PLoS ONE: Sammenslutninger af genetiske varianter i PSCA, MUC1 og PLCE1 Gener med mavekræft Følsomhed i en kinesisk Befolkning

Abstrakt

Baggrund

Flere genetiske varianter, herunder PSCA
rs2294008 C > T og rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, og PLCE1
rs2274223 A > G har vist signifikant sammenhæng med mavekræft risiko i de tidligere genom-dækkende forening undersøgelser (GWASs)

Metoder

for at evaluere sammenslutninger af disse. SNP'er i Han-kinesere, blev et selvstændigt hospital baseret case-kontrol undersøgelse udført af genotype disse fire polymorfier i alt 692 mave kræfttilfælde og 774 raske kontrolpersoner erhvervet ved hjælp af frekvens matching for alder og køn. Falsk-positive rapport sandsynlighed (FPRP) analyse blev også udført for at validere alle statistisk signifikante fund.

Resultater

I den aktuelle undersøgelse blev signifikant sammenhæng med mavekræft modtagelighed observeret for alle de fire polymorfier af interesse. Specifikt blev en signifikant øget mavekræft risiko forbundet med PSCA
rs2294008 (CT vs CC: justeret OR = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74, og CT /TT vs.CC: justeret OR = 1,30 , 95% CI = 1,03-1,63), PSCA
rs2976392 (AG vs. GG: justeret OR = 1,30, 95% CI = 1,02-1,65, og AG /AA vs. GG: justeret OR = 1,26, 95% CI = 1,00-1,59), eller PLCE1
rs2274223 (AG vs. AA: justeret OR = 1,48, 95% CI = 1,15-1,90, og AG /GG vs AA: justeret OR = 1,45, 95% CI = 1,14-1,84), hhv. I modsætning hertil MUC1
rs4072037 viste sig at sænke kræftrisikoen (CT vs TT: justeret OR = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). Patienter med flere risici genotyper havde signifikant øget risiko for at udvikle mavekræft (justeret OR = 1,30, 95% CI = 1,03-1,64), sammenlignet med dem, der har 0-1 risikofaktorer genotyper. Stratificeret analyse viste, at den øgede risiko var mere udtalt hos yngre forsøgspersoner, mænd, nogensinde rygere, rygere med pack år ≤ 27, patienter med højt BMI, eller ikke-Cardia mavekræft.

Konklusioner

Denne undersøgelse dokumenteret sammenhængen mellem fire tidligere rapporteret genetiske varianter og mavekræft modtagelighed i et selvstændigt Han kinesiske befolkning. Yderligere undersøgelser med større prøve størrelse og forskellige etniske grupper er berettiget til at validere vores resultater

Henvisning:. Sun H, Wu X, Wu F, Li Y, Yu Z, Chen X, et al. (2015) Sammenslutninger af genetiske varianter i PSCA
, MUC1
og PLCE1
Gener med mavekræft Følsomhed i en kinesisk Befolkning. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10,1371 /journal.pone.0117576

Academic Redaktør: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, INDIEN

Modtaget: Juni 30, 2014, Accepteret: December 27, 2014; Publiceret: 6 feb 2015

Copyright: © 2015 Sun et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Data Tilgængelighed: Alle relevante data er inden for papir og dens støtte Information filer

Finansiering:. undersøgelsen blev støttet af China National Natural Science Foundation (nr 81.370.563) tilskud og Zhejiang Provincial Program til dyrkning af højt niveau Innovative Health talenter og en Provincial Administration af traditionel kinesisk medicin i Zhejiang-provinsen, Kina (No.2011ZA072) og projekt støttet af Sundhedsministeriet i Kina-den største medicin for videnskab og teknologi projekt i Zhejiang-provinsen (nr WKJ2012-2-033) og Public velfærdsteknologi ansøgning forskningsprojekt støttet af videnskab teknologi afdeling af Zhejiang-provinsen (No.2012C23108) og Excellent Youth Foundation of Zhejiang Provincial Natural Science (No.LR14H030001) og projekt for videnskab og teknologi i Wencheng amt. De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

mavekræft er den fjerde hyppigst diagnosticeret kræft og den anden førende årsag til kræft dødsfald på verdensplan, med cirka 738 tusind kræft dødsfald i 2008. Generelt, mere end 70% af nye tilfælde mavekræft og dødsfald forekomme i udviklingslandene, med højeste forekomst i Østasien. Især har ca. 40% af verdens tilfælde mavekræft forekom i Kina [1,2]. Helicobacter pylori
( H
. pylori
) infektion er veletableret ætiologisk faktor for mavekræft hele verden, med infektion spænder fra 40% til 80% hos mennesker. Udover den H
. pylori
infektion, saltet og nitrerede fødevarer forbrug, og cigaretrygning er også blevet rapporteret at være forbundet med øget risiko mavekræft, mens frisk frugt og grøntsager indtag indregnes som beskyttende faktorer [3]. Høj body mass index (BMI) er også blevet foreslået som en risikofaktor for mavekræft i vestlige lande [4], men ikke i Kina [5]. Alligevel er det kun en lille brøkdel af personer udsat for risikofaktorer tiden udvikle mavekræft i levetiden [6], hvilket tyder på, at genetiske faktorer kan spille en vigtig rolle i patogenesen af ​​mavekræft. Til dato, genetisk ætiologi mavekræft, såsom gen-gen, og gen-miljø interaktioner, forbliver uklart.

Over de seneste år, genom-dækkende forening undersøgelser (GWASs), høje gennemløb genotype teknologier, har været et robust værktøj i opdagelsen af ​​hidtil ukendte cancer modtagelighed loci eller gener i hele genomet [7]. Indtil videre har GWASs held identificerede hundredvis af genetiske markører, der er relateret til modtagelighed for sygdomme, herunder mavekræft [8]. Vi havde til formål at undersøge enkelt-nukleotid polymorfier (SNP) i PSCA
, MUC1
og PLCE1
gener i denne undersøgelse. PSCA
genet (lokaliseret på kromosom 8q24) koder for et prostatastamcellekultur antigen (PSCA), et protein sammensat af 123 aminosyrerester. PSCA tilhører LY-6 /Thy-1-familien af ​​celleoverfladeantigener. Det er stærkt udtrykt i normal prostata og yderligere opreguleret i prostatacancer [9], såvel som ikke-prostata-maligniteter herunder gastrisk cancer [10]. PSCA spiller en kritisk rolle i celleadhæsion, proliferation og overlevelse [11]. In vitro Salg forsøg indikerede, at nogle PSCA Salg varianter (fx rs2294008T) kan nedsætte transkriptionen af ​​værtsgenet ved at modulere dens opstrøms fragment [10]. En to-trins GWAS for mavekræft foretaget blandt japanske og koreanske populationer viste, at PSCA
rs2976392 G > A og rs2294008 C > T SNPs signifikant øget mavekræft risiko [10]. De sammenslutninger af PSCA
SNPs med mavekræft blev også bekræftet i kinesiske befolkning [12-18]. Desuden er en to-trins GWAS blandt en kinesisk befolkning ved Abnet et al. [19] for nylig identificeret to klynger af SNPs på 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) og 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) og deres foreninger med mavekræft modtagelighed [19]. Samtidig en tre-trins GWAS i en anden kinesiske befolkning af Wang et al. [20] også observeret foreningen med rs2274223 A > G SNP. Mucin 1 (MUC1) er et membranbundet protein, som kan forankre til den apikale overflade af gastrointestinal epitel gennem et transmembrant domæne [21]. MUC1 spiller en vigtig rolle i mucosal smøring, beskyttelse mod patogener, signaltransduktion, og celle-celle-interaktion [22,23]. Den beskyttende funktion af MUC1 mod infektion i normale epitelceller blev bekræftet af både in vitro
og in vivo
eksperimenter [24]. Derudover PLCE1
gen koder phospholipase C. Dette proteinprodukt kan katalysere hydrolysen af ​​polyphatidylinositol 4,5-bisphosphat (PIP2) i to kritiske second messengers: inositol 1,4,5-trisphosphat (Insl, 4, 5P3) og 4,5-diacylglycerol (DAG) [25], og dermed regulere celle motilitet, gødskning, og sensorisk transduktion [26]. De sammenslutninger af MUC1
rs4072037 T > C og PLCE1
rs2274223 A > G med risiko mavekræft er også blevet gentaget i forskellige etniske grupper [27-31]. Ikke desto mindre har den kombinerede effekt af alle disse fire polymorfier på risiko mavekræft ikke blevet undersøgt.

I den aktuelle undersøgelse, vi genotype disse fire GWAS-identificeret SNPs og vurderet deres foreninger med mavekræft på et hospital baseret sag -styring undersøgelse, bestående af 692 tilfælde og 774 kræft-fri kontrol.

Metoder

studiepopulation

Denne case-kontrol undersøgelse omfattede 692 genetisk ubeslægtede etniske Han kinesiske patienter og 774 kræft-fri kontroller. Alle sager blev nydiagnosticerede og histopatologisk bekræftede primære mave kræftpatienter, rekrutteret fra Institut for Gastroenterology, First Affiliated Hospital i Wenzhou Medical University mellem januar 2010 og september 2013. Patienter med interstitialoma, spredt kræft fra andre organer og tilbagevendende tumorer blev udelukket. Alle kontroller blev tilfældigt udvalgt fra hospital besøgende, der ledsagede patienter til hospitalet, men ikke søger for lægehjælp på samme tid periode, er genetisk relateret til de tilmeldte case fag. De var frekvens matchet til de sager, alder (± inden for 5 år) og køn. Under ansættelsen af ​​forskningsresultater deltagere, blev hver deltager planlagt til et interview med uddannede interviewere efter en skriftligt informeret samtykke blev underskrevet. Demografiske data og eksponering historie miljøet blev indsamlet, såsom alder, køn, etnicitet, rygevaner, alkoholforbrug og familie historie af kræft. Hver deltager doneret ca. 5 ml blod, hvoraf 2 ml blev anvendt til genomisk DNA ekstraktion. Svarprocenten var ca. 95% for mavekræft fag og 92% for kontrol. Denne undersøgelse blev godkendt af Clinical Research etiske komité Wenzhou Medical University, og alle deltagere gav en skriftligt informeret samtykke til at donere deres biologiske prøver. Aldrig rygere henvist til mindre end 100 cigaretter alt liv. De, der drak alkohol mindst en gang om ugen i et år eller mere eller regelmæssigt blev defineret som drikkende.

Genotypning

Genomisk DNA blev ekstraheret og behandlet som tidligere beskrevet [32]. Vi vedtog Taqman real time PCR metode til genotype de udvalgte fire SNPs i cases og kontroller ved hjælp af en 7900 HT sekvens detektor-system (Applied Biosystems). Otte positive kontroller og otte negative kontroller blev indbefattet i hver brønd plade 384 for at sikre nøjagtigheden af ​​genotypebestemmelse resultater. Vi har også gentagne gange genotype 10% af prøverne, og resultaterne var 100% overensstemmende.

Statistisk analyse

χ ^{2 test blev beregnet til at vurdere forskellene i fordelingen af ​​allel og genotypefrekvenser samt demografiske mellem cases og kontroller. Godhed-of-fit χ 2 test blev anvendt til at teste Hardy-Weinberg ligevægt (HWE) i kontrollerne. Rå og justerede odds ratio (OR) og deres tilsvarende 95% konfidensintervaller (CIS) blev beregnet ved univariate og multivariate logistiske regressionsmodeller, hhv. Vi yderligere udført lagdeling analyser af alder, køn, rygning /drikke status, pack-år, BMI, tumor websted og TNM stadie. Vi udførte også falsk-positive rapport sandsynlighed (FPRP) analyse for alle statistisk signifikante fund [33]. Kort fortalt forudindstillet vi en FPRP tærskel på 0,2 og en forudgående sandsynlighed på 0,1 for en given forbindelse mellem udvalgte SNP og mavekræft risiko. Statistisk magt blev beregnet til påvisning af en OR på 1,50 /0,67 for alleler med en risiko /beskyttende virkning. Foreningen med FPRP værdi < 0,2 blev erklæret som bemærkelsesværdigt [34]. Al statistik blev udført ved anvendelse af SAS-software (version 9.1, SAS Institute, Cary, NC). Alle statistiske tests var to-sidet, og P
< 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant}

Resultater

forsøgspersoner

De demografiske karakteristika. de 692 mave kræfttilfælde og 774 kontrolpersoner blev opsummeret i tabel 1. Der var ingen signifikant køn forskellige mellem cases og kontroller ( P
= 0,944). Men kontrollerne var mere tilbøjelige til at være rygere ( P
< 0,0001) og drikker ( P
= 0,0006) sammenlignet med patienterne. Sagerne var mere tilbøjelige til at have mangel på næringsstoffer og lavere BMI ( P
< 0,0001). Derfor blev rygestatus, pakke-år, drikker status og BMI korrigeret for i den efterfølgende multivariat logistisk regressionsanalyse. Blandt alle tilfælde, 199 (28,76%) havde Cardia kræft og 493 (71,24%) havde ikke Cardia kræft. Desuden blev mavekræft iscenesat ifølge TNM i 7 ^{th Edition af AJCC [35]. Som følge heraf blev 274 sager (39,60%) er udpeget som TNM stadie I eller II-sygdomme, mens 418 (60,40%), præsenteret med TNM stadie III eller IV sygdom.}

associering mellem udvalgte SNP'er og mavekræft modtagelighed

genotypen fordelinger af de fire udvalgte SNPs i alle fag blev vist i tabel 2. alle de observerede genotype distributioner i kontroller var enige med HWE ( P
= 0,105 for rs2294008, P
= 0,130 for rs2976392, P
= 0,155 for rs2274223, og P
= 0,735 for rs4072037).

Som angivet i tabel 2, alle disse fire udvalgte polymorfier var forbundet med mavekræft modtagelighed. Når PSCA
rs2294008 CC genotype blev anvendt som reference, CT genotype og en kombination af CT og TT genotyper var forbundet med en øget risiko mavekræft (justeret OR = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74 for CT, og justeret OR = 1,30; 95% CI = 1,03-1,63 for CT /TT). En lignende sammenhæng med risiko mavekræft blev også fundet for PSCA
rs2976392 G > En polymorfi (AG vs. GG: justeret OR = 1,30, 95% CI = 1,02-1,65, og AG /AA vs. GG : justeret OR = 1,26; 95% CI = 1,00-1,59). Desuden PLCE1
rs2274223 A > G polymorfi viste sig at øge mavekræft risici efter homozygot model (AG vs. AA: justeret OR = 1,48, 95% CI = 1,15-1,90), og dominerende model (AG /GG vs AA: justeret OR = 1,45, 95% CI = 1,14-1,84). I modsætning hertil MUC1
rs4072037 T > C polymorfi blev vist signifikant nedsat mavekræft modtagelighed under homozygot model (CT vs TT: justeret OR = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). Desuden fandt vi, at patienter med 2-4 risikofaktorer genotyper (risikoen genotypen henvist til CT /TT for rs2294008 C > T, AG /AA for rs2976392 G > A, AG /GG til rs2274223 A > G, og TT for rs4072037 T > C polymorfi) havde signifikant øget risiko (justeret OR = 1,30, 95% CI = 1,03-1,64) sammenlignet med dem med kun 0-1 risiko genotyper

Stratificering analyse

foreningen. mellem variant genotyper og mavekræft risiko blev yderligere evalueret i lagdeling analyse af alder, køn, rygning status, pack-året, drikker status, og BMI under en dominerende genetisk model (tabel 3). Vi fandt, at PSCA
rs2294008 CT /TT genotyper var associeret med øget mavekræft risiko hos yngre forsøgspersoner, lys rygere og personer med ikke-Cardia kræft, i forhold til de respektive referencegrupper. Med hensyn til PLCE1
rs2274223 A > G polymorfi, lagdeling analyser observeret øget mave kræftrisiko med AG /GG genotyper hos yngre deltagere, kvinder, aldrig rygere, aldrig drinkers, deltagere med højt BMI, og fag med Cardia kræft eller TNM stadie III + IV sygdomme. Mens risiko genotyper blev kombineret, fandt vi, at de emner, med 2-4 risikofaktorer genotyper var mere tilbøjelige til at udvikle mavekræft blandt yngre undergruppe, mænd, nogensinde rygere eller undergrupper med højt BMI og personer med ikke-cardia kræft, end hvert tilsvarende undergruppe modparter med 0-1 risiko genotypen. De yderligere heterogenitet test for stratificeret analyse ikke afsløre nogen forskel mellem undergrupper af forskellige co-variates, såsom alder, køn, og rygning status. Desuden var der ingen statistisk dokumentation for samspillet mellem disse udvalgte SNP'er og co-variates (alder, køn, BMI, osv), enten.

De FPRP værdier for alle statistisk signifikant resultat er vist i tabel 4. Falsk -positive rapport sandsynlighed værdier for sammenhænge mellem mavekræft risiko og hyppigheden af ​​genotyper af udvalgte gener. 4, med en forudindstillet forudgående sandsynlighed på 0,1 og en FPRP tærskel på 0,2. FPRP analyse viste, at signifikant sammenhæng mellem PSCA
rs2294008 C > T og mavekræft risiko var bemærkelsesværdigt under homozygot model. Desuden foreningen var også fortjener opmærksomhed for yngre patienter og dem med ikke-Cardia. Ligeledes signifikant sammenhæng med PLCE1
rs2274223 G > A var bemærkelsesværdigt for alle fag, samt for yngre personer, aldrig rygere, aldrig drikker, dem med BMI > 24,0, cardia kræft eller TNM stadie III + IV sygdomme. FPRP bekræftede også signifikant sammenhæng med PSCA
rs2976392 G > A under homozygote og dominerende modeller og signifikant sammenhæng med MUC1
rs4072037 T > C under homozygot model. Med hensyn til de kombinerede genotyper, bekræftede vi den betydelige forening for de individer med pack-året ≤27 eller ikke-Cardia kræft. Relativt større FPRP værdier blev fundet for resten af ​​signifikante sammenhænge mellem udvalgte polymorfier og mavekræft risiko, som kan henføres til den relative lille stikprøve af denne undersøgelse samt moderate effekter af udvalgte SNP'er. Disse resultater har brug for yderligere validering i undersøgelser med stor stikprøve.

Diskussion

I den aktuelle hospital baseret case-kontrol undersøgelse, undersøgte vi de potentielle sammenslutninger af PSCA
rs2294008 C > T og rs2976392 G > a, PLCE1
rs2274223 a > G og MUC1
rs4072037 T > C polymorfier med mavekræft modtagelighed blandt en kinesiske befolkning. Vi fandt, at PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA og PLCE1
rs2274223 AG /GG genotyper var associeret med en signifikant øget mavekræft risiko i et kinesiske befolkning, mens den MUC1
rs4072037 T > C blev forbundet med nedsat mavekræft modtagelighed. Vi fandt også, at emner, der bærer 2-4 risikofaktorer genotyper havde en udpræget øget mavekræft risiko, når der sammenlignes med dem, der udfører 0-1 risiko genotype. Effekten af ​​risikofaktorer genotyper kombineret på kræftrisiko var mere tydelig i yngre, mænd, nogensinde rygere, emner med højt BMI og ikke-Cardia mavekræft. Disse resultater viser, at de valgte SNPs fra GWASs kan bidrage til mave carcinogenese.

Indtil videre fire GWASs har undersøgt mavekræft risiko [10,16,19,20] som nævnt i indledningen, som førte til fund af de fire SNP'er af interesse. PSCA
rs2294008 C > T resultater i Met /Thr substitution, og PSCA
rs2976392 G > En kan ændre transskriptionsfaktorbindende stedet aktivitet af genet [10]. Desuden MUC1
rs4072037 T > C kan føre til splejsning ændring, hvorimod, PLCE1
rs2274223 A > G kan forårsage en Arg-til-Hans forandring, der var signifikant associeret med risiko for mavekræft i den indledende scanning fase [19]. Mens scanning og validering faser blev kombineret, blev en genom-dækkende forening kun observeret for PLCE1
rs2274223 A > G polymorfi, men ikke den MUC1
rs4072037 T > C polymorfi [19]. Samtidig Wang et al. også fundet rs2274223 polymorfi var forbundet med gastrisk Cardia adenocarcinom ( P
= 1,74 × 10 ^{-39) [20]. Senest har GWAS af Shi et al. [16], bekræftede tidligere rapporterede sammenslutninger af ikke-Cardia mavekræft modtagelighed med ikke kun PSCA
rs2294008 og rs2976392, men også MUC1
rs4072037.}

Resultaterne fra tidligere GWASs var bredt valideret blandt forskellige etniske befolkningsgrupper i de seneste år (S1 tabel). For eksempel Wu et al. [18] viste, at sammenhængen mellem PSCA
rs2294008 og mavekræft var mere fremtrædende blandt patienter med ikke-cardia mavekræft end dem med Cardia mavekræft. Den signifikant association blev også valideret af undersøgelser foretaget blandt forskellige etniske grupper i hele verden [14-17,19,36-40]. Men sammenhængen mellem rs2294008 C > blev T og mavekræft ikke valideret af andre [12,41]. For at løse striden, har seks meta-analyser er udført for at vurdere forholdet mellem PSCA
polymorfier og mavekræft modtagelighed [42-47]. Qiao et al. [42] omfattede otte case-kontrol undersøgelser fra syv artikler og fandt, at rs2294008 T allel og rs2976392 En allel var signifikant forbundet med øget gastrisk kræftrisiko. Disse resultater blev også bekræftet af andre meta-analyse [43-46]. For nylig, at få adgang til bidragene fra disse to vidt undersøgte PSCA
SNPs til mavekræft modtagelighed, Gu et al. [47] udføres en meta-analyse af 16 undersøgelser med i alt 18,820 tilfælde og 35,756 kontroller. Den poolede OR var 1,46 (95% CI = 1,30-1,69) for PSCA
rs2294008 og 1,49 (95% CI = 1,22-1,82) for rs2976392 polymorfier. Desuden efter opdaget af Abnet et al. [19] og Wang et al. [23], PLCE1
rs2274223 polymorfi er blevet undersøgt i udstrakt grad mellem forskellige etniske grupper i forskellige kræftformer, såsom mavekræft, kræft i spiserøret, hoved- og halscancer, og galdeblæren kræft [48-60]. Men konklusionerne om sammenhængen mellem PLCE1
rs2274223 A > G polymorfi og kræft risiko er kontroversielle. Den signifikant association blev observeret i nogle undersøgelser [49-52,56,58], men ikke i andre [48,53-55,57,59,60]. Fire metaanalyser blev udført for at revurdere foreningen [27-30]. Hao et al. [27] omfattede i alt 13 case-control studier, hvoraf fem studier med 5127 tilfælde og 5791 kontroller undersøgte rolle denne SNP i gastrisk kræftrisiko. De fandt statistisk signifikante associationer mellem rs2274223 polymorfi og øget gastrisk kræftrisiko under homozygot model og heterozygot model. Disse resultater var i overensstemmelse med de andre tre meta-analyser, der omfattede færre associationsstudier på mavekræft. Med hensyn til MUC1
rs4072037 T > C polymorfi, blev sammenhængen mellem denne polymorfi og mavekræft valideret mellem forskellige etniske grupper [49,53,61]. Saeki et al. [61] og Zhang et al. [49] fandt, at denne polymorfi var forbundet med nedsat mavekræft blandt asiater, mens ingen signifikant sammenhæng blev fundet blandt kaukasiere [53] .Der var kun én metaanalyse for MUC1
rs4072037 T > C polymorfi [31 ], hvori i alt 10 undersøgelser med 6580 gastriske kræfttilfælde og 10324 kontroller blev indbefattet. Det blev konstateret, at den MUC1
rs4072037 G allelen var signifikant associeret med en nedsat gastrisk kræftrisiko (OR = 0,72, 95% CI = 0,68-0,77), når der sammenlignes med A-allelen.

Talrige undersøgelser har været gennemført for at validere GWAS konklusioner om mavekræft. Men ingen af ​​undersøgelserne dækkede alle de fire SNP'er som vi gjorde her, bortset fra en undersøgelse foretaget af Palmer et al. blandt kaukasiere, som undersøgte PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 og MUC1
rs4072037 polymorfier [53]. De fandt, at MUC1
rs4072037 polymorfi var forbundet med en nedsat risiko for tarm-typen mavekræft (OR = 0,4, 95% CI = 0,2-0,9); dog blev der ikke associationer fundet med både PLCE1
rs2274223 og C20orf54
rs13042395. I den aktuelle undersøgelse, fandt vi alle disse fire SNPs var individuelt forbundet med mavekræft modtagelighed blandt kinesiske fag. Vi fandt også, at 2-4 risiko genotype luftfartsselskaber havde en meget højere mavekræft risiko end de 0-1 luftfartsselskaber. Dette fænomen var mere udtalt hos yngre forsøgspersoner, mænd, nogensinde ryger, dem med høj BMI, og personer med ikke-Cardia mavekræft. Cigaretrøg indeholder omkring 55 kræftfremkaldende stoffer, der kan generere reaktive oxygenarter til at fremkalde en række DNA-skader. Mandlige nogensinde rygere konsekvent udsat for cigaretter røg muligvis harbor DNA skader, der kan interagere med genetiske variationer at føre til udvikling af kræft. Med andre ord, kan gen-miljø interaktion spiller en vigtig rolle i at indlede og fremme carcinogenese [62]. Høj BMI er blevet anerkendt som en risikofaktor for mavekræft i vestlige lande [4]. Cardia mavekræft er lokaliseret til gastroøsofageal krydset og kan afvige fra ikke-cardia kræft vedrørende epidemiologi og kliniske funktioner [16] .Derfor, foreningen med ikke-cardia mavekræft syntes at være biologi plausibel.

I resumé, vi bekræftet sammenhængen mellem fire tidligere GWAS-der identificeres SNP'er og mavekræft modtagelighed i dette hospital baseret case-kontrol undersøgelse. Imidlertid bør adskillige begrænsninger i den foreliggende undersøgelse rettes. For det første kan den iboende selektionsbias og information skævhed være uundgåelige i dette hospital baseret case-kontrol designet studie. For det andet, vi kun medtaget fire SNPs i den aktuelle undersøgelse, i stedet for at dække alle lovende GWAS-identificeret SNPs. Generelt kan undersøgelser omfatter flere SNPs potentielt relateret til risiko mavekræft være bedre i stand til at belyse den nøjagtige rolle af genetiske varianter i maven carcinogenese. Endelig på grund af karakteren af ​​retrospektivt studie design, vi havde ikke pålidelige og tilstrækkelige oplysninger til enkeltpersoner på andre miljømæssige engagementer, såsom H
. pylori
infektion, kosten, erhverv eksponering, samt mavekræft klassificering og undertyper, såsom tarm og diffus undertype. Mangel på alle de værdifulde oplysninger hindrede os for yderligere at undersøge de ætiologiske roller disse faktorer i maven carcinogenese. På trods af disse begrænsninger, resultaterne fra vores undersøgelse var informativt for forskere og læger på dette område. er behov for yderligere veldesignede prospektive populationsbaserede studier for yderligere at bekræfte vores resultater, især dem med detaljerede oplysninger om risikofaktorer for mavekræft og stor stikprøvestørrelse herunder forskellige etniske grupper.

Støtte Information
S1 data. Originale data
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001
(XLS)
S1 Table. Karakteristik af tidligere studier fokuseret på disse fire SNP'er
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s002
(DOC)

• PLoS ONE: på vej mod den rigtige retning-Solution Package for Endoskopisk Submukøs Tunneling resektion i Stomach
• PLoS ONE: Mave Virtual Ikke Forbedret CT med Second-Generation, Dual-Energy CT: En foreløbig Study