Dans l'œsophage de Barrett (BE), le reflux acide chronique de l'estomac endommage les cellules qui tapissent la partie inférieure de l'œsophage, les faisant devenir plus comme des cellules du système digestif inférieur. Les cellules de la partie inférieure de l'œsophage passent par plusieurs stades précancéreux avant de se développer parfois en adénocarcinome de l'œsophage, un cancer avec un taux de survie à cinq ans inférieur à 20 pour cent. BE est le seul précurseur connu de l'adénocarcinome de l'œsophage.
Les cliniciens peuvent détecter ces états progressifs dans l'EB en recherchant des altérations chromosomiques connues sous le nom d'aneuploïdie - une caractéristique commune à la plupart des cellules cancéreuses - mais jusqu'à présent, le processus impliquait de multiples biopsies.
Un seul brossage oesophagien associé à la technique de séquençage appelée RealSeqS est suffisamment sensible et spécifique pour identifier l'aneuploïdie à plusieurs stades de la progression de l'EB, et peut même faire correspondre des types spécifiques d'aneuploïdie à des stades spécifiques de la maladie, disent les chercheurs.
L'aneuploïdie est depuis longtemps impliquée dans le développement, l'initiation ou la progression du cancer de l'œsophage, mais les tests ou les méthodes expérimentales pour le détecter n'ont pas été aussi faciles à réaliser ni aussi élevés que nous l'aurions souhaité pour une mise en œuvre clinique. »
Chetan Bettegowda, MARYLAND., Doctorat., Auteur principal de l'étude et professeur de neurochirurgie des familles Jennison et Novak, Centre de cancérologie Kimmel
La méthode pourrait aider les cliniciens à identifier les personnes à risque plus élevé de développer un EB vers un adénocarcinome de l'œsophage, « instituer un suivi plus intensif de ces patients ou instituer des traitements à des stades plus précoces de la maladie, " dit Bettegowda.
Les résultats ont été publiés en ligne le 21 janvier dans la revue Gastroentérologie.
Le brossage de l'œsophage utilise une brosse douce pour un endoscope afin de collecter les cellules de la muqueuse œsophagienne. La méthode peut prélever des cellules sur une plus grande surface de l'œsophage qu'une biopsie habituelle. Endoscopie, souvent au brossage, "fait partie de la norme de soins pour les personnes atteintes de la maladie de Barrett, " Bettegowda dit, ainsi, l'incorporation de la méthode de détection de l'aneuploïdie ne changerait pas substantiellement la pratique clinique.
Seules quelques cellules sur des centaines échantillonnées par brossage peuvent présenter une aneuploïdie, cependant, Il est donc essentiel de combiner le brossage avec un séquençage massivement parallèle pour trouver ces cellules. Les chercheurs ont utilisé une technique appelée RealSeqS pour examiner plus de 350, 000 régions du génome pour identifier des altérations spécifiques des bras chromosomiques. RealSeqS peut généralement détecter une aneuploïdie au niveau d'environ 1 sur 200 cellules, ce qui est nécessaire lorsque de grandes parties du brossage œsophagien proviennent de cellules normales, dit l'auteur principal de l'étude Christopher Douville, le chercheur du Kimmel Center qui a conçu RealSeqS.
"La méthode est rapide et peut traiter des centaines d'échantillons de manière rentable, ce qui en fait un choix idéal pour la recherche BE, " dit Douville.
Les chercheurs ont obtenu des brossages oesophagiens de patients sans BE, avec BE et pas de cellules anormales, avec BE et des anomalies cellulaires de bas ou de haut grade, et les patients atteints d'adénocarcinome de l'œsophage. Ils ont entraîné leur système d'identification à distinguer les brossages des patients BE sans anomalies cellulaires de ceux atteints d'adénocarcinome en utilisant des échantillons de 79 patients. L'équipe de recherche a ensuite examiné des échantillons de 268 patients pour tester si la méthode pouvait distinguer différents stades de la progression de l'EB.
Bettegowda, Douville et leurs collègues ont identifié un seuil d'aneuploïdie qui distinguait les patients présentant des anomalies cellulaires de haut grade et un adénocarcinome des patients BE sans anomalie cellulaire. A ce seuil, la méthode a identifié les patients à haut risque dans 232 ou 86,7% des cas.
La méthode a également identifié des changements de bras chromosomiques spécifiques à chaque étape de la progression de l'EB vers l'adénocarcinome. Certains de ces changements spécifiques ont déjà été liés aux stades de la maladie par des recherches antérieures, "mais ils n'étaient pas assez complets pour être utilisés d'une manière diagnostique ou pronostique, " dit Douville.
Les chercheurs ont utilisé ces changements pour développer un outil d'évaluation qu'ils ont appelé BAD (Barrett's Aneuploïdy Decision), pour distinguer les étapes de la progression de BE. L'outil pourrait être particulièrement utile pour identifier les individus à haut risque lorsque les biopsies cellulaires semblent bénignes, parce que l'outil BAD signale les changements moléculaires liés à une maladie plus agressive, dit Bettegowda.
"L'aneuploïdie est un biomarqueur aussi universel que l'on peut en trouver actuellement pour le cancer, nous sommes donc ravis de voir comment nous pouvons utiliser cette technologie pour une multitude de cancers, " dit-il. " Nous sommes optimistes qu'étant donné la polyvalence du test RealSeqS, nous pourrions étudier d'autres processus pathologiques, d'autres types de cancer et potentiellement trouver d'autres moyens d'intervenir plus tôt."
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