V Barrettovom pažeráku (BE), chronický kyslý reflux zo žalúdka poškodzuje bunky výstelky dolného pažeráka, čím sa stanú viac ako bunky dolného tráviaceho systému. Bunky v dolnom pažeráku prechádzajú niekoľkými prekanceróznymi štádiami, než sa niekedy vyvinú do adenokarcinómu pažeráka, rakovina s päťročnou mierou prežitia pod 20 percent. BE je jediným známym predchodcom adenokarcinómu pažeráka.
Lekári môžu tieto progresívne stavy v BE detegovať hľadaním chromozomálnych zmien známych ako aneuploidia-bežný znak vo väčšine rakovinových buniek-ale doteraz tento proces zahŕňal viacnásobné biopsie.
Jediné čistenie pažeráka spárované s technikou sekvenovania nazývanou RealSeqS je dostatočne citlivé a špecifické na to, aby identifikovalo aneuploidiu v niekoľkých fázach progresie BE, a dokonca môže spájať konkrétne typy aneuploidie s konkrétnymi štádiami ochorenia, hovoria vedci.
Aneuploidia je už dlho súčasťou vývoja, iniciácia alebo progresia rakoviny pažeráka, ale testy alebo experimentálne metódy na detekciu tohto nebolo dosiahnuté tak ľahko alebo tak vysoko, ako by sme chceli umožniť klinickú implementáciu. “
Chetan Bettegowda, M.D., Ph.D., Študujte hlavného autora a profesora neurochirurgie Jennison a Novak Families, Centrum rakoviny Kimmel
Metóda by mohla klinickým lekárom pomôcť identifikovať ľudí s vyšším rizikom progresie BE do adenokarcinómu pažeráka, „zavedenie intenzívnejšieho sledovania týchto pacientov alebo zahájenie liečby v skorších štádiách ochorenia, „Hovorí Bettegowda.
Výsledky boli zverejnené online 21. januára v časopise Gastroenterológia.
Kefovanie pažeráka používa mäkký kefkový nástavec na endoskop na zber buniek z pažerákovej výstelky. Metóda môže vzorkovať bunky z väčšieho povrchu pažeráka ako bežná biopsia. Endoskopia, často kefovaním, "je súčasťou štandardu starostlivosti o ľudí s Barrettovou „Bettegowda hovorí, začlenenie metódy detekcie aneuploidie by teda podstatne nezmenilo klinickú prax.
Iba niekoľko buniek zo stoviek vzoriek odobratých kefou môže demonštrovať aneuploidiu, však takže kombinácia kefovania s masívne paralelným sekvenovaním je kľúčová pre nájdenie týchto buniek. Vedci použili techniku nazývanú RealSeqS na prehľadanie viac ako 350, 000 oblastí genómu na identifikáciu špecifických zmien ramena chromozómu. RealSeqS môže typicky detekovať aneuploidiu na úrovni asi 1 z 200 buniek, čo je nevyhnutné, ak sú veľké časti kefky na pažerák odvodené od normálnych buniek, hovorí hlavný autor štúdie Christopher Douville, výskumník Kimmel Center, ktorý navrhol RealSeqS.
„Metóda je rýchla a dokáže nákladovo efektívne spracovať stovky vzoriek, je ideálnou voľbou pre výskum BE, “hovorí Douville.
Vedci získali kefky na pažerák od pacientov bez BE, s BE a bez abnormálnych buniek, s BE a abnormalitami buniek nízkeho alebo vysokého stupňa, a pacienti s adenokarcinómom pažeráka. Vyškolili svoj identifikačný systém, aby rozlíšil kefovanie od pacientov s BE bez bunkových abnormalít od pacientov s adenokarcinómom pomocou vzoriek od 79 pacientov. Výskumný tím sa potom pozrel na vzorky od 268 pacientov, aby otestoval, či metóda dokáže rozlíšiť rôzne štádiá progresie BE.
Bettegowda, Douville a ich kolegovia identifikovali prah aneuploidie, ktorý odlišoval pacientov s abnormalitami buniek vysokého stupňa a adenokarcinómom od pacientov s BE bez bunkových abnormalít. Na tomto prahu, metóda identifikovala vysoko rizikových pacientov v 232 alebo 86,7% prípadov.
Metóda tiež identifikovala špecifické zmeny chromozomálneho ramena v každom štádiu progresie BE smerom k adenokarcinómu. Niektoré z týchto špecifických zmien boli už v predchádzajúcom výskume spojené s fázami ochorenia, „ale neboli dostatočne komplexné na to, aby sa dali použiť nejakým diagnostickým alebo prognostickým spôsobom, “hovorí Douville.
Vedci použili tieto zmeny na vývoj hodnotiaceho nástroja, ktorý nazvali BAD (Barrettovo rozhodnutie o anuploidii), na rozlíšenie fáz progresie BE. Tento nástroj by mohol byť obzvlášť užitočný pri identifikácii vysokorizikových osôb, keď biopsie buniek vyzerajú benígne, pretože BAD nástroj poukazuje na molekulárne zmeny, ktoré sú spojené s agresívnejším ochorením, Hovorí Bettegowda.
„Aneuploidia je taký univerzálny biomarker, aký v súčasnosti môžeme nájsť pre rakovinu, preto sme nadšení, že vidíme, ako môžeme túto technológiu využiť pri mnohých rakovinách, "hovorí." Sme optimistickí v tom, že vzhľadom na univerzálnosť testu RealSeqS by sme mohli študovať ďalšie chorobné procesy, iné typy rakoviny a potenciálne nájsť iné spôsoby, ako zasiahnuť skôr. “