociacijų genetinių variantų į PSCA, MUC1 ir PLCE1 Genai su skrandžio vėžio imlumo Kinijos gyventojų

Anotacija

Fonas

Keletas genetinių variantų, įskaitant PSCA
rs2294008, C > T ir rs2976392 "G > A MUC1
rs4072037 T > C ir PLCE1
rs2274223 a > G parodė didelę asociaciją su skrandžio vėžio rizikos ankstesnių genomo asociacijos tyrimų (GWASs)

metodai

įvertinti jų asociacijos. SNP į Han kinų, nepriklausoma ligoninės remiantis atvejo-kontrolės tyrimas buvo atliekamas genotipo šias keturias polimorfizmas kurį 692 skrandžio vėžio atvejų ir 774 naudojant dažnio suderinimą pagal amžių ir lytį įgytų sveikų viso. Klaidingai teigiami ataskaita tikimybė (FPRP) analizė taip pat buvo atliekama siekiant patikrinti visas statistiškai reikšmingas išvadas.

Rezultatai

dabartinės tyrime buvo pastebėta visų keturių polimorfizmas reikšmingas ryšys su skrandžio vėžio jautrumą interesų. Tiksliau, didelė padidėjęs skrandžio vėžio rizika buvo susijusi su PSCA
rs2294008 (CT vs BK: koreguotas = 1.37, 95% PI = 1,07-1,74, o ct /TT vs.CC: koreguotas = 1.30 , 95% PI = 1,03-1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs vS: koreguotas = 1.30, 95% PI = 1,02-1,65, o AG /A. vs GG: koreguotas = 1.26, 95% PI = 1,00-1,59) arba PLCE1
rs2274223 (AG vs AA: koreguotas = 1.48, 95% PI = 1.15-1.90, ir AG /GG vs AA: koreguotas = 1.45, 95% PI = 1,14-1,84), atitinkamai. Priešingai, MUC1
rs4072037 buvo įrodyta, kad sumažinti vėžio riziką (KT vs TT: koreguotas = 0,77, 95% PI = 0,60-0,98). Pacientai, kurių daugiau kaip vieno rizikos genotipų turėjo reikšmingą rizikos padidėjimą plėtoti skrandžio vėžys (reguliuojamas arba = 1,30, 95% PI = 1,03-1,64), lyginant su tais, turintys 0-1 rizikos genotipai. Sluoksninė analizė parodė, kad padidėjusi rizika buvo ryškesnis jaunesnių tiriamųjų, vyrams, rūkusiųjų, rūkalių su pakuotės metų ≤ 27, pacientams, sergantiems didelio KMI, ar ne CARDIA skrandžio vėžio.

Išvados

Šis tyrimas pagrįstas tarp keturių ankstesnių pranešta genetinių variantų ir skrandžio vėžio jautrumą asociacijas nepriklausoma Han Kinijos gyventojų. Tolesni tyrimai su didesnėmis imties dydžio ir skirtingų tautybių yra tikslingas siekiant patvirtinti mūsų išvadas

nurodomoji dalis:. Saulės O, VU X VU F Li Y J. Z Chen X et al., (2015) Asociacijos genetinių variantų PSCA
MUC1 parsisiųsti ir PLCE1
Genai su skrandžio vėžio imlumo Kinijos gyventojų. PLoS ONE 10 (2): e0117576. Doi: 10,1371 /journal.pone.0117576

Akademinė redaktorius: Balraj "Mittal, Sanjay Gandhi medicinos institutas, Indija

Įstojo birželio 30, 2014 m Priimtas gruodžio 27 2014 m Paskelbta: Vasario 6, 2015

Visos teisės saugomos: © 2015 Saulės et al. Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Duomenų Prieinamumas: Visi susiję duomenys yra per popieriaus ir jo Pagalbinė informacija failus

finansavimas:. tyrimas parėmė Kinijos nacionalinės gamtos mokslo fondo (Nr 81.370.563) dotacijos ir Zhejiang provincijos programa, skirta aukšto lygio naujoviškų sveikatos talentus ir auginimo provincijos administracija tradicinės kinų medicinos, Zhejiang Province, Kinija (No.2011ZA072) ir remiamas projektas sveikatos apsaugos ministerija Kinija-pagrindinių medicinos mokslo ir technologijų projekto Zhejiang provincijoje (Nr WKJ2012-2-033) ir visuomenės gerovę technologijų taikymo Mokslinių tyrimų projektas remiamas mokslo technologijų departamento Zhejiang provincijoje (No.2012C23108) ir puikus jaunimo fondas Zhejiang provincijos gamtos mokslų (No.LR14H030001) ir projekto mokslo ir technologijų Wencheng apskrityje. Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

skrandžio vėžys yra ketvirtas dažniausiai diagnozuojama vėžio ir antroji pagrindinė priežastis, dėl vėžio susijusių mirčių visame pasaulyje, su maždaug 738.000 vėžio mirčių 2008 metais apskritai daugiau kaip 70% naujų skrandžio vėžio atvejų ir mirčių įvyksta besivystančiose šalyse, kuriose yra didžiausia sergamumo Rytų Azijoje. Ypač, maždaug 40% pasaulio skrandžio vėžio atvejų įvyko Kinijoje [1,2]. Helicobacter pylori
( O
. pylori
) infekcija yra nusistovėjęs etiologinis veiksnys skrandžio vėžio visame pasaulyje, užsikrėtusių svyruoja nuo 40% iki 80% žmonių. Be H
. pylori
infekcija, sūdyti ir nitrinti maisto vartojimas ir rūkymas taip pat buvo pranešta, kad būti susijęs su padidėjusia skrandžio vėžio rizika, o šviežių vaisių ir daržovių kiekiai yra apskaitomi kaip apsauginiai veiksniai [3]. Aukštos kūno masės indeksas (KMI) buvo taip pat pasiūlė, kaip rizikos veiksnys skrandžio vėžiui Vakarų šalyse [4], bet ne Kinijoje [5]. Nepaisant to, tik nedidelė asmenų veikiami rizikos veiksnių galiausiai sukurti skrandžio vėžiu gyvenimą [6], o tai rodo, kad genetiniai veiksniai gali vaidinti svarbų vaidmenį skrandžio vėžio patogenezėje. Iki šiol, genetinis etiologija skrandžio vėžio, pavyzdžiui, genų geno ir genų-aplinkos sąveikos, lieka neaišku.

Per pastaruosius metus, genomo asociacijos tyrimai (GWASs), didelio našumo genotipa- technologijos, turinčios buvo tvirtas įrankis naujo vėžys jautrumo lokusų ar genų atradimo visoje [7] genomą. Iki šiol, GWASs sėkmingai identifikuoti šimtai genetinių markerių, kurie yra susiję su jautrumu ligų, įskaitant skrandžio vėžio [8]. Siekėme ištirti vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) į PSCA
MUC1
, ir PLCE1
genų šiame tyrime. PSCA
genas (esantis chromosomos 8q24) koduoja prostatos kamieninių ląstelių antigeną (PSCA), baltymą, kurį sudaro 123 aminorūgščių liekanų. PSCA priklauso LY-6 /Tavo-1 šeimos ląstelių paviršiaus antigenų. Ji yra labai išreikštas įprastais prostatos ir toliau iki reguliuojama prostatos vėžio [9], o taip pat ne-prostatos navikais, įskaitant skrandžio vėžio [10]. PSCA vaidina svarbų vaidmenį ląstelių sukibimą, platinimu ir išlikimo [11]. vitro
eksperimentai parodė, kad kai kurie PSCA
variantai (pvz, rs2294008T) gali sumažėti priimančiosios geno transkripciją, keičiant savo tiekėjų fragmentas [10]. Dviejų pakopų GWAS už skrandžio vėžio atliktas tarp Japonijos ir Korėjos gyventojai įrodė, kad PSCA
rs2976392 "G > A ir rs2294008, C > T SNP gerokai padidėjo skrandžio vėžio rizika [10]. Asociacijų, PSCA
SNP su skrandžio vėžiu, taip pat buvo patvirtinta Kinijos gyventojų [12-18]. Be to, dviejų pakopų GWAS tarp Kinijos gyventojų skaičius Abnet et al. [19] neseniai nustatė dvi grupes VNP-ai ne 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) ir 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) ir jų asociacijas su skrandžio vėžio jautrumą [19]. Tuo pačiu metu, trijų pakopų GWAS kitoje Kinijos gyventojų Wang et al. [20] Taip pat pastebėta, kad asociacijos rs2274223 A > G SNP. Mucino 1 (MUC1) yra membrana-prisijungia prie baltymų, kurie gali įtvirtinti į viršūnės paviršiaus virškinimo trakto epitelyje per transmembraniniu domeno [21]. MUC1 vaidina svarbų vaidmenį gleivinės sutepimas, apsauga nuo ligų sukėlėjų, signalo perdavime, ir ląstelių ląstelių sąveikos [22,23]. Apsauginė funkcija MUC1 nuo infekcijos normaliomis epitelio ląstelių buvo patvirtinta tiek in vitro parsisiųsti ir vivo
eksperimentų [24]. Be to, PLCE1
genas koduoja fosfolipazę C. Šis baltymas produktas gali katalizuoja polyphatidylinositol 4,5-bisfosfato (PIP2) hidrolizę į dvi kritines antrojo pasiuntiniai: inozitolį 1,4,5-trisphosphate (Insl, 4, 5P3) ir 4,5-diacilglicerolio (DAG) [25], ir tokiu būdu reguliuoti ląstelių judrumą, tręšimas, ir jutimo transdukavimo [26]. Asociacijų, MUC1
rs4072037 T > C PLCE1
rs2274223 a > G su skrandžio vėžio rizika taip pat buvo pakartotas įvairiose tautybių [27-31]. Nepaisant to, nebuvo tirta bendrą poveikį visų šių keturių polimorfizmas apie skrandžio vėžio riziką.

dabartinės tyrime mes genotipą šias keturias GWAS-identifikuojami SNP ir įvertinti jų asociacijas su skrandžio vėžio ligoninėje pagrįstas atveju -control tyrimas, apimantis 692 atvejai ir 774 vėžiu nemokamai kontrolę.

metodai

tiriamojoje populiacijoje

atvejo-kontrolės tyrime dalyvavo 692 genetiškai nesusijusių etninių Han kinų pacientams ir 774 vėžio nemokamai kontrolė. Visi atvejai buvo naujai diagnozuota ir histopathologically patvirtino pirminius skrandžio vėžiu sergantiems pacientams, parinkti iš Gastroenterologijos skyriaus pirmasis filialas ligoninės Wenzhou medicinos universiteto nuo 2010 sausio ir rugsėjo 2013 Sergančiųjų interstitialoma, Metastazė vėžį iš kitų organų ir pasikartojančių navikų buvo atmesti. Visi kontrolė buvo atsitiktinai atrinkti iš ligoninės lankytojų, kurie lydi pacientus į ligoninę, bet ne ieškančioms medicininės priežiūros tuo pačiu laikotarpiu, genetiškai nesusijusių su mokosi atvejų dalykų. Jie buvo dažnis atitiko atvejams pagal amžių (± per 5 metus) ir lytį. Per tyrimo dalyvių įdarbinimo, kiekvienas dalyvis buvo planuojama interviu su apmokyti Interviuotojas po parašyta informuotas sutikimas buvo pasirašyta. Demografiniai duomenys ir poveikio aplinkai istorija buvo surinkti, pavyzdžiui, amžiaus, lyties, tautybės, rūkymo istorija, alkoholio vartojimo ir šeimos istorijos vėžio. Kiekvienas dalyvis paaukoti maždaug 5 ml kraujo, iš kurių 2 ml buvo naudojamas genomo DNR ekstrakcijai. Atsako dažnis buvo maždaug 95% skrandžio vėžio dalykų ir 92% už kontrolę. Šis tyrimas buvo patvirtintas klinikinių tyrimų etikos komiteto Wenzhou medicinos universiteto, ir visi dalyviai pateikė rašytinį informuoto sutikimo dėl dovanoti savo biologinius mėginius. Niekada rūkaliams nurodyta mažesnė nei 100 cigarečių visas gyvenimas. Tie, kurie gėrė alkoholinius gėrimus bent kartą per savaitę vienerius metus arba daugiau, arba reguliariai buvo apibrėžiamas kaip girdyklas.

genotipo

Genomo DNR buvo išskirta ir apdorojimo, kaip aprašyta anksčiau [32]. Mes priėmė TaqMan realaus laiko PGR metodas genotipo pasirinktus keturis SNP atvejais ir kontrolės, naudojant 7900 HT seka detektoriaus sistemą (taikoma BIOSYSTEMS). Aštuoni teigiami kontrolės ir aštuoni neigiami kontroliniai mėginiai buvo įtraukta į kiekvieną 384 šulinėlių plokštelės užtikrinti genotipo rezultatų tikslumą. Mes taip pat ne kartą genotipą 10% mėginių, o rezultatai buvo 100% Współbrzmieniowy.

Statistinė analizė

χ ^{2 bandymas buvo apskaičiuojamas įvertinti, padaryti alelio skirstinių skirtumai ir genotipas dažniai, taip pat demografinių tarp atvejų ir kontrolės. Gėris-of-Fit χ 2 bandymas buvo naudojama patikrinti Hardy-Weinberg pusiausvyrą (HWE) Atsižvelgiant kontrolės. Neapdorotos ir pritaikytas šansai santykis (AR) ir jų atitinkami 95% patikimumo intervaluose (CIS) buvo apskaičiuojamas Vienaveiksnės ir daugiamatis logistinės regresijos modelių, atitinkamai. Mes taip pat atliekamas stratifikacija analizuoja pagal amžių, lytį, rūkymas /gėrimas statusą, pakuotės metų, KMI, auglio vietą ir TNM etape. Mes taip pat atliekami klaidingai teigiami ataskaita tikimybė (FPRP) analizė visoms statistiškai reikšmingų išvadų [33]. Trumpai tariant, mes iš anksto yra FPRP ribą 0,2 ir išankstinio tikimybę 0,1 už tam tikrą ryšį tarp pasirinktos SNP ir skrandžio vėžio riziką. Statistiniai galia buvo apskaičiuojamas aptikti 1,50 /0,67 arba alelių su rizikos /apsauginį poveikį. Asociacija su FPRP vertės < 0,2 buvo paskelbta svarbiame [34]. Visi statistiniai duomenys buvo atlikta naudojant SAS programinę įrangą (versija 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Visi statistiniai testai buvo dvipusiai, ir P
< 0,05 buvo laikomas statistinis reikšmingas}

Rezultatai

Studijų dalykai

demografinės charakteristikos. su 692 skrandžio vėžio atvejų ir 774 patikrinimai buvo apibendrinti 1 lentelėje nebuvo jokių reikšmingų lyčių skirtumų tarp atvejų ir kontrolės ( P
= 0,944). Tačiau kontrolė yra labiau tikėtina, kad rūkaliai ( P
< 0,0001) ir girdyklas ( P
= 0,0006), palyginti su pacientais. Bylos buvo labiau linkę turėti maistinių medžiagų trūkumus ir sumažinti KMI ( P
< 0,0001). Todėl, rūkymas statusą, PACK-metų, geriamojo statusą ir KMI buvo pakoreguota ir vėlesnis daugiamatis logistinės regresijos analizę. Tarp visų atvejų, 199 (28,76%) buvo CARDIA vėžiu ir 493 (71,24%) buvo ne CARDIA vėžį. Be to, skrandžio adenokarcinoma buvo pastatytas pagal TNM į 7 ^{-asis leidimas iš AJCC [35]. Kaip rezultatas, 274 atvejai (39,60%) buvo paskirtas I TNM stadija arba II ligų, o 418 (60,40%) pristatė su TNM etape III ar IV ligas.}

asociacija tarp pasirinktų VNP-ai ir skrandžio vėžio jautrumą

genotipas skirstiniai keturių pasirinktų VNP-ai visų dalykų buvo parodyta 2 lentelėje visos nustatytos genotipas paskirstymo kontrole buvo susitarusi su HWE ( p
= 0,105 už rs2294008, p
= 0,130 už rs2976392 p
= 0,155 už rs2274223, ir p
= 0,735 už rs4072037).

Kaip nurodyta 2 lentelėje, visi šie keturi pasirinkti polimorfizmas buvo susijęs su skrandžio vėžio jautrumą. Kai PSCA
rs2294008 CK genotipas buvo naudojamas kaip nuoroda, CT genotipo ir CT ir TT genotipų buvo susijusios su padidėjusia skrandžio vėžio rizika (Pritaikytas arba = 1,37, 95% PI = 1.07-1.74 kartu CT ir reguliuojamas arba = 1.30; 95% PI = 1,03-1,63 CT /TT). Panaši asociacija su skrandžio vėžio rizika taip pat buvo nustatyta, kad PSCA
rs2976392 "G >, A polimorfizmo (AG vs GG: pakoreguotas arba = 1,30, 95% PI = 1.02-1.65, ir AG /AA vs VS : koreguotas = 1.26; 95% PI = 1,00-1,59). Be to, PLCE1
rs2274223 a > buvo rastas G polimorfizmo gerokai padidinti skrandžio vėžio riziką pagal homozigotiniu modelis (AG vs AA: pakoreguotas arba = 1,48, 95% PI = 1.15-1.90) ir dominuojančia modelį (AG /vS vs A.: koreguotas = 1.45, 95% PI = 1,14-1,84). Priešingai, MUC1
rs4072037 T > C polimorfizmas buvo įrodyta, kad žymiai sumažėjo skrandžio vėžio jautrumą pagal homozigotiniu modelio (KT vs TT: pakoreguotas arba = 0,77, 95% PI = 0.60-0.98). Be to, mes nustatėme, kad dalykai, kurių 2-4 rizikos genotipų (nurodytas CT /Audi TT rs2294008 C >rizikos genotipą; T, AG /AA rs2976392 G > A, AG /GG už rs2274223 a > G ir TT už rs4072037 T >C polimorfizmas) turėjo reikšmingą rizikos padidėjimą (Pritaikytas arba = 1,30, 95% PI = 1.03-1.64), kai, palyginti su tais, tik su 0-1 rizikos genotipų

stratifikacija analizė

asociacija. tarp variantas genotipų ir skrandžio vėžio rizika buvo toliau vertinami stratifikacijos analizės pagal amžių, lytį, rūkymą, pakuotės metų, geriamo statusą, ir KMI pagal dominuojančia genetinio modelio (3 lentelė). Mes nustatėme, kad PSCA
rs2294008 ct /TT genotipai buvo susijęs su padidėjusia skrandžio vėžio rizikos jaunesnėms dalykų, šviesos rūkalių, ir asmenims, kurių ne CARDIA vėžiu, palyginti su atitinkamų referencinių grupių. Atsižvelgiant į PLCE1
rs2274223 a > G polimorfizmo, stratifikacija analizuoja pastebėtas padidėjęs skrandžio vėžio rizika su AG /GG genotipų jaunesnių dalyvių, moterims, niekada rūkymo niekada girdyklas, dalyviai su dideliu KMI, ir tiriamųjų, kurių Cardia vėžys arba TNM stadija III + IV ligos. Nors rizikos genotipai buvo sujungti, mes nustatėme, kad dalykai, kurių 2-4 rizikos genotipų buvo labiau linkę plėtoti skrandžio vėžio tarp jaunų pogrupyje, vyrų, rūkusiųjų ar pogrupiai su dideliu KMI ir dalykai, kurių ne CARDIA vėžio, nei kiekvienos atitinkamos pogrupio kolegos su 0-1 rizikos genotipo. Tolimesni heterogeniškumas testai sluoksniuotoji analizė neaptiko jokio skirtumo tarp pogrupių skirtingų bendraautorių variates, pavyzdžiui, amžių, lytį, ir rūkymą. Be to, nebuvo statistiniai įrodymai sąveikos tarp šių pasirinktų VNP-ai ir bendradarbių variates (amžius, lytis, KMI ir tt), arba.

FPRP vertes visoms statistiškai reikšmingas rezultatas rodomi 4 lentelėje Neteisingų -positive ataskaita tikimybė vertės asociacijų tarp skrandžio vėžio rizikos ir genotipų pasirinktų genų dažnį. 4, su iš anksto nustatytu išankstinio tikimybės 0,1 ir FPRP riba 0,2. FPRP analizė parodė, kad reikšmingas ryšys tarp PSCA pervežimas rs2294008 C > T ir skrandžio vėžio rizika buvo pažymėti pagal homozigotiniu modelį. Be to, asociacija taip pat buvo verti dėmesio dėl jaunesnių tiriamųjų ir tiems, kurie ne Cardia. Be to, reikšmingas ryšys su PLCE1
rs2274223 G > buvo pažymėtini visų dalykų, taip pat jaunesnių tiriamųjų niekada rūkančiųjų niekada girdyklas, turinčių KMI > 24,0, Cardia vėžys arba TNM stadija III + IV ligos. FPRP taip pat patvirtino reikšmingą asociacijos PSCA
rs2976392 "G > A po homozigotinių ir dominuojančių modelių ir reikšmingas ryšys su MUC1
rs4072037 T > C temperatūroje homozigotiniu modelį. Kaip Kombinuotąją genotipų, mes patvirtino reikšmingą asociacija dalykų, kurių pakuotės metų ≤27 ar ne CARDIA vėžio. Santykinai didesnį FPRP vertės reikšmingų asociacijų tarp pasirinktų polimorfizmas ir skrandžio vėžio rizika, kuri gali būti priskirta prie santykinio mažos imties šio tyrimo taip pat nedidelį poveikį pasirinktų VNP-ai poilsio nerasta. Šios išvados reikia daugiau suderinimą tyrimus su didele imties dydis.

Diskusijos

dabartinės ligoninių atvejo-kontrolės tyrimo, mes ištirti galimą asociacijas PSCA
rs2294008 C > T ir rs2976392 G > a PLCE1
rs2274223 a > G ir MUC1
rs4072037 T > C polimorfizmas su skrandžio vėžio jautrumą tarp Kinijos gyventojų. Mes nustatėme, kad PSCA
rs2294008 ct /TT PSCA
rs2976392 AG /AA ir PLCE1
rs2274223 AG /GG genotipai buvo susijęs su žymiai padidėjusia skrandžio vėžio rizika A Kinijos gyventojų, tuo tarpu, MUC1
rs4072037 T > C buvo susiję su sumažėjusiu skrandžio vėžio jautrumą. Mes taip pat nustatė, kad subjektai, vežantys 2-4 rizikos genotipai turėjo Ryžtingai padidėjęs skrandžio vėžio riziką, palyginti su tų atlikti 0-1 rizikos genotipą. Mišrių rizikos genotipų vėžio rizikos poveikis buvo labiau akivaizdu, jaunesnių, vyrai, rūkusiųjų, temos su dideliu KMI ir ne CARDIA skrandžio vėžio. Šie rezultatai rodo, kad pasirinktos SNP iš GWASs gali prisidėti prie skrandžio kancerogenezėje.

Iki šiol, keturių GWASs ištyrė skrandžio vėžio rizika [10,16,19,20], kaip minėta įvade, dėl kurių nebuvo įvykdyta išvada iš keturių VNP-ai interesų. PSCA
rs2294008, C > T rezultatai RER /THR keitimą, ir PSCA
rs2976392 "G >, A gali pakeisti transkripcijos faktorius jungimosi vieta aktyvumą genų [10]. Be to, MUC1
rs4072037 T > C gali sukelti sandūrų pakeitimo, o PLCE1
rs2274223 a > G gali sukelti Arg-į-Jo pokyčius, kurie buvo žymiai susijęs su rizika skrandžio vėžio į pradinį skenavimo etapą [19]. Nors skenavimo ir tvirtinimo etapai buvo sujungti A genomo asociacija buvo pastebėtas tik PLCE1
rs2274223 a > G polimorfizmo, bet ne MUC1
rs4072037 T > C polimorfizmas [19]. Tuo pačiu metu, Wang ir kt. taip pat rado rs2274223 polimorfizmas buvo susijęs su skrandžio CARDIA adenokarcinoma ( P
= 1.74 × 10 ^{-39) [20]. Neseniai GWAS Shi et al. [16] patvirtino anksčiau pranešė asociacijas ne CARDIA skrandžio vėžio jautrumą su ne tik PSCA
rs2294008 ir rs2976392, bet ir MUC1
rs4072037.}

iš ankstesnių GWASs buvo plačiai patvirtintas tarp skirtingų etninių gyventojų per pastaruosius metus (S1 lentelė). Pavyzdžiui, Wu et al. [18] nurodė, kad tarp PSCA
rs2294008 ir skrandžio vėžio asociacija buvo ryškesni tarp pacientų, kuriems ne CARDIA skrandžio vėžio, negu su Cardia skrandžio vėžio. Reikšmingas asociacija taip pat buvo patvirtinti atliktų tarp skirtingų etninių grupių visame pasaulyje [14-17,19,36-40] studijas. Tačiau tarp rs2294008 C >asociacijas; T ir skrandžio vėžio buvo nepatvirtina kiti [12,41]. Norėdami išspręsti šią kontroversiją, šeši metaanalizės buvo atliktas siekiant įvertinti ryšį tarp PSCA
polimorfizmas ir skrandžio vėžio jautrumą [42-47] santykius. Qiao ir kt. [42] įtrauktos aštuonios atvejo-kontrolės tyrimai iš septynių straipsnių ir nustatė, kad rs2294008 T alelio ir rs2976392 A alelio buvo reikšmingai susijęs su padidėjusia skrandžio vėžio riziką. Šie duomenys taip pat buvo patvirtinta kita metaanalizė [43-46]. Visai neseniai, prieiti prie šių dviejų plačiai ištirtų PSCA
VNP-ai įmokas skrandžio vėžio jautrumą, Gu et al., [47] atliko metaanalizę 16 tyrimų su 18,820 atvejais ir 35,756 kontrolės iš viso. Bendrus ARBA buvo 1,46 (95% PI = 1,30-1,69) už PSCA
rs2294008 ir 1,49 (95% PI = 1,22-1,82) už rs2976392 polimorfizmas. Be to, po to, kai atrado Abnet et al. [19] ir Wang ir kt. [23], PLCE1
rs2274223 polimorfizmas buvo plačiai ištirtas tarp skirtingų etninių grupių iš įvairių vėžio, pavyzdžiui, skrandžio vėžio, stemplės vėžio, galvos ir kaklo vėžio, ir tulžies pūslės vėžiu [48-60]. Tačiau dėl tarp PLCE1
rs2274223 a >asociacijos išvados; G polimorfizmo ir vėžio rizika yra prieštaringas. Reikšmingas asociacija buvo pastebėtas kai kurių tyrimų [49-52,56,58], bet ne kitiems [48,53-55,57,59,60]. Keturi metaanalizės buvo atliekami iš naujo įvertinti asociaciją [27-30]. Hao ir kt. [27] buvo įtraukta 13 atvejo-kontrolės tyrimų, iš kurių penki tyrimai su 5127 atvejų ir 5791 kontrolę patikrintų šio SNP vaidmenį skrandžio vėžio rizika iš viso. Jie nustatė statistiškai reikšmingą ryšį tarp rs2274223 polimorfizmo ir padidėjusio skrandžio vėžio rizikai padengti pagal homozigotiniu modelio ir heterozigotinės modelį. Šie rezultatai buvo tokie patys kaip ir kitų trijų metaanalizes kad įtrauktų mažiau asociacijos tyrimus skrandžio vėžio. Kalbant MUC1
rs4072037 T > C polimorfizmas, tarp šio polimorfizmo ir skrandžio vėžio asociacija buvo patvirtintas tarp skirtingų etninių grupių [49,53,61]. Saeki ir kt. [61] ir Zhang et al. [49] nustatyta, kad šis polimorfizmas buvo susijęs su sumažėjusiu skrandžio vėžio tarp azijiečių, o ne reikšmingas ryšys buvo rastas tarp baltaodžių [53] .Yra tik vienas metaanalizė už MUC1 pervežimas rs4072037 T > C polimorfizmo [31 ], kuriame buvo įtraukti iš 10 tyrimų bendras su 6580 skrandžio vėžio atvejų ir 10324 kontrolės. Buvo nustatyta, kad MUC1
rs4072037 G alelis buvo reikšmingai susijęs su sumažėjusiu skrandžio vėžio rizika (arba = 0,72, 95% PI = 0,68-0,77), lyginant su A alelio.

Daugybė tyrimų buvo atlikta patvirtinti GWAS išvadas dėl skrandžio vėžio. Nepaisant to, nė vienas iš tyrimų, kuriems visų keturių VNP-ai, kaip mes čia padarė, išskyrus vieną tyrimo, kurį atliko Palmeris et al. tarp baltųjų, kuri tirtų PLCE1
rs2274223 C20orf54
rs13042395 ir MUC1
rs4072037 polimorfizmas [53]. Jie nustatė, kad MUC1
rs4072037 polimorfizmas buvo susijęs su sumažėjusiu rizika žarnyno tipo skrandžio vėžio (OR = 0,4, 95% PI = 0,2-0,9); Tačiau jokių asociacijų buvo rasta tiek PLCE1
rs2274223 ir C20orf54
rs13042395. Atsižvelgiant į dabartinę studijų, mes nustatėme, visų šių keturių VNP-ai buvo konkrečiai susijęs su skrandžio vėžio jautrumą tarp Kinijos dalykų. Mes taip pat nustatė, kad 2-4 rizikos genotipas vežėjai turėjo daug didesnę skrandžio vėžio riziką nei 0-1 vežėjams. Šis reiškinys buvo ryškesnis jaunesnių tiriamųjų, vyrų, Ever rūkalius, turintiems aukštą KMI ir dalykų su ne CARDIA skrandžio vėžio. Cigarečių dūmuose yra apie 55 kancerogenų, kurie gali generuoti reaktyvių deguonies sužadinti DNR žalą įvairovė. Vyras rūkusiųjų nuosekliai veikiami cigarečių dūmai galbūt uosto DNR žalą, kuri gali sąveikauti su genetiniais variantų sukelti vėžio vystymąsi. Kitaip tariant, genų-aplinkos sąveika gali vaidina svarbų vaidmenį inicijuojant ir skatinant kancerogenezės [62]. Aukštos KMI buvo pripažinta kaip rizikos veiksnys skrandžio vėžiui Vakarų šalyse [4]. Cardia skrandžio vėžys yra lokalizuotas į gastroezofaginio sankryžos ir gali skirtis nuo ne CARDIA vėžiu dėl epidemiologinių charakteristikas ir klinikiniais požymiais [16] .Todėl, asociacija su ne CARDIA skrandžio vėžio pasirodė biologija patikimas.

santrauka, mes patvirtino tarp keturių ankstesnių GWAS-atpažįstamose VNP-ai ir skrandžio vėžio jautrumą asociacijas šiame ligoninių atvejo-kontrolės tyrimas. Tačiau reikėtų atkreipti dėmesį į keletą apribojimai šiame tyrime. Pirma, būdingas atrankos paklaida ir informacija šališkumo gali būti neišvengiama šiame ligoninių atvejo-kontrolės, skirtas tyrimą. Antra, mes tik įtraukti keturis SNP dabartinio tyrimo, o ne apimanti visus perspektyvius GWAS-identifikuojami SNP. Apskritai, tyrimai, apimantys daugiau SNP, greičiausiai susijusių su skrandžio vėžio rizika gali būti pajėgesnė apšviesti tikslią vaidmenį genetinių variantų skrandžio kancerogenezėje. Galiausiai, dėl retrospektyvinio tyrimo dizainas pobūdžio, mes neturėjome patikimą ir pakankamą informaciją asmenims apie kitų aplinkos poveikiui, pavyzdžiui, H
. pylori
infekcija, su maistu, žmonių poveikis, taip pat skrandžio vėžys klasifikacija ir potipių, pavyzdžiui, žarnyno ir difuzinio potipio. Trūksta visų vertingos informacijos mums sutrukdė toliau tirti etiologinėms vaidmenis šių veiksnių skrandyje kancerogenezėje. Nepaisant šių trūkumų, išvados iš mūsų tyrime buvo informatyvus mokslininkų ir gydytojų šioje srityje. Papildomos gerai suprojektuoti numatomi gyventojų pagrindu tyrimai siekiant toliau patvirtina savo išvadas, ypač su išsamia informacija apie rizikos veiksnius skrandžio vėžio ir didelio imties dydis, įskaitant įvairių etninių grupių.

Parama Informacija
S1 duomenys. Duomenų originalų
Doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001
(xls)
S1 lentelė. Charakteristikos ankstesniuose tyrimuose sutelktas į šių keturių VNP-ai
Doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s002
(DOC)

• PLoS ONE: krypsta teisinga linkme-solution paketo endoskopinių gleivine tunelinio rezekcija Europos Sąjungos oficialiajame Stomach
• PLoS ONE: Skrandis Virtualus neišplėstinį CT antros kartos, Dual-energijos CT: priimti prejudicinį Study