In de slokdarm van Barrett (BE), chronische zure reflux uit de maag beschadigt de cellen die de onderste slokdarm bekleden, waardoor ze meer gaan lijken op cellen van het lagere spijsverteringsstelsel. Cellen in de onderste slokdarm doorlopen verschillende precancereuze stadia voordat ze zich soms ontwikkelen tot adenocarcinoom van de slokdarm, een kanker met een vijfjaarsoverleving van minder dan 20 procent. BE is de enige bekende voorloper van adenocarcinoom van de slokdarm.
Clinici kunnen deze progressieve toestanden in BE detecteren door te zoeken naar chromosomale veranderingen die bekend staan als aneuploïdie - een veelvoorkomend kenmerk in de meeste kankercellen - maar tot nu toe omvatte het proces meerdere biopsieën.
Een enkele slokdarmpoetsbeurt gecombineerd met de sequencingtechniek genaamd RealSeqS is gevoelig en specifiek genoeg om aneuploïdie te identificeren in verschillende stadia van BE-progressie, en kan zelfs specifieke soorten aneuploïdie matchen met specifieke stadia van de ziekte, zeggen de onderzoekers.
Aneuploïdie is al lang betrokken bij de ontwikkeling, initiatie of progressie van slokdarmkanker, maar de testen of experimentele methoden om dit te detecteren zijn niet zo gemakkelijk bereikt of zo hoog als we hadden gewild voor klinische implementatie."
Chetan Bettegowda, MD, doctoraat, Studie Senior Auteur en Jennison en Novak Families Professor in Neurochirurgie, Kimmel Kankercentrum
De methode kan clinici helpen bij het identificeren van mensen met een hoger risico op BE-ontwikkeling tot oesofageaal adenocarcinoom, "het instellen van een intensievere follow-up van die patiënten of het instellen van behandelingen in eerdere stadia van de ziekte, ' zegt Bettegowda.
De resultaten werden op 21 januari online gepubliceerd in het tijdschrift Gastro-enterologie.
Bij het poetsen van de slokdarm wordt een zacht opzetborsteltje voor een endoscoop gebruikt om cellen uit de slokdarmwand te verzamelen. De methode kan cellen bemonsteren van een groter oppervlak van de slokdarm dan een gebruikelijke biopsie. Endoscopie, vaak met poetsen, "maakt deel uit van de zorgstandaard voor mensen met Barrett's, "Bettegowda zegt, dus het opnemen van de aneuploïdie-detectiemethode zou de klinische praktijk niet wezenlijk veranderen.
Slechts een paar van de honderden cellen die zijn bemonsterd door middel van borstelen, kunnen aneuploïdie vertonen, echter, dus het combineren van poetsen met massaal parallelle sequencing is de sleutel tot het vinden van deze cellen. De onderzoekers gebruikten een techniek genaamd RealSeqS om over meer dan 350, 000 regio's van het genoom om specifieke chromosoomarmveranderingen te identificeren. RealSeqS kan typisch aneuploïdie detecteren op het niveau van ongeveer 1 op 200 cellen, wat nodig is wanneer grote delen van het poetsen van de slokdarm afkomstig zijn van normale cellen, zegt hoofdauteur Christopher Douville, de Kimmel Center-onderzoeker die RealSeqS heeft ontworpen.
"De methode is snel en kan honderden monsters kosteneffectief verwerken, waardoor het een ideale keuze is voor het BE-onderzoek, ' zegt Douville.
De onderzoekers kregen slokdarmpoetsbeurten van patiënten zonder BE, met BE en geen abnormale cellen, met BE en laag- of hooggradige celafwijkingen, en patiënten met slokdarmadenocarcinoom. Ze trainden hun identificatiesysteem om poetsbeurten van BE-patiënten zonder celafwijkingen te onderscheiden van die met adenocarcinoom met behulp van monsters van 79 patiënten. Het onderzoeksteam bekeek vervolgens monsters van 268 patiënten om te testen of de methode verschillende stadia van BE-progressie kon onderscheiden.
Bettegowda, Douville en hun collega's identificeerden een drempel van aneuploïdie die patiënten met hoogwaardige celafwijkingen en adenocarcinoom onderscheidde van BE-patiënten zonder celafwijkingen. Bij deze drempel de methode identificeerde hoogrisicopatiënten in 232 of 86,7% van de gevallen.
De methode identificeerde ook specifieke chromosomale armveranderingen in elk stadium van BE-progressie naar adenocarcinoom. Sommige van deze specifieke veranderingen zijn al in verband gebracht met ziektestadia door eerder onderzoek, "maar ze waren niet uitgebreid genoeg om op een diagnostische of prognostische manier te worden gebruikt, ' zegt Douville.
De onderzoekers gebruikten deze veranderingen om een beoordelingsinstrument te ontwikkelen dat ze BAD noemden (Barrett's Aneuploidy Decision), voor het onderscheiden van stadia van BE-progressie. De tool kan vooral nuttig zijn voor het identificeren van personen met een hoog risico wanneer celbiopten er goedaardig uitzien, omdat de BAD-tool wijst op moleculaire veranderingen die verband houden met agressievere ziekten, zegt Bettegowda.
"Aneuploïdie is een even universele biomarker als we op dit moment kunnen vinden voor kanker, dus we zijn verheugd om te zien hoe we deze technologie kunnen gebruiken voor een groot aantal kankers, " zegt hij. "We zijn optimistisch dat we, gezien de veelzijdigheid van de RealSeqS-assay, andere ziekteprocessen kunnen bestuderen, andere kankersoorten en mogelijk andere manieren vinden om eerder in te grijpen."