Expresie a klinický význam dlhá nekódujúcej RNA HNF1A-AS1
v ľudskej rakoviny žalúdka
abstraktné
pozadia
čoraz viac dôkazov preukázala, že dlhá nekódujúcej RNA (lncRNAs) hrajú zásadnú úlohu vo výskyte a vývoj ľudských nádorov, vrátane rakoviny žalúdka (GC). Avšak, funkčné a klinický význam lncRNAs stále nedostatočne pochopené.
Metódy
V tejto štúdii expresie LncRNA HNF1A antisencie RNA 1 (HNF1A-AS1
) bola najprv skúmaná analýzou lncRNAs microarray v 6 GC tkaniva a potom bola ďalej overená pomocou real-time kvantitatívnej reverznej transkripcii PCR (QRT-PCR), a to ako do 3 GC bunkových línií a 161 prípadov GC tkanív. Tiež sme vyhodnotili vzťah medzi HNF1A-AS1
expresných a klinicko-funkcií u pacientov s GC.
Výsledky
výsledkov analýzy LncRNAs microarray vystavoval že HNF1A-AS1
bol downregulated v GCS tkanivách (znamenať násobnú zmenu 2.06 , p
menšie ako 0,05), ktorá bola ďalej potvrdená QRT-PCR. Výsledky QRT-PCR ukázala, že expresia HNF1A-AS1
sa nielen downregulated v troch GC bunkových líniách (AGS, BGC-823, a MKN-45), vzhľadom k, že v normálnej žalúdočnej sliznice epiteliálne bunkové línie ( GES-1), ale tiež sa znížila v GC tkanivách, vzhľadom k, že v párových okolitom normálnom tkanív (nízkou expresiou, 94 161, nízku mieru expresie, 58,38%). Okrem toho, nízka HNF1A-AS1
expresie bola spojená s veľkosťou nádoru /priemeru (p = 0,005
, viacrozmerné analýza), sérové hladiny karcinoembryonálneho antigénu (CEA) a antigén uhľohydráty 19-9 (CA19-9), a RRM1 výraz v tkanivových vzoriek (p = 0,028
, s
= 0,009 a p = 0,006
, v uvedenom poradí).
Závery
Celkom vzaté, naše dáta ukazujú, že lncRNA HNF1A-AS1
môže byť regulátor GC, a tým, že môže mať potenciál ako nový biomarkeru a ciele liečby pre tento typ rakoviny.
Kľúčové
karcinóm žalúdka lncRNA HNF1A-AS1
biomarker pozadí
rakovina žalúdka (GC) je jedným z najčastejších typov rakoviny a môže dôjsť v ktorejkoľvek časti ľudského žalúdka. Tieto nádory sú často malígne a majú schopnosť napádať tkaniva perineurální [1]. Údaje z posledného celosvetového ročného šetrenie ukázali, že existuje takmer milión nových prípadov a 740,000 úmrtí na rakovinu ročne po celom svete. Výskyt GC v Číne je vyšší ako vo väčšine krajín na svete, s viac než 400.000 nových prípadov ročne a zhruba 300 tisíc úmrtí. Štúdie ukázali, že ak sa táto choroba môže byť diagnostikovaná v ranej fáze, môže byť dobrá prognóza dosiahnuté kompletné chirurgické resekcii primárneho nádoru tkaniva [2]. Bohužiaľ, pacienti s GC ukazujú niekoľko príznakov v skorých štádiách ochorenia a diagnóza je zvyčajne veľmi ťažké. Miera prežitia po dobu 5 rokov GC v pokročilých štádiách je stále slabé a je tvrdohlavý na približne 30% [3]. Rakovinové biomarkery umožňujú rakoviny, ktoré majú byť diagnostikované a môžu slúžiť ako terapeutických cieľov, rovnako ako môžu byť použité k objavovaniu patogenéze ochorenia; Preto, identifikácia rakovinových biomarkerov by bolo veľmi prínosné.
Dlhé nekódujúca RNA (lncRNAs) sú nekódujúca RNA vyššia ako 200 nukleotidov [4]. Tieto RNA nie sú kódujú proteíny a predstavujú hlavné súčasti ľudského transkriptomů [5]. Objavujúce sa dôkazy naznačujú, že lncRNAs sú dôležité regulačné molekuly, ktorých hlavné funkcie sú spojené s moduláciou expresie génov sietí [6]. Mnohé z týchto sietí sú úzko spojené s rozvojom rakoviny a progresie ochorenia [6-9]. Dáta z rôznych skupín zistili, že zmeny v expresii lncRNAs sa vzťahujú k patogenéze rôznych ľudských rakovín. Súčasné poznatky z Wang et al., Song et al., A Shao et al. preukázali, že zmeny v expresných profiloch lncRNAs sú spojené s žalúdočné karcinogenéze rakoviny a progresiu a lncRNAs by mohli byť použité ako skoré biomarkery alebo ako terapeutických cieľov pre GC [10-12].
Na identifikáciu abnormálne expresiu lncRNAs nádorové súvisiace a tie lncRNAs s potenciálnymi hodnoty ako biomarkery, v tejto štúdii lncRNAs expresné analýza profil microarray bolo vykonané v šiestich GC tkanív a ich párových okolitom normálnom žalúdočné tkaniva. LncRNA HNF1A antisencie RNA 1 (HNF1A-AS1
) bol jeden z LncRNAs, ktoré boli identifikované, ktoré majú byť v downregulated GC tkanivách pomocou microarray analýzy. HNF1A-AS1
, single-exon génu v pásme 12q24.31 chromozómu 12, je obojsmerný lncRNA z 2455 nukleotidov [13]. Transkripční miesto začiatku tohto lncRNA je veľmi blízko k tomu pečeňovej nukleárneho faktora 1 alfa génu (HNF1A
; HNF1A-AS1
's počiatočnou miesto je približne 5 kb po prúde od HNF1A
) [13]. Pokiaľ je nám známe, expresie HNF1A-AS1
v GC tkanivách zostáva neodhalené. Preto sa v tejto práci sme zistili, expresných hladín HNF1A-AS1
do 3 GC bunkových líniách a v 161 prípadoch GC tkanív a ich párových okolitom normálnom žalúdočné tkaniva. Skúmali sme tiež možný vzťah medzi expresiou HNF1A-AS1 stroje a klinicko-funkcií u pacientov s GC. Naše dáta ilustrujú potenciál tohto lncRNA ako nové biomarkeru a ciele liečby pre GC.
Metódy
vzorky tkaniva a klinická zber dát
sto šesťdesiat jedna čerstvá párované vzorky tkaniva (GC tkanivo a non -neoplastic tkaniva odobraté 5 cm od okraja rakoviny sa) boli získané z Fuzhou General Hospital, Fujian, Čína, v roku 2014 a 2015. Všetky vzorky boli získané bezprostredne po chirurgickom zákroku a zachované v RNAlater (Qiagen, Nemecko) pri -80 ° C C až do použitia. Vzorky séra používané pre detekciu nádorových biomarkerov v sére a vzoriek parafínových tkanivových používaných pre detekciu imunohistochemických markerov boli tiež odobraté z rovnakých pacientov. Každá vzorka tkaniva bol diagnostikovaný histopatologicky a potvrdené aspoň dvoma patológmi. Štandardy pre nádorové-Node-metastázy (TNM) Fáza a histologického stupňa boli v súlade s pokynmi Medzinárodnej únie proti rakovine (UICC; 5. Ed) a National Comprehensive Cancer Network je (NCCN) klinických odporúčaných postupov v onkológii (V. 1,2011), v danom poradí. Žiadny z pacientov bola liečená pred resekciou.
Vyhlásenia pre etiku
Informovaný súhlas bol získaný od všetkých jednotlivých účastníkov zahrnutých do štúdie, a táto štúdia bola schválená etickou komisiou Fuzhou General Hospital.
LncRNAs microarray test
lncRNAs microarrays použité v tejto štúdii boli Human LncRNAs mikroskopické sústavy V3.0 (Arraystar Inc., MD, USA), ktorý sa skladá z lncRNAs a mRNA z ľudského genómu. lncRNAs microarray test a analýza dát boli vykonané KANGCHEN Bio-tech (Shanghai, Čína) na základe pokynov výrobcu.
bunkovej kultúre
AGS, GC bunkové línie BGC-823 a MKN-45 a normálne ľudských žalúdočné epiteliálne bunkové línie (GES-1) boli získané z American Type Culture Collection, Manassas, VA, Shanghai ústavu biochémie a bunkovej biológie, čínskej akadémie vied v Šanghaji, Čína, Cancer japonského výskumného banky a Pekingu Cancer Institute ( Peking, Čína), resp. Bunky boli kultivované v F12, RP1640, alebo DMEM (Invitrogen, Grand Island, NY, USA), z ktorých všetky obsahovali 10% fetálne hovädzie sérum, v inkubátore pri 37 ° C s 5% CO
2.
Celková extrakcie RNA a QRT-PCR
Celkové RNA boli izolované z oboch tkanív a kultivovaných bunkách za použitia TRIzolu činidla (Invitrogen). Reverzný transkripcie sa potom vykonáva za použitia súpravy Reverse Transcription (Promega) v súlade s pokynmi výrobcu. Real-time kvantitatívnej reverznej transkripciou PCR (QRT-PCR) bola vykonaná za použitia súpravy SYBR Green Mix (Promega, Madison, WI, USA) v kroku jedna real-time PCR systém (ABI, Grand Island, NY, USA) , Priméry na 18s a HNF1A-AS1
qPCR boli nasledovné: (dopredu) 5'-TCAAGAAATGGTGGCTAT-3 'a (reverznej) 5'-GCTCTGAGACTGGCTGAA-3' pre HNF1A-AS1
; (Dopredu) 5'-AGAAACGGCTACCACATCCA-3 'a (reverznej) 5'-CACCAGACTTGCCCTCCA-3 "na 18s. Podmienky pre PCR boli nasledujúce: stupeň 1, 95 ° C počas 10 minút; stupeň 2, 40 cyklov pri teplote 95 ° C počas 15 sekúnd, 57 ° C po dobu 1 minúty; stupeň 3 (disociačná stupeň), 95 ° C počas 15 s, 60 ° C počas 15 s, 95 ° C počas 15 sekúnd. Prah zaznamenal cyklu (Ct) hodnoty zahŕňal oba HNF1A-AS1 stroje a 18 s; druhý slúžil ako kontrola. Hladina expresie HNF1A-AS1
bolo získané pomocou metódy ΔCt. Vyššie hodnoty ΔCt uvedené nižšieho HNF1A-AS1
výraz. Výsledky boli získané z troch nezávislých experimentov a sú vyjadrené ako stredná hodnota ± štandardná odchýlka (SD).
Meranie AFP, CA-125, CEA, a koncentrácia CA19-9 v sére u pacientov s GC
koncentráciách alfa-fetoproteínu (AFP), karcinoembryonálneho antigénu (CEA), rakovinový antigénne 125 (CA-125), a sacharidov antigénu boli v sére všetkých 161 prípadov tejto skupiny pacientov zistená 19-9 (CA19-9) za použitia množstvového Kit pre nádorový marker (Protein Chip-chemiluminiscencie) (HealthDigit, Huzhou, Čína) s HD-2001a ChipReader systému (HealthDigit). V tejto štúdii bežnej referenčnej hodnoty pre zdravého jedinca boli < 20,0 ng /ml, < 5,0 ng /ml, < 35,0 U /ml a < 35,0 IU /ml pre AFP, CEA, CA-125 a CA19 -9, resp.
IHC
Použili sme imunohistochémia (IHC) v parafínových sekcií pre stanovenie expresie vaskulárneho endoteliálneho rastového faktora (VEGF), ľudský receptor epidermálneho rastového faktora 2 (C-ErbB-2 alebo HER2 ), thymidylátsyntázu (TS), karcinóm prsníka 1 (BRCA1), excízia oprava cross-komplementáciu skupina 1 (ERCC1), Ki67 antigén (Ki67), a ribonukleotid reduktázy podjednotku M1 (RRM1), synaptophysin (syn), neurónové molekuly bunkovej adhézie (CD56), a chromograninu a (CGA); 150 prípady vzoriek parafínových tkanivových tejto skupiny pacientov boli k dispozícii pre test IHC. IHC bola vykonaná patológmi v súlade s pokynmi výrobcu. Protilátky a iné činidlá pre IHC použité v tejto práci boli zakúpené od Maixin (Fujian, Čína) a ZSGB-BIO (Peking, Čína). S výnimkou Ki67, intenzita sfarbenia bola odstupňovaná od 0 do 4, 0 znamená farbenie; 1, menej ako 25% buniek pozitívne; 2, 25 až 50% buniek pozitívnych; 3, 51 až 75% buniek pozitívnych; a 4, > 76% buniek pozitívne. Pre Ki67, že stupňa boli priamo posudzované ako percento pozitívne na expresiu Ki67. Sklíčka sa klasifikovali podľa najmenej dvoma patológmi.
Štatistická analýza
štatistického programu v oblasti spoločenských vied (SPSS) 16,0 softvér (SPSS, Chicago, IL, USA) a GraphPad Prism 5.0 (GraphPad Software, LaJolla, CA, USA ) boli použité pre všetky štatistické analýzy. Jednosmerná analýza rozptylu (ANOVA), skúšobné poradie súčtom, a študent je t
testu boli hlavnými štatistické metódy použité v tejto práci, p Hotel < 0,05 bola považovaná za štatisticky významnú.
Výsledky
LncRNAs microarray analýza vykazuje, že HNF1A-AS1
výraz downregulated v GCS tkanivách
Ako je znázornené na Obr. 1, výsledky analýzy lncRNAs profil expresie microarray získala, zo šiestich GC tkanív a ich párových okolitom normálnom žalúdočné tkanivá vystavené že HNF1A-AS1
expresie bola downregulated vo všetkých šiestich GC tkanív (stredná násobok zmeny 2,06, p
< 0,05), čo ukazuje, že táto lncRNA môže mať potenciál byť jedným z LncRNAs nádorom súvisiace. Preto sme vybrali pre ďalšiu analýzu. Obr. 1 HNF1A-AS1
bol downexpressed v šiestich GC tkanivách identifikovaných analýzou lncRNAs mikročipov. 84C, 83C, 87C, 78c, 97c a 90C je uvedené šesť GC tkaniva (84, 83, 87, 78, 97 a 90 bolo šesť prípadov čísla tkaniva, C
rakoviny); 83N, 87N, 90N, 78n, 97N a 84N je uvedené šesť zodpovedajúce párované okolitom normálnom žalúdočné tkaniva (N
nenádorových žalúdočné tkaniva). zhluková analýza na základe výsledkov microarray vykazovali, že HNF1A-AS1
expresiu v tkanivách bol GC downregulated v porovnaní s párových nenádorových žalúdočné tkaniva (stredná násobok zmeny 2,06, p Hotel &0,05)
qRT- PCR overenie ďalej potvrdzuje, že HNF1A-AS1
výraz downregulated v bunkových líniách GC a tkanív
sme prvú vyšetrovaných expresiu lncRNA HNF1A-AS1
v troch GC bunkových líniách: AGS, BGC-823 a MKN -45. Pomocou QRT-PCR, sme potvrdili, že expresia HNF1A-AS1
bola výrazne u všetkých troch bunkových línií GC v porovnaní s tým, že v normálnej žalúdočnej epiteliálne bunky (GES-1 buniek, znížilo, AGS, p Hotel &0,0001 , BGC-823, p Hotel &0,05; MKN-45, p
menšie ako 0,05, obr. 2). Tiež sme skúmal HNF1A-AS1
expresiu vo vzorkách tkanív GC a spárovaný susedné vzorky nenádorových tkanív. Naše výsledky ukazujú, že HNF1A-AS1
sa downregulated na 58,38% (94/161) GC tkanív vzhľadom k, že v non-neoplastických tkanivách (p
< 0,01, obr. 3). Dohromady tieto údaje naznačujú, že HNF1A-AS1
je downregulated v ľudskej GC. Obr. 2. Znížená expresia HNF1A-AS1 Br &GC buniek vzhľadom k, že v normálnej žalúdočnej epiteliálne bunky. QRT-PCR bola použitá pre porovnanie expresie HNF1A-AS1
v BGC-823, MKN-45, a AGS GC buniek ako u non-neoplastických GES-1 buniek. Uvedené údaje sú z troch nezávislých experimentov a sú vyjadrené ako stredná hodnota ± SD. Hviezdičky označujú
hodnoty sa štatisticky významný rozdiel v porovnaní s hodnotou v bunkách GES-1. * P Hotel < 0,05, p **** Hotel < 0,0001. GC
rakovina žalúdka, QRT-PCR
kvantitatívne real-time PCR, SD
smerodajnú odchýlku
Obr. 3 Expresia HNF1A-AS1
v nádorových a nenádorových tkanív žalúdka. Expresie HNF1A-AS1 Br &GC tkanivách bola v porovnaní s v okolitom normálnom tkanív (n = 161
, ** p Hotel &0,01). T
GC tkaniva, N
nenádorových tkanív. Uvedené údaje sú z troch nezávislých experimentov a sú vyjadrené ako stredná hodnota ± SD (ΔCt hodnota). GC
rakovina žalúdka, SD
štandardná odchýlka
Asociácie HNF1A-AS1
prejavu s klinicko-rysy pacientov s GC
posúdiť klinický význam HNF1A-AS1
sme analyzovali vzťah medzi jej prejavu a klinicko-rysy pacientov s GC. Ako je uvedené v tabuľkách 1 a 2, jednorozmerné analýze vykazovali, že expresia HNF1A-AS1
bolo spojené s veľkosťou nádoru /priemer (p = 0,002)
, hĺbku invázie (T fáz, p = 0,032
), lymfatické metastázy (N štádia, p
= 0,006), žilovej invázie (p
= 0,001) a perineurální invázie (PNI, p
= 0,014). Avšak, po kontrole vplyv faktory, ako je vek, pohlavie, umiestnenie nádoru, veľkosť nádoru /priemer, diferenciácie, invázia (T fáz), lymfatické metastázy (N fáz), žilovej inváziu a PNI, multivariačný analýzy ďalej potvrdili, že veľkosť nádoru pretrvávala do byť významne koreluje s HNF1A-AS1 výrazu (p
= 0,005), čo znamenalo, že pacienti s veľkosťou nádoru ≥ 5 cm mali nižšie hladiny HNF1A-AS1. Tieto údaje naznačujú, že HNF1A-AS1
môže zohrávať úlohu pri vzniku rakoviny a progresii a môže byť nový biomarker žalúdka cancer.Table 1 Asociácie HNF1A-AS1 výrazu (ΔCt) s klinicko-rysy pacientov
Charakteristika
No. prípadu (%)
priemer ± SD
p
hodnoty
vek (roky)
predstavujú 0,119
≥60
82 (50,9 )
16,17 ± 2,90 Hotel < 60
79 (49,1)
15,47 ± 2,71
Pohlavie
0,688
Muž
123 (76,4)
15,78 ± 2,88
Žena
38 (23,6)
15,99 ± 2,66
Tumor umiestnenie
0,560
dutín ventriculi
57 (35,4)
16,06 ± 3,13
Cardia
33 (20,5)
15,87 ± 3,04
Corpora ventriculi
45 (28,0)
15,92 ± 2,50
Ostatné
26 (16,1)
15,11 ± 2,36
priemer (cm)
0,002
≥5
73 (45,3)
16,59 ± 2,8 Hotel < 5
88 (54,7)
15,2 ± 2,70
Diferenciácia
0,396
Well
2 (1.2)
16,15 ± 0,71
Stredná
34 (21,1)
15,24 ± 2,66
Poor
125 (77,7 )
15,98 ± 2,87
Invasion
0,032
T1
13 (8,1)
16,13 ± 1,95
T2
14 (8,7)
14,09 ± 2.24
T3
16 (9,9)
14,85 ± 3,71
T4
118 (73,3)
16,13 ± 2,76
Lymfatická metastázy
0,006
n0
38 (23,6)
14,74 ± 2,77
N1-3
123 (76,4)
16,16 ± 2,76
Žilová invázie
0,001
Absent
86 (53,4)
15,14 ± 2,58
Prezentujte
75 (46,6)
16,61 ± 2,90
perineurální invázie (PNI)
0,014
nep prítomnosti
89 (55,3)
15,34 ± 2,77
Prezentujte
72 (44,7)
16,43 ± 2,79
CEA
0,028
Normal
130 (80,7 )
15,59 ± 2,74
vysoká
31 (19,3)
16,83 ± 2,97
CA19-9
0,009
Normal
140 (87,0)
15,60 ± 2,70
vysoká
21 (13,0)
17,32 ± 3,22
AFP
0,936
Normal
150 (93,2)
15,82 ± 2,80
high
11 (6,8)
15,89 ± 3,25
CA-125
0,494
Normal
154 (95,7)
15,79 ± 2,84
High
7 (4,3 )
16,55 ± 2,33
kurzívou hodnoty sú významné na str Hotel < 0,05
Tabuľka 2 Porovnanie s
hodnotami získanými z jednorozmerné a viacrozmerné analýzy združenia HNF1A-AS1 výrazom (ΔCt) s klinicko-rysy pacientov
Charakteristika
jednorozmerných
multivariačných
p
Value
p
hodnota
vek (roky)
predstavujú 0,119 0,197
Pohlavie
0,688 0,174
Priemer (cm)
0,002 0,005
Diferenciácia
0,396 0,603
Invasion
0,032 0,580
Lymfatická metastázy
0,006 0,235
Žilová invázie
0,001 0,057
perineurální invázie (PNI)
0,014 0,192
lokalizácia nádoru
0,560
0,342
kurzívou hodnoty sú významné na str Hotel < 0,05
Asociácie HNF1A-AS1
prejavu so sérom alebo imunohistochemických markerov GC
HNF1A-AS1
prejavu v GC tkanivách bolo spojené s dvoma markerov v sére nádorov zažívacieho traktu, CEA (p
= 0,028) a CA19-9 (p = 0,009
), ale nebol zistený žiadny významný vzťah s iným zažívacieho traktu rakoviny sérum markeru AFP, alebo s epiteliálne nádorového markeru CA125 (Tabuľka 1). Expresie HNF1A-AS1
v nádorových vzoriek bol tiež významne koreluje s jedným imunohistochemických markerov rakoviny, RRM1 (p = 0,006
), ale nie s VEGF, C-ErbB-2, TS, BRCA1, ERCC1, Ki67, CD56, Syn, alebo CGA (tabuľka 3) .Table 3 Združenia HNF1A-AS1 výrazu (ΔCt) s immunohisochemical vlastnosťami GC tkaniva
Charakteristika
No. prípadu (%)
Stredná ± SD
p
hodnota
VEGF
0,809
0
15 (10,0)
15,27 ± 3,69
1
22 (14,7)
15,57 ± 2,92
2
33 (22,0)
15,83 ± 2,72 Sims 3
59 (39,3)
15,94 ± 2,54
4
21 (14,0)
16,39 ± 3,32
C-ErbB-2
0,312 NETHRY.cz 0
129 (86,0)
15,70 ± 2,84
1
5 (3,3)
16,37 ± 2,96
2
4 (2.7)
15,77 ± 1,01 Sims 3
12 (8.0)
17,30 ± 3.21
TS
0,543 NETHRY.cz 0
22 (14,7)
16,41 ± 2,45
1
53 (35,3)
15,99 ± 2,97
2
52 (34,7)
15,33 ± 2,73 Sims 3
21 (14,0)
16,25 ± 3,34
4
2 (1.3)
15,92 ± 1,82
BRCA1
0,893
0
10 (6,7)
16,59 ± 1,83
1
31 (20,7)
16,07 ± 2,91
2
73 (48,6)
15,78 ± 2,57 Sims 3
34 (22,7)
15,61 ± 3,57
4
2 (1.3)
15,77 ± 5,01
ERCC1
0,585
0
19 (12,7)
15,81 ± 2,39
1
22 (14,7)
16,51 ± 3,61
2
44 (29,3)
15,96 ± 2,85 Sims 3
41 (27,3)
15,85 ± 3,05
4
24 (16,0)
15,11 ± 2,02
RRM1
0,006
0
81 ( 54,0)
15,79 ± 2,41
1
10 (6,7)
13,27 ± 4,11
2
17 (11,3)
15,51 ± 3,08 Sims 3
35 (23.3)
16,98 ± 2,93
4
7 (4,7)
15,48 ± 2,67
Ki67
0,328
1
14 (9,3)
16,54 ± 1,67
2
35 (23,3)
16,44 ± 2,79 Sims 3
57 (38,0)
15,48 ± 2,97
4
44 (29,4)
15,66 ± 3,02
Syn
0,463
0
128 (85,3)
15,99 ± 2,95
1
16 (10,7)
15.15 ± 2,17
2
3 (2,0)
13,98 ± 0,87 Sims 3 Sims 3 (2,0)
15,59 ± 3,06
CD56
0,364
0
137 (91,4)
15,94 ± 2,86
1
9 (6,0)
15,66 ± 3,09
2
2 (1.3)
12,72 ± 0,84 Sims 3
2 (1,3)
14,22 ± 0,97
CGA
0,980
0
141 (94,0)
15,87 ± 2,91
1
7 (4.7)
15,69 ± 1,83
2
2 (1.3)
15,63 ± 3,26
kurzívou hodnoty sú významné na str Hotel < 0,05
Diskusia
Niekoľko línií dôkazov, preukázali, že zmeny v expresii lncRNAs hrajú dôležitú úlohu v karcinogenéze a rozvoju rakoviny [14, 15] a že zmenená expresia lncRNA je známe, že sa významne spojená s niekoľkými klinicko rysmi ľudské nádory, ako je napríklad lymfatických uzlín, TNM štádiu, vzdialených metastáz, a stupeň diferenciácie tkanív. Napríklad znížená expresia žalúdočné rakovina súvisiace s transkript 1 (GACAT1
) je významne spojená s metastázami, inváziou, a diferenciáciu tkanív u pacientov s GC [16]. Okrem toho zvýšená expresia homeoboxový (HOx) prepis nezmyselné RNA (hotair
), dlhý intergenní nekódujúca RNA, je spojená so stupňom endometria karcinómu (ES), metastázy, hĺbka myometria invázie a celkovo chudobnejšie prežitia [17]. Konečne, nízka expresia HMlincRNA717 Br &GC je spojený s distálnym metastázy a invázia žilovej a nervového systému [12]. Všetky tieto nálezy svedčia o dôležitých rolí lncRNAs v karcinogenéze a potenciálnej hodnoty v ich klinickej aplikácii.
V tejto štúdii sme zistili, že hladina expresie HNF1A-AS1
v troch žalúdočných rakovinových bunkových línií sa významne znížila v porovnaní so, že v normálnej žalúdočnej epiteliálne bunky. Ešte dôležitejšie je, že bola downregulated v 58,38% vzoriek žalúdočnej rakovina tkaniva vzhľadom k, že v okolitom normálnom tkanív. Nálezy z Yang et al. ukazujú, že tento lncRNA bola up-regulovaná v adenokarcinómu pažeráka (EAC) [13]. Karcinogenéza a progresie rakoviny je komplexný patologický proces, ktorý je sprostredkovaný génovej expresie sietí. výskyt rakoviny v rôznych orgánov alebo tkanív môže byť regulovaná odlišne exprimovaných úrovňou rovnakých génov alebo z rovnakých lncRNAs [18, 19]. To môže vysvetľovať, prečo HNF1A-AS1
vykazuje odlišné expresné profily v rôznych typov rakovinových buniek. Ďalšie vyšetrovanie môže byť potrebné na odhalenie presný molekulárnej mechanizmus pre tieto rozdiely
Je dobre známe, že rakovina invázia a metastázy často sa vykonáva pomocou troch spoločnej cesty :. Lymfatických uzlín, cestovať cez cievach, a miestne siatie a rast. PNI je doplnkovým prostriedkom invázia, ktorá je zvyčajne korelované s lokálnou recidívy. Vzhľadom k tomu, lokálne recidíva je úzko spojená so zlou prognózou, identifikáciu pacientov s vysokým rizikom PNI má veľký klinický význam.
Prognózu a prežitia pacientov s GC môže byť tiež ovplyvnená veľkosťou nádoru, ktorý je vo vzťahu k jeho času rastu. Menšie nádory vykazujú menšie porušenie do žalúdka ako robiť väčšie nádory. Okrem toho, zvýšenie hĺbky invázie väčšie nádory zvyšuje pravdepodobnosť, že lymfatický systém sa bude v prípade porušenia. Zvýšenie lymfatických uzlín umožňuje rakovina rast ľahšie a výsledky v zlou prognózou.
Obaja CEA a CA19-9 sú dobre známe nádorové markery, ktoré sú up-regulované zvyčajne vo vzorkách séra alebo tkanív pacientov s dočasnými alebo primárnych malígnych nádorov zažívací trakt. RRM1 je jedným z troch známych ľudských ribonukleotid reduktázy s funkciou regulácie proliferácie rakovinových buniek cez sprostredkujúcu syntézu DNA a opravy, a detekciu expresie RRM1 v GC tkanív IHC bola preukázané, že vykazujú prognostický význam u pacientov s GC [ ,,,0],20].
závery
V súhrne sme analyzovali asociáciu úrovňou expresie HNF1A-AS1
s klinicko-rysy pacientov s GC. Naše výsledky ukazujú, že expresia HNF1A-AS1 významne
downregulated ako GC tkanív a bunkových línií. Okrem toho, znížená expresia bola spojená s veľkosťou nádoru /priemer a sérové hladiny CEA, CA19-9, a tkanivo RRM1. Tieto zistenia ukazujú, že HNF1A-AS1
môžu byť použité pri potláčaní žalúdočnej vzniku a rozvoju rakoviny a že má potenciál slúžiť ako nový cieľ liečby a biomarker pre hodnotenie závažnosti ochorenia u pacientov s GC. Vzhľadom k tomu, veľkosť vzorky tejto štúdie bolo pomerne malé, môže byť potrebné ďalšie overenie potvrdiť skutočnú klinickú hodnotu HNF1A-AS1
očiam.
Deklarácia
Poďakovanie
Táto práca bola podporená Nadáciou Innovation tímu Fuzhou General Hospital pre Lie Wang (2014CXTD04); po ukončení doktorandského štúdia Založenie Fuzhou General Hospital (43853) pre Yuan Dang; Národná prírodná Science Foundation of China (Grant No. 81372788), lekárska Vedecký výskum Key Foundation of Nanjing vojenského veliteľstva (č 11Z032) a Natural Science Foundation provincie Fujian (č 2014J01427) pre Qiaojia Huang; . A The Medical Scientific Innovation Foundation of Nanjing vojenského veliteľstva (No. 2013-MS122) pre Yinghao Yu
Otvoriť AccessThis článku je distribuovaný pod podmienkami 4.0 Medzinárodná licencie Creative Commons (http: //. Creative Commons org /licencie /od /4 0 /), ktorý umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, dať patričné uznanie pôvodného autora (y) a zdroje, poskytujú odkaz na PSH a uviesť, či boli vykonané zmeny. Venovanie vzdanie Creative Commons Public Domain (http: //. Creative Commons org /public domain /nula /1 0 /) sa týka údajov, ktoré boli k dispozícii v tomto článku, ak nie je uvedené inak
Konkurenčné. záujmy
autori vyhlasujú, že nemajú žiadne protichodné záujmy. príspevky
autorov
YD vykonal experimenty a analýza dát. FL vedené nejaké pokusy. XO, KW, a YL podieľal na vzorkách odobratých. YY viedol parafínových tkanivo formalínom fixované zhromažďované a imunohistochemické testu. LW a YW vedený hlavný čerstvé vzorky odobraté. LW takisto prispela k výraznejšej podpore financovania. QH navrhol štúdium. QH a YD napísal rukopis. Všetci autori čítať a schválená konečná rukopis.